Nuevos datos sobre objetivos y moléculas de la tuberculosis disponibles para su uso en acceso público

2 de mayo de 2011

Nuestra colaboración con el SRI está dando lugar a nuevos conjuntos de datos públicos que aprovechan las pequeñas moléculas y los datos sobre la tuberculosis recogidos en CDD con la experiencia en bases de datos de vías. La Dra. Malabika Sarker ha completado la curación de los enlaces de los genes diana, las vías, las estructuras de las proteínas, las referencias y la información de esencialidad in vivo para todas las pistas y los fármacos para los que inicialmente teníamos información sobre la diana de la tuberculosis. Ahora tenemos enlaces a KEGG, TBDB, Pubmed, PDB, etc.

El protocolo de "pistas y objetivos" puede combinarse con el de "fármacos y objetivos" para obtener más de 700 moléculas, que pueden encontrarse en la lista de fármacos y pistas con objetivos para la tuberculosis

El conjunto de 314 "dianas esenciales in vivo" es quizás el primer conjunto de datos públicos en CDD que no incluye contenido de moléculas pequeñas. Sin embargo, proporciona por primera vez en un solo lugar enlaces de genes, vías y proteínas para todos ellos. Esta base de datos es la base de datos de objetivos de TB para los genes esenciales in vivo.

Estas deberían ser adiciones útiles a nuestras bases de datos de TB y podrían ser útiles para encontrar estructuras similares que puedan imitar las moléculas activas contra un objetivo particular.


Este blog está escrito por miembros de la comunidad de CDD Vault . CDD Vault es una plataforma informática de descubrimiento de fármacos alojada que gestiona de forma segura datos biológicos y químicos tanto privados como externos. Proporciona una funcionalidad básica que incluye el registro químico, la relación estructura-actividady el inventario químico, así como capacidades de cuaderno de laboratorio electrónico.

CDD Vault : La informática para el descubrimiento de fármacos que todo el equipo del proyecto adoptará.