GSK und Online-Communities gründen einzigartige Allianz zur Förderung der Open-Source-Wirkstoffforschung für Malaria
20. Mai 2010
GSK ist das erste Unternehmen, das die chemischen Strukturen von 13.500 Molekülen aus seiner Substanzbibliothek frei zugänglich macht
Bildung von Allianzen mit führenden wissenschaftlichen Forschungsgemeinschaften aus der Privatwirtschaft und öffentlich zugänglichen Datenanbietern
BURLINGAME, Kalifornien. 19. Mai 2010 - GlaxoSmithKline (GSK) hat sich mit führenden öffentlichen Datenanbietern wie dem European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), der U.S. National Library of Medicine (NLM) und dem US-amerikanischen Informatikdienstleister Collaborative Drug Discovery (CDD) zusammengetan, um wichtige wissenschaftliche Informationen über mehr als 13.500 Wirkstoffe frei zugänglich zu machen, die letztlich zu neuen Behandlungsmöglichkeiten für Malaria führen könnten.
Die Freigabe dieser Daten markiert das erste Mal, dass ein pharmazeutisches Unternehmen die Strukturen so vieler Wirkstoffe zur Verfügung stellt, und wird durch die Zusammenarbeit mit den Webhostern und ihren spezialisierten Recherchetools ermöglicht, die den Forschern kostenlos zur Verfügung stehen werden. Die Informationen, die auf Websites gehostet werden, die regelmäßig von Forschern genutzt werden, umfassen hochwertige wissenschaftliche Daten über die Moleküle aus der GSK-eigenen Substanzbibliothek, die ihre Wirksamkeit gegen den tödlichsten Malariaparasiten, P. falciparum, bewiesen haben.
"Wir freuen uns, dass EMBL-EBI, NLM und CDD sich uns in diesem lohnenden Unterfangen angeschlossen haben, um die Prinzipien von Open Source auf die Entdeckung von Medikamenten gegen Malaria anzuwenden", sagte Patrick Vallance, Leiter der Arzneimittelforschung bei GSK. "Um diese Krankheit zu besiegen, müssen viele Wissenschaftler zusammenarbeiten. Wir hoffen, dass Forscher aus der ganzen Welt diese Informationen nutzen werden, um weitere Studien voranzutreiben, und dass andere Gruppen, von der pharmazeutischen Industrie bis zur Wissenschaft, ihre Informationen zu dieser Online-Ressource hinzufügen werden".
Diese Art von Daten ist der erste Schritt auf dem Weg zur Entwicklung neuer Medikamente. Mit der Struktur der Verbindungen und Informationen darüber, wo sie auf den Malariaparasiten einwirken, könnten Wissenschaftler dann weitere Forschungen an diesen Verbindungen für die Medikamentenentwicklung durchführen oder um zu verstehen, wie diese verwendet werden könnten, um den Lebenszyklus des Parasiten zu hemmen und schließlich zu neuen Medikamenten zu führen. Die weite Verbreitung dieser Informationen ist im Wesentlichen ein Beispiel für die Anwendung der "Open-Source"-Taktik bei der Arzneimittelentdeckung.
"Informationen aus den Biowissenschaften für die Forschungsgemeinschaft offen zugänglich zu machen, ist das Herzstück der Mission des EMBL-EBI", fügte John Overington, Leiter des ChEMBL-Teams des EMBL-EBI, hinzu, das über seine ChEMBL-Ressource als primäres Repository für die Daten fungieren wird. "Wir sind stolz darauf, dass wir den GSK-Daten einen Mehrwert verleihen können, indem wir sie in ChEMBL einbinden und mit einer Vielzahl von Informationen verknüpfen, die Forschern helfen könnten, neue Behandlungsmethoden für Malaria zu finden. Dies ist der Beginn einer neuen Ära der öffentlich-privaten Zusammenarbeit in der Arzneimittelforschung."
"Die NLM freut sich, an dieser bahnbrechenden Freigabe von Informationen für die Öffentlichkeit beteiligt zu sein", sagte Steve Bryant, Leiter der PubChem-Datenbank der NLM, in der die Daten untergebracht sind. "Indem GSK diese Daten über öffentliche Ressourcen wie PubChem zur Verfügung stellt, erleichtert es den Forschungsprozess erheblich, da die Informationen mit verwandten Verbindungen, Bioaktivitätsergebnissen, veröffentlichter Literatur und anderen Ressourcen verknüpft sind, die den Forschern helfen werden, neue Entdeckungen zur Bekämpfung von Malaria zu machen."
"CDD ist hocherfreut, bei diesem wahrhaft historischen Ereignis eine Rolle zu spielen", kommentierte Barry A. Bunin, CEO von Collaborative Drug Discovery. "Nach Jahrzehnten medizinischer Durchbrüche durch die großen Pharmakonzerne ist dies das erste Mal, dass eine Gruppe alle chemischen und biologischen Daten - und nicht nur die wenigen Treffer - offen zugänglich macht. Darüber hinaus können die Forscher mit den Tools von CDD bei phänotypischen Screens damit beginnen, Hypothesen aufzustellen und die Targets aus den Ganzzell-Screens zu validieren."
EMBL-EBI wird als primäres Repositorium für die Daten dieses Substanzsatzes fungieren und weitere Informationen, die beigetragen werden, indexieren und formatieren. GSK wird weitere Informationen hinzufügen, sobald sie generiert werden, und externe Wissenschaftler, die diese Verbindungen und die Daten erforschen, werden gebeten, dies ebenfalls zu tun.
Über die Daten
Die Daten enthalten die "Treffer" oder Ergebnisse aus einem Screening der 2 Millionen Verbindungen in der Substanzbibliothek von GSK, um die Wirkung dieser Verbindungen auf den Malariaparasiten zu bestimmen. Das Screening-Projekt identifizierte ~13.500 Verbindungen, die eine starke Hemmung auf den Parasiten zeigten.
Kinase-Inhibitoren machten einen großen Teil der Moleküle mit zuvor bekannter Aktivität aus, die nun als Antimalaria-Treffer identifiziert wurden. Die Daten umfassen die chemischen Familien, die GSK derzeit für diese Indikation erforscht, sowie die "Wirkmechanismen" derjenigen Verbindungen, die das Unternehmen zuvor für andere Indikationen getestet hat.
Die meisten der identifizierten Verbindungsstrukturen wurden als für die Umwandlung in ein Medikament geeignet eingestuft.
Die aktuellen mikrobiologischen Informationen zu den Verbindungen und die Strukturen wurden auf Online-Ressourcen gestellt, die für Forscher leicht zugänglich sind. Die EMBL-EBI-Site wurde so aufgebaut, dass Wissenschaftler weltweit ihre Daten zu den dortigen Informationen hinzufügen können, wobei der Zugang für alle frei ist. Der Wert der Freigabe von Informationen wird durch die Zusammenarbeit der Web-Hosts und die spezialisierten Forschungswerkzeuge auf der Site erhöht, die den Forschern kostenlos zur Verfügung gestellt werden.
GSK bedankt sich für die Unterstützung von Medicines for Malaria Venture, das dieses Projekt finanziell unterstützt hat.
Vollständige Informationen können online eingesehen werden unter:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
Über Malaria
Malaria ist eine lebensbedrohliche Krankheit, die durch Parasiten verursacht wird, die durch die Stiche infizierter Moskitos auf den Menschen übertragen werden. Alle 30 Sekunden stirbt ein Kind an Malaria. Im Jahr 2009 gab es 243 Millionen Malariafälle, die fast eine Million Todesfälle verursachten, hauptsächlich unter afrikanischen Kindern.
Die beste verfügbare Behandlung für Malaria - insbesondere für den tödlichsten Stamm P. falciparum - ist eine Kombination von Medikamenten, bekannt als Artemisinin-basierte Kombinationstherapien (ACTs). Allerdings ist die Resistenz der Parasiten ein Problem und untergräbt die Bemühungen zur Malariakontrolle. Es gibt keine wirksamen Alternativen zu Artemisininen für die Behandlung von Malaria, die entweder auf dem Markt sind oder kurz vor dem Ende der Medikamentenentwicklung stehen.
Über GlaxoSmithKline
GlaxoSmithKline - eines der weltweit führenden forschenden Pharma- und Gesundheitsunternehmen - setzt sich für die Verbesserung der menschlichen Lebensqualität ein, indem es Menschen ermöglicht, mehr zu tun, sich besser zu fühlen und länger zu leben. Weitere Informationen über GSK finden Sie unter www.gsk.com
Über das Europäische Bioinformatik-Institut (EMBL-EBI)
Das Europäische Bioinformatik-Institut (EMBL-EBI) ist Teil des Europäischen Laboratoriums für Molekularbiologie (EMBL) und befindet sich auf dem Wellcome Trust Genome Campus in Hinxton bei Cambridge (UK). Das EMBL-EBI ist aus der Pionierarbeit des EMBL bei der Bereitstellung öffentlicher biologischer Datenbanken für die Forschungsgemeinschaft hervorgegangen. Es beherbergt einige der weltweit wichtigsten Sammlungen biologischer Daten, darunter DNA-Sequenzen (ENA), Proteinsequenzen (UniProt), Tiergenome (Ensembl), dreidimensionale Strukturen (die Protein-Datenbank in Europa), Daten aus Genexpressions-Experimenten (ArrayExpress), Protein-Protein-Wechselwirkungen (IntAct) und Informationen über Signalwege (Reactome). Das EMBL-EBI beherbergt mehrere Forschungsgruppen und seine Wissenschaftler entwickeln ständig neue Werkzeuge für die Biocomputing-Community. Für weitere Informationen über das EMBL-EBI besuchen Sie www.ebi.ac.uk
Über die National Library of Medicine (NLM)
Die National Library of Medicine(http://www.nlm.nih.gov/) ist die weltweit größte Bibliothek der Gesundheitswissenschaften. Die NLM ist ein Teil der National Institutes of Health (NIH), einer Komponente des U.S. Department of Health and Human Services. Die NIH sind die wichtigste Bundesbehörde für die Durchführung und Unterstützung von grundlegender, klinischer und translationaler medizinischer Forschung und erforschen die Ursachen, Behandlungen und Heilungsmöglichkeiten sowohl für häufige als auch für seltene Krankheiten. Weitere Informationen über die NIH und ihre Programme finden Sie unter www.nih.gov.
Über kollaborative Arzneimittelentdeckung (CDD)
CDD beherbergt die am weitesten verbreitete Cloud-Plattform für die Arzneimittelforschung auf dem Markt. "CDD Vault " ist die sichere, private Datenbank auf Industriestandard, die traditionelle Arzneimittelforschungsinformatik (Registrierung und SAR) mit sozialen Netzwerkfunktionen kombiniert. "CDD Collaborate" ermöglicht die Zusammenarbeit in Echtzeit durch den sicheren Austausch ausgewählter vertraulicher Daten mit externen Forschern. "CDD Public" hat einzigartige Inhalte. Für weitere Informationen über CDD besuchen Sie bittewww.collaborativedrug.com.
GSK Presse Kontakt:
UK: Janet Morgan Tel: + 44 (0) 20 8047 5502
US: Melinda Stubbee Tel: +1 919 483 2839
EMBI-EBI Pressekontakt:
Katrina Pavelin Tel: +44 (0) 1223 494 452
EMBL-EBI Scientific Outreach Officer E-Mail: [email protected]
NLM Presse-Kontakt:
Melanie Modlin Tel: +1 301 496 7771
NLM Büro für Kommunikation und Öffentlichkeitsarbeit E-Mail: [email protected]
CDD Pressekontakt:
Barry Bunin, PhD Tel: +1 650 204 3084
Präsident & CEO von Collaborative Drug Discovery, Inc. E-Mail: [email protected]
