Spotlight Interview mit Rick Keenan, Ph.D.

11. Oktober 2016

„Die andere Sache ist, dass die meisten von uns Wissenschaftlern mit Computern vertraut sind, sie die ganze Zeit verwenden und Smartphones besitzen, aber wir wollen nicht wissen, was rechnerisch hinter dem Vorhang vor sich geht. Wir wollen es nur benutzen. Es muss also benutzerfreundlich und intuitiv sein. Das hat Apple so erfolgreich gemacht - sie haben nichts davon erfunden, sie haben es nur benutzerfreundlich gemacht. Das ist wo CDD Vault Bei der Evaluierung war ich aufgefallen - es ist benutzerfreundlich, es macht intuitiv Sinn, es ist für mich einfacher zu bedienen. Ich denke, dies wird der Schlüssel für die Zukunft in dieser Branche sein. “


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Rick Keenan
Projektleiter OptiKira
Präsident, RMK Drug Discovery Consulting

Rick Keenan ist ein hochrangiger Wissenschaftler für Wirkstoffforschung mit umfassender globaler Erfahrung in der Beratung von Pharma- und Biotechnologieunternehmen, Risikokapitalinstitutionen, Stiftungen für philanthropische Krankheiten und akademischen Forschungslabors. Rick hatte Positionen bei GlaxoSmithKline inne und war Gründungsmitglied von CEEDD bei GSK (dem Kompetenzzentrum für externe Wirkstoffforschung). Am GSK-Zentrum für muskuloskelettale und proliferative Erkrankungen (MMPD CEDD) in der Mikrobiologie wurde in Zusammenarbeit mit einem Team medizinischer Chemiker der TPO-Rezeptoragonist identifiziert eltrombopag (Derzeit als Promacta vermarktet). In seinen derzeitigen Funktionen (Leitung der Forschungskooperationen für BioMotiv und Tätigkeit als Projektleiter für OptiKiras Entdeckungsaktivitäten für neuartige Kinaseinhibitoren für die Augenheilkunde) empfiehlt Rick die Verwendung von CDD Vault für das Management mehrerer CRO-Projekte, die in virtuellen Wirkstoffforschungsunternehmen durchgeführt werden. Rick erkennt die Vorteile, die das mit sich bringt CDD Vault bietet der sich entwickelnden datenintensiven Pharmaindustrie Geschäftsmodelle, die von offenen wissenschaftlichen Praktiken profitieren und die Entdeckung beschleunigen.


CDD Advocate Dr. Shirley Louis-May sprach mit Rick über seine Karriere in der Förderung von Open-Source-Datenrichtlinien in seinen zahlreichen Branchenpositionen und über seine Verwendung von CDD Vault insbesondere für das virtuelle Pharmadatenmanagement.

SLM: Rick, in Ihrer langen Karriere und vielen Rollen in der Wirkstoffforschung und derzeit als Projektleiter für ein virtuelles Unternehmen, OptiKira, waren Sie ein Verfechter von Open Innovation, neuartigen Initiativen zum Datenaustausch und Open Source-Wirkstoffforschung. Können Sie mir etwas über Ihre strategische Vision für die aktuellen Bemühungen zur Wirkstoffforschung und darüber erzählen, wie CDD Vault passt in diese Vision?

RMK: Sicher. Es wurde mir klar, als ich für BioMotiv verschiedene Projekte leitete. Sie haben virtuelle Unternehmen erwähnt, dies ist ein Paradebeispiel für ein virtuelles Unternehmen. Ich bin der Projektleiter in Pennsylvania, der Projektmanager ist in Cleveland ansässig, die Hauptwissenschaftler sind von der University of California in San Francisco und der University of Washington in Seattle. Wir müssen zusammenarbeiten, zusammenarbeiten und eine Möglichkeit haben, unsere Daten zu teilen. Mir wurde klar, dass dies eine große Lücke war, die gemeinsame Nutzung von Daten, als wir versuchten, das Forschungsteam und die Forschungsplanung zusammenzustellen.

Ich wurde von BioMotiv gebeten, verschiedene Computerplattformen zu untersuchen. Ich hatte ein paar Jahre zuvor eng mit Barry Bunin, Kellan Gregory und dem Rest des CDD-Teams am Malaria-Datenprojekt (bei GSK) zusammengearbeitet und dachte sofort an CDD. Ich habe einige andere Daten-Hosting-Plattformen getestet und keine kam der Art von Leistung und Leistungsfähigkeit, die diese bieten, nahe CDD Vault hätten. Also empfahl ich BioMotiv zu verwenden CDD Vault als Plattform für alle virtuellen Unternehmen, die sie gründen. Ich denke, dass mindestens ein anderes Unternehmen im BioMotiv-Portfolio verwendet CDD Vault Ich bin mir sicher, dass wir im Moment, in dem immer mehr Unternehmen von BioMotiv profitieren, noch mehr Nutzer von sehen werden CDD Vault.

SLM: Welche spezifischen Attribute haben Sie gesucht, als Sie eine Reihe von Hosting-Plattformen für Computerdaten evaluiert haben??

RMK: Es musste benutzerfreundlich und einfach zu bedienen sein. Es musste sowohl auf Macintosh- als auch auf Windows-Computern funktionieren. Die Strukturzeichnung musste unkompliziert sein und die Möglichkeit bieten, nicht nur nach Stichwörtern und Phrasen, sondern auch nach Strukturinformationen zu suchen - das war von größter Bedeutung. Ein Zufall, der bei der Entscheidungsfindung half, war, dass Barry Bunins Laborkollege von der Graduiertenschule, Bradley Backes, einer der Mitbegründer von OptiKira war. Er hatte auch schon früher mit CDD gearbeitet und mochte es, ein paar Leute im wissenschaftlichen Team zu haben, die mit CDD vertraut waren CDD Vault, und wer seine Eigenschaften schätzte, machte es zu einem leichten Verkaufserfolg. Ich schätzte auch die Unterstützung, die Charlie Weatherall und sein Team uns zu Beginn gaben, wie zum Beispiel verschiedene Wege, um Daten einzugeben, Daten zurückzugewinnen, zu suchen - diese Art von Händchenhalten zu Beginn war für eine Reihe von Menschen wichtig die Teammitglieder. Da hatte ich eine gewisse Vertrautheit mit CDD VaultFür mich war es unkompliziert, für einige andere jedoch nicht. Derzeit werden die meisten Daten von Mitarbeitern der Programmverwaltungsgruppe eingegeben, die möglicherweise keine erfahrenen Chemiker sind, das System jedoch problemlos verwenden und die erforderlichen Informationen generieren können.

SLM: Verwenden Sie Standarddatentypen oder werden erweiterte Datentypen eingegeben, z. B. die Notwendigkeit von Kurvenberechnungen oder quantifizierbaren Bildern?

RMK: Wir sind in der Forschung noch nicht so weit gekommen, aber wir werden in diese Richtung arbeiten, wenn wir anfangen, Tierstudien durchzuführen. Insbesondere müssen wir in der Lage sein, die optischen Kohärenztomographiedaten einzugeben CDD Vault. Ich denke das anders so CDD Vault Als sehr nützlich hat sich erwiesen, wenn wir uns einer externen Prüfung unterziehen. Unsere Bemühungen in Bezug auf Retinitis pigmentosa ziehen die Aufmerksamkeit einiger potenzieller Lizenzgeber auf sich. Es gibt einige große Unternehmen, die in diesem Bereich tätig sind und unsere Forschungskapazitäten untersuchen möchten, und weil unsere Daten in unseren so gut organisiert sind CDD VaultEs ist relativ einfach, diese Sorgfaltspflichten als kleines Unternehmen zu durchlaufen. Wir müssen nicht viel Zeit aufwenden, um Dateien zu organisieren und alle Daten zusammenzuführen. Es ist alles in Ordnung CDD Vault. Wenn Sie mehrere dieser Sorgfaltspflichten durchlaufen, kann dies zu einer sehr zeitaufwendigen Übung werden, wenn die Daten nicht auf einer Computerplattform wie z CDD Vault. Dies erleichtert uns nicht nur das Verwalten der Forschung, sondern auch den Austausch unserer Daten sowohl innerhalb des Teams als auch mit potenziellen Lizenzgebern.

SLM: Inwieweit haben Sie in Ihrer Beratungskompetenz für eine Reihe von Unternehmen Due Diligence durchgeführt? CDD Vault die Informationsanforderungen erfüllen, die Unternehmen bei der Speicherung ihrer Daten berücksichtigen müssen, z. B. die Dokumentation von Protokollen und die Dokumentation der Erstellung neuer Ideen für Verbindungen oder Tests?

RMK: Due Diligence ist ein Prozess, bei dem Wissenschaftler eines anderen Unternehmens Vertrauen in die wissenschaftlichen Ergebnisse gewinnen müssen, die Sie ihnen präsentieren. Sie können ihnen also PowerPoint-Folien und -Diagramme zeigen, aber nichts geht über die Anzeige der Rohdaten. Das hilft wirklich. Das sind Wissenschaftler, die mit Wissenschaftlern sprechen. Sie möchten sehen, wie Sie die Daten berechnet haben, woher die Daten stammen, und sie möchten die Gewissheit haben, dass Sie die Experimente korrekt durchgeführt haben. Das ist was CDD Vault können Sie tun. Sie können ihnen so viele Details anzeigen, wie sie benötigen, um dieses Vertrauen zu gewinnen, da Sie einfach so lange klicken und klicken können, bis Sie zu den Rohdaten gelangen. Während einige Leute früher im Prozess zufriedener sind und andere erschöpfender, ist der Arbeitsaufwand von unserer Seite nicht anders. Es geht darum, ihnen Zugriff auf die Daten zu gewähren. Wir werden dies in den nächsten paar Monaten noch zweimal tun, also werden wir sehen, wie es läuft, wenn wir mehr Daten sammeln, aber ich dachte ehrlich, dass dies viel mühsamer werden würde, als es sich tatsächlich herausstellen würde. Ironischerweise ist das Teilen der Daten jetzt der einfache Teil. Der schwierige Teil besteht darin, die Besprechungen mit allen beteiligten Mitgliedern in diesen Unternehmen zu planen und dabei die Zeit in jedem Kalender zu koordinieren!

SLM: Zu diesem Zweck weiß ich das in mir CDD Vault Sie können Berichte über die Tresordaten erstellen. Einige der anderen CDD-Kunden, mit denen ich gesprochen habe, verwenden das Tool zur Berichterstellung, um vor gemeinsamen Besprechungen zahlreiche Informationen bereitzustellen. Sie verwenden auch ein Datenbenachrichtigungssystem, damit bei der Eingabe neuer Daten diese Informationen automatisch an die Teammitglieder weitergeleitet werden, sodass zwischen den Besprechungen Informationen zum Projekt hin- und herfließen. Lassen Sie die Unternehmen, mit denen Sie gearbeitet haben, eine dieser Methoden anwenden CDD Vault Eigenschaften?

RMK: Derzeit ist unser Unternehmen so klein, dass wir keinen Bedarf dafür hatten. Die Unternehmen, mit denen ich im Portfolio von Atlas Ventures vertraut bin - ich habe einige Beratungsarbeiten für Quartet Medicine ausgeführt, und Mark Tebbe und seine Gruppe - Quartet Medicine ist ein kleines Unternehmen. Ich denke, sie haben nur vier Leute, also werden sie dem Namen gerecht. Der Datenaustausch zwischen vier Personen war nicht so schwierig. Bei OptiKira bin ich der Projektleiter und Glen Gaughan der Projektleiter. Wir sind nur zu zweit und treffen uns alle zwei Wochen mit den Ermittlern des akademischen Prinzips. Zwei von ihnen haben einen chemischen Hintergrund und stöbern gern in ihnen herum CDD Vault und schauen Sie sich die Rohdaten an. Die anderen beiden wollen nur Updates hören und nicht so viel in den Tresor tauchen, also habe ich nur zweiwöchentlich ein paar Updates zusammengestellt und es ist gut genug für sie. Ich denke, wir werden unser kleines Team in den nächsten anderthalb Jahren erweitern, und es könnte in naher Zukunft sein, wenn wir anfangen, erweiterte Funktionen von zu verwenden CDD Vault.

SLM: Nun, ich kann mir vorstellen, dass Sie in der frühen Phase eines Unternehmens alle Daten so sehen möchten, wie sie eingehen, weil Sie sicherstellen möchten, dass die Dinge wie beabsichtigt aufgezeichnet werden und dass Formatierungsprobleme auftreten, die dazu führen könnten Datenfehler werden überprüft, bevor Sie mit der Automatisierung eines Prozesses beginnen. Wenn es also klein und handlich ist, ist es wahrscheinlich in Ordnung. Ich weiß jedoch, dass der CDD-Support Ratschläge zur Automatisierung und Validierung der Prozesse bietet, sobald der Durchsatz höher ist als die komfortable manuelle Handhabung. Ich denke, das ist definitiv einer der Vorteile, die das CDD-Team bietet.

RMK: Das ist ein guter Punkt, da verschiedene CROs ihre eigenen Arten von Rechenplattformen haben. Viele chinesische Unternehmen verwenden Software, die es einfacher gemacht hätte, die Chemiedaten auf diese Weise in das System einzuspeisen. Aber wir fanden, dass es einfach nicht so gut war wie CDD Vault. Es war etwas klobiger. Ich weiß nicht, wie ich das technischer sagen soll.

SLM: Ich denke eines der wirklich schönen Dinge CDD Vault ist, dass es, obwohl es in einem chemiezentrierten Format entstanden ist, die Art und Weise, wie es die biologischen Daten beschreibt, wirklich erweitert hat. Die chemischen Daten werden sich kaum ändern, aber die biologischen Daten variieren ständig von einfachen Zahlen über Diagramme bis hin zu quantifizierbaren Bildern und allen damit verbundenen Daten. Daher war die Entwicklung der Funktionen für biologische Daten eine der wirklichen Stärken von CDD.

RMK: Ja, wir sind bestrebt, all das auszunutzen, während wir voranschreiten. Wir haben im April letzten Jahres mit der Chemie begonnen und unser erstes Molekül erst später im Juli oder August getestet. Daher geben wir Daten erst seit weniger als einem Jahr ein. Aber es hat wirklich gut für uns geklappt.

SLM: Haben Sie vor diesen virtuellen Unternehmensprojekten mit CDD gearbeitet? Hatten Sie, abgesehen von dem ursprünglichen Vault, in dem die GSK-Malariadaten gehostet wurden, öffentliche CDD-Datensätze verwendet oder private CDD-Vault-Datensätze für externe Kooperationen in Ihren früheren Rollen bei GSK konsultiert?

RMK: Nein, GSK hat CDD für diese Zwecke nicht verwendet. Sie benutzten es ein wenig für die gemeinsamen Tuberkulose-Daten, die Barry dort als Ergebnis der Finanzierung von CDD durch die Gates Foundation veröffentlichte, und GSK hatte einige Arbeiten in Bezug auf Tuberkulose im Gange. Die meisten Projekte in GSK waren eigenständig und hatten nicht viel Datenaustausch. Ich denke, damals gab es viel mehr Besorgnis um Firewalls und Sicherheit. Ich denke, dass diese Bedenken alle von CDD und anderen Anbietern gut gemanagt wurden, und ich denke, dass sich die Welt weiterentwickelt hat. du musst jetzt teilen. In der Vergangenheit konnte man mehr unternehmen, und ich glaube nicht, dass das heutige Leben in der Pharmaindustrie so ist. Sie müssen nach draußen gehen und Wege finden, um Daten an einem Ort abzulegen, an dem Personen von verschiedenen Standorten auf sie zugreifen können. Vor sechs Jahren, als ich das letzte Mal dort war, gab es in GSK interne Datenbanken, in denen jeder die Daten sehen konnte, und es war weniger notwendig, nach außen zu gehen, aber ich denke, das Leben hat sich wahrscheinlich auch in GSK geändert.

SLM: Sind Sie als Berater, der mit einigen der kleineren Unternehmen zusammenarbeitet und diese mit größeren Pharmas zusammenarbeitet, auf andere Pharmas gestoßen, von denen Sie wissen, dass sie gehostete Datenbanklösungen oder irgendeine Art von Datenaustauschtechnologie verwenden?

RMK: Ich erwähnte Quartet, die Atlas Venture-Firma, mit der ich gesprochen habe. Sie hat kürzlich einen Vertrag abgeschlossen, der die Finanzierung für ihr Sepiapterin-Reduktase-Programm vorsieht. Ich weiß, dass es für Mark und sein kleines Team sehr hilfreich war, dass ihre Daten in gehostet wurden CDD Vault. Ich war an einem vierteljährlichen Chemieberatungsvertrag als einer von drei Chemieberatern beteiligt. Mark hatte immer alle Daten zur Hand. Er würde uns nur für den Nachmittag beherbergen, starten CDD Vaultund wir konnten ihm jede Frage stellen, die ihm in den Sinn kam. Er hätte nur die Datenergebnisse einer schnellen Suche genau dort für uns. Das hat mir geholfen, es zu verkaufen. Ich war der Meinung, dass das BioMotiv-Portfolio dem Atlas-Portfolio sehr ähnlich ist und dass, als neue Portfolio-Unternehmen auftauchten, die von sehr kleinen Teams auf der Management-Seite (weitgehend virtuell) geführt werden sollten, CDD Vault wäre das ideale Fahrzeug, um diesen Datenaustausch zu ermöglichen.

SLM: Haben Sie sich die verfügbaren Visualisierungstools angesehen? CDD Vault überhaupt?

RMK: Ich habe. Ich habe es mir in einem früheren Projekt angesehen. Ich habe das Gefühl, dass mein Bedürfnis danach kommt und geht. Ich verstehe, dass es sich um ein Datenanalysetool handelt, mit dem Sie die Beziehung zwischen zwei Assays oder Eigenschaften zweidimensional grafisch darstellen können. Es war für einige Monate verfügbar. Ich habe ein paar Diagramme erstellt und dabei einige Ausreißer hervorgehoben, mit denen wir feststellen konnten, dass die Daten falsch eingegeben wurden, und zwar als mikromolar, das hätte nanomolar sein müssen. Also diese CDD Vault Mithilfe von Visualisierungstools konnten diese Instanzen identifiziert werden. In meinen aktuellen Projekten habe ich jedoch keinen Zugriff auf die CDD Vault Visualisierungs-Tools.

SLM: Nun, auch wenn Sie sich in den frühen Stadien der Datengenerierung befinden, sind Sie vielleicht noch nicht sehr mit der Datenanalyse befasst. Verwendet Ihr Team derzeit eine unabhängige Software für die statistische Analyse und Visualisierung?

RKM: Nein, wir verwenden momentan nichts.

SLM: Ich habe mich gefragt, weil es meiner Erfahrung nach bei jedem externen Datenanalysepaket erforderlich ist, Ihre Daten irgendwie mit der Analyse zu verbinden, indem Sie Dateien importieren, Formate auflösen, Variablen und Datentypen definieren usw. Erst dann werden Sie festgelegt gehen. Als ehemaliger Benutzer mehrerer anderer Datenanalyseplattformen gab es immer Kontinuitätsprobleme. Die größeren Plattformen hatten viel mehr Schnickschnack, was in der Praxis nicht so häufig eingesetzt wurde, aber den Preis so stark erhöhte, dass sich kleinere Unternehmen, mit denen wir zusammengearbeitet hatten, diese nicht leisten konnten. Daher waren unsere Analysen unterschiedlich und Vergleiche schwieriger. Außerdem wurden meine Daten bei jedem Versions-Upgrade mehrerer beliebter Anwendungen unterschiedlich erkannt und ich habe viel Zeit damit verbracht, ältere Versions-Datendateien in die neueren Versionen zu exportieren und zu importieren, um meine längerfristigen Analysen fortzusetzen.
Ich glaube, dass ein großer Vorteil der Visualisierungstools darin besteht CDD Vault ist, dass es deine daten schon kennt. Sie müssen nichts definieren oder Ihre Daten in die neue Anwendung übersetzen. Ein weiterer großer Vorteil von diesen Visualisierungstools stellen die nahtlose Verbindung zwischen der Analyse her Anwendung und die CDD Vaults. Über diese Verbindung können Sie einen beliebigen Teil Ihrer Daten sowie die Daten aller Mitarbeiter analysieren. CDD Vaults haben Sie Zugriff auf sowie die öffentlichen Datensätze, die in verfügbar sind CDD Vault. Sie können alle verfügbaren Datensätze mit sehr fortschrittlichen Suchwerkzeugen auf einfache Weise und gleichzeitig durchsuchen und dann die zurückgegebenen Daten als eigenen Datensatz für zukünftige Referenz- oder Analysezwecke unterteilen.

RMK: Ja. Mir gefällt, dass es nur ein Knopfdruck war, um von der Anzeige der Daten zur Visualisierung zu gelangen. Ich erinnere mich, dass es nicht sehr teuer war, also muss ich mich für das Hinzufügen des entscheiden CDD Vault Visualisierungstools zu unserem Paket.

SLM: Ich denke, Charlie wäre eine hervorragende Quelle, um Ihnen zu zeigen, wie viel mehr Sie mit dem tun können CDD Vault Visualisierungstools neben XY-Plots. Mit dieser intuitiven Funktion können Sie Daten mit mehreren Parametern in X und Y untersuchen und dabei Farbe und Größe als zusätzliche Dimensionen der Daten verwenden, um Trends zu erkennen, interessierende Teilmengen zu identifizieren oder Ausreißer zu markieren.

Meiner Meinung nach liegt die eigentliche Stärke der Visualisierungstools nicht in der Erzeugung von 2D-Plots, sondern darin, dass Sie (auf demselben Bildschirm) eine Panel-Histogramm-Analyse aller verschiedenen Eigenschaften der von Ihnen angezeigten Daten durchführen. Während Sie also die Daten in 2-4-Dimensionen im Plot anzeigen, werden im rechten Bereich alle möglichen Dimensionen der Daten angezeigt, die Sie möglicherweise untersuchen. Darüber hinaus sind die Diagramme und Histogramme dynamisch und interaktiv. Wenn Sie einen Bereich des Diagramms auswählen, werden die Eigenschaften der Teilmenge in den Histogrammen hervorgehoben und umgekehrt. Alternativ können Sie mithilfe der Histogramme filtern, was in Ihrem Diagramm angezeigt wird, und nach Eigenschaftsbereichen Ihrer Wahl filtern. So haben Sie die Möglichkeit, Teilmengen der Daten, die Sie interessieren, detaillierter zu visualisieren und auszuwählen oder Hypothesen zu formulieren und zu untersuchen. Wenn Sie beispielsweise Verbindungen in einem bestimmten pH-Bereich anzeigen möchten, während Sie zwei andere Eigenschaften zeichnen, können Sie die Teilmenge auf einem 2D-Plot aller Verbindungen eindeutig färben oder alle Verbindungen außerhalb des ausgewählten pH-Bereichs herausfiltern. Es ist das interaktive Spiel zwischen Ihrem Grundstückspanel und Ihrem Grundstück, das die Analyse wirklich stark macht. Das ist wirklich das Genie von CDD VaultVisualisierungsanalyse-Tools, wie ich es sehe.

RMK: Ja - ich spiele einfach viel mehr mit CDD Vault (eigentlich gerade), während ich einen Bericht für ein neues Team von Chemikern erstelle. Das neue Chemieteam möchte wissen, was wir bisher gemacht haben und wo sie einspringen können, also erstelle ich ihnen einfach den Bericht und sende ihn ihnen. Dann zeige ich es ihnen CDD Vault und haben eine gute offene Diskussion. Ich denke, das wird gut gehen.

SLM: Dies ist genau die Art von Situation, in der ein Support-Mitglied von CDD Sie bei diesem Treffen unterstützen und die Daten auf der Grundlage der Fragen, die die medizinischen Chemiker möglicherweise haben, sehr schnell und dennoch umfassend navigieren und visualisieren könnte. Kellan Gregory von der CDD, der für die Entwicklung des. Von zentraler Bedeutung war CDD VaultVisualisierung Analyse-Tools ist ein Daten-Assistent. Ich liebe es, ihn während der Produktdemos auf dem CDD-Messestand zu beobachten, wenn die Leute alle möglichen einzigartigen Fragen zu den öffentlichen Datensätzen im Internet stellen CDD Vault. Er kann mühelos ein Abfrageergebnis in eine Kalkulationstabelle einfügen oder ein Diagramm erstellen, das eine wirklich prägnante Möglichkeit zur Beantwortung ihrer Frage bietet. Sie können jederzeit Ihr CDD-Team um diese Art von Unterstützung bitten.

SLM: Zusammenfassend lässt sich sagen, dass Rick aufgrund Ihrer langen Geschichte in diesem Bereich, Ihrer Positionen in globalen Pharmaunternehmen, von der Leitung von Teams medizinischer Chemiker bis hin zu strategischen Entscheidungen auf viel höherer Ebene und darüber hinaus bei der Beratung für diskretere Kooperationen zwischen Hochschulen und privaten Institutionen und Können Sie für philanthropische Organisationen erläutern, wie sich der Umgang mit Daten im Feld entwickelt hat und wie sich der Datenaustausch entwickelt hat, und was Ihrer Meinung nach dazu beiträgt, diese Bewegung in Richtung eines neuen Wissenschaftsmodells zu fördern, das die Datenverarbeitung potenziell beschleunigen kann? Entdeckung von Therapeutika?

RMK: Ich denke, dass im Großen und Ganzen eine sich bewegende Leiste als vorwettbewerblich angesehen wird. In der Vergangenheit waren die IP-Bedenken so groß, dass die Leute nichts teilen wollten und Unternehmen fast alles patentieren ließen. Sie haben Gensequenzen patentiert, was nicht mehr als akzeptabel angesehen wird - niemand patentiert das mehr. Sie haben Röntgenstrukturen patentiert, die nicht mehr patentiert sind. Jetzt wird eine Menge davon geteilt. Die Brookhaven-Datenbank teilt Strukturen etwa ein Jahr nach ihrer Veröffentlichung, manchmal früher. Jetzt hat man das Gefühl, dass man in diesem Geschäft immer noch mithalten kann, aber dass man etwas weiter stromabwärts konkurriert und die frühen Dinge mehr geteilt werden.

Die frühen Bemühungen sind sehr datenintensiv und Sie benötigen Fahrzeuge, die mit diesen großen Datendateien umgehen können, bei denen es sich nicht nur um Textzeichenfolgen handelt, sondern um chemische Strukturen, zweidimensionale und dreidimensionale chemische Strukturen, Genanmerkungen und das müssen Sie können Suche nach Struktur sowie Suche nach Textzeichenfolgen. Die Rechenanforderungen sind gerade gestiegen. Während immer mehr Daten öffentlich zugänglich sind (Sie haben beispielsweise PubChem und ChemBL), sind dies alles Fahrzeuge, die öffentlich zugängliche Datenbanken sind. Die Herausforderung für die Wissenschaftler besteht nun darin, alle diese Daten durchzuarbeiten. Wie man die Nuggets aus all den anderen Sachen mit geringerem Wert herausholt, ist nicht so nützlich. Bessere Rechenwerkzeuge sind heutzutage nur noch unerlässlich.

Die andere Sache ist, dass die meisten von uns Wissenschaftlern mit Computern vertraut sind, sie die ganze Zeit benutzen, Smartphones besitzen, aber wir wollen nicht wissen, was rechnerisch hinter dem Vorhang vor sich geht. Wir wollen es nur benutzen. (Gelächter) Es muss also benutzerfreundlich und intuitiv sein. Das hat Apple so erfolgreich gemacht - sie haben nichts davon erfunden, sie haben es nur benutzerfreundlich gemacht. Das ist wo CDD Vault Bei der Evaluierung war ich aufgefallen - es ist benutzerfreundlich, es macht intuitiv Sinn, es ist für mich einfacher zu bedienen. Ich denke, dies wird der Schlüssel für die Zukunft in dieser Branche sein.

Virtuelle Unternehmen gibt es schon ein bisschen, fünf oder zehn Jahre, und ich denke, das Geschäftsmodell ist da, um zu bleiben. Die CRO-Branche hat sich weiterentwickelt - als ich vor Jahren mit 30 anfing, gab es nur wenige CROs für Chemie, und jetzt verlassen sich die meisten Unternehmen ausschließlich oder fast überwiegend darauf, dass Moleküle außerhalb ihrer vier Wände hergestellt werden. Das Verfolgen all dieser Daten ist äußerst wichtig. Immer mehr CROs aus dem Bereich Biologie stoßen an Bord, und die CROs aus dem Bereich Chemie werden zu Full-Service-CROs, bei denen nicht nur chemische Synthesen, sondern auch In-vitro-Assays und DMPK-Studien durchgeführt werden. All dies ist jetzt nur alltäglich. Es hat das Feld erheblich verändert.

Also denke ich, wir kreisen zurück. Ich denke, dass sich Unternehmen weiterentwickeln, wenn sie Daten gemeinsam nutzen, über Grenzen hinweg arbeiten können (unabhängig von den Unternehmensstrukturen). Sie können die Discovery-Aktivitäten vollständig virtuell oder unternehmensintern durchführen, müssen jedoch weiterhin in der Lage sein, Daten gemeinsam zu nutzen. Denn am Ende gibt es immer mehr Übergaben bei der Wirkstoffentdeckung. Wo früher von Suppe bis Nuss alles in einem Unternehmen erledigt wurde, entdeckt heute oft eine akademische Gruppe ein Ziel und übergibt es einem kleinen Biotech-Unternehmen, das ein kleines Molekül entdeckt, das sich an das Ziel bindet und es auf den Punkt bringt dass es es einem größeren Unternehmen übergibt, um die klinische Entwicklung dieses kleinen Moleküls durchzuführen. Jedes Mal müssen Sie Daten freigeben und zeigen, was Sie getan haben. Sie müssen die Ergebnisse Ihrer Arbeit an ein neues Team von Wissenschaftlern übergeben, und dies auf einfache Weise zu tun, ist selbstverständlich. So läuft das Geschäft jetzt.


Dieser Blog wurde von Mitgliedern der verfasst CDD Vault Gemeinschaft. CDD Vault ist ein gehosteter Drogenforschung Informatik Plattform, die sowohl private als auch externe biologische und chemische Daten sicher verwaltet. Es bietet Kernfunktionen einschließlich chemische Registrierung, Struktur Aktivitätsbeziehung, chemisches Inventar, und elektronisches Labornotizbuch Fähigkeiten!

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