Öffentlicher Zugang

Als Service für die Community stellt CDD Public Access-Daten bereit, die für die Wirkstoffentdeckung von führenden Forschungsgruppen auf der ganzen Welt relevant sind.

Voll integriert mit dem CDD Vaulthaben Benutzer vollen Zugriff auf diese Sätze direkt von ihren Konten. Wissenschaftler ohne CDD Vault Zugang, der unser Repository von Public Access Data einsehen oder abbauen möchte, kann Registrieren Sie sich für ein kostenloses Konto. Wir begrüßen und ermutigen Beiträge. Wissenschaftler, die auf CDD Public Access veröffentlichen möchten, sollten zu kontaktieren.

Perlara ArkBase

Veröffentlicht von: Perlstein Lab Molecules: 56756

PI: Ethan Perlstein

Veröffentlicht: 10 / 27 / 2019

Ein vollständig auf Open-Source-Modellen basierendes phänotypisches Screening-Datenkorpus, das aus Wirkstoff-Repurposing- und Blei-Discovery-Screenings in Hefe-, Wurm-, Fliegen- und Humanzellmodellen angeborener Stoffwechselstörungen wie Lysosomenerkrankungen und angeborenen Glykosylierungsstörungen besteht. Diese Daten wurden in drei Fallstudien in den Fachzeitschriften G3 (Lao et al., 2019 https://www.g3journal.org/content / 9 / 2 / 413.long) und Krankheitsmodelle & -mechanismen (Iyer et al., 2019a https://dmm.biologists.org/Inhalt / früh / 2019 / 09 / 18 / dmm.040576.long; Iyer et al., 2019b https://dmm.biologists.org/Inhalt / früh / 2019 / 10 / 19 / dmm.040584.long).


Serotoninrezeptor in vitro und in vivo Aktivität

Veröffentlicht von: Nichols Molecules: 84

PI: Dave Nichols

Veröffentlicht: 10 / 14 / 2019

Datensätze konzentrieren sich auf Gehirnsysteme, die Dopamin oder Serotonin als Neurotransmitter verwenden. Dies umfasst molekulare Sonden, die nur für einen der fünf allgemeinen Typen von Dopaminrezeptoren (D1 - D5) spezifisch sind, sowie Datensätze zu Serotonin-5-HT1A-, 5-HT2A- und 5-HT2C-Rezeptoren. Diese Projekte umfassen eine systematische Strukturmodifikation, gekoppelt mit einem pharmakologischen Assay, um strukturelle Determinanten der Ligandenbindungsdomäne in diesen Rezeptoren zu identifizieren. Ein Thema dieser Arbeit war es zu identifizieren, wie Moleküle aus verschiedenen chemischen Klassen innerhalb der gleichen Rezeptorbindungsstelle untergebracht werden können.


MEHRFACHE SKLEROSE: OL Differenzierung

Veröffentlicht von: Myelin Repair Foundation Moleküle: 710

PI: Tassie Collins

Veröffentlicht: 10 / 21 / 2016

Akuter Oligodendrozytendifferenzierungsassay O4-immungereinigte OPCs wurden mit 5k / Vertiefung ausplattiert. 1 Stunden nach dem Ausplattieren wurde der Testartikel zugegeben und die Zellen wurden vier Tage inkubiert, woraufhin die Zellen fixiert und auf MBP und Gesamtkeime (DAPI) immungefärbt wurden. Die OPC-Differenzierung in OLs wurde durch Quantifizierung der MBP-Färbung / Anzahl der Zellen (identifiziert durch DAPI-Kernfärbung) bestimmt. Das Screening der Verbindungen wurde vierfach bei 2-Konzentrationen (10 & 2 uM; 2 & 0.4 uM; 0.4 & 0.08 uM) durchgeführt. Die Daten sind auf DMSO (0% -Differenzierung) und 40 ng / ml T3 (100% -Differenzierung) normalisiert. EC50 wird relativ zum EMax des Testartikels bestimmt. Für technische Details siehe Lariosa-Willingham, et. al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 419 oder Kontakt [Email protected] für detaillierte Protokolle.


MEHRFACHE SKLEROSE: OL-Schutz

Veröffentlicht von: Myelin Repair Foundation Moleküle: 723

PI: Tassie Collins

Veröffentlicht: 10 / 21 / 2016

Oligodendrozyten-Schutz-Assay - Lebensfähigkeit (TNF + IFNg) Erweiterte OPCs wurden bei 10K / Vertiefung ausplattiert. 24 Stunden nach dem Plattieren wurde Testartikel hinzugefügt, 1hr nach dem Hinzufügen des Testartikels wurde Insult mit 10U / ml IFN-gamma / 1ng / ml TNF-alpha hinzugefügt. 2-Tage inkubieren, AlamarBlue zugeben und vier Stunden inkubieren. Quantifizieren Sie die AlamarBlue-Fluoreszenz, um die Lebensfähigkeit der Zellen zu bestimmen. Die Daten werden auf DMSO (0% Aktivität) und 1.1 uM Quetiapin (100% Aktivität) skaliert. Für technische Details siehe Rosler, et. al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 444-Kontakt [Email protected] für detaillierte Protokolle.


MEHRFACHE SKLEROSE: Myelinisierungstest

Veröffentlicht von: Myelin Repair Foundation Moleküle: 715

PI: Tassie Collins

Veröffentlicht: 10 / 21 / 2016

Kortikale Myelinisierungsassayzellen aus dem E18-Hirnkortex wurden präpariert und in neuralbasalen Medien ausplattiert. Vier Tage später wurde das Medium auf MyM Media umgestellt. Am Tag 5 werden Testartikel hinzugefügt, und die Myelinisierung kann acht Tage lang erfolgen. Am Tag 13 in vitro wurden die Zellen für MBP und Olig2 fixiert und immungefärbt. Die Myelinisierung wurde durch Quantifizierung der MBP / Olig2 + -Kernfärbung und Änderung der MBP-Morphologie (Ausrichtung der zusammenhängenden MBP-Färbung - Faserlänge) bestimmt. Die OL-Differenzierung wurde durch Quantifizierung der MBP-Dichte x Fläche / Olig2 + -Kerne bestimmt. Die Verbindungen wurden doppelt mit 4-Bildern / Vertiefung bei 2-Konzentrationen (5 & amp; 1 uM) gescreent. Die Daten werden auf DMSO (0% Differenzierung / Myelinisierung) und DAPT (100% Differenzierung / Myelinisierung) normalisiert. EC50s, die im Verhältnis zur Reaktion auf 1 uM DAPT bestimmt wurden. Für technische Details siehe Lariosa-Willingham, et. al. BMC Neurosci. 2016 Apr 22; 17: 16 oder Kontakt [Email protected] für detaillierte Protokolle.


MEHRFACHSKLEROSE: HEK293-Tunicamycin-Schutzassay

Veröffentlicht von: Myelin Repair Foundation Moleküle: 740

PI: Tassie Collins

Veröffentlicht: 10 / 7 / 2016

HEK-293-Schutzassay

HEK-293-Zellen (10K / Vertiefung) werden 24-Stunden lang inkubiert, dann wird der Testartikel hinzugefügt. Nach 1 Stunde wird 100 ng / ml Tunicamycin zugegeben. Nach einer zusätzlichen Inkubation von 48 Stunden wird AlamarBlue hinzugefügt und die Fluoreszenz wird 4 Stunden später quantifiziert. Die Daten sind auf DMSO (0% Aktivität) und 5 uM Guanabenz (100% Aktivität) normalisiert. EC50 wird relativ zum EMax des Testartikels bestimmt. Kontakt [Email protected] für detaillierte Protokolle.


MEHRFACH-SCLEROSE: OL-Toxizitäts-Screening

Veröffentlicht von: Myelin Repair Foundation Moleküle: 709

PI: Tassie Collins

Veröffentlicht: 10 / 7 / 2016

Oligodendrozytentoxizitätstest (TNF + IFNg)

Toxizitätsassay an passagierten Ratten-OPCs, plattiert bei 10k / Vertiefung, mit Arzneimittel für 2 Tage inkubiert. Ausgelesen wird die AlamarBlue-Fluoreszenz nach 4-Inkubation. Die Daten sind als prozentuales Überleben relativ zu DMSO (100%) angegeben. Die maximale Abtötung erfolgt mit 5 ng / ml Tunicamycin, wodurch ~ 15% Zellen am Leben bleiben. Für technische Details siehe Lariosa-Willingham et al., BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 419 oder Kontakt [Email protected] für detaillierte Protokolle.


Grüne Lösungsmittel

Veröffentlicht von: Alex Clark Sandbox Molecules: 117

Veröffentlicht: 9 / 20 / 2016

Daten zu grünen Lösungsmitteln, die von der gleichnamigen mobilen App verwendet werden (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Zusammengestellt aus Informationen des ACS Green Chemical Institute und des GSK Solvent Guide. Veröffentlicht in http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


PARASITEN: GSK Kineto Box trifft mit pIC50

Veröffentlicht von: GSK Kineto Box Project (TCAKS) Moleküle: 592

PI: Pilar Manzano

Veröffentlicht: 6 / 16 / 2016

Unter Verwendung von phänotypischen Ganzzelltests wurde der GlaxoSmithKline-Satz von 1.8-Millionen-Verbindungen für das Hochdurchsatz-Screening (HTS) auf die drei für die menschliche Krankheit wichtigsten Kinetoplastiden, dh Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi und Trypanosoma brucei, gescreent. Sekundäre bestätigende und orthogonale intrazelluläre Antiparasitizidtests wurden durchgeführt und das Potential für nicht-spezifische Zytotoxizität bestimmt. Hit-Verbindungen wurden chemisch geclustert und auf wünschenswerte physikalisch-chemische Eigenschaften untersucht. Der hypothetische biologische Zielraum, der von diesen Diversity-Sets abgedeckt wird, wurde mit bioinformatischen Methoden untersucht. Folglich wurden drei antikinetoplastische Chemikalienboxen mit jeweils ungefähr 200-Verbindungen zusammengebaut. Dieser Datensatz enthält Treffer-Verbindungen und alle zugehörigen Screening-Ergebnisse. http://www.nature.com/articles/srep08771


ANBIETER: ASINEX PPI Library

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 8400

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 3 / 3 / 2016

ASINEX beschäftigt sich seit 2008 mit dem Design und der Synthese von Protein-Protein-Interaktionsbibliotheken (PPI). Die neueste Generation der ASINEX PPI-Bibliothek umfasst Moleküle verschiedener Größen, Gerüste und Formen, von fragmentartigen Entitäten bis hin zu makrocyclischen Derivaten, die als Sekundärstruktur- oder Epitop-Mimetika konzipiert sind.


ANBIETER: ASINEX Elite Library

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 12960

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 3 / 3 / 2016

Welche Probleme gibt es nach dem ersten „Treffer“? Asinex hat diese Probleme mit einer umfassenden ADME-Profilerstellung, einem optimalen Design für die einfache Änderung von Medchem und einer IP-Bewertung behoben, um die Neuheit sicherzustellen.


ANBIETER: ASINEX Phenotypic Library

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 9840

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 3 / 3 / 2016

Asinex führt sowohl zielgerichtete als auch phänotypische Tests im eigenen Haus durch und verwendet die gesammelten experimentellen Informationen, um sowohl zielgerichtete als auch verschiedene Screening-Sets zu erstellen. Aufgrund dieser Erfahrung hat Asinex ein phänotypisches Screening-Set erstellt. Filter für diesen Satz sind wie folgt:

MW: 200-450, verstopfen: -1.0-7.0, verstopfen (pH 7.4): - 5.0-4.0, rot , N + O: 0-10, HAC: 1-10, Dipol: 1-5, SHP15: 135-2.


ANBIETER: ASINEX Diversity Library

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 9968

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 3 / 3 / 2016

Diversity ist nach wie vor ein leistungsstarkes Screening-Instrument, insbesondere in der frühen Phase der Wirkstoffforschung. Bei der Erstellung dieses Sets hat Asinex Rechenwerkzeuge angewendet, um sicherzustellen, dass der chemische Raum korrekt dargestellt wird, und dabei auch Elemente der Konzepte „Elite“ und „BioDesign“ berücksichtigt.


ANBIETER: ASINEX BioDesign

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 8041

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 3 / 3 / 2016

Der BioDesign-Ansatz von ASINEX integriert wichtige Strukturmerkmale bekannter pharmakologisch relevanter Naturstoffe (z. B. Alkaloide und andere sekundäre Metaboliten) in synthetisch realisierbare Gerüste für die medizinische Chemie.


KATALOG: Distributed Drug Discovery (D3) - IUPUI

Veröffentlicht von: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Moleküle: 73234

PI: MJ O'Donnell und WL Scott

Veröffentlicht: 2 / 24 / 2016

Ein kostenloser, frei zugänglicher virtueller Katalog / eine Bibliothek von> 73,000-Molekülen: (a) N-Acyl-nichtnatürliche α-Aminosäuren, (b) Methylester von N-Acyl-nichtnatürlichen α-Aminosäuren und (c) primäre Amide von N -Acylunnatürliche α-Aminosäuren. Die Moleküle im Katalog wurden durch eine Aufzählung erhalten, die auf der kombinatorischen Festphasenalkylierung eines Glycinanionsäquivalents mit 100 R1X basiert, gefolgt von einer N-Acylierung mit 100 R2CO2H und einer Harzspaltung (TFA, MeOH / Et3N bzw. TFA). Der Altdatensatz von 48,818-Molekülen (über den Sätzen a und b plus R1X- und R2CO2H-Eingaben) wurde auf 1 / 1 / 2009 veröffentlicht. Wir ermutigen Kollegen, mit uns über das Interesse am D3-Projekt zu kommunizieren (E-Mail: [Email protected]<mailto:[Email protected]> oder [Email protected]<mailto:[Email protected]>). Referenzen: J. Comb. Chem. 2009, 11, 3-13, 14-33, 34-43; J. Org. Chem. 2014, 79, 3140-51; J. Chem. Educ. 2015, 92, 819-26.


MALARIA: Biochemisches Screening von 5 P. falciparum Kinasen gegen GSK's TCAMS

Herausgegeben von: Gregory J. Crowther Molecules: 13451

PI: Gregory J. Crowther

Veröffentlicht: 2 / 3 / 2016

~ 13,500-zellaktive Verbindungen wurden auf Aktivität gegen fünf verschiedene Proteinkinasen gescreent. Glaxosmithkline Tres Cantos Antimalarial Set (TCAMs) wurde in biochemischen Assays von Plasmodium falciparum calciumabhängigen Proteinkinasen 1 und 4 (CDPK1 / PF3D7_0217500 und CDPK4 / PF3D7_0717500), Mitogen-associated protein kinase 2 (MAPK2 / MAP2 / PF3D7_1113900), Proteinkinase gescreent 6 (PK6 / PF3D7_1337100) und Proteinkinase 7 (PK7 / PF3D7_0213400). Für drei der Kinasen wurden neuartige potente Inhibitoren (IC50 <1 uM) entdeckt: CDPK1, CDPK4 und PK6. Die PK6-Inhibitoren sind die wirksamsten, die bisher für dieses Enzym entdeckt wurden, und verdienen eine weitere Prüfung.


Öffentliche Verbindungen der Dunklen Materie

Veröffentlicht von: Dark Matter Compounds Molecules: 139352

PI: Guillermo Morales

Veröffentlicht: 12 / 7 / 2015

Novartis stellte fest, dass 803,990 ihrer Verbindungen in mindestens Novartis 100-Tests getestet wurde und 112,872-Verbindungen inaktiv waren (14.0%). Eine Analyse der NIH-Daten ergab, dass 363,598-Verbindungen in mindestens 100-Tests getestet wurden, in denen 131,726-Verbindungen inaktiv waren (36.2%).

Anne Mai Wassermann, Eugen Lounkine, Dominic Höpfner, Gaelle Le Goff, Frederick J. King, Christian Studer, John M. Peltier, Melissa L. Grippo, Vivian Prindle, Jianshi Tao, Ansgar Schuffenhauer, Iain M. Wallace, Shanni Chen, Philipp Krastel, Amanda Cobos -Correa, Christian N. Parker, John W. Davies & Meir Glick. Dunkle chemische Materie als vielversprechender Ausgangspunkt für die Entdeckung von Blei. Nature Chemical Biology 2015. 11, S. 958 – 966 (doi: 10.1038 / nchembio.1936)


ADME: AZ Public ChEMBL Data

Veröffentlicht von: AZ Public ChEMBL Data Molecules: 5799

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 10 / 5 / 2015

Experimentelle In-vitro-DMPK- und physikalisch-chemische Daten zu einer Reihe von öffentlich bekannt gemachten Verbindungen, die bei AstraZeneca bestimmt wurden. Die Referenzen, die für die Assays bereitgestellt wurden, veranschaulichen die experimentellen Verfahren, die zur Erzeugung der Daten verwendet wurden.

https://www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole guinea pig plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole dog plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole rat plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole mouse plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.Intrinsic clearance measured in human hepatocytes following incubation at 37C. Experimental range <3 to >150 microL/min/1E6 cells. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Bases: >= 2.Second most acidic pKa value (pKa A2) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Acids: <= 11.

Der drittgrößte pKa-Grundwert (pKa B3) wird durch Absorption und potentiometrische Titration unter Verwendung der Standardmethode von Sirius Analytical bestimmt. Experimenteller Bereich Grundlagen:> = 2.

Zweitgrößter pKa-Grundwert (pKa B2), bestimmt durch Absorption und potentiometrische Titration unter Verwendung der Standardmethode von Sirius Analytical. Experimenteller Bereich Grundlagen:> = 2.

Der meiste saure pKa-Wert (pKa A1) wird durch Absorption und potentiometrische Titration unter Verwendung der Standardmethode von Sirius Analytical bestimmt. Experimenteller Bereich Säuren: <= 11.


PDB-Liganden

Veröffentlicht von: Protein Database (PDB) Molecules: 16826

PI: Dale R. Cameron, Ph.D., MCIC, P.Chem.

Veröffentlicht: 8 / 3 / 2015

Ligandeninformationen werden aus dem PDB extrahiert, gefiltert, um "Polymer" und andere verwandte "nicht freie" Liganden sowie Metalle oder Metallbindungsliganden zu entfernen. Aktualisierungen der Filterprozedur können ohne Warnung erfolgen. Die Daten werden so wie sie sind ohne zusätzliche Kuratierung oder Fehlerkorrektur bereitgestellt. Links zu PDB werden von der RCSB PBD bereitgestellt und können als zitiert werden

HM Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, TN Bhat, H. Weissig, IN Shindyalov, PE Bourne (2000) Die Proteindatenbank Nucleic Acids Research, 28: 235-242.

Bitte melden Sie defekte Links, Anfragen nach zusätzlichen Daten usw. an den Vault-Administrator


EBOLA: niedermolekulare Inhibitoren des Ebola-Virus

Veröffentlicht von: Nadia's Sandbox Molecules: 55

PI: Dr. Nadia Litterman

Veröffentlicht: 2 / 2 / 2015

Dieser gemeinsam genutzte Datensatz enthält kleine 55-Moleküle aus der Literatur (bis Jan 2015), die in vitro und / oder in vivo gegen das Ebola-Virus und verschiedene Krankheitsmodelle wirksam sind. Wir haben eine Bewertung durch einen erfahrenen medizinischen Chemiker sowie Ergebnisse der PAINS-Filterung beigefügt. (Diese Arbeit wurde zur Veröffentlichung von Nadia Litterman, Christopher Lipinski und Sean Ekins bei F1000Research eingereicht.)


ANBIETER: Synthonix - Bessere Bindungen aufbauen

Veröffentlicht von: http://www.synthonix.com Moleküle: 10286

Veröffentlicht: 1 / 2 / 2015

Synthonix hilft medizinischen Chemikern dabei, die Grenzen der Wirkstoffentdeckung zu erweitern, indem es einen Katalog von 10286-Bausteinen bereitstellt, mit denen sie herausforderndere chemische Bereiche erkunden und das Spektrum potenziell bedeutender therapeutischer Ziele zur Behandlung der chronischen und heilbaren Krankheiten der Welt erweitern können. Synthonix, Inc .: 919-875-9277; Allgemeine E-Mail: [Email protected]; Synthonix Ltd (Europe Office): Büro: + 44 1223 597934; Email: [Email protected]


SONDEN: Chemische NIH-Sonden

Veröffentlicht von: Probes Vault Molecules: 319

PI: Christopher Lipinski

Veröffentlicht: 11 / 12 / 2014

Die National Institutes of Health (NIH) haben umfangreiche HTS-Anstrengungen in intra- und akademischen Zentren finanziert, um chemische Sonden oder Werkzeugverbindungen mit kleinen Molekülen über das Molecular Libraries Screening Center Network (MLSCN) und das zu identifizieren Molecular Library Probe Production Center Network (MLPCN). Für Verbindungen, die als Sonden gewählt werden sollen, wurden verschiedene Definitionen verwendet, die auf einer Kombination von Wirksamkeit, Selektivität, Löslichkeit und Verfügbarkeit beruhen. Bisher haben die vom NIH finanzierten akademischen Screening-Zentren mehr als 576-Chemiesonden entdeckt. Diese Sammlung enthält Teststrukturen, Ziele, Anti-Ziele, IC300-Werte und andere Referenzen. Es umfasst auch eine Vielzahl von Messungen der Arzneimittelähnlichkeit, einschließlich des von Dr. Chris Lipinski zugewiesenen Erwünschtheits-Scores, wie in „Computervorhersage und Validierung der Bewertung chemischer Sonden durch einen Experten“ beschrieben. Litterman NK, Lipinski CA, Bunin BA, Ekins S J Chem Inf Model. (50)


ANBIETER: Azepine Ltd. Building Blocks Collection

Veröffentlicht von: Azepine Ltd. Moleküle: 600

PI: Julia

Veröffentlicht: 10 / 8 / 2014

600-Bausteine, AUF LAGER zu wettbewerbsfähigen Preisen. Kontakt [Email protected]


NEU-CSIC-GSK Kinase-Targeted HTS

Veröffentlicht von: Pollastri Lab - Northeastern University Moleküle: 78

PI: Michael Pollastri

Veröffentlicht: 9 / 25 / 2014

Dieser Datensatz enthält die veröffentlichten Ergebnisse eines Hochdurchsatz-Screenings, das in Zusammenarbeit zwischen der Northeastern University (Pollastri Laboratory), dem CSIC (Navarro Laboratory) und dem GlaxoSmithKline Tres Cantos Laboratory (Diseases of the Developing World DPU) durchgeführt wurde. Der Artikel ist Diaz et al., PLoS-NTDs:

DOI: 10.1371 / journal.pntd.0003253

Bitte kontaktieren Sie [Email protected] Fragen stellen können.


VERKÄUFER: Vitas-M Labor Stock HTS Collection

Herausgegeben von: Vitas-M Laboratory Molecules: 388375

Veröffentlicht: 7 / 11 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. Bei der Sammlung von HTS-Verbindungen handelt es sich um 400 000-Einzelmoleküle, die auf Lager sind. Alle von ihnen sind für die schnelle Lieferung in verschiedenen Formaten erhältlich, einschließlich mg, Mikromol, Trockenpulver, DMSO-Lösung und Trockenfilm. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


ANBIETER: Vitas-M Laborbausteine

Herausgegeben von: Vitas-M Laboratory Molecules: 33297

Veröffentlicht: 7 / 10 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. Die Sammlung organischer Bausteine ​​enthält mehr als 33 000 identifizierte und getestete Artikel. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


ANBIETER: Vitas-M Laborgerüste

Herausgegeben von: Vitas-M Laboratory Molecules: 2898

Veröffentlicht: 7 / 8 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. Gerüstsammlung (Azalea-Projekt). Fortgeschrittene Ideen zur Synthese von drogenähnlichen Mini-Bibliotheken. Es ist die beste Wahl, absolut neuartige Verbindungen zu erwerben, die kein anderer Anbieter anbietet. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


VERKÄUFER: Vitas-M-Laborfragmente

Herausgegeben von: Vitas-M Laboratory Molecules: 18631

Veröffentlicht: 7 / 8 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. Sammlung von Fragmenten (chemische Substanzen, die durch "Rule of 3" und andere spezielle Filter geleitet werden) für die fragmentbasierte Wirkstoffentdeckung. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


ANBIETER: Life Chemicals-GPCR-Bibliothek

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 15948

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Die Suche nach Ähnlichkeiten / Pharmakophoren basierte auf der Vorhersage der Topomersuche, die von Sybyl-X bereitgestellt wurde. Erster Schritt - Bei einer Ähnlichkeitssuche wurde ein Vergleich der gesamten Stammverbindungen mit bekannten Inhibitoren aus BindingeDB und ChemblDB vorausgesetzt. Zweiter Schritt - Erzeugung von 3D-Strukturen bekannter Inhibitoren und deren Co-Alignment. Dieser chemische Raum diente als Vorlage für die Anpassung der übrigen "ähnlichen" Verbindungen. Diese Methode wurde jedoch für das "Cherry-Picking" entwickelt und eine alternative Bibliothek kann mit virtuellen Screening-Methoden (alle Screening-Modelle sind mit Trainingssets erhältlich) gegen solche Rezeptoren - Adenosin, Chemokin, Dopamin, Gaba-, Histamin, Muskarin, Opioid, Sphingosin. http://www.lifechemicals.com/


ANBIETER: Life Chemicals-Kinase durch Ähnlichkeit

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 62467

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Ähnlichkeitssuche mit öffentlichen MDL-Schlüsseln und der Tanimoto-Ähnlichkeitsgrenze von 90%. Fast 25K-Referenzverbindungen, die in biologischen 168-Assays (mehr als 100-verschiedene Kinaseziele) als aktiv getestet wurden, wurden für die Ähnlichkeitssuche verwendet. Alle diese Verbindungen können bis zur Kundenbestellung auf ein spezifischeres Ziel untersucht werden. http://www.lifechemicals.com/


ANBIETER: Life Chemicals-Kinase durch Andocken

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 15174

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Die Kinase-Bibliothek wurde basierend auf dem virtuellen Andocken in einer Sybyl-Umgebung erstellt. Zu diesem Zweck wurde eine Reihe von Bindungsstellen der Kinasestrukturen (etwa 20) ausgerichtet und analysiert. Solche überlagerten Stellen wurden für die strukturbasierte Pharmakophormodellierung über das Unity-Modul von Sybyl-X verwendet. Nach allen Vorbereitungen wurde ein ganzer 3D-Stamm gegen dieses Multi-Pharmakophor-Modell gescreent und am Ende ein Top-Ranking durchgeführt. http://www.lifechemicals.com/


ANBIETER: Life Chemicals-Nuclear Receptors

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 9896

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Life Chemicals. Virtuelles Andocken und Ähnlichkeits- / Pharmakophorensuche. http://www.lifechemicals.com/


ANBIETER: Life Chemicals- CNS Library

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 16535

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

In der Literatur beschriebene ZNS-Filter wurden als Sieb für unser gesamtes Lager verwendet. Wie gezeigt wurde, können die einzigen Verbindungen mit solchen Parametern geeignete Eigenschaften für die Permeabilität von Nervengewebe aufweisen. Alle Deskriptoren stammen aus Spreadsheets und Volsurf-Modulen von Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP = <3.6 H-Bindungsakzeptoren = <8 H-Bindungsspender = <5 tPSA = <120 Drehbare Bindungen = <5 LogBB1 = -3.0 bis 1.0) http://www.lifechemicals.com/


ANBIETER: Life Chemicals-Natural Product-like Library

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 7808

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Die erste Methode basierte auf der statistischen Analyse von Deskriptoren. Zuvor wurde eine große Datenbank von NPs analysiert, um NP-Gerüste zu untersuchen, indem sie in Form eines Baums angeordnet wurden. Daher wurde eine Analyse der Eigenschaftsverteilung von mehr als 130 000 NP-Strukturen sowie die Identifizierung von Substrukturen durchgeführt, die für bestimmte Klassen von Naturstoffen typisch sind, um einen Satz von Fragmenten zu erzeugen, die normalerweise in Naturstoffen vorhanden sind. Diese Methode wurde mit dem CRC Dictionary of Natural Products (DNP) und synthetischen Molekülen (SMs) getestet. Eine andere Methode basiert auf der Bewertung der Gerüstähnlichkeit. Die Anzahl der für ein Molekül erzeugten Atomsignaturen (aus Fragmenten) entspricht der Anzahl der Atome, aus denen das Molekül besteht. Jede Atomsignatur stellt unabhängig ein Strukturmerkmal / Fragment des Moleküls dar und es wird eine individuelle Punktzahl dafür berechnet. höhere Anzahl von Atomen aus dem Erreichen einer höheren Punktzahl. Um ein solches Experiment zu reproduzieren, verwendeten wir ein implementiertes Modul Chemistry Development Kit in CDK-Taverna 2.0. Es enthält einen NP-Ähnlichkeitszähler v1.4.1, der die Naturprodukt- (NP-) Ähnlichkeit eines Moleküls berechnet, dh die Ähnlichkeit des Moleküls mit dem von bekannten Naturprodukten abgedeckten Strukturraum. Alle Ergebnisse wurden bewertet und lagen im Bereich von -3 bis + 3. http://www.lifechemicals.com/


VERKÄUFER: Life Chemicals-Screening-Sammlung

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 371998

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Sorgfältig entworfene, neuartige, arzneimittelähnliche kleine Moleküle mit der Lipinski-Regel von 5 und dem einzigen Grund für die Abweichung von diesem Parametersatz ist ein einzigartiges Gerüst oder eine nicht standardisierte Chemie. Es kann mit Filtern für die medizinische Chemie wie PAIN oder mit beliebigen zielgerichteten Filtern (Löslichkeit, Permeabilität, BBB) verwendet werden. http://www.lifechemicals.com/


ANBIETER: Life Chemicals-Fragmente mit garantierter Löslichkeit

Veröffentlicht von: Life Chemicals Molecules: 8241

PI: Alexandr Kucherak

Veröffentlicht: 6 / 20 / 2014

Fragmentverbindungen wurden durch Filtration des gesamten LC-Stamms mit modifizierter "Dreierregel" selektiert. Fragmente wurden im analytischen Labor auf Löslichkeit getestet. Die Löslichkeit ist bei 200mM-Konzentration in DMSO garantiert, und 75% der Fragmente sind in pH7.5-Puffer bei 1mM-Konzentration löslich. http://www.lifechemicals.com/


TB: In-vivo-Wirksamkeit bei Mäusen aus der Literatur

Veröffentlicht von: TB in vivo data2 Molecules: 778

PI: Sean Ekins, PhD

Veröffentlicht: 4 / 10 / 2014

Rückblick auf die Zukunft: Vorhersage der In-vivo-Wirksamkeit kleiner Moleküle gegenüber Mycobacterium tuberculosis. Die Auswahl und Umsetzung von In-vitro-Ableitungen für eine Krankheit in Moleküle mit In-vivo-Aktivität in einem Tiermodell der Krankheit ist eine Herausforderung, die viel Zeit und Geld kostet. Wir demonstrieren das Lernen aus in vivo aktiven und inaktiven Verbindungen unter Verwendung von Klassifizierungsmodellen für maschinelles Lernen (Bayesian, Support Vector Machines und rekursive Partitionierung), die aus 773-Verbindungen bestehen. Das Bayes'sche Modell prognostizierte 8 von 11-zusätzlichen in vivo-Wirkstoffen, die nicht als externes Test-Set in das Modell aufgenommen wurden. Die Kuration von Mtb-Daten aus siebzig Jahren kann daher statistisch belastbare Rechenmodelle liefern, um Ressourcen auf in vivo aktive niedermolekulare Antituberkel zu konzentrieren. Dies unterstreicht einen kostengünstigen Prädiktor für In-vivo-Tests an anderen Stellen bei anderen Krankheiten. PMID: 24665947


TB: Daten für TB Mobile 2

Veröffentlicht von: TB Mobile 2.0-Updates Moleküle: 79

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 3 / 19 / 2014

79-Verbindungen, ausgewählt aus kürzlich erschienenen Veröffentlichungen, mit einem oder mehreren TB-Zielen, wurden TB Mobile für Version 2 der App hinzugefügt. 20-Zusatzmoleküle wurden als Testset verwendet. Das Papier wird eingereicht.


PARASIT: MMV-Malaria-Box-Screen von Schistosoma mansoni

Veröffentlicht von: CDIPD Vault Molecules: 400

Veröffentlicht: 11 / 6 / 2013

Ganzkörper-Screenings von Schistosoma mansoni-Somules (postinfektiösen Larven) und Erwachsenen mit den 400-Verbindungen, aus denen die MMV-Malaria-Box besteht (http://www.mmv.org/malariabox). Nur die Malaria-Box-Verbindungen, die die schwerwiegendsten Phänotypen im Vergleich zu einigen Exemplaren aufwiesen, wurden gegen Erwachsene getestet. Die Daten werden auch in ChEMBL hochgeladen. Kontakt Conor Caffrey, Zentrum für Entdeckung und Innovation bei parasitären Krankheiten (www.cdipd.org/), UCSF ([Email protected]).


Kinase: Kinase-katalytische Aktivität (Theonie Anastassiadis Veröffentlichung in Nature Biotechnology)

Veröffentlicht von: Kinase Catalytic Activity Molecules: 178

PI: Theonie Anastassiadis

Veröffentlicht: 8 / 30 / 2013

Kinase-katalytische Aktivität

Naturbiotechnologie 2011 Oktober 30; 29 (11): 1039-1045. Die getestete Bibliothek enthielt 178-Verbindungen, von denen bekannt ist, dass sie Kinasen aus allen wichtigen Proteinkinase-Unterfamilien hemmen. Der Einfachheit halber wurden alle Verbindungen in einer Konzentration von 0.5 uM in Gegenwart von 10 uM ATP getestet. 0.5 & mgr; M wurde trotz eines durchschnittlichen IC50-Werts für diese Verbindungen im Hinblick auf ihre primären Ziele von 66 nM ausgewählt, um eine schwächere Inhibitoraktivität außerhalb des Ziels einzufangen. Jedes Kinase-Inhibitor-Paar wurde doppelt getestet und die Ergebnisse wurden als durchschnittliche Substratphosphorylierung in Prozent ausgedrückt der Lösungsmittelkontrollreaktionen (im Folgenden als "verbleibende Kinaseaktivität" bezeichnet): Die mittlere verbleibende Kinaseaktivität für jedes Kinase-Inhibitor-Paar ist angegeben. Kinaseaktivitätsdaten wurden als Prozent verbleibende Kinaseaktivität in Testproben im Vergleich zu Vehikelreaktionen (Dimethylsulfoxid) ausgedrückt.


TB: Aktualisieren Sie Medikamente und führt mit Zielen

Veröffentlicht von: TB: Medikamente und führt mit Zielen - Update Moleküle: 38

Veröffentlicht: 6 / 14 / 2013

Veröffentlichte Verbindungen aus der neueren Literatur für TB mit bekannten Zielen, die als Update auch für die TB Mobile App verwendet werden sollen

KINASE: Von GSK veröffentlichtes Kinase-Inhibitor-Set (PKIS)

Veröffentlicht von: Kinome2 Moleküle: 364

Veröffentlicht: 6 / 6 / 2013

Das von GSK veröffentlichte Kinase-Inhibitor-Set (PKIS) ist ein Set von 367-Proteinkinase-Inhibitoren, das hinsichtlich der Aktivität der Proteinkinase-Familie mit Anmerkungen versehen wurde und für das öffentliche Screening verfügbar ist. Detaillierte Informationen zum Screening-Set finden Sie unter den unten aufgeführten Links. Die ChEMBL-Datenbank war die Anlaufstelle für Bioassay-Daten zu diesem Set. Um den Zugang zu wichtigen Daten zu verbessern, haben wir die von ChEMBL zur Verfügung gestellten PKIS - Daten gesammelt und aufbereitet, damit hier auf der Website Collaborative Drug Discovery (CDD) darauf zugegriffen werden kann (ähnlich wie zuvor für das Kinase SARfari-Datenbank).

Durch die Übertragung auf CDD werden die Daten „medizinerfreundlicher“ zur Verfügung gestellt. Wir haben auch den Datensatz aufgeräumt. Beispielsweise gibt es tatsächlich nur 364-Verbindungen (einige Duplikate waren auf Salzformen oder alternative Namen desselben Moleküls zurückzuführen). Wir haben auch versucht, Zielnamen nach Möglichkeit zu normalisieren (zum Beispiel wurden die Kinasen IKKA, IKKB und IKKE als IKK-alpha, IKK-beta, IKK-epsilon für den Datensatz von UNC bezeichnet). Nicht, dass wir perfekt sind ... wir freuen uns auch über Korrekturen an unserem Datensatz!

Zusammenfassend gibt es 364-Verbindungen, die bei 225 und 0.1 uM gegen 1-Targets getestet wurden. In diesem Datensatz gibt es nur ein Protokoll, aber die 225-Ziele werden in einer Anzeige aufgelistet. Die Konzentration ist auch eine Anzeige, sodass die Suche leicht auf Bildschirme beschränkt werden kann, die unter 1 und / oder 0.1 uM ausgeführt werden.

Links:

1) Weitere Informationen zu GSK PKIS

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2) Frühere ChEMBL-Kinasedaten auf CDD

https://www.collaborativedrug.com/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

KINASE: ChEMBL Kinase SARfari-Verbindungen und BioAssay-Daten


Veröffentlicht von: CDD Vault Moleküle: 54211

PI: CDD

Veröffentlicht: 3 / 27 / 2013

Eine wertvolle Ressource, die am ChEMBL verfügbar ist, ist Kinase SARfari, „eine integrierte Chemogenomics-Workbench, die sich auf Kinasen konzentriert. Das System enthält und verknüpft Kinase-Sequenz, Struktur, Verbindungen und Screening-Daten. “ Als äußerst nützliche Ressource stellt diese Datenbank eine große Menge von SAR-Daten für die Kinase-Wirkstoffe gegen eine Vielzahl von Kinasen in einem breiten Spektrum von Assays zur Verfügung, von denen ein Großteil manuell gewonnen und aus der Literatur kuratiert wurde. Um diese Daten in der CDD-Schnittstelle verfügbar zu machen, haben wir die Kerntabelle von Kinase SARfari mit einer anderen Schlüsseltabelle aus der ChEMBL-Datenbank zusammengeführt und ein Feld bereitgestellt, in dem der in jedem Datensatz verwendete Assay ausführlicher beschrieben wird als in nativem SARfari . Wir haben diesen zusammengeführten Datensatz nun über die CDD-Schnittstelle verfügbar gemacht. Detaillierte In-vitro-Daten liegen für 400-Kinasen vor. Darüber hinaus werden auch in vivo funktionale sowie ADMET-Daten veröffentlicht.


TB: ARRA

Veröffentlicht von: TB ARRA Molecules: 1924

PI: Bob Reynolds

Veröffentlicht: 3 / 15 / 2013

Daten von SRI (Bob Reynolds) und Scott Franzblau Group Paper, eingereicht von Ekins et al.

Treffer aus früheren SRI-Screenings wurden verwendet, um in Herstellerbibliotheken nach ähnlichen Verbindungen zu suchen, die in einer Reihe akzeptierter Screenings für neue Wirkstoffentdeckungskandidaten in vitro gebündelt und getestet wurden. Die Verbindungen wurden auch als Testset für zuvor erstellte Bayesianische Modelle verwendet, die mit Informationen zu Bioaktivität und Zytotoxizität erstellt wurden.


TB: GSK

Veröffentlicht von: TB GSK Molecules: 177

PI: Sean Ekins, PhD

Veröffentlicht: 2 / 8 / 2013

Ergänzende Daten aus der Veröffentlichung von Ballell et al., ChemMedChem 2013, in der Pressemitteilung "Die Entdeckung von Open-Source-Medikamenten beflügeln: 177-Moleküle gegen Tuberkulose"

Ursprüngliche Datensätze werden unter https://www.ebi.ac.uk/chemblntd gehostet. Hier werden nur M.tb-Daten angezeigt, während bei ChEMBL weitere BCG-Daten verfügbar sind


TRYPANOSOM: Chagas-Disease-Literaturverbindungen

Veröffentlicht von: Chagas Public Data Molecules: 531

Veröffentlicht: 12 / 21 / 2012

Verbindungsstrukturen und Literaturhinweise wurden für 531-Moleküle kuratiert, die in der veröffentlichten Literatur in vitro oder in vivo gegen Trypanosoma cruzi getestet wurden.


TRYPANOSOM: Optimierung spezifischer chemischer Reihen gegen humane afrikanische Trypanosomiasis (HAT)

Veröffentlicht von: Chagas Public Data Molecules: 5559

Veröffentlicht: 12 / 12 / 2012

SCYNEXIS Inc hat als Mitglied des DNDi HAT Lead Optimization Consortium 4926-Verbindungen entwickelt und auf Aktivität gegen T. brucei untersucht. Verbindungsstrukturen und In-vitro-Aktivitätsdaten gegen T. brucei brucei sind enthalten. Daten zur Zytotoxizität und Aktivität gegen die verwandten eukaryotischen Parasiten T. brucei rhodesiense, L. donavani und P. falciparum für eine Untergruppe von 34-Verbindungen. Alle berichteten Verbindungsreihen befinden sich nicht mehr in der Entwicklung für HAT, da festgestellt wurde, dass sie eine schlechte Selektivität oder Eigenschaften aufweisen, die mit der in vivo-Aktivität nicht kompatibel sind. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRYPANOSOM: DNDi-Optimierung der Fenarimol-Reihe zur Behandlung der Chagas-Krankheit

Veröffentlicht von: Chagas Public Data Molecules: 743

Veröffentlicht: 12 / 9 / 2012

Das DNDi Lead Optimization Consortium, zu dem auch Epichem, die Murdoch University und CDCO gehören, hat eine SAR-Serie entwickelt und getestet, die auf dem Pflanzenfungizid Fenarimol basiert. DNDi veröffentlichte in ChEMBL-NTD öffentliche Verbindungsstrukturen, T. cruzi-Aktivitätsdaten und L-6-Zelltoxizitätsdaten für 743-Verbindungen aus dieser Reihe. Verbindungen und biologische Testdaten sind hier in CDD Public enthalten. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRYPANOSOM: Breites primäres HTS zur Identifizierung von Inhibitoren der T.Cruzi-Replikation

Veröffentlicht von: Chagas Public Data Molecules: 303230

Veröffentlicht: 12 / 6 / 2012

Das Broad Institute führte ein Hochdurchsatz-Screening von 303,224-Verbindungen in zweifacher Ausfertigung in dem rekombinanten Tulahuen-Stamm von Trypanosoma cruzi durch, der den Beta-Galactosidase-Reporter stabil exprimierte, der mit der Wirtszelle Maus-Fibroblast NIH3T3 kultiviert wurde. Von den 4,394-Treffern wurden 4,063 weiter auf inhibitorische Aktivität und Wirtszelltoxizität untersucht. Schließlich wurden 27-Verbindungen als potentielle Sondenverbindungen ausgewählt und weiter validiert. Daten vom primären Screen und nachfolgenden sekundären Assays wurden in PubChem hinterlegt. Chemische Verbindungen und biologische Testdaten für das Primärscreening und sechs Sekundärtests von PubChem sind hier in CDD Public enthalten. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB: Guzman et al., M. tb. MurE-Ligase-Inhibitoren

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 8

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 12 / 6 / 2012

Ganzzell- und zielbasierte Screeningdaten aus der folgenden TB-Veröffentlichung: Guzman JD, Gupta A, Evangelopoulos D, Basavannacharya C, Pabon LC, Plazas EA, Muñoz DR, Delgado WA, Cuca LE, Ribon W, Gibbons S., Bhakta S. J. Antimicrob Chemother. 2010 Okt; 65 (10): 2101-7. Anti-tuberkulöses Screening von Naturstoffen aus kolumbianischen Pflanzen: 3-Methoxynordomesticin, ein Inhibitor der MurE-Ligase von Mycobacterium tuberculosis.


ANBIETER: NIH Clinical Collection 2-Array (281-Moleküle)

Veröffentlicht von: NIH Clinical Collections Moleküle: 281

PI: Projektleiter: Mei Steele

Veröffentlicht: 11 / 21 / 2012

Die NIH Clinical Collection 2 besteht aus plattierten 281-Kleinmolekülen, die in der Vergangenheit in klinischen Studien am Menschen eingesetzt wurden. Die Sammlung wurde von den National Institutes of Health (NIH) im Rahmen der Molecular Libraries Roadmap Initiative zusammengestellt, um die Verwendung von Compound Screens in der biomedizinischen Forschung zu ermöglichen.


ANBIETER: NIH Clinical Collection Array (446-Moleküle)

Veröffentlicht von: NIH Clinical Collections Moleküle: 446

PI: Projektleiter: Mei Steele

Veröffentlicht: 11 / 21 / 2012

Die NIH Clinical Collection besteht aus einer Reihe kleiner 446-Moleküle, die in der Vergangenheit in klinischen Studien am Menschen verwendet wurden. Die Sammlung wurde von den National Institutes of Health (NIH) im Rahmen der Molecular Libraries Roadmap Initiative zusammengestellt, um die Verwendung von Compound Screens in der biomedizinischen Forschung zu ermöglichen.


TB: Drogen und führt mit Zielen - Daten in mobilen App verwendet

Veröffentlicht von: SRI-Moleküle und Ziele für mobile Apps Moleküle: 707

Veröffentlicht: 10 / 23 / 2012

Aktualisierte Daten, die für TB-Ziele mit In-vivo-Wesentlichkeit kuratiert wurden

Informationen von TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB und Pubmed sowie

weitere Referenzen von Malabika Sarker am Stanford Research Institute.

Für das Wesentliche sorgte Gyanu Lamichhane von der Johns Hopkins University

information.ref.http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Erkunden Sie diesen Datensatz auf Mobilgeräten: https://itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


TOX: Nach Hepatotoxizität eingestufte Arzneimittel und Chemikalien

Veröffentlicht von: CDD Vault Moleküle: 83072

PI: CDD

Veröffentlicht: 7 / 16 / 2012

Eine Liste von Arzneimitteln und Chemikalien mit einem Klassifizierungsschema, das auf klinischen Daten zur Hepatotoxizität basiert, wurde zuvor von Pfizer (Hu 2008) zusammengestellt, um eine In-vitro-Testtechnologie für die Bildgebung menschlicher Hepatozyten (HIAT) zu bewerten, die eine Übereinstimmung von 75% mit ergibt klinische Hepatotoxizität. Derselbe Datensatz von Verbindungen, die eine arzneimittelinduzierte Leberschädigung (DILI) verursachen oder nicht verursachen, wurde zusammen mit molekularen Deskriptoren für die Silico-Vorhersage über Bayes-Modelle verwendet.


TB: SRI-Moleküle mit Ganzzellaktivität gegen TB

Veröffentlicht von: SRI Group Vault Molecules: 23

PI: Sean Ekins, PhD

Veröffentlicht: 4 / 24 / 2012

Die in Pharm Res. 2012 Apr 4. PMID: 22477069

Kombination von cheminformatischen Methoden und Pathway-Analyse zur Identifizierung von Molekülen mit Ganzzellaktivität gegen Mycobacterium Tuberculosis.

Sarker M., Talcott C., Madrid P., Chopra S., Bunin BA, Lamichhane G., Freundlich J. S., Ekins S.


MALARIA: MMV Malaria Box

Veröffentlicht von: Public: Malaria Box Molecules: 400

Veröffentlicht: 3 / 29 / 2012

Moleküle von MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (https://www.ebi.ac.uk/chemblntd): MMV Malaria Box, Simon MacDonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows und Tim Wells. Arzneimittel für Malaria Venture (MMV), Postfach 1826, 20, Vorbois, 1215 Genf 15, Schweiz und SCYNEXIS Inc. Postfach 12878 Research Triangle Park, North Carolina 27709-2878 USA.

Alle Verbindungen in der Malaria Box wurden in vitro auf 3D7 (Chloroquin (CQ) -sensitiv, aber sulfadoxinresistenter Stamm von P. falciparum) untersucht, und Zytotoxizitätstests wurden an humanen embryonalen Nierenzelllinien (HEK-293) durchgeführt. Die Daten werden für die Falciparum-Daten als EC50 in nM ausgedrückt.


ADME: ADMEdata.com - Ein kommerzielles Repository für hochwertige ADME-Daten

Veröffentlicht von: G2 Research ADMEdata.com Moleküle: 1760

PI: George Grass

Veröffentlicht: 1 / 13 / 2012

Beispiele für: Caco-2-Permeabilität, Gleichgewichtslöslichkeit bei 5pH-Werten, Proteinbindung beim Menschen, Proteinbindungsratte, Kaninchen-Darmpermeabilität, Human-Blutplasma-Partitionierung und Hämatokrit. Für vollständige Datensätze und Modelle wenden Sie sich direkt an George Glass, Pharm.D. Doktorat an der [Email protected] (über CDD vertrieben)


ANBIETER: Porse Building Blocks Collection

Veröffentlicht von: CDD Vault Moleküle: 29241

PI: CDD

Veröffentlicht: 1 / 13 / 2012

Porse File Chemical Co. widmet sich der kundenspezifischen Synthese neuartiger Verbindungen für die Wirkstoffforschung und bietet eine breite Produktpalette zu wettbewerbsfähigen Preisen und guter Qualität. Der aktuelle Satz ist eine ausgewählte Untermenge von 1554-neuen, vielfältigen Verbindungen und Bausteinen der Morpholin-, Piperidin-, Piperazin-, Pyrimidin-, Aminosäure- und API-Familien. www.porsefinechemical.com, [Email protected] +86-20-28069055


PARASITEN: Schistosoma mansoni schistosomula: Microsource Spectrum & Killer Collections

Veröffentlicht von: Brian Suzuki Sandbox Molecules: 119

Veröffentlicht: 10 / 5 / 2011


Schistosoma mansoni schistosomula: Phänotypischer Screen der Microsource Spectrum & Killer Collections.

PI: Conor R. Caffrey

Veröffentlicht: 10 / 5 / 2011

CDD: Public Data 119-Treffer

Im Rahmen einer Strategie zur Umstellung (Neupositionierung) von Arzneimitteln zur Identifizierung neuartiger Antiparasitika am UCSF Sandler Center for Drug Discovery haben wir ein teilweise automatisiertes Screening des gesamten Organismus (phänotypisch) für den Blutfluss entwickelt, der die infektiöse Tropenkrankheit verursacht. Bilharziose. Wir haben die 1,260-Verbindungen der oben genannten Sammlungen untersucht, die Arzneimittel, arzneimittelähnliche Verbindungen, Naturprodukte und verschiedene Verbindungen umfassen. Wir berichten über die phänotypischen Veränderungen in Larvenstadien (Schistosomula) von Schistosoma mansoni unter Verwendung einfacher Deskriptoren, um die vielfältigen und dynamischen Reaktionen des Parasiten auf zusammengesetzte Beleidigungen zu vermitteln. Die vollständige Quantifizierung der phänotypischen Reaktionen ist noch nicht abgeschlossen. Die präsentierten Daten beziehen sich nur auf die "Hit" -Verbindungen; Die vollständige Auflistung der Verbindungen in den jeweiligen Sammlungen ist bei Microsource Discovery Systems Inc. erhältlich [Email protected] für mehr Details. Wirkstoffsuche bei Bilharziose: Hit- und Blei-Verbindungen, die durch phänotypisches Screening bei mittlerem Durchsatz in einer Bibliothek bekannter Wirkstoffe identifiziert wurden. Abdulla MH, Ruelas DS, Wolff B., Snedecor J., Lim K. C., Xu F., Renslo AR, Williams J., McKerrow J. H., Caffrey CR. PLoS Negl Trop Dis. 2009 Jul 14; 3 (7): e478.PMID: 19597541


TB: SRI Kinase Library Phänotypic Screen

Veröffentlicht von: CDD Vault Moleküle: 23823

PI: CDD

Veröffentlicht: 8 / 29 / 2011

Kinase-Ziele werden darüber hinaus bei einer Vielzahl von Krankheiten verfolgt

Krebs, einschließlich Immun- und metabolischer sowie viraler, parasitärer,

pilzartig und bakteriell. Insbesondere gibt es eine relativ junge

Interesse an Kinase- und ATP-Bindungszielen in Mycobacterium

Tuberkulose, um Inhibitoren und potenzielle Medikamente für

essentielle Proteine, die nicht von aktuellen Medikamentenregimen betroffen sind.

Hier berichten wir über die Hochdurchsatz-Screening-Ergebnisse für eine gezielte

Bibliothek von ungefähr 26,000-Verbindungen, die basierend auf aktuellen Kinase-Inhibitor-Gerüsten und bekannten Kinase-Bindungsstellen entworfen wurde. Die hierin präsentierten phänotypischen Daten können die Grundlage für die Auswahl von Gerüsten / Verbindungen für weitere enzymatische Screenings gegen spezifische Kinase oder andere ATP-Bindungsziele bei Mycobacterium tuberculosis bilden, basierend auf der offensichtlichen Aktivität gegen die gesamten Bakterien in vitro. PMID: 21708485

Tuberkulose (Edinb). 2011 Jun 25. [Epub vor Druck]

Copyright © 2011 Elsevier Ltd. Alle Rechte vorbehalten.

Kontaktieren Sie Melinda Sosa für weitere Informationen: [Email protected]

Hochdurchsatz-Screening einer Bibliothek basierend auf Kinase-Inhibitor

Gerüste gegen Mycobacterium tuberculosis H37Rv.

Reynolds RC, Ananthan S., Faaleolea E., Hobrath JV, Kwong CD, Maddox C., Rasmussen L., Sosa MI, Thammasuvimol E., White EL, Zhang W., Secrist JA 3rd.

Quelle: Southern Research Institute, 2000 Ninth Avenue South,

Birmingham, AL 35205, USA.


FDA-ZULASSUNG: NCGC Pharmaceutical Collection (NPC) V1.1.0

Veröffentlicht von: NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0 Moleküle: 14579

PI: Noel Southall

Veröffentlicht: 8 / 8 / 2011

Die NCGC Pharmaceutical Collection: Ein umfassendes Angebot an klinisch zugelassenen Arzneimitteln zur Ermöglichung von Repurposing und chemischer Genomik. Huang, R., Southall, N., Wang, Y., Yasgar, A., Shinn, P., Jadhav, A., Nguyen, D., Austin, C. 27, Ausgabe 2011, S. 3ps80.

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


ANBIETER: BioBlocks-Katalog mit Preisinformationen

Veröffentlicht von: BioBlocks Molecules: 2971

PI: Doug Murphy

Veröffentlicht: 8 / 3 / 2011

2989-Verbindungen.

BioBlocks bietet eine gezielte Sammlung von über 2200-Gerüsten, Bausteinen und Fragmenten, die als Arzneimittelkomponenten vorqualifiziert sind. Die Mehrzahl dieser Verbindungen wird von BioBlocks auf einzigartige Weise angeboten und hat Anwendungen gefunden, die von Zwischenprodukten für die Wirkstoffentdeckung bis zu Ersatzaminosäuren in der Peptidchemie reichen.

Aktuelle Informationen zu den BioBlocks-Bausteinen finden Sie unter www.bioblocks.com


TOX: Arzneimittelinduzierte Leberschädigungsdaten (DILI)

Veröffentlicht von: BBB Molecules: 519

Veröffentlicht: 4 / 29 / 2011

Daten zu arzneimittelinduzierten Leberschäden - Der Trainingssatz enthält experimentelle Daten von Jim Xu und der Testsatz enthält Literaturdaten.

veröffentlicht in Drug Metab Dispos. 2010 Dez; 38 (12): 2302-8. Epub 2010 Sep 15. Ein prädiktives ligandenbasiertes Bayes'sches Modell für die medikamenteninduzierte Leberschädigung beim Menschen.

Ekins S, Williams AJ, Xu JJ.

TB: Zieldatenbank für in vivo essentielle Gene


Veröffentlicht von: SRI TB Target Database Moleküle: 314

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 4 / 21 / 2011

Daten, die für TB-Ziele mit In-vivo-Essentialitätsinformationen von TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB und Pubmed sowie anderen von Dr. Malabika Sarker am Stanford Research Institute zusammengestellten Referenzen kuratiert wurden. Dr. Gyanu Lamichhane von der Johns Hopkins University wird freundlicherweise für die Bereitstellung von Informationen zur Wesentlichkeit anerkannt.

** Bitte beachten Sie, dass mit diesem Datensatz keine kleinen Moleküle verknüpft sind **


ANBIETER: Enamine Representative Diverse Screening Library

Veröffentlicht von: Enamine Molecules: 200000

PI: Dmytro Mykytenko

Veröffentlicht: 4 / 12 / 2011

Die ursprüngliche 200K-Bibliothek für diverse Screenings wurde speziell für Collaborative Drug erstellt

Discovery-Anwender aus dem weltweit größten Bestand an kommerziell erhältlichen Screening-Compounds

(über 1.7 M Arten). Die Bibliothek enthält exklusive arzneimittelähnliche Verbindungen mit raffiniertem ADME

Eigenschaften. Unsere hochwertigen Compounds können sofort geerntet und geliefert werden

verschiedene Formate.


REPOSITIONIERUNG, FDA-GENEHMIGUNG: Arzneimittel, die unter Verwendung von HTS-Methoden repurponiert wurden

Veröffentlicht von: In-vitro-Repurposing-Moleküle: 109

Veröffentlicht: 3 / 18 / 2011

Arzneimittel, die mit neuen Verwendungszwecken unter Verwendung von HTS-Methoden identifiziert wurden. Diese Tabelle erweitert eine bereits veröffentlichte Version von "Ekins S", "Williams AJ", "Krasowski MD", "Freundlich JS" erheblich .2011 Die Tabelle listet Moleküle, alte Verwendung / Ziel, neue Verwendung / Ziel, wie entdeckt und Referenzen.

Abkürzungen: CCR5, Chemokinrezeptor 5; DHFR, Dihydrofolatreduktase; DOA, Drogenmissbrauch, FDA, Food and Drug Administration; GLT1, Glutamattransporter 1; HSP-90, Hitzeschockprotein 90; JHCCL, John Hopkins Clinical Compound Library; Mtb, Mycobacterium tuberculosis; NK-1, Neurokinin-1-Rezeptor; OCTN2.


UMPOSITIONIERUNG, FDA-GENEHMIGUNG: Produkte mit Orphan-Status

Veröffentlicht von: Rare Disease Repurposing Molecules: 76

Veröffentlicht: 3 / 18 / 2011

FDA-Tabelle 2 - Aus der FDA-Ressource, der Forschungsdatenbank für seltene Krankheiten (RDRD), in der von Orphan designierte Produkte (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) mit mindestens einer Vermarktung aufgeführt sind Zulassung für eine seltene Krankheit Indikation. Diese Daten wurden von Ekins und Williams (eingereichtes Papier) analysiert.


UMPOSITIONIERUNG, FDA-GENEHMIGUNG: Produkte mit Orphan-Status

Veröffentlicht von: Rare Disease Repurposing Molecules: 105

Veröffentlicht: 3 / 18 / 2011

FDA-Tabelle 1 - Aus der FDA-Ressource, der Forschungsdatenbank für seltene Krankheiten (RDRD), in der von Orphan designierte Produkte (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) mit mindestens einer Vermarktung aufgeführt sind Zulassung für eine Indikation der Volkskrankheit.

Die FDA assoziierte die Daten nicht mit Molekülstrukturen.


VERKÄUFER: Colorado Center for Drug Discovery Pilot Library

Veröffentlicht von: C2D2 Öffentliche Moleküle: 2240

PI: Greg Miknis, stellvertretender Direktor

Veröffentlicht: 3 / 7 / 2011

Die Bibliothek enthält strukturell verschiedene kleine Moleküle, die den Kriterien für Arzneimittel entsprechen. Es sind mehrere Chemotypen vertreten, und die Bibliothek kann auf eine Vielzahl potenzieller Ziele angewendet werden.

Um Informationen über die Sammlung anzufordern, senden Sie bitte eine Anfrage an [Email protected]


LIPID: Strukturdatenbank für Lipidkarten

Veröffentlicht von: Lipid Maps Database Moleküle: 22215

PI: Lipidomics Gateway

Veröffentlicht: 2 / 11 / 2011

Die Lipid-Maps (http://www.lipidmaps.org/) -Strukturen wurden mit üblichen 5-Ionen (H +, 2H ++, K +, Na +, NH4 +) einschließlich Säugerfettacyls, Glycerolipiden, Glycerophospholipiden, Sphingolipiden, Sterollipiden und Prenollipiden annotiert . Die Strukturen und Ionen können nach Struktur und MW durchsucht werden, um die Identifizierung neuer Lipide zu erleichtern.


TB: Mycobacterium drugome

Veröffentlicht von: virtuelle Metaboliten Moleküle: 274

Veröffentlicht: 11 / 5 / 2010

Datensatz von 274-Arzneimitteln (für die Anwendung am Menschen in den USA und in Europa zugelassen) aus einer Veröffentlichung von Kinnings et al., PLoS Computational Biology, Band 6: e1000976 (2010)

Arzneimittel, die mit mindestens einer Struktur in PDB kokristallisiert sind. Dieser Datensatz kann mit den anderen Datensätzen zum TB-Screening in CDD verwendet werden, um zu bestimmen, welche dieser zugelassenen Arzneimittel eine Aktivität gegen Mtb aufweisen (aus der Literatur).

TB: Inhibitoren von nicht replizierendem Mtb aus der Literatur


Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 26

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 10 / 28 / 2010

Strukturen und Daten aus veröffentlichten Arbeiten:

Darby und Nathan J Antimicrob Chemother 2010: 65: 1424-1427

Bryk et al., Cell Host und Microbe 2008: 3: 137-145

Lin et al., Arch. Biochem. Biophys. 2010 501: 214-220

Lin et al., J. Biol. Chem. 2008: 283: 34423-34431

von Cavalho et al .: J Med Chem. 2009: 52: 5789-5792

Lin et al., Nature 2009: 461: 621-626


ANBIETER: Astatech, Inc. Building Block Collection

Veröffentlicht von: Astatech, Inc. Moleküle: 6140

Veröffentlicht: 10 / 15 / 2010

AstaTech, Inc. bietet fortschrittliche und neuartige Zwischenprodukte zur Erleichterung des Arzneimittelentdeckungsprozesses an. Unsere breite Auswahl umfasst Bausteine, neue Amine, geschützte Amine, unnatürliche Aminosäuren, Ketone, Aldehyde, Heterocyclen, Isatosäureanhydride, Borinsäuren und chirale Zwischenprodukte. Kontakt [Email protected] für Bestellinformationen.


ANBIETER: Chemik 2010 Catalog

Veröffentlicht von: CDD Vault Moleküle: 3889

PI: CDD

Veröffentlicht: 10 / 5 / 2010

Chemik hat Wirkstoffforschungsunternehmen wie Wyeth erfolgreich bei ihren Frühphasenprojekten unterstützt. Wir liefern den Rohstoff und die wichtigsten Zwischenprodukte von Gramm bis zu mehreren Tonnen. Mit der langjährigen Erfahrung von 10 auf diesem Gebiet können wir unseren Kunden bei der Entwicklung eines neuen Zwischenprodukts in den 4-6-Wochen mit wettbewerbsfähigen Preisen, hervorragender Qualität und kontinuierlichem Service helfen.


MALARIA: Phenanthren- und Anthracenaminoalkohole

Veröffentlicht von: CDD Vault Moleküle: 35

PI: CDD

Veröffentlicht: 9 / 21 / 2010

Antimalariadaten gegen P. berghei bei Mäusen für halogensubstituierte Anthracen- und Phenanthren-N-di- und monoalkylsubstituierte Aminoalkoholhydrochloride. Siebenundzwanzig Verbindungen zeigten Aktivität (Zunahme der mittleren Überlebenszeit> 6 Tage); acht Verbindungen waren kurativ (IMST> 60 Tage). Die Tabelle enthält PubMed-IDs für Details und Synthesen.


TB: BCG / MTB-Aktivität

Veröffentlicht von: Novartis: TB Data Molecules: 283

PI: Srinivasa Rao

Veröffentlicht: 9 / 15 / 2010

Aerobe BCG-Aktivität (MIC50) - 274-Verbindungen

Aerobe MTB-Aktivität (MIC50) - 283-Verbindungen

Anaerobe BCG-ATP-Aktivität (IC50) - 283-Verbindungen

Anaerobe MTB-ATP-Aktivität (IC50) - 283-Verbindungen

Zytotoxizität (CC50) - Zusammengesetzte 223-Schlüsselwörter: Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, TB


MALARIA: Hemmung von JHU JHCCL Plasmodium falciparum

Veröffentlicht von: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Moleküle: 2693

Veröffentlicht: 6 / 4 / 2010

Prozentuale Hemmung von 2663-zugelassenen Arzneimitteln bei 10 microM

TB, MALARIA: Bayesianische Vorhersagen für GSK-Malariahits


Veröffentlicht von: GSK Data Bayesian Models (Ekins et al.) Moleküle: 13355

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 5 / 28 / 2010

Vorhersagen für die GSK-Malariahits (veröffentlicht von Gamo et al., Nature 465: 305-310 (2010)) unter Verwendung der Bayes'schen Modelle (veröffentlicht von Ekins et al., Mol BioSyst 6: 840-851 (2010)).

Aktivitätsgrenzwerte (220,000-Modell> 0.31, 2,200-Modell> -1.37 werden auf dem gesamten Zellenbildschirm als aktiv eingestuft).

MALARIA: Ganzzelliger Malaria-Datensatz des St. Jude-Kinderforschungskrankenhauses


Erschienen bei: St. Jude - Malaria / Trypanosome Bioactives Moleküle: 1524

PI: Kip Guy

Veröffentlicht: 5 / 26 / 2010

Ergänzende Daten für Nature Article, veröffentlicht von St. Jude CRH (Guiguemde, W, et al. Chemische Genetik von Plasmodium falciparum. Nature 465, 311-315 (20 Mai 2010)), einschließlich in einem Primärscreen getesteter 1524-Strukturen in acht Protokollen: Bland-Altman-Analyse, berechnete ADMET-Eigenschaften, phylochemogenetisches Screening, Empfindlichkeits-, Synergie- und Enzymtests sowie eine thermische Schmelzanalyse.


MALARIA: Novartis GNF-Pf-Datensatz

Veröffentlicht von: Novartis Malaria Molecules: 5695

Veröffentlicht: 5 / 21 / 2010

Die aus MR3 gewonnenen Plasmodium falciparum-Stämme 7d2 (arzneimittelempfindlich) und W4 (chloroquin-, chinin-, pyrimethamin-, cycloguanil- und sulfadoxinresistent) wurden in einem Erythrozyten-Infektionsassay auf ihre Proliferationshemmung getestet ausgewählte Verbindungen.


ANBIETER: ASINEX Novel Anti-Malaria Screening Set

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 1

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 5 / 20 / 2010

VERTRAULICHER DATENSATZ: 594 Neuartige Compounds von ASINEX. Weitere Informationen zum ASINEX-Design finden Sie in der angehängten Datei.

ZUGRIFF: Neue CDD-Benutzer - Ihre Registrierung wird einem Genehmigungsprozess unterzogen, bevor der Zugriff auf den Datensatz gewährt wird. Bestehende CDD-Benutzer wenden sich bitte an [Email protected]


ANBIETER: ASINEX Tres Cantos (GSK) Antimalarial Subset

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 278

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 5 / 20 / 2010

278 ASINEX Active Anti-Malaria-Daten stimmen mit GSK-Daten überein.

VERFÜGBAR FÜR SOFORTIGES SCREENING. Der entsprechende Datensatz ist Eigentum von ASINEX. Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an Mark Parisi: E-Mail: [Email protected]

Telefon: 1-877-ASINEX1

Fax: 1-336-721 1618-


MALARIA: Tres Cantos Antimalariaset (TCAMS)

Veröffentlicht von: GSK Anti-Malaria-Datenmoleküle: 13471

PI: Javier Gamo

Veröffentlicht: 5 / 19 / 2010

Durchmusterung von ungefähr 2 Millionen Verbindungen in der GlaxoSmithKline-Durchmusterungsbibliothek, die über 13,500-Inhibitoren der Proliferation von P. falciparum in menschlichen Erythrozyten identifiziert wurde. Die Arbeiten wurden auf dem Medizinentwicklungscampus von Tres Cantos, GlaxoSmithKline, Severa Ochoa 2, 28760 Tres Cantos, Spanien, durchgeführt.

TB: Sacchettini et. al. Überprüfung - zusätzliche Antituberkulose-Mittel

Veröffentlicht von: PK Molecules: 18

Veröffentlicht: 2 / 5 / 2010

Nicht zugelassene Antituberkulose-Wirkstoffe aus Abbildung 1 bei Sacchettini JC, Rubin EJ und Freundlich JS Drugs versus Bugs: bei der Verfolgung des persistierenden Raubtiers Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008).


TB: Tuberkulose-Small-Molecule-Patentdaten

Veröffentlicht von: TB Patent Data Molecules: 20775

PI: Kollaborative Wirkstoffforschung

Veröffentlicht: 1 / 27 / 2010

Strukturen und Patentinformationen zur Tuberkuloseforschung des US-Patent- und Markenamts, des Europäischen Patentamts und der Weltorganisation für geistiges Eigentum.


TB: Makarov et al., NM4TB-Konsortien

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 32

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 1 / 21 / 2010

Strukturaktivitätsbeziehungsdaten für 1,3-Benzothiazin-4-one (BTZ). Daten aus der Veröffentlichung "Benzothiazinones Kill Mycobacterium tuberculosis by Blocking Arabinan Synthesis", veröffentlicht in Science von Makarov et al., 2009 und Kollegen bei den NM4TB-Konsortien (PMID: 19299584).


ANBIETER: TimTec Diversity Set

Veröffentlicht von: TimTec Molecules: 9998

PI: Verkäufer

Veröffentlicht: 1 / 5 / 2010

Durchmusterungsbibliothek von 10,000-verschiedenen medikamentösen Verbindungen


ANBIETER: TimTec OGT-Inhibitors Analogs SET

Veröffentlicht von: TimTec Molecules: 334

PI: Verkäufer

Veröffentlicht: 1 / 5 / 2010

O-GlcNAc-Transferase-Inhibitor-Analoga SET


ANBIETER: TimTec ActiTarg-K, Kinasemodulatoren

Veröffentlicht von: TimTec Molecules: 6212

PI: Verkäufer

Veröffentlicht: 1 / 5 / 2010

ActiTarg-K zählt über 6,000-Verbindungen und bietet eine hochwertige Screeningbibliothek arzneimittelähnlicher Moleküle zur Identifizierung der Syntheserichtung für neue Proteinkinase-Inhibitoren

ANBIETER: TimTec Natural Product Derivatives Library

Veröffentlicht von: TimTec Molecules: 3001

PI: Verkäufer

Veröffentlicht: 1 / 5 / 2010

NDL-3000 Natürliche Derivate von TimTec


ANBIETER: TimTec Natural Product Library

Veröffentlicht von: TimTec Molecules: 479

PI: Verkäufer

Veröffentlicht: 1 / 5 / 2010

NPL Pure Natural Products von TimTec


VENDOR: Screening Library

Veröffentlicht von: AsisChem Molecules: 43121

Veröffentlicht: 10 / 26 / 2009

Eine Sammlung von über 40,000 arzneimittelähnlichen niedermolekularen Verbindungen, die Sie individuell auswählen können. Alle Compounds sind bis 25mg auf Lager.


VENDOR: Bausteine

Veröffentlicht von: AsisChem Molecules: 176

Veröffentlicht: 10 / 26 / 2009

Eine Sammlung von Verbindungen, die für die Wirkstoffforschung nützlich sind. Alle Verbindungen, sofern nicht auf Lager, sind innerhalb weniger Wochen für Mengen bis zu 10 Gramm verfügbar.


TB: TAACF - NIAID CB2-Bibliothek

Veröffentlicht von: Southern Research Institute Moleküle: 102634

PI: Robert Goldman

Veröffentlicht: 9 / 30 / 2009

Ergebnisse des Screenings einer kommerziellen (ChemBridge) -Verbindungsbibliothek auf die Fähigkeit, das Wachstum des M. tuberculosis-Stamms H37Rv zu hemmen. Siehe PMID: 19758845


TB: EthR-Inhibitoren (Willand et al.)

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 5

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 9 / 28 / 2009

Arzneimittelähnliche Inhibitoren des Transkriptionsrepressors EthR. Moleküle und Daten von Willand et al. Nature Medicine 15: 537-544 (2009) PMID: 19412174


VENDOR, ADME: Benchmark-Daten aus einer Reihe von strukturell unterschiedlichen kommerziellen Arzneimitteln.

Veröffentlicht von: NM4TB: Karlen Group Site Molecules: 24

PI: Anders Karlen

Veröffentlicht: 6 / 11 / 2009

Eine multivariate Analyse von Arzneimitteln auf dem schwedischen Markt war die Grundlage für die Auswahl eines kleinen, physikochemisch vielfältigen Sets von 24-Arzneimitteln. Faktoren wie strukturelle Vielfalt, kommerzielle Verfügbarkeit, Preis und eine geeignete Analysetechnik zur Quantifizierung wurden bei der Auswahl berücksichtigt. Lipophilie, pKa, Löslichkeit und Permeabilität über humane Caco-2-Zellmonoschichten wurden für den zusammengestellten Datensatz gemessen. Wir gehen davon aus, dass dieser Datensatz als Benchmark für die Validierung neuer experimenteller Techniken oder in silico-Modellen dienen kann. Es kann auch als vielfältiger Startdatensatz für die Entwicklung neuer Rechenmodelle verwendet werden.

Daten entnommen aus:

Präsentation eines strukturell vielfältigen und kommerziell verfügbaren Arzneimitteldatensatzes für Korrelations- und Benchmarking-Studien.

Sköld C, Winiwarter S., Wernevik J., Bergström F., Engström L., Allen R., Box K., Comer J., Mole J., Hallberg A., Lennernäs H., Lundstedt T., Ungell AL, Karlén A.

J Med. Chem. 2006 Nov 16; 49 (23): 6660-71.


TB: Absorptionsdaten aus publizierter Literatur

Veröffentlicht von: CDD: TB Curated Literature Molecules: 24

Veröffentlicht: 5 / 28 / 2009

TB-Absorptionsdaten aus Referenzartikel

Hemmung der Siderophor-Biosynthese durch 2-Triazol-substituierte Analoga von 5'-O- [N- (Salicyl) sulfamoyl] adenosin: antibakterielle Nukleoside, die gegen Mycobacterium tuberculosis wirksam sind.

Gupte, A .; Boshoff, HI; Wilson, DJ; Neres, J .; Labello, NP; Somu, RV; Xing, C .; Barry, CE; Aldrich, CC

J Med Chem (2008) Vol. 51, Nr. 23, S. 7495-7507Durchlässigkeitsdaten.


TB: Pharmakokinetische Daten aus veröffentlichter Literatur

Veröffentlicht von: CDD: TB Curated Literature Molecules: 28

Veröffentlicht: 5 / 28 / 2009

Pharmakokinetische TB-Daten aus veröffentlichten Literaturquellen. SAR-Daten für 28 unique sowie für gängige Verbindungen.

Die Daten umfassen PubMed-Zitate, Ziele, getestete Zellen und Organismen, Bioverfügbarkeit, Vm, Vd, Cmax usw.


TB: Toxizitätsdaten aus veröffentlichter Literatur

Veröffentlicht von: CDD: TB Curated Literature Molecules: 638

Veröffentlicht: 5 / 28 / 2009

TB-Toxizitätsdaten aus veröffentlichten Literaturquellen. SAR-Daten für 638 unique sowie gängige Verbindungen aus PubMed-Referenzen.

Die Daten umfassen PubMed-Zitate, Targets, Teste von Zellen und Organismen, Lebensfähigkeit der Zellen, LD50, CC50, MNTD usw.


TB: Wirksamkeitsdaten aus veröffentlichter Literatur

Veröffentlicht von: CDD: TB Curated Literature Molecules: 6768

Veröffentlicht: 5 / 28 / 2009

Daten zur TB-Wirksamkeit aus veröffentlichten Literaturquellen. SAR-Daten für 6771 Unique sowie allgemeine Verbindungen aus über 300 PubMed-Referenzen.

Die Daten umfassen PubMed-Zitate, Targets, Zellen und Organismen-Hoden, MIC,% -Inhibition, EC50-EC100, IC50 usw.


TB: MLSMR

Veröffentlicht von: Southern Research Institute Moleküle: 214507

PI: Robert Goldman

Veröffentlicht: 5 / 8 / 2009

Eine vielfältige Sammlung von über 200,000-Verbindungen, die im Small Molecule Repository (MLSMR) von Molecular Libraries gesammelt wurden, wurde dem Southern Research Molecular Libraries Screening Center im Frühjahr 2008 für Primärtests gegen Mtb H37Rv zur Verfügung gestellt. Die aktivsten Verbindungen aus diesem Primärscreening wurden ausgewählt und bei 10-Konzentrationen sowohl in einem Dosis-Wirkungs-Assay gegen H37Rv als auch in einem Zytotoxizitäts-Counterscreen unter Verwendung von Verozellen getestet.


MALARIA: Johns Hopkins Clinical Compound Library

Veröffentlicht von: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Moleküle: 1878

Veröffentlicht: 4 / 28 / 2009

Die Arzneimittel wurden bei einer Konzentration von 10 uM gescreent. Parasiten im synchronisierten Ringstadium aus chloroquinempfindlichem 3D7 oder multiresistentem Dd2 wurden in RPMI 1640-Medium mit 10% Humanserum kultiviert und in Gegenwart von Arzneimittel und [48H] -Hypoxanthin entweder für 96 oder 3h inkubiert. Eine 96-Well-Platte mit 0.2 ml Kulturmaterial pro Well bei 0.2% Parasitämie und 2-4% Hämatokrit ergibt ein radioaktives Inkorporationssignal von ungefähr 10,000 cpm bei 48 h und 20,000 cpm bei 96 h mit Hintergrundzahlen von weniger als 500 cpm. Screening-Experimente wurden doppelt durchgeführt und die prozentuale Hemmung wird als Durchschnitt von zwei Experimenten angegeben.


TB: Literaturübersicht

Veröffentlicht von: TB Literature Data Molecules: 49

PI: Ballel et al.

Veröffentlicht: 4 / 17 / 2009

SAR-Daten zur Tuberkulose wurden in einer Umfrage unter Wirkstoffen gegen M. tuberculosis zusammengestellt, einschließlich Wirkstoffen mit bekannten und unbekannten Wirkmechanismen (Ballel et al., „New Small-Molecule Synthetic Antimycobacterials“ in Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Juni 2005). 4 / 17 mit TubercuList / TBDB / anderen Ziellinks und verbesserten Referenzen aktualisiert.


TB: Sacchettini et al., Review

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 14

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 2 / 18 / 2009

Antituberkulose-Mittel der ersten und zweiten Reihe aus den Tabellen 1 und 2 bei Sacchettini JC, Rubin EJ und Freundlich JS Drugs versus Bugs: bei der Verfolgung des persistierenden Raubtiers Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008).


ANBIETER: IUPUI - Distributed Drug Discovery (D3) Public Data

Veröffentlicht von: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Moleküle: 48818

PI: MJ O'Donnell und WL Scott

Veröffentlicht: 1 / 1 / 2009

Ein offen zugänglicher virtueller Katalog von acylierten unnatürlichen Aminosäuren und ihren Methylestern. Wir ermutigen unsere Kollegen, mit uns über das Interesse am Distributed Drug Discovery-Projekt und der Synthesemethode zu sprechen, die in einer Reihe von drei Artikeln im Journal of Combinatorial Chemistry (in press) beschrieben sind.


ANBIETER: ASINEX Building Blocks

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 6745

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 12 / 23 / 2008

Arzneimittelähnliche Bausteine: Wenn Sie ein Lead-Optimierungsprogramm in Betracht ziehen, könnten sich unsere Bausteine ​​als genau das erweisen, wonach Sie suchen.


PARASITEN: Düfte

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 228

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 12 / 21 / 2008

Daten zu Molekül- und Strukturnamen für Düfte aus einem Buch von Roman Kaiser, "Sinnvolle Düfte auf der ganzen Welt", veröffentlicht von Wiley-VCH in 2006. Die Molekülnummer bezieht sich auf die Nummerierung im Buch.


TOX: Toxcast

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 306

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 12 / 18 / 2008

Die EPA-Toxcast-Bibliothek von Verbindungen (hauptsächlich Pestizide) ist unter http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html verfügbar

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


FDA-GENEHMIGT, TOX: Maximal empfohlene Tagesdosis

Veröffentlicht von: CDD - Sean Ekins Molecules: 1215

PI: Sean Ekins

Veröffentlicht: 12 / 10 / 2008

Eine FDA-Datenbank, die die empfohlenen maximalen Tagesdosiswerte für über 1200-Arzneimittel enthält. Der Datensatz repräsentiert einige der in der folgenden Veröffentlichung von Matthews, EJ, et al., Current Drug Discovery Technologies, 1 (1), verwendeten Moleküle: 61-76. (2004)


ANBIETER: Ayurveda-Traditionen angesichts aktueller Gesundheits- und Wellnessbedürfnisse

Veröffentlicht von: Falguni Dasgupta: Zusammenstellung personenbezogener Daten Moleküle: 37

PI: Falguni Dasgupta

Veröffentlicht: 10 / 30 / 2008

Die traditionelle Verwendung von indischen Heilpflanzen und ihren Extrakten wird unter Bezugnahme auf moderne Perspektiven mit dem Ziel diskutiert, Gemeinsamkeiten zu finden, Ansprüche neu zu bewerten und Möglichkeiten im Gesundheits- und Wellnessbereich in Übereinstimmung mit den behördlichen Anforderungen zu schaffen sowie neue Wirkstoff-Zuleitungen zu finden. "


PARASITEN: Sandler-UCSF-Celera-Cystein-Protease-Inhibitor-Bibliothek

Veröffentlicht von: McKerrow Group Molecules: 1860

PI: Jim McKerrow

Veröffentlicht: 10 / 23 / 2008

In-vitro-Parasiten von T. cruzi und T. brucei und spezifische Enzymscreenings.


FDA-ZULASSUNG: Zugelassene Arzneimittel

Veröffentlicht von: Johns Hopkins Clinical Compound Library Moleküle: 2815

PI: David Sullivan

Veröffentlicht: 10 / 16 / 2008

FDA-zugelassene Arzneimittel mit definierter Molekülstruktur, einschließlich 763-Molekülen aus der Physicians 'Desk Reference, 780 von DrugBank, 1151 im Orange Book 2007 und 1007 aus der FDA-Liste von Dr. Chris Lipinski


ANBIETER: ASINEX GPCR Focused Library

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 3502

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 10 / 2 / 2008

Hochwertige, außergewöhnlich medikamentöse, GPCR-orientierte Sets, die für die CDD-Community zu einem ermäßigten Preis erhältlich sind. Diese Bibliothek vereint unser medizinisch-chemisches Know-how und unsere Fähigkeit, privilegierte Fragmente aus der Literatur zu identifizieren und sie auf beispiellose Weise zusammenzusetzen.


GPCR: PDSP Ki-Datenbank

Veröffentlicht von: PDSP Ki Database Molecules: 20026

PI: Bryan Roth

Veröffentlicht: 9 / 16 / 2008

Über 47,000 Ki-Werte gegen 699 GPCR-Ziele aus der PDSP-Datenbank (NIMH Psychoactive Drug Screening Program)


ANBIETER: ASINEX Synergy Libraries

Veröffentlicht von: ASINEX Molecules: 25008

PI: Mark Parisi

Veröffentlicht: 4 / 26 / 2008

ASINEX hat eine neue Bibliothek mit hoher Diversität entwickelt, die reich an pharmakophoren Fragmenten ist. Das Design der Bibliothek basiert auf zwei Formen von Synergy. Das erste ist die Wechselbeziehung zwischen verschiedenen und zielgerichteten Techniken, und das zweite beinhaltet die Konvergenz von mehrstufigen Schlüsselintermediaten (6-9-Schritte), um anspruchsvolle Verbindungen zu erzeugen. Weitere Informationen finden Sie im PDF unten.


TOX: Strukturen mit den öffentlichen Daten bekannter Toxizitätsprofile

Veröffentlicht von: Strukturen mit bekannten Toxizitätsprofilen Moleküle: 135

PI: Sean Ekins, PhD

Veröffentlicht: 3 / 28 / 2008

Gewebespezifische Toxizitätsprofile bekannter Verbindungen mit Referenzen


PROMISCUOUS INHIBITORS: Shoichet veröffentlichte promiskuitive Inhibitoren

Veröffentlicht von: Shoichet veröffentlicht Promiscuous Inhibitors Molecules: 111

PI: Brian Shoichet

Veröffentlicht: 3 / 26 / 2008

Aggregate, die durch Selbstassoziation organischer Moleküle in wässrigen Lösungen "falsch-positive" Ergebnisse erzielen


TOX: UC Davis - Die öffentlichen Daten der Hängematte

Veröffentlicht von: UC Davis - Hammock Molecules: 714

PI: Bruce Hammock

Veröffentlicht: 3 / 17 / 2008

Inhibitoren löslicher Epoxidhydrolasen (sEH) - Diese Enzyme haben 3-Hauptfunktionen: Entgiftung, Katabolismus und Regulation von Signalmolekülen.


MALARIA, TRYPANOSOM: St. Jude Public Data

Erschienen bei: St. Jude - Malaria / Trypanosome Bioactives Moleküle: 2426

PI: Kip Guy

Veröffentlicht: 3 / 5 / 2008

Open-Access-Ergebnisse von Kip Guys Labor im St. Jude Children's Research Hospital, einschließlich HTS von Bioaktivstoffen gegen Malaria und T. brucei


MALARIA: Drexel Public Data

Herausgegeben von: Drexel University Molecules: 195

PI: Jean-Claude Bradley

Veröffentlicht: 3 / 2 / 2008

Ergebnisse einer laufenden Open-Data-Zusammenarbeit zwischen

Drexel (Ugi-4CC-Produkte) und UCSF (Antimalaria-Screening). Dieser Datensatz ist ein Beispiel dafür, wie Forscher ausgewählte Ergebnisse offen veröffentlichen können. (Standardmäßig sind im Gegensatz dazu alle Gruppen privat.)


MALARIA: Umfrage der US-Armee

Veröffentlicht von: US Army Malaria Literature Survey Moleküle: 12318

Veröffentlicht: 2 / 29 / 2008

Eine umfangreiche Sammlung von SAR-Daten für Malariamedikamente, einschließlich chemischer Strukturen, Bioaktivitätsdaten, pharmakologischer Daten und Toxizitätsdaten (ursprünglich von der US-Armee in 1946 als „Übersicht über Malariamedikamente“ veröffentlicht)


MALARIA: PlasmoDB

Veröffentlicht von: UPenn - Malaria Literature Data Molecules: 120

PI: David Roos

Veröffentlicht: 2 / 19 / 2008

PlasmoDB von Malariainhibitoren, zusammengestellt aus der Literatur, einschließlich chemischer Struktur, PlasmoDB-Genidentifikator, Zielgenname und Referenzen gegen P. falciparum, P. vivax, P. berghei, P. yoelii, P. chabaudi, P. vinckei petteri


MALARIA: Naturprodukte (NPPDB)

Herausgeber: Nationales Zentrum für Naturstoffforschung Moleküle: 426

PI: Babu Tekwani

Veröffentlicht: 2 / 15 / 2008

Antimalariadatenbank von Flavon-Naturstoffen, einschließlich Antimalaria- und Zytotoxizitätsdaten (University of Mississippi, Nationales Zentrum für Naturstoffforschung)


TB: TAACF-Testergebnisse

Veröffentlicht von: TB Early Phase Drug Discovery Program Moleküle: 812

PI: Bernard Munos

Veröffentlicht: 2 / 12 / 2008

Antibakterielle Aktivität einer öffentlich erhältlichen Bibliothek von 812-Verbindungen gegen Mycobacterium tuberculosis (H37Rv) im Alamar Blue-Ganzzelltest


FDA-ZULASSUNG: Orphan Drugs

Veröffentlicht von: Bekannte Medikamente Moleküle: 1721

PI: Christopher Lipinski

Veröffentlicht: 10 / 26 / 2007

Von der FDA zugelassene Arzneimittel mit bestimmten Indikationen, Sponsornamen und chemischen Strukturen (sofern verfügbar)