Die öffentliche Datenbank vonCDDist eine wertvolle Ressource.

CDD Public bietet CDD Vault Nutzern Zugang zu mehr als 100 gut kuratierten Datensätzen, die in Verbindung mit Ihren eigenen privaten Daten einfach abgerufen und analysiert werden können. Die in CDD Public gespeicherten Verbindungen können über die CDD Vaulteinfach zu bedienenden, chemisch intelligenten Schnittstelle. Darüber hinaus hat CDD kürzlich die Fähigkeit entwickelt, QSAR-Modelle zu erstellen. Das bedeutet, dass Sie jetzt ein Modell auf der Grundlage jeder in CDD Public gespeicherten Eigenschaft erstellen und sehen können, wie Ihre Verbindungen im Vergleich stehen. Dies kann insbesondere für die Vorhersage von Zielselektivität oder ADME/Tox-Eigenschaften nützlich sein.

In Zusammenarbeit mit NCBI-PubChem hat CDD nun Links zu unterstützenden Daten wie Bioaktivität, ADME, Toxizität, Eigenschaften und Quellen für die mehr als eine Million Moleküle in CDD Public bereitgestellt. Darüber hinaus wurden auf CDD 94.000 Strukturen hinzugefügt, die PubChem bisher nicht bekannt waren. Dazu gehören eine Reihe von Struktur-Wirkungs-Sammlungen für seltene und vernachlässigte Krankheiten wie Malaria, Tuberkulose und tropische Parasiten sowie Toxizitäts- und Eigenschaftsdaten. PubChem hat diese Ankündigung kürzlich auf seiner Homepage veröffentlicht:

Die PubChem-Datenbank hat vor kurzem die Marke von 50 Millionen bekannten Verbindungen überschritten und ist damit wahrscheinlich die umfassendste Sammlung. CDD ist stolz auf diesen Beitrag unserer Nutzergemeinschaft. Wenn Sie einen öffentlichen Datensatz kennen, von dem Sie glauben, dass er für die Gemeinschaft von CDD wertvoll sein könnte, lassen Sie es uns bitte wissen, und wir werden ihn in die Datenbank CDD Public aufnehmen.

Hier eine kurze Auswahl von Datensätzen, die für die Nutzer von CDD von großem Interesse sind:

• FDA ZUGELASSEN: Zugelassene Medikamente - mit definierter Molekularstruktur, darunter 763 Moleküle aus der Physicians' Desk Reference, 780 aus DrugBank, 1151 im Orange Book 2007 und 1007 aus der FDA-Liste von Dr. Chris Lipinski.
• KINASE: ChEMBL Kinase SARfari Compounds & BioAssay Data - stellt eine große Menge an SAR-Daten für kinaseaktive Verbindungen gegen eine Vielzahl von Kinasen in einer breiten Palette von Assays zur Verfügung, von denen viele manuell aus der Literatur ermittelt und kuratiert wurden.
• GPCR: PDSP Ki Database-enthält über 47.000 Ki-Werte gegen 699 GPCR-Targets aus der NIMH Psychoactive Drug Screening Program (PDSP) Database

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Dieser Blog wird von Mitgliedern der CDD Vault Community verfasst. CDD Vault ist eine gehostete Plattform für die Arzneimittelforschung, die sowohl private als auch externe biologische und chemische Daten sicher verwaltet. Sie bietet Kernfunktionen wie Registrierung von Chemikalien, Struktur-Aktivitäts-Beziehung, chemisches Inventar und elektronische Labornotizbücher!

CDD Vault : Drug Discovery Informatics - Ihr gesamtes Projektteam wird begeistert sein!