CDDLa base de datos pública es un recurso valioso

CDD Public ofrece a los usuarios de CDD Vault acceso a más de 100 conjuntos de datos bien conservados que pueden ser fácilmente extraídos y analizados junto con sus propios datos privados. Los compuestos almacenados en CDD Public pueden buscarse y filtrarse fácilmente utilizando la interfaz de CDD Vaultde fácil uso y con una interfaz químicamente inteligente. Además, CDD ha desarrollado recientemente la capacidad de construir modelos QSAR. Esto significa que ahora puede construir un modelo basado en cualquier propiedad almacenada en CDD Public, y ver cómo se comparan sus compuestos. Esto puede ser especialmente útil para predecir la selectividad de la diana o las propiedades ADME/tox.

En colaboración con NCBI-PubChem, CDD ha proporcionado enlaces a datos de apoyo, como bioactividad, ADME, toxicidad, propiedades y fuentes, para las más de un millón de moléculas de CDD Public. Además, CDD también ha añadido 94.000 estructuras que hasta ahora eran desconocidas en PubChem. Entre ellas se encuentran varias colecciones de estructura-actividad para enfermedades raras y desatendidas, como la malaria, la tuberculosis y los parásitos tropicales, así como datos de toxicidad y propiedades. PubChem destacó recientemente este anuncio en su página web:

La base de datos PubChem ha superado recientemente los 50 millones de compuestos conocidos, lo que la convierte posiblemente en la colección más completa. CDD está orgullosa de nuestra comunidad de usuarios por esta contribución. Si conoce un conjunto de datos públicos que considere valioso para la comunidad de CDD , comuníquenoslo y lo añadiremos a la base de datos pública de CDD .

He aquí una rápida muestra de conjuntos de datos de gran interés para los usuarios de CDD :

• APROBADOS POR LA FDA: Medicamentos aprobados - con estructura molecular definida, incluyendo 763 moléculas del Physicians' Desk Reference, 780 del DrugBank, 1151 en el Orange Book 2007, y 1007 de la lista de la FDA del Dr. Chris Lipinski.
• KINASE: ChEMBL Kinase SARfari Compounds & BioAssay Data - pone a disposición una gran cantidad de datos SAR para compuestos activos en quinasas contra una amplia gama de quinasas en una amplia gama de ensayos, gran parte de ellos extraídos manualmente y curados de la literatura.
• GPCR: PDSP Ki Database-tiene más de 47.000 valores Ki contra 699 objetivos GPCR de la base de datos del NIMH Psychoactive Drug Screening Program (PDSP)

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Este blog está escrito por miembros de la comunidad de CDD Vault . CDD Vault es una plataforma informática de descubrimiento de fármacos alojada que gestiona de forma segura datos biológicos y químicos tanto privados como externos. Proporciona una funcionalidad básica que incluye el registro químico, la relación estructura-actividady el inventario químico, así como capacidades de cuaderno de laboratorio electrónico.

CDD Vault : La informática para el descubrimiento de fármacos que todo el equipo del proyecto adoptará.