Prof. Jonathan Baell de "PAINS" Filtros Fama de la Universidad de Monash

7 de octubre de 2013

"La gente está encontrando compuestos con un poco de actividad y publicando realmente éxitos de selección como si fueran auténticos candidatos optimizables. Y estas cosas pueden ser subversivas y pueden parecer reales, por lo que estas publicaciones están siendo aceptadas y, por desgracia, hay mucho ruido por ahí, mucha contaminación, y esta es una de las cosas que ciertamente nos esforzamos por hacer aquí es no publicar algo por publicar, sino publicarlo después de hacer optimizaciones que demuestren que son absolutamente reales."


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Profesor Jonathan Baell

El profesor Jonathan Baell, destacado químico medicinal australiano y becario de Larkins, se incorporó al Instituto Monash de Ciencias Farmacéuticas (MIPS) en 2012. Antes de su nombramiento en la Universidad, el profesor Baell trabajaba en el Instituto Walter y Eliza Hall, donde desempeñó un papel fundamental en la creación y dirección de un grupo de química medicinal de primera clase.

El Dr. Baell tiene una serie de intereses de investigación que incluyen el descubrimiento de nuevos compuestos antiparasitarios para el tratamiento de la malaria y las enfermedades olvidadas, el diseño y la síntesis de peptidomiméticos y el desarrollo de criterios de selección para el cribado de calidad de alto rendimiento.

Entrevistado por Barry Bunin, director general de Collaborative Drug Discovery, Inc.

Escuche el audio completo


Transcripción editada de la entrevista

 

Barry Bunin

Quería empezar con una pregunta más general porque la última vez que te vi fue en esta ICBS, reunión de la Sociedad Internacional de Biología Química en Kansas.

 

Jonathan Baell

Kansas, así es.

 

Barry Bunin

Pensé que alguien que lo viera desde Australia podría comentar con cierta imparcialidad los esfuerzos que se realizan en Estados Unidos, Europa y Asia. Tengo curiosidad por saber qué opinas sobre los avances en términos de esfuerzos globales para el descubrimiento de fármacos, el tipo de coordinación que se ha producido y cómo ha evolucionado desde tu punto de vista.

 

Jonathan Baell

Desde mi punto de vista, es un momento muy emocionante. Parece ser que la idea, iniciada hace unos años, de que las empresas farmacéuticas estaban reduciendo los descubrimientos internamente y que, por lo tanto, eso podría suponer una oportunidad para los institutos académicos, realmente parece ser el caso. Estoy seguro de que no hay ninguna universidad importante en todo el mundo que no esté discutiendo activamente o que no haya firmado ya algún tipo de asociación con la industria farmacéutica, y ese es ciertamente nuestro caso en la Universidad de Monash, el Instituto de Ciencias Farmacéuticas de Monash. Hemos firmado con Servier, una empresa farmacéutica francesa, y parece que tiene mucho sentido. Pueden ofrecer habilidades y recursos complementarios en el descubrimiento de fármacos, mientras que a menudo ven los institutos académicos como lugares atractivos en los que creen que los fondos del gobierno ya han apalancado una buena parte de la investigación, por lo que tal vez pueden tomar algunos riesgos con la inversión temprana en la biología temprana de lo que normalmente tendrían. Así que, definitivamente, eso ha resultado ser un desarrollo global, lo cual es muy bueno. Y creo que, en el mundo académico, todos nos beneficiamos de ello.

 

Barry Bunin

Chris Lipinski, de nuestro SAB, me presentó inicialmente a usted justo después de su influyente publicación en J. Med. Chem. sobre los filtros PAINS y luego hiciste un blog invitado, que ha sido uno de nuestros blogs invitados más leídos sobre el tema...

 

Jonathan Baell

Fantástico.

 

Barry Bunin...

...en lo que respecta a la moneda en nuestro campo con las patentes. Así que, por curiosidad, ¿cómo ha impactado ese documento en el campo y por qué ha tocado un nervio?

 

Jonathan Baell

Bueno, esa es una buena pregunta. Acabo de estar en el blog de invitados. En realidad, me divertí mucho haciéndolo y fue una oportunidad para entrar en algunos aspectos operativos prácticos de cómo se leen los filtros y cómo se interpretan. En el blog, hay opciones para hacer eso donde no había tal oportunidad de hacer con cualquiera de las publicaciones posteriores. Así que me complace saber que eso fue lo que más me gustó.

El documento PAINS... Bueno, ha tocado absolutamente un nervio y el momento fue justo. Fuimos uno de los primeros en iniciar nuestro seguimiento de HTS desde una Biblioteca Académica de HTS y eso fue en el Instituto Walter y Eliza Hall de Melbourne. Empezamos a crear la biblioteca en 2002 y creo que sólo había un par de institutos más en todo el mundo que estuvieran haciendo algo similar. Posiblemente ninguno lo hacía de la forma en que nosotros lo hacíamos. Sin embargo, después de años de campañas de HTS, seguíamos encontrando estos compuestos que no eran exactamente el mismo compuesto, pero que se parecían un poco y nunca llegaban a ninguna parte. Esto se relaciona, obviamente, con este artículo de PAINS, en el que finalmente dije: tiene que haber una manera de formular estos compuestos en una clase, una clase subestructural, que la gente pueda reconocer y se dé cuenta de que no es sólo un análogo en particular, sino que cualquier cosa que se asocie con una determinada clase es generalmente una mala noticia. Así que publicamos esto en 2010, y sospecho que debe haber sido el caso en todo el mundo que para entonces había docenas y docenas de laboratorios de HTS probablemente haciendo la detección y haberlo hecho durante un par de años y sólo golpeó un nervio. Creo que debieron ver estas cosas, estos círculos de compuestos de interferencia (o PAINS, como los llamamos) y fueron capaces de reconocer instantáneamente que: wow, estas son las cosas que han estado causando el problema. Así que, realmente tuvo una aceptación casi instantánea entre los académicos, posiblemente alimentada por el hecho de que había ex-farmacéuticos ahora en la academia que probablemente reconocieron algunos de estos pero no podían hablar mucho de ellos desde sus días de farmacéuticos. Sé que para Chris Lipinski fue un soplo de aire fresco, porque cada vez estaba más exasperado por algunos de estos éxitos de cribado de alto rendimiento que salían con verdaderas responsabilidades. Así que creo que probablemente por eso le tocó la fibra sensible.

 

Barry Bunin

Así que quiero hablar un poco sobre el CDD Vault , el software que hemos desarrollado. ¿Por qué se decidió por él para sus colaboraciones en Monash? ¿Qué le gusta de la tecnología, según lo que ha visto hasta ahora?

 

Jonathan Baell

Bueno, mira, hicimos esto antes en WEHI. Así que cuando buscamos un sistema de gestión de información de laboratorio LIMS, contratamos uno diferente, que era un competidor y probablemente no sea justo nombrar cuál es, así que me centraré específicamente en lo que nos gustó de CDD Vault . Cuando llegué a Monash, me di cuenta de que aquí había un entorno académico con químicos de computación, químicos que hacían compuestos, biólogos que hacían ensayos, y que realmente se necesitaba un sistema centralizado, un sistema de tipo LIMS, pero que pudiera pagarse con un presupuesto académico, y por eso hicimos lo apropiado. Recibimos un montón de demostraciones de varias opciones en la zona, y lo que me gustó de CDD, y a mis colegas les gustó, fue el servicio, el servicio y el apoyo amistosos, la paciencia en llevar a uno a través de la demostración inicial, pero también en realidad el hecho de que no se necesitaba mucha paciencia porque era tan fácil de usar, simplemente me gustó mucho la interfaz. Tengo que decir que no me ha decepcionado en absoluto. Incluso en algunas de las primeras versiones, hace un par de años quizás -hace más de un año-, las primeras funcionalidades que pensamos, vaya que sería bueno tener, han resultado ser el caso y están implementadas elegantemente en el CDD Vault hoy. Por lo tanto, está bastante claro que CDD es un equipo de desarrollo bastante activo que responde a los comentarios que hace la gente. Así que, tendría que decir que la interfaz amigable, la usabilidad, y nos gusta mucho los aspectos basados en la web. Así que tenemos colegas en la Universidad de Australia Occidental, que pueden entrar y ver los últimos datos, hacer un comentario. Acabamos duplicando los objetivos, los compuestos objetivo, y nos sentimos cómodos porque la seguridad es estricta. Así que diría que nos gusta mucho, y la asequibilidad en el entorno académico. Tendría que decir que probablemente eso lo resume.

 

Barry Bunin

Para preparar esta convocatoria, estuve mirando en su página web algunos de los proyectos que han mencionado, como el proyecto sobre el cáncer de la PI3-cinasa, el proyecto sobre el T. brucei, un proyecto sobre la malaria, y mi pregunta era conocer un poco esos interesantes proyectos de investigación en el contexto de cuáles se benefician ya de CDD Vault y qué otras colaboraciones podrían beneficiarse en el futuro, al tiempo que hablaba de la ciencia. Pensé que esos temas cubrirían una buena combinación natural de ciencia y tecnología.

 

Jonathan Baell

Sí. Bueno, si me conectara a la página CDD Vault ahora mismo, vería lo que está creciendo cada día con los proyectos. No estoy muy seguro de lo que estamos haciendo, pero parecía que había 20 proyectos diferentes la última vez que me conecté. Así que realmente se está extendiendo su uso. Curiosamente, el proyecto de PI3-cinasa que sería mi colega, el profesor asociado Phil Thompson. No creo que hayan subido el proyecto todavía en el CDD Vault . En realidad es un buen ejemplo de que a veces estas cosas toman un poco de tiempo en un entorno académico. No es necesariamente instantáneo donde todo el mundo carga sus datos de inmediato. Puede llevar un poco de tiempo cambiar la mentalidad a una forma de trabajo centralizada. El de T. brucei, por supuesto, es el mío y fue posiblemente el primer proyecto que empezamos a operar dentro de CDD Vault , así que ahora está lleno de cientos de compuestos que son activos contra T. brucei y nuestros colegas que hacen pruebas en Griffith en Queensland y otros estados, cargan hasta la fecha los datos biológicos desde su extremo, y hemos encontrado que funciona muy bien. Teníamos un sistema en el que teníamos un montón de hojas de Excel diferentes flotando por ahí y entonces los datos bilaterales cambiaban o había un punto de datos con el que alguien no estaba contento desde una perspectiva científica y entonces teníamos que asegurarnos de que la hoja maestra de Excel se actualizaba, etcétera, etcétera. Ahora eso no ocurre, así que creo que algunas personas están viendo eso, y las ventajas que tiene, y por eso estamos consiguiendo que estos proyectos se desarrollen cada vez mejor en el CDD Vault .

El T. brucei, bueno, supongo que, como probablemente sabes, es una enfermedad desatendida o es un parásito que causa una enfermedad desatendida, simplemente la enfermedad del sueño transmitida por la picadura de la mosca Tsetse. T-s-e-t-s-e, por interés, si miras la pronunciación en la web, da ambas como Tsetse y Tsetse, y no estamos muy seguros de cuál es la correcta. Yo sigo diciendo Tsetse, es mi origen inglés. Pero se trata de una enfermedad desatendida y hay mucho interés entre los organismos benéficos que tratan de encontrar una cura para esta enfermedad desatendida. Otra en la que estamos a punto de trabajar, y en la que ya hemos trabajado un poco en el pasado, es la enfermedad de Chagas, también causada por el tripanosoma. Estos proyectos son realmente agradables para los entornos académicos porque los estudiantes pueden hablar de ellos abiertamente. No hay problemas de propiedad intelectual asociados a ellos porque no hay un mercado real, por lo que los organismos de financiación -organizaciones benéficas como DNDi, que hacen progresar estos compuestos- no creen en las patentes. La malaria, todo el mundo la conoce. No es realmente una enfermedad olvidada. Es una de esas enfermedades que se ha beneficiado fantásticamente de la filantropía de la Fundación Bill y Melinda Gates. Realmente serán responsables, tal vez, de lo que esperamos sea la curación de una enfermedad, dentro de una década más o menos. Hay mucho interés en las vacunas, pero a nosotros nos interesan las moléculas pequeñas, y hemos descubierto una serie de moléculas pequeñas que son muy potentes contra el P. falciparum, el agente causante, y también tienen una fuerte actividad gametocitotóxica, que es de gran interés en este momento para quienes trabajan en la malaria. En el MIPS tenemos la suerte de contar con un grupo de ADMET llamado CDCO, dirigido por la profesora Sue Charman, que proporciona un acceso casi sin fisuras a algunas de las predicciones de AMDET y PK preliminares que se necesitan para que todo funcione. Esos son esos tres proyectos, pero hay muchos más.

 

Barry Bunin

Así que tal vez para la gente que no está tan familiarizada con el impacto de los principales descubrimientos científicos en Australia, (obviamente no los cubrirá todos, pero estoy familiarizado con algunos de los trabajos allí debido a mi experiencia en química combinatoria), como el trabajo pionero de Mario Geysen en Australia desarrollando los pines mimotópicos para las bibliotecas de péptidos para encontrar epítopos. A través de la comunidad de enfermedades olvidadas con la que estoy familiarizado, ha mencionado algunos de los trabajos que he conocido del trabajo de Ron Quinn con el Instituto Eskitis en la Universidad de Griffith y algunas de sus colaboraciones. Creo que la investigación sobre la malaria también tiene una larga trayectoria en Australia. Así que tengo curiosidad por saber cuáles son algunos de los descubrimientos más interesantes que se han producido a partir de su experiencia dentro de esa comunidad tan unida, y puede ser para las enfermedades desatendidas o para el descubrimiento de fármacos comerciales, para mostrar algunas de las cosas más interesantes que ha encontrado en su carrera allí en Australia.

 

Jonathan Baell

Vaya, pues veamos. Es una pregunta difícil sobre la marcha. Y si tuviera 24 horas para pensar en ello, probablemente podría hablar durante horas y horas. De buenas a primeras, está claro que has mencionado la malaria. La malaria, por alguna razón (y es difícil saber las razones exactas), la investigación sobre la malaria en Australia es realmente grande y muy exitosa y creo que es por una serie de razones en realidad. Hemos tenido actores clave en biología, ya sea Geoff McFadden, Leann Tilley u otros biólogos especializados en malaria. Así, los biólogos más destacados en diferentes áreas de la investigación sobre la malaria están haciendo constantemente avances en términos de cómo funciona básicamente el parásito de la malaria. Alan Cowman, por ejemplo, tiene un largo historial de avances científicos. Ha atraído a jóvenes científicos brillantes que han hecho carrera y han hecho descubrimientos innovadores. Usted sabe, los gustos de Justin Boddey y Jake Baum, que ahora han dejado para el Imperial College. Creo que esa es una de las razones, y la otra son los centros como el CDCO, con Sue Charman, que son realmente el motor de la PK para la MMV(Medicines for Malaria Venture), y eso es realmente lo que hay que hacer. Han participado directamente en los compuestos, concretamente en este compuesto de peróxido similar a la artemisinina que parece que va a llegar hasta el final. Y también tenemos el Instituto de Malaria del Ejército Australiano en el norte, con Mike Edstein, que trabaja con modelos animales y mucho más. Así que creo que toda la combinación funciona bastante bien.

Otros grandes avances son, obviamente, la vacuna contra el cáncer de cuello de útero, que surgió en Sídney y Nueva Gales del Sur y dio lugar a Gardasil, gracias a la colaboración de Ian Frazer. Volviendo atrás, no puedo dejar de mencionar Relenza y, con Peter Colman y Mark von Itzstein, a Graeme Laver, que descubrió los compuestos antigripales. ¿Qué más? Son numerosos, numerosos desarrollos a lo largo de los años. Lo que es interesante en Australia es que no hemos tenido el beneficio de un motor de investigación farmacéutica, por lo que la química medicinal no ha estado exactamente en la retaguardia, sino que tiende a haber estado menos en el centro de atención de lo que podría ser en los países donde hay una gran presencia farmacéutica. Pero esperamos que esto cambie y creo que donde estoy ahora en el MIPS, el Instituto Monash de Ciencias Farmacéuticas, se ha convertido en una especie de centro neurálgico de la química médica en Australia. Así que esperamos aprovechar los desarrollos antes mencionados en la industria farmacéutica que buscan lugares como nosotros para invertir y colaborar.

¿Ha mencionado otra área de descubrimiento, creo?

 

Barry Bunin

Lo mencioné porque conocía el trabajo de Mario Geysen sobre el análisis de epítopos...

 

Jonathan Baell

Sí, por supuesto, así es. En realidad es interesante hasta cierto punto muchos de los químicos más jóvenes que vienen por aquí generalmente se dan cuenta de su lugar en toda esta área. Incluso, de hecho, volviendo a Merrifield con la síntesis de péptidos en fase sólida. Mucha gente no se da cuenta necesariamente de los grandes descubrimientos que se produjeron en ese tipo de áreas. Los mimotopos siguen funcionando y son muy populares. No sé si la gente está familiarizada con estos aparatos de fase sólida, en los que cargas tus péptidos o tus orgánicos o muchas moléculas, en realidad.

 

Barry Bunin

Una de las cosas que ha mencionado sobre los análogos de la artemisinina ha captado mi interés, ya que ha habido mucho entusiasmo por la disponibilidad de la terapia combinada de artemisinina para la malaria. A lo largo de la historia, han surgido resistencias a diversas terapias, por lo que me gustaría saber, en cuanto a la trayectoria de la malaria, cuáles son las próximas cosas interesantes que se necesitan o que ya se están desarrollando, desde su punto de vista. ¿Qué es lo siguiente que podría llamar la atención de la gente cuando miremos hacia atrás dentro de una década?

 

Jonathan Baell

La malaria está siendo atacada en todos los frentes, así que, como químico medicinal, mi principal interés está en los tratamientos con pequeñas moléculas y uno se da cuenta de que hay algunos compuestos innovadores que tienen muy buena pinta. Por ejemplo, hay una espiralindalona que procede del cribado de una biblioteca de productos naturales. Creo que es el NITD, el Instituto Novartis para la Investigación de Enfermedades Tropicales, y creo que sólo examinaron unos 12.000 productos naturales. Consiguieron este producto natural, que es relativamente simple, y claramente hicieron una excelente medchem para conseguir este compuesto realmente potente, y ahora está progresando en la clínica y se ve realmente bien. Es uno de esos casos clásicos que tenemos con los microbios y los parásitos, los antibióticos, y hay un montón de cribado fenotípico interesante primero y se encuentra el objetivo después. Así es exactamente como se encontró este compuesto. Primero hicieron el cribado y luego retrocedieron para encontrar el objetivo, que creo que de memoria estaba involucrado en la síntesis de ATP, pero tendré que comprobarlo. Lo mismo ocurrió con la bedaquilina, un medicamento antituberculoso que se aprobó a finales del año pasado, cuando se descubrió que afectaba a la bomba de protones asociada a la ATP sintasa. J&J, Johnson & Johnson, ya en 1996, examinó 70.000 compuestos, dio con este compuesto que parecía dar con el organismo modelo de la tuberculosis y, para abreviar la historia, acabó con med-chem consiguiendo un compuesto, encontrando el objetivo, y ahora está aprobado para la tuberculosis multirresistente.

Así que creo que algunas de esas son las cosas más interesantes que están surgiendo y, de nuevo, este compuesto de tipo peróxido que realmente se ha desarrollado en una gran cantidad de biología mecanicista muy inteligente. Ya sabes, persiguiendo algo que muchos químicos medicinales, tal vez con la perspectiva farmacéutica tradicional, simplemente no se acercarían. Un peróxido, whoa, ¿quién progresaría con un peróxido? Bueno, si tienes una cierta hipótesis y un razonamiento de investigación detrás de ella, entonces uno debe estar abierto a perseguir tales cosas. Así que algunas de las últimas generaciones de ese compuesto están progresando y tienen muy buena pinta, y por supuesto, hay un potencial para la vacuna. No sé mucho sobre el área de las vacunas contra la malaria, pero está claro que es de gran interés para una especie de cura semipermanente, por lo que la Fundación Gates está investigando mucho al respecto. Y justo la semana pasada oí hablar de lo que puede haber sido una especie de avance en términos de encontrar un epítopo de unión apropiado para generar una vacuna. Hay toda un área de la genética, para modificar genéticamente los mosquitos para básicamente acabar con la transmisión de esa manera. Incluso una de las formas más efectivas es simplemente proporcionar mejores barreras físicas, simples redes para dormir. Así pues, hay casi todos los ángulos imaginables de ataque a la malaria y uno espera que uno de esos enfoques, o una combinación de ellos, dé resultado, posiblemente dentro de una década.

 

Barry Bunin

Gracias por las amplias reflexiones sobre la malaria. Quiero volver a tu propia investigación y pensar o compartir lo que ves en el futuro previsible y, en el mejor de los casos, si tu investigación va bien para tus colaboraciones a corto plazo, digamos de 6 a 12 meses o en un futuro muy previsible, cuáles serían las cosas interesantes que te gustaría ver desarrollarse, y luego pensando un poco más ampliamente, como de 5 a 10 años, y puede ser ciencia básica o ciencia aplicada. Comparta algunas de las cosas que le resultan interesantes y motivadoras, y otros pueden hacerlo también.

 

Jonathan Baell

Soy principalmente un académico, por lo que hay un constante burbujeo de diferentes proyectos que vienen a través de proyectos de estudiantes o proyectos financiados por subvenciones. Por eso, uno de los principales motores es conseguir esa POC. Si se trata de una publicación de calidad centrada en la química médica, conseguir esa publicación en J. Med. Chem. por ejemplo. Y lo que es mejor, si se colabora con la biología de vanguardia, se pueden conseguir artículos con un factor de impacto realmente alto. Ese es un motor definitivo para lo que hago, pero al ser un químico medicinal de corazón, soy necesariamente oportunista. Así que cualquier cosa que realmente parezca que podría estar asociada con algo de valor terapéutico, entonces miramos el camino de la progresión. ¿Cómo lo hacemos progresar? ¿Podemos, y si es así, patentarlo? Así que en el ámbito del cáncer, por ejemplo, incluso en el de la malaria, uno tendría un plan de patentes. Así que un par de proyectos, en este momento en el cáncer, en los que estamos buscando ese camino, presentando patentes, y luego la idea sería separarse de eso y progresar en un sentido de colaboración. Esto ha funcionado muy bien en el Instituto Walter y Eliza Hall durante la última década. Sólo llevo un año en el MIPS. Tuvimos un proyecto que partió de un éxito de cribado contra BCL2, BCL XLs, algunas dianas del cáncer, que fue muy bien y terminó con la concesión de licencias a Abbott y Genentech y que progresó extremadamente bien. Ahora está empezando a publicarse. Ese es el tipo de modelo que veo que podría funcionar aquí también.

Así que la combinación de artículos de calidad, y digo artículos de calidad, una de las cosas que me preocupan en todo el mundo está relacionada con estos PAINS. La gente está encontrando compuestos con un poco de actividad y publicando realmente éxitos de selección como si fueran auténticos candidatos optimizables. Y estas cosas pueden ser subversivas y pueden parecer reales, por lo que estas publicaciones están siendo aceptadas y, por desgracia, hay mucho ruido por ahí, mucha contaminación, y esta es una de las cosas que ciertamente nos esforzamos por hacer aquí es no publicar algo por publicar, sino publicarlo después de hacer optimizaciones que demuestren que estos son absolutamente reales. Así que ese sería nuestro modelo. Publicar, patentar, si algo parece realmente emocionante, patentar primero, luego quizás publicar dentro de los 18 meses de esa patente, y luego buscar la licencia. Ese es nuestro enfoque para obtener ese resultado, con las áreas de interés principal que son las enfermedades infecciosas y el cáncer.

Así que estamos empezando una serie de proyectos de investigación sobre la resistencia a los antibióticos con colegas de aquí. La otra gran cosa que queremos hacer es, a escala de Monash (Monash es grande, creo que tiene 50.000 estudiantes o algo así), desarrollar unas bibliotecas de compuestos internas adecuadas. A finales de este año esperamos tener 300 de nuestros compuestos almacenados en unas instalaciones de última generación en Queensland, llamadas Biblioteca de Compuestos de Queensland, con códigos de barras, con un sistema de eco que proporciona una muestra estrecha y acústica para el cribado en un formato listo para el ensayo. Ahora nos gustaría, de hecho, con la ayuda del softwareCDD Vault para ser honestos, expandir esta iniciativa, no sólo a mis compuestos en los 300 durante 12 meses de mi grupo, sino a cada grupo en Monash. Y realmente desarrollar nuestro propio tipo de HTS de cribado pequeño a través de la industria de descubrimiento / instalación internamente. Esa es probablemente una de las cosas más importantes que queremos hacer. Probablemente tardaremos al menos cinco años en conseguirlo a escala de Monash, posiblemente incluso diez. Pero eso sería una visión a gran escala que yo preveo.

 

Barry Bunin

Excelente. Así que, actualmente estamos en la fase de formación de la planificación de nuestra próxima reunión de usuarios y comunidad de CDD para el 4 de abril de 2014 para celebrar nuestro 10º aniversario. Es memorable y un poco divertido ya que fuimos fundados en el Día de los Inocentes por lo que es fácil de recordar, cuatro días después. Así que tenemos algunos oradores confirmados. Así que tenemos Chris Lipinski, tenemos Jerry Shipps que está trabajando con nosotros con esta colaboración de la Fundación Gates TBDA que involucra a siete grandes Pharmas trabajando con académicos y...

 

Jonathan Baell

Sí.

 

Barry Bunin

...y varios laboratorios gubernamentales también. Y luego tenemos a Bob Volkmann que es un ex científico de Pfizer que trabaja en dos biotecnologías utilizando dos bóvedas diferentes CDD , así como Ruo Steensma de Orphagen Pharmaceuticals y otros científicos bien conocidos. Así que estos son algunos de los tipos de personas de calidad que tenemos hablando. Supongo que mi pregunta es, mientras planificamos esto, ¿hay alguna persona o problema interesante que sería bueno para centrar la atención de la gente en lo que más importa, porque ahora estamos estableciendo la agenda y los temas. Por lo general, la gente da charlas e incluso estaba pensando que tal vez algunas personas podrían plantear los problemas de la comunidad como otra forma de darle la vuelta, pero sólo quería abrir las ideas mientras planificamos nuestra próxima reunión.

 

Jonathan Baell

En mi opinión, uno de los grandes problemas es uno de los que acabo de mencionar: la presión por publicar y la capacidad de publicar en el mundo académico y, de nuevo, el tratamiento de estos compuestos subversivos. Trato de difundir el mensaje de que un compuesto con un éxito de cribado, un éxito de cribado basado en la diana con actividad micromolar, si se trian esos conjuntos de éxitos basados en la actividad celular, es probable que se elijan también compuestos fuera de la diana. A menudo hay que llegar a una actividad de 500 nanomoles o a una unión específica a la diana inferior, para obtener una actividad celular significativa. Probablemente estoy entrando en detalles, pero este tipo de cuestiones generales es algo que creo que la comunidad en general todavía necesita. Cada vez hay más personas que se dedican al cribado, su número es abrumador, por lo que la difusión de ese tipo de conocimientos básicos sobre el descubrimiento de fármacos que la gente de la industria farmacéutica conoce bien será útil.

Veamos si puedo ampliar un poco los temas más importantes. Quiero decir que las cosas más importantes siguen siendo las asociaciones privadas, público-privadas y cómo están funcionando, y cuáles son los modelos, si tienen éxito, si hay problemas con la combinación del enfoque privado con el enfoque público en términos de las diferentes necesidades o si están funcionando realmente bien. ¿Depende del contexto, es decir, depende del proyecto? Depende de la cultura de la universidad o del socio farmacéutico. Me imagino que habrá variables.

La otra cosa que me interesa y de la que me gustaría saber más, porque es en Europa, por lo que no la mencionamos tanto en Australia, es el progreso de esta iniciativa IMI de la que probablemente hayas oído hablar. Sé que pusieron 500 millones para... oh, mejor te advierto, alguien está limpiando mis ventanas con una manguera de alta potencia. Así que me taparé el oído.

 

Barry Bunin

...cosas espontáneas como esta suelen aparecer en la grabación, saldrán en la transcripción del texto, lo cual es gracioso. Pero sí, el IMI que mencionabas, escuchar lo nuevo de algunos de los esfuerzos europeos, y acaba de haber grandes iniciativas de investigación de mapeo del cerebro anunciadas en los EE.UU. y en Europa también.

 

Jonathan Baell

Sí, sí, sí, exactamente. Así que tendré curiosidad por saber qué está pasando allí. Quiero decir una cosa que es de interés es esto, y Ron Quinn podría hablar potencialmente sobre esto también, él está haciendo este QCL, Queensland Compound Library. Se trata de una iniciativa a nivel australiano, en la que se está recorriendo las universidades y animando a todas las universidades a almacenar sus compuestos, que es de lo que hablaba antes, donde los compuestos de Monash se almacenan en la Biblioteca de Compuestos de Queensland, tratando de llegar a una base australiana para que sea una especie de biblioteca de cribado de Australia que es de libre acceso para todos. El modelo consiste en que las estructuras no se muestran, los biólogos acceden a esta biblioteca abierta al público para todas las bibliotecas universitarias, y si obtienen un resultado hablan con el bioquímico de QCL sobre cómo seguir adelante. No sé si tiene espacio en su programa, pero sería una charla interesante porque podría ser relevante para otros países, no sólo para Australia. Pero, me encantaría, si quisieras dejarme esa pregunta, me encantaría hacer una pequeña reflexión, Barry, y aportar otras ideas. Sólo estoy tratando de pensar en las cuestiones en un entorno de descubrimiento de drogas de la comunidad.

 

Barry Bunin

Creo que son buenas ideas y nos gustaría tener una buena diversidad de tipos de científicos, tipos de institutos y geografías representadas, así que eso ya me da que pensar. Ya he terminado con mis preguntas principales, pero me gustaría dejarles un espacio para sus últimas reflexiones. Por lo demás, me parece que esta es una muy buena entrevista en primer plano.

 

Jonathan Baell

Oh, bien. Muy bien, lo he disfrutado mucho y he cubierto prácticamente todo, este es un proceso espontáneo, así que habrá cosas en tus preguntas posteriores en las que pensaré "por qué no mencioné ese descubrimiento o por qué no mencioné esto". Pero estoy muy contento con la espontaneidad de la entrevista.

 

Barry Bunin

Eso es lo que lo hace divertido. Bueno, gracias por tu tiempo Jon haciendo esto a través del Océano Pacífico. Hablaré contigo más tarde.


Este blog está escrito por miembros de la comunidad de CDD Vault . CDD Vault es una plataforma informática de descubrimiento de fármacos alojada que gestiona de forma segura datos biológicos y químicos tanto privados como externos. Proporciona una funcionalidad básica que incluye el registro químico, la relación estructura-actividady el inventario químico, así como capacidades de cuaderno de laboratorio electrónico.

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