Coronavirus COVID-19 (SARS-CoV-2): Hechos y actualizaciones del descubrimiento de fármacos (antes 2019-nCoV)
Datos científicos para entender y responder a la pandemia de COVID-19
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Escrito originalmente por Barry Bunin, PhD el 28 de enero de 2020,
Actualizado por Jason Bret Harris, PhD el 18 de marzo de 2022.
A medida que las noticias sobre el COVID-19 y el Coronavirus dominan los titulares, es fácil emocionarse y reaccionar ante cada novedad. Sin embargo, creemos que es útil examinar los hechos y tener una visión más amplia de este brote. Esto es lo que sabemos hasta ahora sobre el nuevo virus, y cómo la comunidad científica está trabajando para contrarrestarlo.
¿Qué es el Coronavirus 2019 (COVID-19), anteriormente 2019-nCoV, y SARS-COV-2?
El 2019-nCoV es un Coronavirus, de la familia de los virus tradicionalmente asociados al resfriado común y leve. Está genéticamente más relacionado con los Coronavirus del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS ) y del Síndrome Respiratorio de Oriente Medio (MERS), aunque es distinto. Se denominó temporalmente como el nuevo Coronavirus-2019 (2019-nCoV) y posteriormente se denominó COVID-19 (nombre de la enfermedad) y SARS-COV-2 (nombre del virus). Estamos aprendiendo a medida que la enfermedad se desarrolla diariamente ante nuestros ojos:
El NIAID proporcionó un resumen equilibrado del estado actual de los asuntos relacionados con el 2019-nCoV:
"La aparición de otro brote de enfermedad humana causado por un patógeno de una familia viral que antes se consideraba relativamente benigna subraya el desafío perpetuo de las enfermedades infecciosas emergentes y la importancia de una preparación sostenida.2”
NPR tiene una lista de terminologías y definiciones médicas clave utilizadas habitualmente en la cobertura mediática del brote.
A finales de noviembre de 2019, se sospecha que el origen del COVID-19 es el cruce entre murciélagos y humanos en Wuhan, China. Los estudios de variación genética parecen sugerir que el principal reservorio de huéspedes en la naturaleza para el 2019-nCoV es probablemente el murciélago. La posible recombinación y transmisión puede haber implicado a huéspedes serpientes, según los análisis genéticos de glicoproteínas.
El 31 de diciembre de 2019, la Comisión Municipal de Salud de Wuhan, en la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, China, informó de un grupo de casos de neumonía de etiología desconocida, con un vínculo común informado con el mercado mayorista de mariscos Huanan de Wuhan (un mercado mayorista de pescado y animales vivos que vende diferentes especies de animales).
El 10 de enero se publicaron los datos de secuenciación del virus 2019-nCoV. El agente causante de la misteriosa neumonía fue identificado como un nuevo coronavirus mediante secuenciación profunda e investigaciones etiológicas por parte de al menos 5 laboratorios independientes de China. El genoma completo del virus de la neumonía del mercado de mariscos de Wuhan aislado Wuhan-Hu-1 está ahora depositado en línea en el Genbank.
El12 de enero, la Organización Mundial de la Salud denominó temporalmente al nuevo virus como 2019 novel coronavirus (2019-nCoV). En un artículo titulado "Coronavirus: estructura del genoma, replicación y patogénesis" se compartieron los detalles genéticos:
"El genoma de los CoVs es un ARN de sentido positivo monocatenario (+ssRNA) (~30kb) con estructura de 5'-cap y cola de 3'-poly-A" y "El tamaño del genoma de los CoVs (~30kb) es el mayor entre todos los virus de ARN, que es casi dos veces mayor que el de los segundos virus de ARN más grandes. El mantenimiento del tamaño gigante del genoma de los CoV podría estar relacionado con las características especiales del RTC del CoV, que contiene varias enzimas de procesamiento de ARN, como la exorribonucleasa 3'-5' de nsp14. La exorribonucleasa 3'-5' es única para los CoVs entre todos los virus de ARN, y ha demostrado funcionar como una parte de corrección de pruebas del RTC [12-14]. El análisis de la secuencia mostró que el 2019-nCoV posee una estructura genómica típica de los coronavirus y pertenece al grupo de betacoronavirus que incluye al Bat-SARS-like (SL)-ZC45, Bat-SL ZXC21, SARS-CoV y MERS-CoV. Basándose en el árbol filogenético de los CoVs, el 2019-nCov está más estrechamente relacionado con el Bat-SL-CoV ZC45 y el Bat-SL-CoV ZXC21 y más distantemente relacionado con el SARS-CoV.1”
El11 de febrero, la OMS anuncia los nombres oficiales del virus responsable del COVID-19 (anteriormente conocido como "2019 novel coronavirus") y de la enfermedad que provoca. Los nombres oficiales son Enfermedad por coronavirus (COVID-19) Virus del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2).
El14 de febrero, el biólogo John D. Loike escribió una opinión sobre la obligación ética de los científicos de proporcionar información objetiva para educar al público en general sobre el coronavirus.
El17 de marzo, Scripps completa un estudio y descubre que el COVID-19 tiene un origen natural y no fue creado en un laboratorio como se rumoreaba.
¿Dónde y cómo se propaga COVID-19 (epidemiología)?
Los casos originales en humanos aparecieron alrededor de la ciudad de Wuhan, en la provincia central de Hubei, en China, donde se identificó por primera vez el 2019-nCoV.
En noviembre de 2015, un estudio predice una amenaza potencial de que los humanos contraigan el CoV SHC014, similar al SARS, que circula entre los murciélagos.
A finales de noviembre de 2019, se sospecha que el origen del COVID-19 es el cruce entre murciélagos y humanos en Wuhan, China. Los estudios de variación genética parecen sugerir que el principal reservorio de huéspedes en la naturaleza para el 2019-nCoV es probablemente el murciélago. La posible recombinación y transmisión puede haber implicado a huéspedes serpientes, según los análisis genéticos de glicoproteínas.
El 30 de diciembre de 2019 se recogieron tres muestras de lavado broncoalveolar de un paciente con neumonía de etiología desconocida que fue secuenciado y se determinó que se trataba de un nuevo coronavirus (COVID-19), informado por la OMS.
El 31 de diciembre de 2019, la Comisión Municipal de Salud de Wuhan, en la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, China, informó de un grupo de casos de neumonía de etiología desconocida, con un vínculo común informado con el mercado mayorista de mariscos Huanan de Wuhan (un mercado mayorista de pescado y animales vivos que vende diferentes especies de animales).
El 9 de enero se publicaron los datos de secuenciación del virus 2019-nCoV. El agente causante de la misteriosa neumonía fue identificado como un nuevo coronavirus mediante secuenciación profunda e investigaciones etiológicas por al menos 5 laboratorios independientes de China.
También se confirmaron varios casos en Tailandia, Japón, Taiwán, Corea del Sur, Estados Unidos y Europa en los siguientes meses.
- Ver Datos en vivo, WorldOMeter proporciona pruebas de Coronavirus: Criterios y cifras por país.
- Ver datos en vivo, OurWorldInData ofrece gráficos interactivos por país.
- Ver Datos en Vivo, la Universidad Johns Hopkins tiene un útil tablero de control que rastrea el número total de casos conocidos de COVID-19 a nivel mundial.
- Ver Live Data, los CDC hacen un seguimiento de los casos en Estados Unidos.
- Ver datos en vivo. Mutación/Evolución de la cepa del virus (tasas de cambio lentas, aproximadamente 2 mutaciones/mes).
Aunque se creía que se transmitía inicialmente de animales a humanos (con el origen en un mercado específico, ahora cerrado, de la ciudad de Wuhan, donde se vendían animales vivos de forma rutinaria), ahora hay múltiples ejemplos de transmisión de persona a persona del virus 2019-nCoV.
El 24 de enero, hubo 830 casos reportados y veintiséis muertes confirmadas por el 2019-nCoV, por supuesto no todos los casos son necesariamente reportados por lo que estos deben ser considerados los números mínimos.
El 25 de enero, la OMS ha publicado 5 informes de situación sobre el 2019-nCoV. El quinto informe de la OMS incluye 1320 casos confirmados de 2019-nCoV. Se ha notificado la transmisión de persona a persona, aunque la gran mayoría de los casos están relacionados con el historial de viajes a la ciudad de Wuhan (China).
El 26 de enero, algunos modelos sugieren que puede haber entre 30.000 y 200.000 humanos con el 2019-nCoV.
El21 de febrero, se cree que COVID-19 se transmite principalmente de persona a persona a través de las gotitas respiratorias, y no hay pruebas definitivas de la transmisión fecal o aérea. Se ha sospechado de la transmisión por portadores asintomáticos.
El 3 de marzo, la OMS publicó un informe de 40 páginas de la Misión Conjunta OMS-China sobre el COVID-19, con conclusiones detalladas sobre el virus y la enfermedad, evaluación de la situación actual y recomendaciones para las comunidades mundiales.
El 11 de marzo, La OMS califica el COVID-19 como una pandemia.
Desde el 27 de marzo, al menos 8 cepas de SARS-CoV-2 se están abriendo camino en el mundo.
A partir del3 de julio, evidencia de una mayor infectividad de la mutación, D614G, en el SARS-COV-2 y una disminución de la diseminación S1.
Aunque las muertes son obviamente significativas para los implicados directa e indirectamente, la novedad y la trayectoria desconocida del brote es lo que lo convierte en noticia. Dado que hay órdenes de magnitud más de muertes por la gripe común, los científicos han discutido la posibilidad de cambiar el nombre de la gripe. "Deberíamos cambiar el nombre de la gripe; llamarla virus XZ-47, o algo más aterrador", dijo el Dr. Paul Offit, director del Centro de Educación sobre Vacunas del Hospital Infantil de Filadelfia.
La Organización Mundial de la Salud dijo que la estimación preliminar del R0 (número de reproducción) es de 1,4 a 2,5, lo que significa que cada persona infectada podría contagiar a entre 1,4 y 2,5 personas. Por tanto, se está transmitiendo, pero actualmente no se está propagando con relativa rapidez. El número exacto de reproducción se desconoce, por supuesto, ya que no se notifican todos los casos y hay un desfase entre la infección, el aviso y la notificación.
Eldistanciamiento social ha sido la respuesta general para controlar la enfermedad. Sirve para frenar la propagación de la enfermedad y mantener la capacidad de atención crítica para los pacientes más enfermos. El distanciamiento social es difícil de aplicar y una pregunta común es cuánto y durante cuánto tiempo aplicarlo. Esto se analiza con más detalle en un artículo: "¿Cuánto tiempo debe durar el distanciamiento social? Predicción del tiempo de moderación, control y contención del COVID-19".
¿A qué se parece COVID-19?
El 2019-nCoV forma parte de una familia de coronavirus que incluye el resfriado común, el síndrome respiratorio agudo severo (SARS) y el síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS). Desde que se identificó por primera vez en Arabia Saudí en 2012, alrededor del 34% de las personas notificadas como infectadas por MERS han muerto (858 de 2494 casos). El R0 del MERS es inferior a uno. El brote de SARS provocó 8098 casos identificados y 774 muertes (9,6%). El SRAS tenía un R0 de 2 a 5. El SRAS desapareció tan rápidamente como apareció en 2002-03. Si somos sinceros, no siempre sabemos del todo por qué crecen o disminuyen las infecciones contagiosas. A menudo somos mejores para determinar la correlación, más que la causalidad. Esto no es sorprendente, ya que las infecciones contagiosas son, por definición, fenómenos que evolucionan.
Los investigadores están evaluando contramedidas para el 2019-nCoV utilizando el SARS-CoV y el MERS-CoV como prototipos. Por ejemplo, se están adaptando rápidamente las plataformas de diagnóstico para incluir el 2019-nCoV, lo que permite el reconocimiento y el aislamiento tempranos de los casos. Los antivirales de amplio espectro, como el remdesivir, un inhibidor de la ARN polimerasa, así como el lopinavir/ritonavir y el interferón beta, se han mostrado prometedores contra el MERS-CoV en modelos animales y se están evaluando frente al 2019-nCoV. En el Centro de Investigación de Vacunas del Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas se está trabajando en vacunas, con enfoques de plataformas de vacunas de ácido nucleico utilizadas para el SARS-CoV o el MERS-CoV. "Durante el SARS, los investigadores pasaron de obtener la secuencia genómica del SARS-CoV a un ensayo clínico de fase 1 de una vacuna de ADN en 20 meses, y desde entonces han comprimido ese plazo a 3,25 meses para otras enfermedades víricas. Para el 2019-nCoV, esperan avanzar aún más rápido, utilizando la tecnología de vacunas de ARN mensajero (ARNm). Otros investigadores están igualmente preparados para construir vectores virales y vacunas de subunidades.2”
El11 de marzo, la Clínica Cleveland resume los datos actuales sobre los síntomas de Covid-19 en comparación con el resfriado común y la gripe.
Desarrollo de la vacuna COVID-19
El desarrollo de vacunas (y anticuerpos) tiene sentido, dado el plazo potencialmente más rápido que el descubrimiento de moléculas pequeñas de novo, aunque se han utilizado otros antivirales en el SARS y el MERS. El Wall Street Journal informó de que varios fabricantes de medicamentos se apresuran a desarrollar vacunas que puedan proteger contra el nuevo virus respiratorio originado en China. Moderna Inc., Inovio Pharmaceuticals Inc. y Novavax Inc. planean desarrollar vacunas contra la nueva cepa viral identificada. Los investigadores de la Universidad de Queensland, en Australia, también están tratando de desarrollar una vacuna contra la cepa.
Más recientemente, FierceBiotech informó de que tanto JNJ como Gilead se han lanzado a la carrera de la vacuna contra el coronavirus acelerada.
Año 2020
El 10 de enero, los científicos de Inovio se apresuran a fabricar la vacuna INO-4800 y a iniciar las pruebaspreclínicas en
. Los ensayos clínicos en humanos están previstos para abril con 30 voluntarios sanos en Estados Unidos y China y Corea del Sur poco después. Si tienen éxito, se prevé realizar un millón de ellos a finales de 2020.El11 de febrero, Johnson & Johnson anunció una colaboración con el Departamento de Salud y Servicios Humanos de los Estados Unidos (BARDA) para acelerar el desarrollo de una vacuna, utilizando su tecnología de plataforma de vacunas, que se utilizó para el desarrollo de una vacuna experimental contra el ébola en 2009,
El13 de enero, los NIH y Moderna finalizaron la secuencia del ARNm-1273, la vacuna de la empresa contra el nuevo coronavirus. Los NIH revelaron su intención de realizar un estudio de fase 1.
El23 de febrero, GSK anuncia que utilizará su plataforma de adyuvantes para vacunas pandémicas para dirigirse a COVID-19, una tecnología utilizada para desarrollar vacunas contra el VPH y la gripe en el pasado.
El24 de febrero, el Dr. James Hamblin habló de las perspectivas de desarrollo de la vacuna y de cómo la baja tasa de mortalidad del COVID-19 hace que sea difícil de contener.
El16 de marzo, los NIH anunciaron la dosificación del primer participante en su estudio de fase 1 para el ARNm-1273, lo que supone un total de 63 días desde la selección de la secuencia hasta la primera dosificación en humanos. Se espera que en el ensayo abierto se inscriban 45 voluntarios adultos sanos de entre 18 y 55 años durante aproximadamente seis semanas. El ARNm-1273 es una vacuna de ARNm contra el SARS-CoV-2 que codifica una forma estabilizada por prefusión de la proteína Spike (S).
El 23 de abril, Moderna anunció la segunda ronda de dosificación de mRNA-1273.
El 18 de mayo, Moderna publica los primeros resultados, demostrando que la vacunación con ARNm-1273 provoca una respuesta inmunitaria de la magnitud de la causada por la infección natural a partir de una dosis tan baja como 25 µg.
El 20 de mayo, el prototipo de vacuna de ADN protege contra el SARS-CoV-2 en macacos rhesus.
El 20 de mayo, La infección de SARS-CoV-2 protege contra la reexposición en macacos rhesus.
El29 de mayo,el estudio de fase 2, que está llevando a cabo Moderna, evaluará la seguridad, la reactogenicidad y la inmunogenicidad de dos vacunas de ARNm-1273 administradas con 28 días de diferencia con 600 participantes sanos en dos cohortes de adultos de 18 a 55 años (n=300) y de adultos mayores de 55 años (n=300).
El 2 de julio, La vacuna contra el SARS-CoV-2 (BNT162b1) muestra signos de actividad en un estudio de fase 1/2.
El 14 de julio, El candidato a vacuna de Moderna (mRNA-1273) para COVID-19 induce una respuesta inmunitaria en todos los participantes de la fase 1.
El 27 de julio, Moderna y los NIH inician el ensayo de fase 3 de la vacuna candidataCOVID-19 V (mRNA-1273).
El 11 de agosto, Rusia aprueba la primera vacuna COVID-19 del Instituto Gamaleya, que no fue evaluada en ningún ensayo de fase 3.
El 4 de septiembre, Los investigadoresrusos publican los datos de la nueva vacuna COVID-19.
El 8 de septiembre, El estudio de la vacuna Covid-19de AstraZeneca se suspende por una presunta reacción adversa en un participante del Reino Unido.
El 8 de septiembre, Los desarrolladores de la vacuna contra el SARS-CoV-2 firman un compromiso de seguridad.
El 11 de septiembre. Resultados positivos de la fase 1-2 de la vacuna COVID-19 de Novavax.
El 12 de septiembre. AstraZeneca y Oxford reanudan el ensayo de la vacuna COVID-19 tras una revisión de seguridad.
El23 de septiembre, Johnson & Johnson inicia el ensayo clínico global de fase 3 delcandidato a vacuna COVID-19 de Janssen, JNJ-78436735, que , a diferencia de las otras vacunas COVID-19 en fase de ensayo clínico, no requiere una vacuna de refuerzo.
El24 de septiembre, Sinovac anunció ayer que se había aprobado el inicio de un ensayo de fase1/2 paraadolescentes y niños de su vacuna CoronaVac.
El 16 de octubre, la vacuna en investigaciónde Covaxx, UB-612, se convierte en la primera vacuna basada en un péptido múltiple que activa tanto las células B como las T.
El 16 de octubre, Pfizer, BioNTech vacuna COVID-19, BNT-162. prevista para finales de noviembre la presentación de la FDA.
El 9 de noviembre, La vacuna COVID-19de Pfizer reporta una eficacia del 90% en datos preliminares no revisados.
El 9 de noviembre, la FDA concede a Novavax el estatus de vía rápida para su vacuna en investigación COVID-19, NVX-CoV2373.
El 16 de noviembre, La vacuna de Moderna, en un análisis preliminar, muestra una eficacia de casi el 95% en la prevención de la enfermedad, incluidos los casos graves.
El 19 de noviembre, La vacuna COVID-19 deAstraZeneca/Oxford, ChAdOx1 nCoV-19, resultó ser segura e invocar una respuesta inmunitaria en el ensayo clínico de fase 2.
El 23 de noviembre, La vacuna COVID-19 en investigaciónde AstraZeneca, AZD1222, tuvo una eficacia del 90% en 1 de sus 2 regímenes de dosificación.
El9 de diciembre, Canadá aprueba la vacuna de Pfizer para la autorización de uso de emergencia.
El 9 de diciembre, Emiratos Árabes Unidos dijo que había aprobado una vacuna para China con una eficacia del 86%.
El 10 de diciembre, Elpanel asesor de la FDA vota a favor de la vacuna de Pfizer.
El 17 de diciembre, Elpanel asesor de la FDA vota a favor de la vacuna de Moderna.
El 7 de enero de 2021, laComisión Europea ha concedido una autorización de comercialización condicional (CMA ) a la vacuna de Moderna, mRNA1273.
El7 de enero de 2021, se dijo que la vacuna COVID-19 de la empresa china Sinovac, CoronaVac, en fase de investigación, tenía una eficacia del 78% según los investigadores brasileños en un ensayo de fase 3.
El14 de enero de 2021, la vacuna JNJ-78436735 COVID-19 de Johnson & Johnson (J&J ) mostró anticuerpos neutralizantes contra COVID-19 en más del 90% de los participantes del estudio en el día 29 y en el 100% de los participantes de entre 18 y 55 años en el día 57.
El 15 de enero de 2021, Moderna anuncia que su vacuna, mRNA-1273, produce títulos neutralizantes contra la B.1.1.7 (variante del Reino Unido) y la B.1.351 (variante de Sudáfrica).
El 15 de enero de 2021, Merk suspende las vacunas candidatas V590 y V591 y pasa a centrarse en los esfuerzos de producción de vacunas.
El 28 de enero de 2021, El candidato a vacunabasada en proteínas NVX-CoV2373, de Novavax, tiene resultados de fase 3 que muestran una eficacia del 89,3% en la prevención de COVID-19 en participantes del Reino Unido.
El 29 de enero de 2021, La vacuna deJohnson & Johnson ( J&J), JNJ-78436735, muestra una eficacia del 85% en la prevención de la enfermedad grave en todas las regiones estudiadas-28 días después de la vacunación.
El 2 de febrero de 2021, La vacunarusa, Gam-COVID-Vac, demuestra una eficacia del 91,6%, según los nuevos resultados de la fase 3.
El8 de febrero de 2021, Sudáfrica suspende el despliegue de la vacuna de dos dosis de AstraZeneca después de descubrir que no es tan eficaz contra la variante 501Y.V2que se transmite en la región .
El 18 de febrero de 2021, Tanto la vacunade Pfizer/BioNTech como la de Moderna muestran una eficacia reducida contra la variante sudafricana.
El 19 de febrero de 2021, Los CDC muestran tasas relativamente bajas de eventos adversos para las vacunasde Pfizer/BioNTech y Moderna .
El24 de febrero de 2021, la vacuna de una sola vez de Janssen, Ad26.COV2.S, muestra una eficacia del 66,1% (IC del 95%, 55,0 - 74,8) en la prevención de la COVID-19 frente al placebo ≥28 días después de su administración.
El 26 de febrero de 2021, Canadá autoriza la vacunade AstraZeneca.
COVID-19 Desarrollo de medicamentos
La secuencia del 2019-nCoV generada rápidamente y la información de diagnóstico están ahora disponibles públicamente en Virological.org.
El 10 de enero se publicaron en GenBanklos datos de secuenciación del virus 2019-nCoV.
El16 de enero, los investigadores del Centro Alemán de Investigación de Infecciones del hospital universitario Charité de Berlín desarrollaron un ensayo de laboratorio.
El25 de enero, cinco protocolos de PCR y cebadores para el diagnóstico de las cepas de Wuhan City 2019-nCoV están disponibles en la Organización Mundial de la Salud (OMS). Información adicional sobre los protocolos de RT-PCR en tiempo real para los laboratorios está disponible en línea en los CDC.
El 29 de enero, RNA Primer Designs from WHO Protocol & Publication: Real-time RT-PCR assays for the detection of SARS-CoV-2.
El3 de febrero, los médicos de Tailandia informaron de resultados prometedores en el tratamiento de pacientes infectados con una combinación de medicamentos para la gripe y el VIH que incluía grandes dosis del medicamento para la gripe oseltamivir combinadas con los medicamentos para el VIH lopinavir y ritonavir, lo que mejoró las condiciones de varios pacientes en el Hospital Rajavithi de Bangkok
El 4 de febrero, se publicó la estructura cristalina(6LU7)de la proteasa principal COVID-19 en complejo con un inhibidor N3.
El4 de febrero, un artículo de Nature analiza un estudio in vitro sobre la readaptación de fármacos antivirales, en el que dos compuestos, el remdesivir (EC50 = 0,77 μM; CC50 > 100 μM; SI > 129,87) y la cloroquina (EC50 = 1,13 μM; CC50 > 100 μM, SI > 88,50), bloquearon de forma potente la infección del virus a una concentración micromolar baja y mostraron un alto SI.
Para el 18 de febrero, más de 100 ensayos clínicos en curso en China, Japón, Tailandia y Reino Unido para tratar el COVID-19 (la enfermedad causada por el SARS-CoV-2) bajo la supervisión de la OMS.
El25 de febrero, Gilead Sciences inicia dos ensayos clínicos de fase 3 del antiviral de investigación Remdesivir para el tratamiento de la COVID-19, que comenzarán en marzo, tras la rápida revisión y aceptación por parte de la FDA de su IND (Investigational New Drug). Los NIH anuncian ensayos clínicos en los que participarán 1.000 pacientesde Asia y otros países.
El 12 de marzo, se aisló el virus COVID-19 en el laboratorio.
El16 de marzo, COVID-19 Open Research Dataset (CORD-19) creado por la llamada a la acción de la Casa Blanca y contestado por el Allen Institute for AI, Chan Zuckerberg Initiative (CZI), el Center for Security and Emerging Technology (CSET) de la Universidad de Georgetown, Microsoft y la National Library of Medicine (NLM) de los National Institutes of Health.
El17 de marzo, la hidroxicloroquina, un fármaco contra la malaria con una nueva finalidad, muestra signos clínicos de eficacia tras las pruebas iniciales limitadas realizadas en febrero con pacientes de COVID-19.
El 17 de marzo, Estudio clínico abierto y no aleatorio de la hidroxicloroquina (antiviral contra la malaria reutilizado) y la azitromicina (conocido antibacteriano) como tratamiento del COVID-19: resultados de un ensayo clínico abierto y no aleatorio. La combinación de ambos fármacos mostró mejores resultados.
El18 de marzo, Bayer se prepara para donar cloroquina, un medicamento contra la malaria de 70 años de antigüedad, a los Estados Unidos para el probable tratamiento de COVID-19.
El 18 de marzo, Elensayo de Kaletra (Lopinavir-Ritonavir), un potencial antiviral contra el VIH reorientado, no mostró beneficios ni eventos adversos en adultos hospitalizados con Covid-19 grave.
El18 de marzo, las autoridades médicas de China afirmaron que un medicamento utilizado en Japón para tratar las nuevas cepas de la gripe, Avigan (favipiravir), parecía ser eficaz en pacientes con coronavirus. El fármaco actúa como un inhibidor de la ARN polimerasa con un buen perfil de seguridad.
El 19 de marzo, Teva donará comprimidos de sulfato de hidroxicloroquina a hospitales de todo el país para el posible tratamiento de la COVID-19,
El 19 de marzo, Mylan aumenta la fabricación de comprimidos de sulfato de hidroxicloroquina para satisfacer las posibles necesidades de los pacientes estadounidenses de COVID-19.
El20 de marzo, Novartis se compromete a donar hasta 130 millones de dosis de hidroxicloroquina para apoyar la respuesta mundial a la pandemia de COVID-19
El20 de marzo, la nueva estructura cristalina de la proteasa principal del SARS-CoV-2 proporciona una base para el diseño de inhibidores mejorados de α-cetoamida(6Y2E (Mpro sin ligadura), 6Y2F (complejo con 13b en el grupo espacial C2) y 6Y2G (complejo con 13b en el grupo espacial P212121). El plásmido que codifica la Mpro del SARS-CoV-2 estará disponible gratuitamente.
El23 de marzo, AbbVie no hará valer los derechos globales de patente sobre todas las formulaciones del medicamento contra el VIH Kaletra (Aluvia), ya que el fármaco está siendo evaluado para tratar la COVID-19 grave en varios ensayos clínicos.
El23 de marzo, el informe sobre el Instituto Pasteur de Corea (IPK) confirmó la eficacia de la reutilización de Alvesco (ciclesonida), un tipo de esteroide para el tratamiento del asma, en el tratamiento de la COVID-19.
El24 de marzo, Roche anunció que la FDA ha aprobado su ensayo de fase 3 deActemra, un inhibidor de la interleucina 6 -ya aprobado en China-, en pacientes gravemente enfermos de COVID-19, que han sido hospitalizados con neumonía.
El24 de marzo, la FDA planea facilitar el acceso de emergencia para el plasma de convalecencia, derivado de pacientes que ya se han recuperado de la enfermedad, y la FDA dijo que ayudarán a proporcionar acceso a él a los pacientes con infecciones graves o de riesgo vital inmediato de COVID-19
El 25 de marzo Vir Biotechnology indicó que ha identificado varios candidatos a anticuerpos monoclonales (mAb) humanos contra el SARS-CoV-2. Con el fin de ganar tiempo, el desarrollo principal de la empresa fue transferido a WuXi Biologics y Biogen hace varias semanas, con ensayos en humanos probablemente en los próximos 3-5 meses.
El25 de marzo, la Lanzamiento del acelerador terapéutico COVID-19 por la Fundación Gates, Wellcome y Mastercard. Entre las empresas que participan en la colaboración se encuentran BD, bioMérieux, Boehringer Ingelheim, Bristol-Myers Squibb, Eisai, Eli Lilly, Gilead, GSK, Johnson & Johnson, Merck (conocida como MSD fuera de Estados Unidos y Canadá), Merck KGaA, Novartis, Pfizer y Sanofi. Las empresas han acordado compartir sus bibliotecas propias de compuestos moleculares que ya cuentan con cierto grado de datos de seguridad y actividad
El 28 de marzo Descubrimiento de fármacos en colaboración (CDD) publica el conjunto de datos de fragmentos activos de la proteasa principal COVID-19 (Mpro ) en CDD Vault. Aquí hay un Vídeo de avance e instrucciones sobre cómo acceder a él. Se trata de fragmentos moleculares activos frente a la estructura cristalina de Mpro/COVID-19 que se ponen a disposición de la Diamond Light Source, la instalación científica del sincotrón nacional del Reino Unido, en colaboración con Dectris.
El 4 de abril, los resultados iniciales de un ensayo controlado con placebo de hidroxicloroquina con 62 pacientes para la COVID-19 leve indican una recuperación más rápida en comparación con el placebo.
El 10 de abril, se publicó un informe sobre el uso de Remdesivirpara la atención compasiva en pacientes con Covid-19 grave.
El 10 de abril, está disponible la estructura crio-EM de la ARN polimerasa dependiente del AR N del virus COVID-19(RdRp, también llamada nsp12).
El 15 de abril, un estudio clínico muestra los beneficios del remdesivir en macacos rhesus (monos ) infectados por el SARS-CoV-2. Se espera que pronto se realicen ensayos en humanos.
El 29 de abril, los resultadosde Gileaddel ensayo de fase 3 de Remdesivir (sin grupo de control) en pacientes con COVID-19 grave demostraron que una dosis de 5 días es tan eficaz como una dosis de 10 días.
El 29 de abril, el primer estudio de Remdesivir en adultos con COVID-19 grave mediante un ensayo aleatorio, doble ciego, controlado con placebo y multicéntrico nomuestra beneficios clínicos estadísticamente significativos. Sin embargo, la reducción numérica del tiempo hasta la mejora clínica en los tratados antes requiere confirmación en estudios más amplios.
El29 de abril, el estudio del NIH sobre Remdesivir, en un ensayo aleatorio controlado con placebo con más de 1.000 pacientes hospitalizados y en múltiples países, mostró que los pacientes se recuperaban un 31% más rápido. Los resultados también sugieren una tasa de mortalidad ligeramente inferior, pero esta importancia no está clara hasta que se analicen los resultados completos.
El1 de mayo, Remdesivir recibe la autorización de uso de emergencia de la FDA para el tratamiento de COVID-19.
El12 de mayo, Nafamostat muestra una potencia ∼ 600 veces mayor que Remdesivir y otros candidatos a fármacos aprobados por la FDA en un ensayo de cribado antiviral con células pulmonares humanas.
El15 de mayo, Sorrento Therapeutics anunció el viernes que su anticuerpo contra el SARS-CoV-2, STI-1499, neutralizaba completamente la infectividad del virus con una dosis muy baja de anticuerpo, lo que indicaba su candidatura para una mayor evaluación y desarrollo.
El15 de mayo, un ensayo de fase 2 sugiere que la terapia antiviral combinada acelera la recuperación en los pacientes de COVID-19 utilizando interferón beta-1b, lopinavir-ritonavir y ribavirina, lo que parece ser seguro y superior en comparación con la monoterapia con lopinavir-ritonavir.
El27 de mayo, el ensayo de Remdesivir no es concluyente sobre la duración del tratamiento de 5 o 10 días para COVID-19.
El 29 de mayo, la revisión encuentra que los inhibidores de la ECA y los ARA no empeoran el riesgo de COVID-19.
El 3 de junio, Hidroxicloroquina No demuestra su eficacia en la profilaxisde la COVID-19 .
El 15 de junio, la FDA retira la autorización de uso de emergencia para la hidroxicloroquina.
El15 de junio, Pepcide (Famotidine) para la acidez estomacal se estudia por su beneficio clínico observado para los pacientes de COVID-19.
El 17 de junio, La dexametasona, un esteroide bien estudiado, parece ayudar a los casos graves de COVID-19 suprimiendo una respuesta inmune más activa.
El30 de julio, el BMJ publica una "Actualización de los tratamientos farmacológicos para el covid-19: revisión sistemática viva y meta-análisis en red".
El 3 de septiembre, Elensayo de fase 3 de Remdesivir para la COVID-19 moderada muestra resultados modestos e inciertos.
El14 de septiembre, Baricitinib más Remdesivir mejora la COVID-19 hospitalizada en un ensayo doble ciego, aleatorio y controlado patrocinado por el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID).
El30 de septiembre, el cóctel de anticuerpos en investigaciónde Regeneron, REGN-COV2, demostró que reducía la carga viral y el tiempo para aliviar los síntomas en pacientes no hospitalizados con COVID-19.
El7 de octubre, los anticuerpos en investigaciónde Eli Lilly and Company, Bamlanivimab (LY-CoV555) y Etesevimab (LY-CoV016), se relacionan con una menor carga viral, riesgo hospitalario, en pacientes de Covid-19.
El 9 de octubre, Remdesivir más Baricitinib reduce la mortalidad hospitalizada por COVID-19 en un 35% en el nuevo resultado del ensayo ACTT-2.
El 22 de octubre, Elprimer tteatamiento aprobado por la FDA en EE.UU. es el remdesivir (Veklury®) de Gilead Sciences para el tratamiento de la enfermedad por coronavirus 2019.
El9 de febrero de 2021, la Administración de Alimentos y Medicamentos de los Estados Unidos (FDA) ha emitido unaautorización de uso de emergencia (EUA) para la combinación de bamlanivimab y etesavimab para el tratamiento del coronavirus 2019 (COVID-19) de leve a moderado en adultos y niños mayores de 12 años (que pesen al menos 40 kg).
¿Lecciones para la colaboración en el descubrimiento de fármacos?
Tal y como se ha compartido en un oportuno punto de vista del NIH JAMA de Catharine I. Paules, MD; Hilary D. Marston, MD, MPH; Anthony S. Fauci, MD sabemos que el 2019-nCoV es similar al MERS y al SARS gracias al rápido intercambio de datos y a la colaboración internacional:
"Aunque el MERS no ha causado el pánico internacional visto con el SARS, la aparición de este segundo CoV zoonótico altamente patógeno ilustra la amenaza que supone esta familia viral. En 2017, la OMS incluyó el SARS-CoV y el MERS-CoV en su lista de patógenos prioritarios, con la esperanza de impulsar la investigación y el desarrollo de contramedidas contra los CoV. La acción de la OMS resultó ser premonitoria. El 31 de diciembre de 2019, las autoridades chinas informaron de un grupo de casos de neumonía en Wuhan, China, la mayoría de los cuales incluían pacientes que informaron de la exposición a un gran mercado de mariscos que vendía muchas especies de animales vivos. Se sospechó la aparición de otro HCoV zoonótico patógeno, y el 10 de enero de 2020, los investigadores del Centro Clínico de Salud Pública de Shanghái y la Escuela de Salud Pública y sus colaboradores publicaron una secuencia genómica completa del 2019-nCoV en las bases de datos públicas, lo que ejemplifica el rápido intercambio de datos en la respuesta a los brotes."
Editoriales como el British Medical Journal (y en un momento de solidaridad otras editoriales como Wiley y Elsevier) están proporcionando información sobre el Coronavirus de forma gratuita en Internet para estimular los esfuerzos de respuesta global a corto plazo y apoyar la investigación a largo plazo, en contraste con sus modelos de negocio habituales de contenido de pago. El British Medical Journal también ha facilitado información gratuita sobre el MERS y el SARS.
Recursos compartidos:
- El16 de marzo, COVID-19 Open Research Dataset (CORD-19) creado por la llamada a la acción de la Casa Blanca y respondido por el Allen Institute for AI, Chan Zuckerberg Initiative (CZI), el Center for Security and Emerging Technology (CSET) de la Universidad de Georgetown, Microsoft y la National Library of Medicine (NLM) de los National Institutes of Health.
- El25 de marzo, la Lanzamiento del acelerador terapéutico COVID-19 por la Fundación Gates, Wellcome y Mastercard. Entre las empresas que participan en la colaboración se encuentran BD, bioMérieux, Boehringer Ingelheim, Bristol-Myers Squibb, Eisai, Eli Lilly, Gilead, GSK, Johnson & Johnson, Merck (conocida como MSD fuera de Estados Unidos y Canadá), Merck KGaA, Novartis, Pfizer y Sanofi. Las empresas han acordado compartir sus bibliotecas propias de compuestos moleculares que ya cuentan con cierto grado de datos de seguridad y actividad.
- El 28 de marzo Descubrimiento de fármacos en colaboración (CDD) publica el conjunto de datos de fragmentos activos de la proteasa principal COVID-19 (Mpro ) en CDD Vault. Aquí hay un Vídeo de avance e instrucciones sobre cómo acceder a él. Se trata de fragmentos moleculares activos frente a la estructura cristalina de Mpro/COVID-19 que se ponen a disposición de la Diamond Light Source, la instalación científica del sincotrón nacional del Reino Unido, en colaboración con Dectris.
- STM tiene una lista de datos de investigación disponibles gratuitamente relacionados con el Coronavirus de las principales editoriales.
- opencovid-19 : Un repositorio dedicado a compartir todo lo relacionado con COVID-19, incluyendo APIs para flujos de datos para DESARROLLADORES DE WEB Y APP.
Recurso de los NIH para analizar la literatura sobre COVID-19: La herramienta de la cartera COVID-19
- Un consorcio de laboratorios nacionales, empresas y universidades acelera las propuestas de tiempo de computación.
Una de las formas únicas de combatir las epidemias, de la que no disponían las generaciones anteriores, es aprovechar el acceso gratuito, global e instantáneo a toda nuestra especie a través de Internet. Sólo hemos arañado la superficie de todo el potencial de este mecanismo tanto para la respuesta como para la investigación.
Un ejemplo de intercambio y reutilización de datos: el comentario de Certara D360 pretende compartir algunas ideas clave relevantes para optimizar la posología de las terapias candidatas a COVID19 que se aprendieron de los intentos de optimizar la posología antiinfecciosa en entornos en los que la calidad y la disponibilidad oportuna de los datos es un reto, con especial atención a la PK/PD de la gripe, incluyendo las experiencias de los brotes de H5N1 y pH1N1.
La colaboración puede abarcar desde dos científicos que comparten datos en privado hasta datos compartidos públicamente con la comunidad científica internacional. La cantidad tiene una calidad propia. En el caso de un brote, la información compartida públicamente permite que la conversación coevolucione con muchos cerebros (y tecnologías) rápidamente en paralelo, cuando también se comparten oportunamente datos, análisis y conocimientos adicionales.
Cuando se necesita una respuesta oportuna, el intercambio de datos en colaboración permite acelerar el ritmo de aprendizaje.
En el ámbito comercial del descubrimiento de fármacos, hay dos contrapartidas a la puesta en común inmediata. En primer lugar, los datos de diversos ensayos de descubrimiento de fármacos son heterogéneos, complejos y pueden requerir metadatos de procedimientos para su comprensión. En segundo lugar, la puesta en común de los datos, debido a esta heterogeneidad, requiere herramientas sofisticadas (es decir, compartir las relaciones estructura-actividad de una serie de pantallas primarias y secundarias de alto rendimiento realizadas con cientos de miles de compuestos, a nueve concentraciones, por triplicado, no es tan trivial como, por ejemplo, compartir un like en Facebook). No obstante, la colaboración puede ser la clave para dar un salto cualitativo en la eficiencia del descubrimiento de fármacos.
Compartir datos (e ideas) de forma abierta es el objetivo de la literatura científica. La literatura científica se convirtió en un fenómeno más global con la llegada de la imprenta.
Hoy en día damos por sentado que Internet es un medio de comunicación, pero la capacidad de compartir información de forma instantánea en todo el mundo es, sin duda, el cambio de paradigma más importante para nuestra especie. Ya no somos hormigas, sino una colonia de hormigas. Podemos aprender del arte de la inteligencia emergente y colectiva. Nuestros memes viajando a la velocidad de la www para coordinar nuestro pensamiento colectivo es nuestra ventaja competitiva frente a los antiguos e implacables mecanismos de mutación, selección y transferencia horizontal de genes. El as que tenemos en el bolsillo es la capacidad de aprender colectivamente y compartir instantáneamente los aprendizajes colectivos. Los procariotas tienen una velocidad fija de aprendizaje y transferencia de información (diferente en cada caso, pero metafóricamente hablando en general). Los humanos, combinando nuestra inteligencia con Internet, tenemos el potencial de un aprendizaje acelerado y sin límites.
El siguiente nivel de aprendizaje acelerado es la integración de ordenadores y algoritmos, a través de plataformas basadas en la web. No sólo la nuestra CDD Vault que equilibra la protección de la propiedad intelectual mediante el intercambio seguro de datos al tiempo que promueve la máxima colaboración... sino todas las plataformas de intercambio de datos científicos basadas en la web que se conectan (la mayoría patrocinadas por nuestros esfuerzos coordinados por el gobierno y financiados con fondos públicos, como PubMed, GenBank, ChEMBL, KEGG y PubChem, por mencionar sólo un puñado de las muchas plataformas de intercambio de datos científicos basadas en la web de gran impacto). Además, existen iniciativas de gran impacto basadas en la comunidad, como Wikipedia (y su prima igualmente importante, DBpedia). Podemos colaborar mejor, y lo haremos, con el tiempo.
Es necesario acelerar el intercambio de datos y el descubrimiento de una serie de enfermedades víricas, entre las que se encuentra el 2019-nCoV:
"Como no hay terapias ni vacunas eficaces, la mejor manera de hacer frente a las infecciones graves por CoVs es controlar la fuente de infección, el diagnóstico temprano, la notificación, el aislamiento, los tratamientos de apoyo y la publicación oportuna de información sobre la epidemia para evitar el pánico innecesario. En el caso de los individuos, una buena higiene personal, una mascarilla ajustada, ventilación y evitar los lugares concurridos ayudarán a prevenir la infección por CoVs.1”
Cabe destacar el rápido desarrollo de los kits de diagnóstico 2019-nCoV, algunos de los cuales ya están disponibles.
Al igual que con la respuesta a la última epidemia de ébola y después de esta epidemia de 2019-nCoV, tendremos que considerar soluciones generales para la vigilancia y la respuesta. Lo único que sabemos con seguridad es que la próxima vez será ligeramente diferente. En respuesta, nuestras tácticas y herramientas pueden mejorar con cada nueva epidemia gracias a una mayor colaboración coordinada en la red.
En un futuro próximo, no es difícil imaginar un momento en el que los datos y protocolos emergentes estén representados en formatos estandarizados FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) para los análisis informáticos paralelos.3 Bioportal ya cuenta con términos estandarizados y definidos con precisión para el nuevo Coronavirus. Las generaciones futuras podrán colaborar mejor, más rápido, a más largo plazo y de forma más inteligente.4 Estamos todos juntos en esto.
El28 de febrero, Bill Gates escribió una opinión sobre las medidas que deberían tomar los líderes mundiales en respuesta a la amenaza del COVID-19.
Síntomas, diagnóstico y tratamiento de la COVID-19
La secuencia del 2019-nCoV generada rápidamente y la información de diagnóstico están ahora disponibles públicamente en Virological.org.
El 24 de enero se publicaron las características clínicas de 41 pacientes de la UCI infectados por el 2019-nCoV en Wuhan, China. Los pacientes tenían neumonía con hallazgos anormales en la TC de tórax y una "tormenta de citoquinas" con niveles plasmáticos más altos de IL2, IL7, IL10, GSCF, IP10, MCP1, MP1A y TNFα. Estos datos son sólo del paciente en la UCI, obviamente la mayoría de las personas infectadas no están en la UCI.
El29 de enero, el análisis de los primeros 425 pacientes en Wuhan mostró que la edad media era de 59 años, el periodo medio de incubación era de 5,2 días y el R0 se estimó en 2,2.
El31 de enero, The New England Journal of Medicine publicó un informe en el que se detalla la identificación, el diagnóstico, la evolución clínica y el tratamiento del primer caso de 2019-nCoV en Estados Unidos.
El3 de febrero, los médicos de Tailandia informaron de resultados prometedores en el tratamiento de pacientes infectados con una combinación de medicamentos para la gripe y el VIH.
El6 de febrero, la revista JAMA publicó un artículo con información importante para los clínicos que incluye criterios para guiar la evaluación de los Pacientes Bajo Investigación (PUI) en los Estados Unidos.
El11 de marzo, la Clínica Cleveland resume los datos actuales sobre los síntomas de Covid-19 en comparación con el resfriado común y la gripe.
El18 de marzo, un estudio realizado en China demuestra que los síntomas digestivos son un indicador de los resultados de la recuperación. El estudio sugiere que los síntomas digestivos pueden utilizarse como una alerta temprana para los pacientes de riesgo antes de desarrollar síntomas respiratorios.
El19 de marzo, Una prueba de anticuerpos de 15 minutos (CoronaCheck ™) de la gota de sangre sin equipo de laboratorio o personal requerido está disponible de 20/20 GeneSystems, Inc. La prueba está destinada a identificar a las personas que tienen una respuesta inmune contra el SARS-CoV-2.
El21 de marzo, la FDA emitió la primera autorización de uso de emergencia para un diagnóstico de COVID-19 en el punto de atención para la prueba Cepheid Xpert Xpress SARS-CoV-2, que proporcionará resultados en cuestión de horas, en lugar de días como las pruebas existentes, y la empresa tiene previsto ponerla en marcha antes del 30 de marzo.
El 23 de marzo, la FDA suaviza los requisitos de pruebas de laboratorio y de imagen para los medicamentos con estrategias de evaluación y mitigación de riesgos (REMS) que requieren dichas medidas en un esfuerzo por garantizar el acceso de los pacientes a ciertos medicamentos durante la pandemia de COVID-19.
El28 de marzo, la FDA aprobó para uso de emergencia una nueva prueba COVID-19 de 5 minutos de la plataforma ID Now de Abbott que puede realizarse en la consulta del médico.
El 1 de abril, la FDA aprueba el uso de emergencia de una prueba de inmunidad de anticuerpos de 15 minutos de Cellex descrita como prueba rápida qSARS-CoV-2 IgG/IgM.
El21 de abril, el kit de autodiagnóstico casero deLabCorp para COVID-19 fue aprobado por la FDA.
El 3 de mayo, La prueba de anticuerpos COVID-19 deRoche, de gran precisión, recibe el uso de emergencia de la FDA.
El 18 de mayo, la FDA autoriza el uso de emergencia del kit de recogida de Coronavirus en casa a Everlywell y es el primero que no está asociado a un laboratorio específico.
El 25 de junio, La FDA autoriza un kit de pruebas de anticuerpos de 15 minutos.
El 15 de agosto, La FDA concede la autorización de emergencia COVID-19 al método de pruebas de salivade código abierto de Yale .
Referencias
- Coronavirus: estructura del genoma, replicación y patogénesis. Chen Y, Liu Q, Guo D. J Med Virol. 2020 Jan 22. doi: 10.1002/jmv.25681. Revisión. PMID: 31967327
- Infecciones por coronavirus: algo más que un resfriado común. Paules CI, Marston HD, Fauci AS. JAMA. 2020 Jan 23. doi: 10.1001/jama.2020.0757. PMID: 31971553.
- Los principios rectores de FAIR para la gestión y administración de datos científicos. Wilkinson, M., Dumontier, M., Aalbersberg, I. et al. Sci Data 3, 160018 (2016). https://doi.org/10.1038/sdata.2016.18
- La Fundación Long Now sugiere que utilicemos la fecha 02020 para pensar a largo plazo, en lugar de la más convencional 2020(http://longnow.org/).
Este blog está escrito por miembros de la comunidad de CDD Vault . CDD Vault es una plataforma informática de descubrimiento de fármacos alojada que gestiona de forma segura datos biológicos y químicos tanto privados como externos. Ofrece una funcionalidad básica que incluye el registro químico, la relación estructura-actividad, el inventario químico y las capacidades del cuaderno de laboratorio electrónico.
