GSK y las comunidades online crean una alianza única para estimular el descubrimiento de fármacos de código abierto para la malaria
20 de mayo de 2010
GSK se convierte en la primera empresa que comparte libremente las estructuras químicas de 13.500 moléculas de su biblioteca de compuestos
Alianzas con las principales comunidades de investigación científica de la industria privada y el proveedor de datos de dominio público
BURLINGAME, Calif. 19 de mayo de 2010 - GlaxoSmithKline (GSK) se ha asociado con los principales proveedores de datos de dominio público, el Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI), la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM ) y el proveedor de servicios informáticos estadounidense Collaborative Drug Discovery (CDD), para poner a disposición del público información científica clave sobre más de 13.500 compuestos que, en última instancia, podrían conducir a nuevos tratamientos contra la malaria.
La publicación de estos datos marca la primera vez que una empresa farmacéutica pone a disposición las estructuras de tantos compuestos y es posible gracias a la colaboración de los anfitriones de la web y sus herramientas de investigación especializadas, que estarán disponibles sin coste alguno para los investigadores. La información, alojada en sitios web utilizados habitualmente por los investigadores, incluye datos científicos de alta calidad sobre las moléculas de la propia biblioteca de compuestos de GSK que han demostrado su potencia contra el parásito más letal de la malaria, el P. falciparum.
"Estamos encantados de que el EMBL-EBI, la NLM y CDD se hayan unido a nosotros en este valioso esfuerzo por aplicar los principios del código abierto al descubrimiento de fármacos contra la malaria", dijo Patrick Vallance, jefe de descubrimiento de fármacos de GSK. "La derrota de esta enfermedad requerirá la colaboración de muchas mentes científicas. Esperamos que investigadores de todo el mundo utilicen ahora esta información para impulsar nuevos estudios, y que otros grupos, desde la industria farmacéutica hasta el mundo académico, añadan su información a este recurso en línea."
Este tipo de datos es el primer paso en el camino hacia el desarrollo de nuevos medicamentos. Con la estructura de los compuestos y la información sobre el lugar en el que afectan al parásito de la malaria, los científicos podrían seguir investigando sobre estos compuestos para el descubrimiento de fármacos o para entender cómo podrían utilizarse para inhibir el ciclo vital del parásito y, en última instancia, dar lugar a nuevos medicamentos. La apertura de esta información es un ejemplo de la táctica del "código abierto" aplicada al descubrimiento de fármacos.
"Poner la información sobre ciencias de la vida a disposición de la comunidad investigadora es el núcleo de la misión del EMBL-EBI", añadió John Overington, líder del equipo ChEMBL del EMBL-EBI, que actuará como principal repositorio de los datos a través de su recurso ChEMBL. "Estamos orgullosos de poder añadir valor a los datos de GSK incorporándolos a ChEMBL y enlazándolos con una amplia gama de información que podría ayudar a los investigadores a encontrar nuevos tratamientos para la malaria. Este es el comienzo de una nueva era de colaboración público-privada en la investigación de medicamentos."
"La NLM se complace en participar en esta innovadora publicación de información al público", dijo Steve Bryant, director de la base de datos PubChem de la NLM, que alberga los datos. "Al hacer que estos datos estén disponibles a través de recursos públicos como PubChem, GSK está facilitando enormemente el proceso de investigación, ya que la información está vinculada a compuestos relacionados, resultados de bioactividad, literatura publicada y otros recursos que ayudarán a los investigadores a hacer nuevos descubrimientos para combatir la malaria."
"CDD está encantado de participar en este acontecimiento verdaderamente histórico", comentó Barry A. Bunin, director general de Collaborative Drug Discovery. "En décadas de avances médicos de las grandes farmacéuticas, ésta es la primera vez que un grupo comparte abiertamente todos los datos químicos y biológicos, no sólo los pocos aciertos. Además, en el caso de las pantallas fenotípicas, las herramientas de CDD permiten a los investigadores empezar a formular hipótesis y validar las dianas de las pantallas de células completas."
El EMBL-EBI actuará como repositorio principal de los datos de este conjunto de compuestos, e indexará y formateará la información adicional que se aporte. GSK añadirá más información a medida que se genere y se pedirá a los científicos externos que investiguen estos compuestos y los datos que hagan lo mismo.
Sobre los datos
Los datos contienen los "éxitos" o resultados de un cribado de los 2 millones de compuestos de la biblioteca de compuestos de GSK para determinar el efecto de estos compuestos sobre el parásito de la malaria. El proyecto de cribado identificó unos 13.500 compuestos que mostraron una fuerte inhibición sobre el parásito.
Los inhibidores de la cinasa constituían una gran proporción de las moléculas con actividad previamente conocida y ahora identificadas como éxitos antimaláricos. Los datos incluyen las familias químicas que GSK está investigando actualmente para esta indicación y los "mecanismos de acción" de aquellos compuestos que la empresa ha probado previamente para otras indicaciones.
La mayoría de las estructuras de los compuestos identificados se han clasificado como susceptibles de convertirse en medicamentos.
La información microbiológica actual de los compuestos y las estructuras se han puesto en recursos en línea de fácil acceso para los investigadores. El sitio del EMBL-EBI se ha construido de forma que los científicos de todo el mundo puedan añadir sus datos a la información que allí se encuentra, con acceso libre para todos. El valor de la difusión de la información se ve reforzado por la colaboración de los anfitriones de la web y las herramientas de investigación especializadas del sitio, que se ponen a disposición de los investigadores sin coste alguno para ellos.
GSK agradece el apoyo de Medicines for Malaria Venture, que contribuyó a la financiación de este proyecto.
La información completa puede consultarse en línea en
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
Sobre el paludismo
El paludismo es una enfermedad potencialmente mortal causada por parásitos que se transmiten a las personas a través de las picaduras de mosquitos infectados. Un niño muere de malaria cada 30 segundos. En 2009 se produjeron 243 millones de casos de malaria, que causaron casi un millón de muertes, sobre todo entre los niños africanos.
El mejor tratamiento disponible para el paludismo -en particular para la cepa más mortífera P. falciparum- es una combinación de fármacos conocida como terapias combinadas a base de artemisinina (TCA). Sin embargo, la resistencia del parásito es un problema que está socavando los esfuerzos de control de la malaria. No existen alternativas eficaces a las artemisininas para el tratamiento de la malaria, ni en el mercado ni cerca del final del proceso de desarrollo de medicamentos.
Acerca de GlaxoSmithKline
GlaxoSmithKline, una de las principales empresas farmacéuticas y sanitarias del mundo basadas en la investigación, está comprometida con la mejora de la calidad de la vida humana, permitiendo a las personas hacer más, sentirse mejor y vivir más tiempo. Para más información sobre GSK, visite www.gsk.com
Acerca del Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI)
El Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI) forma parte del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) y está situado en el Wellcome Trust Genome Campus de Hinxton, cerca de Cambridge (Reino Unido). El EMBL-EBI surgió a partir del trabajo pionero del EMBL en el suministro de bases de datos biológicas públicas a la comunidad investigadora. Alberga algunas de las colecciones de datos biológicos más importantes del mundo, incluyendo secuencias de ADN (ENA), secuencias de proteínas (UniProt), genomas animales (Ensembl), estructuras tridimensionales (el banco de datos de proteínas en Europa), datos de experimentos de expresión génica (ArrayExpress), interacciones proteína-proteína (IntAct) e información sobre vías (Reactome). El EMBL-EBI alberga varios grupos de investigación y sus científicos desarrollan continuamente nuevas herramientas para la comunidad bioinformática. Para más información sobre el EMBL-EBI, visite www.ebi.ac.uk
Acerca de la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM)
La Biblioteca Nacional de Medicina(http://www.nlm.nih.gov/) es la mayor biblioteca de ciencias de la salud del mundo. La NLM forma parte de los Institutos Nacionales de Salud (NIH), un componente del Departamento de Salud y Servicios Humanos de los Estados Unidos. Los NIH son la principal agencia federal para realizar y apoyar la investigación médica básica, clínica y traslacional, e investigan las causas, los tratamientos y las curas de las enfermedades comunes y raras. Para más información sobre los NIH y sus programas, visite www.nih.gov.
Acerca de Collaborative Drug Discovery (CDD)
CDD alberga la plataforma en la nube para el descubrimiento de fármacos más utilizada en el mercado. "CDD Vault " es la base de datos segura y privada de carácter industrial que combina la informática tradicional de descubrimiento de fármacos (registro y SAR) con las capacidades de las redes sociales. "CDD Collaborate" permite la colaboración en tiempo real mediante el intercambio seguro de datos confidenciales seleccionados con investigadores externos. "CDD Public" tiene un contenido único. Para más información sobre CDD, visite www.collaborativedrug.com
Contacto de prensa de GSK:
REINO UNIDO: Janet Morgan Tel: + 44 (0) 20 8047 5502
EE.UU: Melinda Stubbee Tel: +1 919 483 2839
Contacto de prensa de EMBI-EBI:
Katrina Pavelin Tel: +44 (0) 1223 494 452
Oficial de divulgación científica del EMBL-EBI Correo electrónico: [email protected]
Contacto de prensa de la NLM:
Melanie Modlin Tel: +1 301 496 7771
Oficina de Comunicaciones y Enlace Público de la NLM Correo electrónico: [email protected]
CDD Contacto de prensa:
Barry Bunin, PhD Tel: +1 650 204 3084
Presidente y Director General de Collaborative Drug Discovery, Inc. Correo electrónico: [email protected]
