Acceso público

Como un servicio para la comunidad, CDD alberga datos de acceso público relevantes para el descubrimiento de fármacos de los principales grupos de investigación de todo el mundo.

Totalmente integrado con el CDD Vault, los usuarios tienen acceso completo a estos conjuntos directamente desde sus cuentas. Científicos sin CDD Vault Acceder a quienes deseen ver o extraer nuestro repositorio de datos de acceso público puede Regístrate para una cuenta gratis. Damos la bienvenida y alentamos contribuciones. Los científicos que deseen publicar en CDD Public Access deberían Contáctenos.

Depósito de compuestos EDASA COVID-19 disponible para colaboraciones

Publicado por: Andrea Altieri, PhD Moléculas: 2733

Publicado: 5 / 12 / 2020

EDASA Scientific, una pequeña organización de MedChem (http://www.edasascientific.com) está buscando socios biológicos en el área COVID-19. Con aproximadamente 2700 compuestos en stock, EDASA está dispuesta a proporcionar los compuestos de forma gratuita (el envío es responsabilidad del receptor) para las pruebas y, en caso de cualquier resultado positivo, listo para asignar un químico para optimizar los compuestos activos y avanzar más. EDASA está dispuesto a explorar la modificación in-silico de cualquiera de estos compuestos y sintetizar (sin cargo) un número limitado de los compuestos modificados como prueba de concepto. Todos los datos recibidos, o una parte de ellos, serán publicados en una presentación conjunta a revistas científicas con un IF> 3. Tenga en cuenta que todos estos compuestos son internos, propiedad de EDASA Scientific y hemos desarrollado un protocolo sintético validado para todos ellos.


Fragmentos activos COVID-19 Mpro

Publicado por: Alex Clark Moléculas: 1003

Publicado: 3 / 28 / 2020

Fragmentos encontrados como activos contra Mpro / COVID19 por la estructura de cristal disponible de Diamond Light Source, la instalación científica nacional de sincrotrón del Reino Unido en colaboración con Dectris (cuyos detectores se han utilizado en todos los experimentos de MX en Diamond). Para los datos originales, consulte: https://www.diamond.ac.uk/covid-19/for-scientists/Main-protease-structure-and-XChem/Downloads.html


Perlara ArkBase

Publicado por: Perlstein Lab Moléculas: 56756

PI: Ethan Perlstein

Publicado: 10 / 27 / 2019

Un corpus de datos de cribado fenotípico basado en organismos modelo de código abierto completo compuesto por cribados de reutilización de fármacos y descubrimiento de plomo en modelos de levadura, gusanos, moscas y células humanas de errores innatos del metabolismo, como la enfermedad lisosómica y los trastornos congénitos de la glucosilación. Estos datos han sido publicados en tres estudios de caso en las revistas G3 (Lao et al., 2019 https://www.g3journal.org/content / 9 / 2 / 413.long) y Modelos y mecanismos de enfermedades (Iyer et al., 2019a https://dmm.biologists.org/content / early / 2019 / 09 / 18 / dmm.040576.long; Iyer y col., 2019b https://dmm.biologists.org/content / early / 2019 / 10 / 19 / dmm.040584.long).


Actividad in vitro e in vivo del receptor de serotonina

Publicado por: Nichols Moléculas: 84

PI: Dave Nichols

Publicado: 10 / 14 / 2019

Los conjuntos de datos se centran en los sistemas cerebrales que utilizan dopamina o serotonina como neurotransmisor. Esto incluye sondas moleculares que tienen especificidad para solo uno de los cinco tipos generales de receptores de dopamina (D1 - D5), así como conjuntos de datos sobre serotonina 5-HT1A, 5-HT2A y 5-HT2C. Estos proyectos comprenden una modificación estructural sistemática, junto con un ensayo farmacológico, con el objetivo de identificar los determinantes estructurales del dominio de unión al ligando en estos receptores. Un tema de este trabajo ha sido identificar cómo las moléculas de diferentes clases químicas se pueden acomodar dentro del mismo sitio de unión al receptor.


ESCLEROSIS MÚLTIPLE: diferenciación OL

Publicado por: Myelin Repair Foundation Moléculas: 710

PI: Tassie Collins

Publicado: 10 / 21 / 2016

Ensayo de diferenciación aguda de oligodendrocitos Los OPC inmunopurificados O4 se colocaron en placas en 5k / pocillo. 1 h después del enchapado, se añadió el artículo de prueba y las células se incubaron durante cuatro días, después de lo cual las células se fijaron e inmunotintaron para MBP y núcleos totales (DAPI). La diferenciación de OPC en OL se determinó mediante la cuantificación de la tinción de MBP / número de células (identificado por tinción nuclear DAPI). La detección de compuestos se realizó por cuadruplicado a concentraciones de 2 (10 y 2 uM; 2 y 0.4 uM; 0.4 y 0.08 uM). Los datos se normalizan a DMSO (0% de diferenciación) y 40 ng / ml T3 (100% de diferenciación). EC50 se determina en relación con el EMax del artículo de prueba. Para detalles técnicos ver Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 419 o contacto [email protected] para protocolos detallados.


ESCLEROSIS MÚLTIPLE: Protección OL

Publicado por: Myelin Repair Foundation Moléculas: 723

PI: Tassie Collins

Publicado: 10 / 21 / 2016

Ensayo de protección de oligodendrocitos - Viabilidad (TNF + IFNg) Los OPC expandidos se colocaron en placas en 10K / pocillo. 24 horas después del enchapado, se añadió el artículo de prueba, 1hr después de la adición del artículo de prueba, se añadió insulto con 10U / ml IFN-gamma / 1ng / ml TNF-alfa. Incubar 2 días, agregar AlamarBlue e incubar cuatro horas. Cuantifique la fluorescencia de AlamarBlue para leer la viabilidad celular. Los datos se escalan a DMSO (0% de actividad) y 1.1 uM quetiapina (100% de actividad). Para detalles técnicos ver Rosler, et. , al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): contacto 444 [email protected] para protocolos detallados.


ESCLEROSIS MÚLTIPLE: Ensayo de mielinización

Publicado por: Myelin Repair Foundation Moléculas: 715

PI: Tassie Collins

Publicado: 10 / 21 / 2016

Ensayo de mielinización cortical Las células de la corteza cerebral E18 se prepararon y se colocaron en placas en medio Neuralbasal. Cuatro días después, los medios se cambiaron a MyM. El día 5, se agregan artículos de prueba y se permite que la mielinización continúe durante ocho días. El día 13 in vitro, las células se fijaron y se inmunotinizaron para MBP y Olig2. La mielinización se determinó mediante la cuantificación de la tinción de núcleos MBP / Olig2 + y el cambio de la morfología de MBP (alineación de la tinción contigua de MBP - longitud de la fibra). La diferenciación OL se determinó mediante la cuantificación de la densidad MBP x área / núcleo Olig2 +. Los compuestos se seleccionaron por duplicado con imágenes 4 / pocillo a concentraciones de 2 (5 & amp; 1 uM). Los datos se normalizan a DMSO (0% diferenciación / mielinización) y DAPT (100% diferenciación / mielinización). EC50s determinado en relación con la respuesta a 1 uM DAPT. Para detalles técnicos ver Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Neurosci. 2016 Apr 22; 17: 16 o contacto [email protected] para protocolos detallados.


ESCLEROSIS MÚLTIPLE: ensayo de protección con tunicamicina HEK293

Publicado por: Myelin Repair Foundation Moléculas: 740

PI: Tassie Collins

Publicado: 10 / 7 / 2016

Ensayo de protección HEK-293

Las células HEK-293 (10K / pocillo) se incuban durante horas 24, luego se agrega el artículo de prueba. Después de 1 hora, se agrega 100 ng / ml tunicamicina. Después de una incubación adicional de 48-hora, se agrega AlamarBlue y se cuantifica la fluorescencia 4 horas más tarde. Los datos se normalizan a DMSO (0% de actividad) y 5 uM guanabenz (100% de actividad). EC50 se determina en relación con el EMax del artículo de prueba. Contacto [email protected] para protocolos detallados.


ESCLEROSIS MÚLTIPLE: Detección de toxicidad OL

Publicado por: Myelin Repair Foundation Moléculas: 709

PI: Tassie Collins

Publicado: 10 / 7 / 2016

Ensayo de toxicidad de oligodendrocitos (TNF + IFNg)

Ensayo de toxicidad en OPC de ratas pasadas, en placa en 10k / pozo incubado con fármaco durante días 2. La lectura es la fluorescencia de AlamarBlue después de la incubación de 4 hr. Los datos se muestran como porcentaje de supervivencia en relación con DMSO (100%). La muerte máxima es con tunicamicina 5 ng / ml, que deja ~ 15% de células vivas. Para detalles técnicos ver Lariosa-Willingham, et., Al., BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 419 o contacto [email protected] para protocolos detallados.


Solventes verdes

Publicado por: Alex Clark Sandbox Moléculas: 117

Publicado: 9 / 20 / 2016

Datos de Green Solvents, utilizados por la aplicación móvil homónima (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Compilado de la información publicada por el ACS Green Chemical Institute y GSK Solvent Guide. Publicado en http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


PARASITOS: GSK Kineto Box impacta con pIC50

Publicado por: GSK Kineto Box Project (TCAKS) Moléculas: 592

PI: Pilar Manzano

Publicado: 6 / 16 / 2016

Utilizando ensayos fenotípicos de células enteras, el conjunto de diversidad de cribado de alto rendimiento GlaxoSmithKline (HTS) de 1.8 millones de compuestos se seleccionó contra los tres cinetoplastidos más relevantes para la enfermedad humana, es decir, Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi y Trypanosoma brucei. Se realizaron ensayos antiparasitarios intracelulares confirmatorios y ortogonales secundarios, y se determinó el potencial de citotoxicidad inespecífica. Los compuestos de impacto se agruparon químicamente y se evaluaron para obtener propiedades fisicoquímicas deseables. El hipotético espacio objetivo biológico cubierto por estos conjuntos de diversidad se investigó a través de metodologías bioinformáticas. En consecuencia, se ensamblaron tres cajas químicas anti-cinetoplásido de aproximadamente compuestos 200 cada una. Este conjunto de datos incluye compuestos de éxito y todos los resultados de detección asociados. http://www.nature.com/articles/srep08771


VENDEDOR: Biblioteca ASINEX PPI

Publicado por: ASINEX Moléculas: 8400

PI: Mark Parisi

Publicado: 3 / 3 / 2016

ASINEX ha estado trabajando en el diseño y síntesis de bibliotecas de interacción proteína-proteína (PPI) desde 2008. La última generación de la Biblioteca ASINEX PPI comprende moléculas de varios tamaños, marcos y formas que van desde entidades similares a fragmentos hasta derivados macrocíclicos diseñados como miméticos de estructura secundaria o miméticos de epítopos.


VENDEDOR: Biblioteca ASINEX Elite

Publicado por: ASINEX Moléculas: 12960

PI: Mark Parisi

Publicado: 3 / 3 / 2016

¿Qué problemas hay después del “golpe” inicial? Asinex ha abordado estos problemas con una amplia elaboración de perfiles ADME, un diseño óptimo para una fácil modificación de medchem y una evaluación de IP para garantizar la novedad.


VENDEDOR: Biblioteca Fenotípica ASINEX

Publicado por: ASINEX Moléculas: 9840

PI: Mark Parisi

Publicado: 3 / 3 / 2016

Asinex ejecuta ensayos basados ​​en objetivos y fenotípicos en casa y utiliza la información experimental que recopila para crear sus conjuntos de detección tanto basados ​​en objetivos como diversos. A través de esta experiencia, Asinex ha creado un conjunto de detección fenotípica; Los filtros para este conjunto son los siguientes:

MW: 200-450, clogP: -1.0 – 7.0, clogD (pH 7.4): - 5.0 – 4.0, Rot.Bond:0-10, HA: 1-10, HD: 1-5, TPSA: 15-X , N + O: 135-2, HAC: 10-19, Dipolo: 34 – 0.3, SHP3.30: 2 – 0.240.


VENDEDOR: Biblioteca de Diversidad ASINEX

Publicado por: ASINEX Moléculas: 9968

PI: Mark Parisi

Publicado: 3 / 3 / 2016

La diversidad continúa siendo una poderosa herramienta de detección, especialmente en la etapa inicial de "investigación" del descubrimiento de fármacos. Al crear este conjunto, Asinex ha aplicado herramientas computacionales para garantizar que el espacio químico esté correctamente representado al tiempo que incorpora elementos de sus conceptos "Elite" y "BioDesign".


VENDEDOR: ASINEX BioDesign

Publicado por: ASINEX Moléculas: 8041

PI: Mark Parisi

Publicado: 3 / 3 / 2016

El enfoque BioDesign de ASINEX incorpora características estructurales clave de productos naturales farmacológicamente relevantes conocidos (por ejemplo, alcaloides y otros metabolitos secundarios) en andamios de química médica sintéticamente factibles.


CATÁLOGO: Descubrimiento Distribuido de Drogas (D3) - IUPUI

Publicado por: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Moléculas: 73234

PI: MJ O'Donnell y WL Scott

Publicado: 2 / 24 / 2016

Un catálogo / biblioteca virtual de acceso abierto y gratuito de> moléculas 73,000: (a) N-Acil α-Aminoácidos no naturales, (b) Metil ésteres de N-Acyl A-Aminoácidos no naturales, y (c) Amidas primarias de N -Acil Aminoácidos no naturales. Las moléculas en el catálogo se obtuvieron mediante una enumeración basada en la alquilación combinatoria en fase sólida de un anión de glicina equivalente con 100 R1X seguido de N-acilación con 100 R2CO2H y escisión de resina (TFA, MeOH / Et3N o TFA, respectivamente). El conjunto de datos heredado de las moléculas 48,818 (por encima de los conjuntos ayb más las entradas R1X y R2CO2H) se publicó en 1 / 1 / 2009. Alentamos a los colegas a comunicarse con nosotros sobre el interés en el proyecto D3 (correo electrónico: [email protected] <Mailto:[email protected] > o [email protected] <Mailto:[email protected] >). Referencias: J. Comb. Chem 2009, 11, 3-13, 14-33, 34-43; J. Org. Chem 2014, 79, 3140-51; J. Chem. Educ. 2015, 92, 819-26.


MALARIA: Análisis bioquímico de 5 P. falciparum quinasas vs. TCAMS de GSK

Publicado por: Gregory J. Crowther Moléculas: 13451

PI: Gregory J. Crowther

Publicado: 2 / 3 / 2016

Los compuestos activos de células 13,500 se seleccionaron para determinar su actividad frente a cinco proteínas quinasas diferentes. Tres Cantos antimaláricos Set de GlaxoSmithKline (TCAMS) se proyectó en ensayos bioquímicos de Plasmodium falciparum dependientes de calcio proteínas quinasas 1 y 4 (CDPK1 / PF3D7_0217500 y CDPK4 / PF3D7_0717500), por mitógenos proteína quinasa asociada a 2 (MAPK2 / MAP2 / PF3D7_1113900), proteína quinasa 6 (PK6 / PF3D7_1337100) y la proteína quinasa 7 (PK7 / PF3D7_0213400). Se descubrieron nuevos inhibidores potentes (IC50 <1 µM) para tres de las quinasas: CDPK1, CDPK4 y PK6. Los inhibidores de PK6 son los más potentes descubiertos hasta ahora para esta enzima y merecen un mayor escrutinio.


Compuestos públicos de materia oscura

Publicado por: Dark Matter Compounds Molecules: 139352

PI: Guillermo Morales

Publicado: 12 / 7 / 2015

Novartis descubrió que 803,990 de sus compuestos se había probado en al menos los ensayos Novartis 100 y que los compuestos 112,872 estaban inactivos (% 14.0). Y un análisis de los datos de NIH mostró que los compuestos 363,598 habían sido probados en al menos ensayos 100 donde los compuestos 131,726 estaban inactivos (% 36.2).

Anne Mai Wassermann, Eugen Lounkine, Dominic Hoepfner, Gaelle Le Goff, Frederick J King, Christian Studer, John M Peltier, Melissa L Grippo, Vivian Prindle, Jianshi Tao, Ansgar Schuffenhauer, Iain M Wallace, Shanni Chen, Philipp Krastel, Amanda Cobos -Correa, Christian N Parker, John W Davies y Meir Glick. Materia química oscura como un punto de partida prometedor para el descubrimiento de plomo en los medicamentos. Nature Chemical Biology 2015, vol. 11, págs. 958 – 966 (doi: 10.1038 / nchembio.1936)


ADME: Datos públicos de AZ CHEMBL

Publicado por: AZ Public ChEMBL Data Molecules: 5799

PI: Sean Ekins

Publicado: 10 / 5 / 2015

Datos experimentales in vitro de DMPK y fisicoquímicos en un conjunto de compuestos divulgados públicamente determinados en AstraZeneca. Las referencias proporcionadas para los ensayos ejemplifican los procedimientos experimentales utilizados para generar los datos.

https://www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole guinea pig plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole dog plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole rat plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole mouse plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.Intrinsic clearance measured in human hepatocytes following incubation at 37C. Experimental range <3 to >150 microL/min/1E6 cells. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Bases: >= 2.Second most acidic pKa value (pKa A2) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Acids: <= 11.

Tercer valor de pKa más básico (pKa B3) determinado por absorción y valoración potenciométrica utilizando la metodología estándar de Sirius Analytical. Bases de rango experimental:> = 2.

Segundo valor de pKa más básico (pKa B2) determinado por absorción y valoración potenciométrica utilizando la metodología estándar de Sirius Analytical. Bases de rango experimental:> = 2.

El valor de pKa más ácido (pKa A1) determinado por absorción y valoración potenciométrica utilizando la metodología estándar de Sirius Analytical. Gama experimental Ácidos: <= 11.


Ligandos PDB

Publicado por: Protein Data Bank (PDB) Moléculas: 16826

PI: Dale R. Cameron, Ph.D., MCIC, P.Chem.

Publicado: 8 / 3 / 2015

La información del ligando se extrae del PDB, se filtra para eliminar el "polímero" y otros ligandos "no libres" relacionados, así como metales o ligandos de unión a metales. Las actualizaciones del procedimiento de filtrado pueden ocurrir sin previo aviso. Los datos se proporcionan tal cual sin curación adicional o corrección de errores. Los enlaces a PDB son proporcionados por el RCSB PBD y pueden citarse como

HM Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, TN Bhat, H. Weissig, IN Shindyalov, PE Bourne (2000) The Protein Data Bank Nucleic Acid Research, 28: 235-242.

Informe los enlaces rotos, las solicitudes de datos adicionales, etc. al administrador del almacén


EBOLA: inhibidores de molécula pequeña del virus Ébola

Publicado por: Moléculas Sandbox de Nadia: 55

PI: Dra. Nadia Litterman

Publicado: 2 / 2 / 2015

Este conjunto de datos compartido contiene pequeñas moléculas 55 de la literatura (hasta Jan 2015) que tienen actividad in vitro o in vivo contra el virus del Ébola y varios modelos de enfermedades. Hemos incluido una evaluación de un químico medicinal experimentado, así como los resultados del filtrado de DOLOR. (Este trabajo ha sido presentado para su publicación por Nadia Litterman, Christopher Lipinski y Sean Ekins a F1000Research).


VENDEDOR: Synthonix - Construyendo mejores enlaces

Publicado por: http://www.synthonix.com Moléculas: 10286

Publicado: 1 / 2 / 2015

Synthonix ayuda a los químicos medicinales a superar los límites del descubrimiento de fármacos al proporcionar un catálogo de bloques de construcción 10286 que les permite explorar un espacio químico más desafiante y expandir el rango de objetivos terapéuticos potencialmente significativos para tratar las enfermedades crónicas y curables del mundo. Synthonix, Inc: 919-875-9277; Correo electrónico general: [email protected] ; Synthonix Ltd (Oficina en Europa): Oficina: + 44 1223 597934; Email: [email protected]


SONDAS: sondas químicas NIH

Publicado por: Probes Vault Molecules: 319

PI: Christopher Lipinski

Publicado: 11 / 12 / 2014

Los Institutos Nacionales de Salud (NIH) han financiado grandes esfuerzos de HTS, estimados en más de $ 576 millones, tanto en centros académicos como intramurales para identificar sondas químicas de moléculas pequeñas o compuestos de herramientas a través de la Red de Centros de Detección de Bibliotecas Moleculares (MLSCN) y el Red de centros de producción de sondas de biblioteca molecular (MLPCN). Para los compuestos que se eligen como sondas, se han utilizado diversas definiciones, basadas en una combinación de potencia, selectividad, solubilidad y disponibilidad. Hasta la fecha, los centros de evaluación académica financiados por los NIH han descubierto más de sondas químicas 300. Esta colección incluye estructuras de sonda, objetivos, anti-objetivos, valores IC50 y otras referencias. También incluye una variedad de medidas de similitud de drogas, incluida la puntuación de conveniencia asignada por el Dr. Chris Lipinski como se describe en "Predicción computacional y validación de la evaluación de un experto de sondas químicas". Litterman NK, Lipinski CA, Bunin BA, Ekins S Modelo J Chem Inf. (2014)


VENDEDOR: Colección de bloques de construcción Azepine Ltd.

Publicado por: Azepine Ltd. Moléculas: 600

PI: Julia

Publicado: 10 / 8 / 2014

Bloques de construcción 600, EN STOCK a precios competitivos. Contacto [email protected]


NEU-CSIC-GSK quinasa dirigida HTS

Publicado por: Pollastri Lab - Northeastern University Molecules: 78

PI: Michael Pollastri

Publicado: 9 / 25 / 2014

Este conjunto de datos contiene los resultados publicados de una pantalla de alto rendimiento realizada a través de la colaboración entre la Universidad Northeastern (Laboratorio Pollastri), el CSIC (Laboratorio Navarro) y el Laboratorio GlaxoSmithKline Tres Cantos (Enfermedades del mundo en desarrollo DPU). El artículo es Díaz et al, PLoS-NTD:

DOI: 10.1371 / journal.pntd.0003253

Por favor contactar [email protected] con preguntas


VENDEDOR: Colección HTS de stock de laboratorio Vitas-M

Publicado por: Moléculas de laboratorio Vitas-M: 388375

Publicado: 7 / 11 / 2014

Laboratorio Vitas-M, LTD. La colección de compuestos HTS se trata de moléculas individuales 400 000, en stock. Todos ellos están disponibles para entrega rápida en diferentes formatos, incluidos mg, micromole, polvo seco, solución DMSO y película seca. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [email protected]


VENDEDOR: bloques de construcción de laboratorio Vitas-M

Publicado por: Moléculas de laboratorio Vitas-M: 33297

Publicado: 7 / 10 / 2014

Laboratorio Vitas-M, LTD. La colección de bloques de construcción orgánicos contiene más de 33 000 elementos identificados y probados. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [email protected]


VENDEDOR: Andamios de laboratorio Vitas-M

Publicado por: Moléculas de laboratorio Vitas-M: 2898

Publicado: 7 / 8 / 2014

Laboratorio Vitas-M, LTD. Colección de andamios (proyecto Azalea). Ideas avanzadas para sintetizar mini-bibliotecas similares a las drogas. Es la mejor opción para adquirir compuestos absolutamente novedosos que ningún otro proveedor ofrece. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [email protected]


VENDEDOR: Fragmentos de laboratorio Vitas-M

Publicado por: Moléculas de laboratorio Vitas-M: 18631

Publicado: 7 / 8 / 2014

Laboratorio Vitas-M, LTD. Colección de fragmentos (sustancias químicas que pasan a través de la "Regla de 3" y otros filtros especiales) para el descubrimiento de fármacos basados ​​en fragmentos. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [email protected]


VENDEDOR: Life Chemicals- GPCR library

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 15948

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

La búsqueda de similitud / farmacóforo se basó en la predicción de Topomer Search proporcionada por Sybyl-X. Primer paso: una búsqueda de similitud supuso una comparación de compuestos de stock completos con inhibidores conocidos derivados de BindingeDB y ChemblDB. Segundo paso: generación de estructuras 3D de inhibidores conocidos y su alineación conjunta. Este espacio espacial químico se utilizó como plantilla para el ajuste del resto de compuestos "similares". Sin embargo, este método fue diseñado para la "recolección de cerezas" y se puede hacer una biblioteca alternativa con métodos de detección virtuales (todos los modelos de detección listos y probados con conjuntos de entrenamiento) contra dichos receptores: adenosina, quimiocina, dopamina, gaba, histamina, muscarínico, opioide, esfingosina. http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Químicos de vida: quinasa por similitud

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 62467

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

Búsqueda de similitud utilizando claves públicas MDL y el corte de similitud de Tanimoto de 90%. Para la búsqueda de similitud se utilizaron casi compuestos de referencia 25K que se probaron activos en ensayos biológicos 168 (más de objetivos de quinasa diferentes de 100). Todos estos compuestos podrían ser seleccionados contra objetivos más específicos hasta el pedido del cliente. http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Life Chemicals- Kinase by docking

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 15174

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

La biblioteca de Kinase se preparó basándose en el acoplamiento virtual en un entorno Sybyl. Para este propósito, se alinearon y analizaron un conjunto de sitios de unión de estructuras de quinasas (aproximadamente 20). Dichos sitios superpuestos se usaron para el modelado de farmacóforos basados ​​en estructuras a través del módulo Unity de Sybyl-X. Después de toda la preparación, se seleccionó un stock completo de 3D contra este modelo de múltiples farmacóforos y al final se realizó una clasificación superior. http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Químicos de vida - Receptores nucleares

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 9896

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

Productos químicos de la vida. Atraque virtual y búsqueda de similitud / farmacóforo. http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Químicos de la vida- Biblioteca CNS

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 16535

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

Los filtros CNS que se describen en la literatura se utilizaron como un tamiz para todo nuestro stock. Como se mostró, los únicos compuestos con tales parámetros pueden tener características apropiadas para la permeabilidad del tejido nervioso. Todos los descriptores se obtuvieron de hojas de cálculo y módulos de Volsurf de Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP = <3.6 H-Bond Acceptores = <8 H-Bond Donors = <5 tPSA = <120 Bonos rotativos = <5 LogBB1 = -3.0 a 1.0) http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Life Chemicals- Biblioteca de productos naturales

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 7808

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

El primer método se basó en el análisis estadístico de descriptores. Anteriormente, se analizaba una gran base de datos de NP para estudiar los andamios de NP organizándolos en forma de árbol. Así, el análisis de la distribución de propiedades de más de 130 000 NP estructuras, así como la identificación de subestructuras típicas de clases particulares de compuestos naturales se llevaron a cabo para generar un conjunto de fragmentos generalmente presentes en compuestos naturales. Este método se probó en el Diccionario CRC de productos naturales (DNP) y moléculas sintéticas (SM). Otro método se basa en la evaluación de similitud de andamios. El número de firmas de átomos (de fragmnets) generadas para una molécula es igual al número de átomos que forman la molécula. Cada firma atómica representa independientemente una característica / fragmento estructural de la molécula, y se calcula una puntuación individual para ella. mayor número de átomos de obtener mayor puntuación. Para reproducir dicho experimento, utilizamos un kit de desarrollo de química de módulo implementado en CDK-Taverna 2.0. Contiene un marcador NP-Likeness v1.4.1 que calcula la similitud de una molécula con el Producto Natural (NP), es decir, la similitud de la molécula con el espacio estructural cubierto por productos naturales conocidos. Todos los resultados se puntuaron y variaron de -3 a + 3. http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Life Chemicals- Colección de cribado

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 371998

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

Pequeñas moléculas cuidadosamente diseñadas, novedosas, similares a las drogas, con la regla de Lipinski de 5 y la única razón para la desviación del conjunto de estos parámetros es un andamiaje único o una química no estándar. Está listo para la aplicación de filtros de química medicinal como DOLOR o cualquier filtro centrado en el objetivo (solubilidad, permeabilidad, BBB). http://www.lifechemicals.com/


VENDEDOR: Productos químicos de vida: fragmentos con solubilidad garantizada

Publicado por: Life Chemicals Molecules: 8241

PI: Alexandr Kucherak

Publicado: 6 / 20 / 2014

Los compuestos de fragmentos se seleccionaron filtrando todo el stock de LC con la "Regla de tres" modificada. Se ha probado la solubilidad de los fragmentos en laboratorio analítico. La solubilidad está garantizada a la concentración de 200mM en DMSO, y el 75% de los fragmentos son solubles en el tampón pH7.5 a la concentración de 1mM. http://www.lifechemicals.com/


TB: eficacia del ratón in vivo de la literatura

Publicado por: TB in-vivo data2 Moléculas: 778

PI: Sean Ekins, PhD

Publicado: 4 / 10 / 2014

Mirando hacia el futuro: prediciendo la eficacia in vivo de pequeñas moléculas frente a Mycobacterium tuberculosis. La selección y traducción in vitro de una enfermedad en moléculas con actividad in vivo en un modelo animal de la enfermedad es un desafío que requiere mucho tiempo y dinero. Demostramos el aprendizaje de compuestos activos e inactivos in vivo utilizando modelos de clasificación de aprendizaje automático (Bayesian, Support Vector Machines y partición recursiva) que consta de compuestos 773. El modelo bayesiano predijo 8 a partir de 11 activos in vivo adicionales no incluidos en el modelo como un conjunto de prueba externo. Por lo tanto, la conservación de setenta años de datos de Mtb puede proporcionar modelos computacionales estadísticamente robustos para enfocar los recursos en antituberculos de molécula pequeña activa in vivo. Esto destaca un predictor rentable para las pruebas in vivo en otras partes de otras enfermedades. PMID: 24665947


TB: datos para TB Mobile 2

Publicado por: TB Mobile 2.0 Actualizaciones Moléculas: 79

PI: Sean Ekins

Publicado: 3 / 19 / 2014

Compuestos 79 seleccionados de documentos recientes con uno o más objetivos en TB agregados a TB Mobile para la versión 2 de la aplicación. Se usaron moléculas adicionales 20 como un conjunto de prueba. Se presenta el trabajo.


PARÁSITO: pantalla de cuadro de malaria MMV de Schistosoma mansoni

Publicado por: CDIPD Vault Molecules: 400

Publicado: 11 / 6 / 2013

Cribado de organismos completos de Schistosoma mansoni somules (larvas posinfecciosas) y adultos con los compuestos 400 que comprenden el MMV Malaria Box (http://www.mmv.org/malariabox). Solo aquellos compuestos de la caja de la malaria 'similares a drogas' que producen los fenotipos más severos frente a los somules se probaron en adultos. Los datos también se cargan en ChEMBL. Póngase en contacto con Conor Caffrey, Centro de Descubrimiento e Innovación en Enfermedades Parasitarias (www.cdipd.org/), UCSF ([email protected] ).


Quinasa: actividad catalítica de la quinasa (publicación Theonie Anastassiadis en Nature Biotechnology)

Publicado por: Kinase Catalytic Activity Molecules: 178

PI: Theonie Anastassiadis

Publicado: 8 / 30 / 2013

Actividad catalítica de quinasa

Nature Biotechnology 2011 Octubre 30; 29 (11): 1039 – 1045. La biblioteca probada comprendía compuestos 178 que se sabe que inhiben las quinasas de todas las subfamilias de proteína quinasas principales. Por simplicidad, todos los compuestos se probaron a una concentración de 0.5 µM ​​en presencia de 10 µM ​​ATP. Se eligió 0.5 µM ​​a pesar de un IC50 reportado promedio para estos compuestos hacia sus objetivos primarios de 66 nM para capturar una actividad inhibidora más débil fuera del objetivo. Cada par de inhibidor de quinasa se probó por duplicado y los resultados se expresaron como un promedio de fosforilación del sustrato como porcentaje de las reacciones de control con solvente (en adelante denominadas "actividad quinasa restante"). Se presenta la actividad quinasa restante media para cada par de inhibidor de quinasa. Los datos de la actividad quinasa se expresaron como el porcentaje de actividad quinasa restante en las muestras de prueba en comparación con las reacciones del vehículo (dimetilsulfóxido).


TB: actualizar medicamentos y clientes potenciales con objetivos

Publicado por: TB: medicamentos y clientes potenciales con objetivos - actualizar Molecules: 38

Publicado: 6 / 14 / 2013

Compuestos publicados de la literatura reciente para TB con objetivos conocidos que se utilizarán como actualización también para la aplicación móvil TB

KINASE: GSK publicó el conjunto de inhibidores de quinasa (PKIS)

Publicado por: Kinome2 Moléculas: 364

Publicado: 6 / 6 / 2013

El Conjunto de inhibidores de quinasa publicados por GSK (PKIS) es un conjunto de inhibidores de la proteína quinasa 367, que se ha anotado para la actividad de la familia de la proteína quinasa y está disponible para esfuerzos de detección pública. Se puede encontrar información detallada sobre el conjunto de selección en los enlaces que se muestran a continuación. La base de datos ChEMBL ha sido el sitio de referencia para los datos de bioensayos en este conjunto. En el espíritu de mejorar el acceso a datos importantes, hemos reunido los datos PKIS que ChEMBL ha puesto a disposición amablemente, y los procesamos para que se pueda acceder aquí en el sitio Collaborative Drug Discovery (CDD) (al igual que lo hemos hecho anteriormente para el Base de datos Kinase SARfari).

La transferencia a CDD hace que los datos estén disponibles de una manera más amigable para los "químicos químicos". También hicimos algunos arreglos del conjunto de datos. Por ejemplo, en realidad solo hay compuestos 364 (algunos duplicados se debieron a formas de sal o nombres alternativos de la misma molécula). También intentamos normalizar los nombres de destino siempre que sea posible (por ejemplo, las quinasas IKKA, IKKB e IKKE se llamaron IKK-alpha, IKK-beta, IKK-epsilon para el conjunto de datos de UNC). No es que seamos perfectos ... ¡apreciamos cualquier corrección a nuestro conjunto de datos también!

Para resumir, hay compuestos 364 que se han probado contra objetivos 225 en 0.1 y 1 uM. En este conjunto de datos, solo hay un protocolo, pero los objetivos 225 se enumeran en una lectura. La concentración también es una lectura, por lo que es fácil limitar las búsquedas a pantallas que se ejecutan en 1 y / o 0.1 uM.

enlaces:

1) Más información sobre el GSK PKIS

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2) Datos de quinasa ChEMBL anteriores en CDD

https://www.collaborativedrug.com/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

CINASA: Compuestos quimblicosa SARfari y datos de bioensayo


Publicado por: CDD Vault Moléculas: 54211

PI: CDD

Publicado: 3 / 27 / 2013

Un recurso valioso disponible en ChEMBL es el Kinase SARfari, “un banco de trabajo de quimiogenómica integrado centrado en las quinasas. El sistema incorpora y vincula la secuencia de la quinasa, la estructura, los compuestos y los datos de detección ”. Un recurso muy útil, esta base de datos pone a disposición una gran cantidad de datos SAR para los compuestos activos de la quinasa contra una amplia gama de quinasas en una amplia gama de ensayos, gran parte extraída y curada manualmente de la literatura. Para hacer que estos datos estén disponibles en la interfaz CDD, tomamos la tabla central de Kinase SARfari y la fusionamos con otra tabla clave de la base de datos ChEMBL, proporcionando un campo que describe el ensayo utilizado en cada registro con mucho mayor detalle que el disponible en SARfari nativo. . Ahora hemos puesto a disposición este conjunto de datos combinado a través de la interfaz CDD. Los datos detallados in vitro están disponibles para 400 quinasas. Además, también se publican datos in vivo funcionales, así como ADMET.


TB: ARRA

Publicado por: TB ARRA Moléculas: 1924

PI: Bob Reynolds

Publicado: 3 / 15 / 2013

Datos del grupo SRI (Bob Reynolds) y Scott Franzblau - documento presentado por Ekins et al.

Los resultados de las pantallas SRI anteriores se usaron para buscar compuestos similares en bibliotecas de proveedores, agrupados y probados in vitro en una serie de paneles de pantallas aceptados para nuevos candidatos para el descubrimiento de fármacos. Los compuestos también se usaron como un conjunto de prueba para modelos bayesianos generados previamente construidos con información de bioactividad y citotoxicidad.


TB: GSK

Publicado por: TB GSK Moléculas: 177

PI: Sean Ekins, PhD

Publicado: 2 / 8 / 2013

Datos suplementarios del artículo de Ballell et al ChemMedChem 2013 en prensa "alimentando el descubrimiento de fármacos de código abierto: 177 de moléculas pequeñas conduce contra la tuberculosis"

Los conjuntos de datos originales están alojados en https://www.ebi.ac.uk/chemblntd, solo se muestran los datos de M.tb aquí, pero hay más datos de BCG disponibles en ChEMBL


TRIPANOSOMA: Compuestos de literatura sobre la enfermedad de Chagas

Publicado por: Chagas Public Data Molecules: 531

Publicado: 12 / 21 / 2012

Las estructuras compuestas y las referencias bibliográficas se curaron para las moléculas 531 probadas contra Trypanosoma cruzi in vitro o in vivo en la literatura publicada.


TRIPANOSOMA: Optimización de series químicas específicas contra la tripanosomiasis africana humana (HAT)

Publicado por: Chagas Public Data Molecules: 5559

Publicado: 12 / 12 / 2012

SCYNEXIS Inc, como miembro del Consorcio de optimización de plomo DNDi HAT, desarrolló y seleccionó compuestos 4926 para determinar su actividad contra T. brucei. Se incluyen estructuras compuestas y datos de actividad in vitro contra T. brucei brucei. Datos y actividad de citotoxicidad contra los parásitos eucariotas relacionados T. brucei rhodesiense, L. donavani y P. falciparum para un subconjunto de compuestos 34. Todas las series de compuestos informadas ya no están en desarrollo para HAT ya que se descubrió que tienen una selectividad pobre o propiedades incompatibles con la actividad in vivo. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRIPANOSOMA: DNDi-Optimización de series de fenarimol para el tratamiento de la enfermedad de Chagas

Publicado por: Chagas Public Data Molecules: 743

Publicado: 12 / 9 / 2012

El DNDi Lead Optimization Consortium, que incluye Epichem, Murdoch University y CDCO, desarrolló y analizó una serie SAR basada en el fungicida de plantas fenarimol. DNDi hizo estructuras compuestas públicas, datos de actividad de T. cruzi y datos de toxicidad de células L-6 para compuestos 743 de esta serie en ChEMBL-NTD. Los datos de compuestos y ensayos biológicos se incluyen aquí en CDD Public. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRIPANOSOMA: HTS primario amplio para identificar inhibidores de la replicación de T.Cruzi

Publicado por: Chagas Public Data Molecules: 303230

Publicado: 12 / 6 / 2012

El Broad Institute realizó un examen de alto rendimiento de compuestos 303,224 por duplicado en la cepa de Tulahuen recombinante de Trypanosoma cruzi que expresa de manera estable el reportero de beta-galactosidasa cocultivado con la célula huésped, fibroblastos de ratón NIH3T3. De los éxitos de 4,394, 4,063 se evaluó adicionalmente para la actividad inhibitoria y la toxicidad de la célula huésped. Finalmente, los compuestos 27 se seleccionaron como compuestos de sonda potenciales y se validaron adicionalmente. Los datos de la pantalla primaria y los ensayos secundarios posteriores se depositaron en PubChem. Los compuestos químicos y los datos de ensayos biológicos para el examen primario y seis ensayos secundarios de PubChem se incluyen aquí en CDD Public. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB: Guzman et al., M.tb. Inhibidores de la ligasa de MurE

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 8

PI: Sean Ekins

Publicado: 12 / 6 / 2012

Datos de detección basados ​​en células enteras y objetivos de la siguiente publicación de TB: Guzman JD, Gupta A, Evangelopoulos D, Basavannacharya C, Pabon LC, Plazas EA, Muñoz DR, Delgado WA, Cuca LE, Ribon W, Gibbons S, Bhakta S. J Antimicrob Chemother. 2010 Oct; 65 (10): 2101-7. Cribado antituberculoso de productos naturales de plantas colombianas: 3-metoxinordomesticina, un inhibidor de la MurE ligasa de Mycobacterium tuberculosis.


VENDEDOR: Colección NIH Clinical Collection 2 (moléculas 281)

Publicado por: NIH Clinical Collections Moléculas: 281

PI: Gerente de proyecto: Mei Steele

Publicado: 11 / 21 / 2012

Los NIH Clinical Collection 2 son matrices en placas 281 de pequeñas moléculas que tienen un historial de uso en ensayos clínicos en humanos. La colección fue reunida por los Institutos Nacionales de Salud (NIH) a través de la Iniciativa Hoja de Ruta de Bibliotecas Moleculares como parte de su misión para permitir el uso de pantallas compuestas en la investigación biomédica.


VENDEDOR: conjunto de NIH Clinical Collection (moléculas 446)

Publicado por: NIH Clinical Collections Moléculas: 446

PI: Gerente de proyecto: Mei Steele

Publicado: 11 / 21 / 2012

La Colección Clínica de NIH es un conjunto plateado de pequeñas moléculas 446 que tienen un historial de uso en ensayos clínicos en humanos. La colección fue reunida por los Institutos Nacionales de Salud (NIH) a través de la Iniciativa Hoja de Ruta de Bibliotecas Moleculares como parte de su misión para permitir el uso de pantallas compuestas en la investigación biomédica.


TB: medicamentos y clientes potenciales con objetivos: datos utilizados en la aplicación móvil

Publicado por: moléculas y objetivos SRI para aplicaciones móviles Moléculas: 707

Publicado: 10 / 23 / 2012

Datos actualizados seleccionados para objetivos de TB con esencialidad in vivo

información de TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB y Pubmed, así como

Otras referencias de Malabika Sarker en el Stanford Research Institute.

Gyanu Lamichhane en la Universidad Johns Hopkins proporcionó esencialidad

information.ref.http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Explore este conjunto de datos en dispositivos móviles: https://itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


TOX: Drogas y productos químicos clasificados por hepatotoxicidad

Publicado por: CDD Vault Moléculas: 83072

PI: CDD

Publicado: 7 / 16 / 2012

Pfizer (Hu 2008) ha preparado previamente una lista de medicamentos y productos químicos con un esquema de clasificación basado en datos clínicos de hepatotoxicidad para evaluar una tecnología de ensayo de imagen de hepatocitos humanos in vitro (HIAT), lo que resulta en una concordancia de 75% con hepatotoxicidad clínica Este mismo conjunto de datos de compuestos que causan o no daño hepático inducido por fármacos (DILI) se ha utilizado junto con descriptores moleculares para la predicción in silico a través de modelos bayesianos.


TB: Moléculas de SRI con actividad de células enteras contra la TB

Publicado por: SRI Group Vault Molecules: 23

PI: Sean Ekins, PhD

Publicado: 4 / 24 / 2012

Moléculas evaluadas en Pharm Res. 2012 Apr 4. PMID: 22477069

Combinando métodos de quiminformática y análisis de vías para identificar moléculas con actividad de células enteras contra Mycobacterium Tuberculosis.

Sarker M, Talcott C, Madrid P, Chopra S, Bunin BA, Lamichhane G, Freundlich JS, Ekins S.


MALARIA: MMV Malaria Box

Publicado por: Público: Malaria Box Molecules: 400

Publicado: 3 / 29 / 2012

Moléculas de MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (https://www.ebi.ac.uk/chemblntd): MMV Malaria Box, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows y Tim Wells. Medicamentos para la malaria Venture (MMV), PO Box 1826, 20, rte de Pré-Bois, 1215 Geneva 15, Suiza y SCYNEXIS Inc. PO Box 12878 Research Triangle Park, Carolina del Norte 27709-2878 USA.

Todos los compuestos en el Malaria Box han sido seleccionados in vitro contra 3D7 (cepa de P. falciparum sensible a la cloroquina (CQ) pero resistente a la sulfadoxina) y se realizaron ensayos de citotoxicidad en líneas celulares de riñón embrionario humano (HEK-293). Los datos se expresan como EC50 en nM para los datos de falciparum.


ADME: ADMEdata.com - Un repositorio comercial de datos ADME de alta calidad

Publicado por: G2 Research ADMEdata.com Moléculas: 1760

PI: George Grass

Publicado: 1 / 13 / 2012

Ejemplos de: permeabilidad Caco-2, valores de solubilidad de equilibrio @ 5pH, unión a proteínas humanas, ratas que se unen a proteínas, permeabilidad intestinal de conejo, particionamiento de plasma sanguíneo humano y hematocrito. Para conjuntos de datos completos y modelos, contacte directamente a George Glass, Pharm.D. Doctorado en [email protected] (distribuido a través de CDD)


VENDEDOR: Colección de bloques de construcción de Porse

Publicado por: CDD Vault Moléculas: 29241

PI: CDD

Publicado: 1 / 13 / 2012

Porse File Chemical Co. se dedica a la síntesis de compuestos novedosos personalizados para el descubrimiento de fármacos, y ofrece una amplia gama de productos con precios competitivos y buena calidad. El conjunto actual es un subconjunto seleccionado de nuevos compuestos diversos 1554 y bloques de construcción en las familias Morfolina, Piperidina, Piperazina, Pirimidina, aminoácidos y API. www.porsefinechemical.com, [email protected] +86-20-28069055


PARASITOS: Schistosoma mansoni schistosomula: Microsource Spectrum & Killer Collections

Publicado por: Moléculas Sandbox de Brian Suzuki: 119

Publicado: 10 / 5 / 2011


Schistosoma mansoni schistosomula: pantalla fenotípica de las colecciones de microsource Spectrum & Killer.

PI: Conor R. Caffrey

Publicado: 10 / 5 / 2011

CDD: hits de datos públicos 119

Como parte de una estrategia de reubicación de drogas (reubicación) para identificar nuevos antiparasitarios en el Centro Sandler para el Descubrimiento de Drogas de UCSF, desarrollamos una pantalla de organismo completo (fenotípico) parcialmente automatizada para el flujo sanguíneo que causa la enfermedad tropical infecciosa, esquistosomiasis Examinamos los compuestos 1,260 de las colecciones mencionadas anteriormente que incluyen medicamentos, compuestos similares a los medicamentos, productos naturales y compuestos misceláneos. Reportamos las alteraciones fenotípicas en estadios larvarios (esquistosomula) de Schistosoma mansoni usando descriptores simples para transmitir las respuestas múltiples y dinámicas del parásito al insulto compuesto. La cuantificación completa de las respuestas fenotípicas está en curso. Los datos presentados se refieren solo a los compuestos 'hit'; la lista completa de compuestos en las colecciones respectivas se puede obtener de Microsource Discovery Systems Inc. Contacto [email protected] para más detalles. Descubrimiento de fármacos para la esquistosomiasis: compuestos de impacto y plomo identificados en una biblioteca de fármacos conocidos mediante detección fenotípica de rendimiento medio. Abdulla MH, Ruelas DS, Wolff B, Snedecor J, Lim KC, Xu F, Renslo AR, Williams J, McKerrow JH, Caffrey CR. PLoS Negl Trop Dis. 2009 Jul 14; 3 (7): e478.PMID: 19597541


TB: pantalla fenotípica de la biblioteca de quinasa SRI

Publicado por: CDD Vault Moléculas: 23823

PI: CDD

Publicado: 8 / 29 / 2011

Se persiguen objetivos de quinasa en una variedad de enfermedades más allá de

cáncer, incluyendo inmunitario y metabólico, así como viral, parasitario,

fúngico y bacteriano. En particular, hay una relativamente reciente

interés en quinasa y objetivos de unión a ATP en Mycobacterium

tuberculosis para identificar inhibidores y posibles fármacos para

proteínas esenciales que no están dirigidas por los regímenes farmacológicos actuales.

Aquí, informamos los resultados de detección de alto rendimiento para un objetivo

biblioteca de aproximadamente compuestos 26,000 que se diseñó en base a los andamios de inhibidores de quinasas actuales y sitios de unión a quinasas conocidos. Los datos fenotípicos presentados aquí pueden formar la base para seleccionar andamios / compuestos para pruebas enzimáticas adicionales contra quinasa específica u otros objetivos de unión a ATP en Mycobacterium tuberculosis en función de la actividad aparente contra la bacteria completa in vitro. PMID: 21708485

Tuberculosis (Edinb). 2011 Jun 25. [Epub antes de imprimir]

Copyright © 2011 Elsevier Ltd. Todos los derechos reservados.

Contacte a Melinda Sosa para más detalles: [email protected]

Detección de alto rendimiento de una biblioteca basada en inhibidor de quinasa

andamios contra Mycobacterium tuberculosis H37Rv.

Reynolds RC, Ananthan S, Faaleolea E, Hobrath JV, Kwong CD, Maddox C, Rasmussen L, Sosa MI, Thammasuvimol E, White EL, Zhang W, Secrist JA 3rd.

Fuente: Instituto de Investigación del Sur, 2000 Ninth Avenue South,

Birmingham, AL 35205, Estados Unidos.


APROBADO POR LA FDA: NCGC Pharmaceutical Collection (NPC) V1.1.0

Publicado por: NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0 Moléculas: 14579

PI: Noel Southall

Publicado: 8 / 8 / 2011

La colección farmacéutica NCGC: un recurso integral de medicamentos clínicamente aprobados que permiten la reutilización y la genómica química. Huang, R., Southall, N., Wang, Y., Yasgar, A., Shinn, P., Jadhav, A., Nguyen, D., Austin, C. Sci Transl Med 27 April 2011: Vol. 3, número 80, pág. 80ps16.

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


VENDEDOR: Catálogo de BioBlocks con información sobre precios

Publicado por: BioBlocks Moléculas: 2971

PI: Doug Murphy

Publicado: 8 / 3 / 2011

Compuestos 2989.

BioBlocks ofrece una colección específica de andamios 2200, bloques de construcción y fragmentos precalificados como componentes de medicamentos. La mayoría de estos compuestos son ofrecidos exclusivamente por BioBlocks y han encontrado aplicaciones que van desde productos intermedios para el descubrimiento de fármacos hasta aminoácidos sustitutos en la química de péptidos.

Los detalles actualizados sobre los bloques de construcción BioBlocks están disponibles en www.bioblocks.com


TOX: datos de lesión hepática inducida por fármacos (DILI)

Publicado por: BBB Moléculas: 519

Publicado: 4 / 29 / 2011

Datos de lesión hepática inducida por fármacos: el conjunto de entrenamiento es datos experimentales de Jim Xu y el conjunto de prueba representa datos de la literatura.

publicado en Drug Metab Dispos. 2010 Dec; 38 (12): 2302-8. Epub 2010 Sep 15. Un modelo bayesiano predictivo basado en ligandos para la lesión hepática inducida por fármacos humanos.

Ekins S, Williams AJ, Xu JJ.

TB: base de datos objetivo para genes esenciales in vivo


Publicado por: SRI TB Target Database Moléculas: 314

PI: Sean Ekins

Publicado: 4 / 21 / 2011

Datos seleccionados para objetivos de TB con información de esencialidad in vivo de TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB y Pubmed, así como otras referencias recopiladas por el Dr. Malabika Sarker en el Stanford Research Institute. El Dr. Gyanu Lamichhane de la Universidad Johns Hopkins es amablemente reconocido por proporcionar información esencial.

** tenga en cuenta que no hay moléculas pequeñas asociadas con este conjunto de datos **


VENDEDOR: Biblioteca de proyecciones diversas de Enamine Representative

Publicado por: Enamine Molecules: 200000

PI: Dmytro Mykytenko

Publicado: 4 / 12 / 2011

La biblioteca de cribado diverso 200K original se generó especialmente para Collaborative Drug

Descubra usuarios del mayor stock del mundo de compuestos de cribado disponibles comercialmente

(sobre especies 1.7 M). La biblioteca presenta compuestos exclusivos similares a medicamentos con ADME refinado

propiedades. Nuestros compuestos de alta calidad pueden ser seleccionados y suministrados inmediatamente en

diferentes formatos


REPOSICIONAMIENTO, APROBADO POR LA FDA: Medicamentos reutilizados utilizando métodos HTS

Publicado por: Moléculas de reutilización in vitro: 109

Publicado: 3 / 18 / 2011

Medicamentos identificados con nuevos usos utilizando métodos HTS. Esta tabla amplía en gran medida una versión publicada anteriormente "Ekins S, Williams AJ, Krasowski MD, Freundlich JS. Reposicionamiento in silico de medicamentos aprobados para enfermedades raras y desatendidas Drug Discov Today. 2011 Mar 1. PMID: 21376136 doi: 10.1016 / j.drudis .2011.02.016 La tabla enumera moléculas, Uso / objetivo antiguo, uso / objetivo nuevo, cómo se descubrieron y referencias.

Abreviaturas: CCR5, receptor de quimiocina 5; DHFR, dihidrofolato reductasa; DOA, Drogas de abuso, FDA, Administración de Drogas y Alimentos; GLT1, transportador de glutamato 1; HSP-90, proteína de choque térmico 90; JHCCL, John Hopkins Clinical Compound Library; Mtb, Mycobacterium tuberculosis; NK-1, receptor de neuroquinina-1; OCTN2.


REPOSICIONAMIENTO, APROBADO POR LA FDA: Productos designados para huérfanos

Publicado por: Enfermedades raras reutilizando Moléculas: 76

Publicado: 3 / 18 / 2011

Tabla 2 de la FDA: del recurso de la FDA, la base de datos de investigación de enfermedades raras (RDRD), que enumera los productos designados para huérfanos (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) con al menos un marketing aprobación para una indicación de enfermedad rara. Estos datos fueron analizados por Ekins y Williams (documento presentado).


REPOSICIONAMIENTO, APROBADO POR LA FDA: Productos designados para huérfanos

Publicado por: Enfermedades raras reutilizando Moléculas: 105

Publicado: 3 / 18 / 2011

Tabla 1 de la FDA: del recurso de la FDA, la base de datos de investigación de enfermedades raras (RDRD), que enumera los productos designados para huérfanos (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) con al menos un marketing aprobación para una indicación de enfermedad común.

La FDA no asoció los datos con estructuras moleculares.


VENDEDOR: Biblioteca Piloto del Centro para el Descubrimiento de Drogas de Colorado

Publicado por: C2D2 Moléculas públicas: 2240

PI: Greg Miknis, Director Asociado

Publicado: 3 / 7 / 2011

La biblioteca contiene moléculas pequeñas estructuralmente diversas que se ajustan a criterios similares a los medicamentos. Se representan varios quimiotipos y la biblioteca está diseñada para ser aplicable a una amplia variedad de objetivos potenciales.

Para solicitar información sobre la colección, envíe una solicitud a [email protected]


LIPID: Base de datos de estructura de mapas de lípidos

Publicado por: Lípidos Mapas Base de datos Moléculas: 22215

PI: portal de lipidómica

Publicado: 2 / 11 / 2011

Las estructuras de los mapas de lípidos (http://www.lipidmaps.org/) se anotaron con iones comunes 5 (H +, 2H ++, K +, Na +, NH4 +) que incluyen acilos grasos de mamíferos, glicerolípidos, glicerofosfolípidos, esfingolípidos, lípidos esterol y lípidos prenol . Las estructuras y los iones se pueden buscar por estructura y MW para facilitar la identificación de nuevos lípidos.


TB: farmaco de Mycobacterium

Publicado por: metabolitos virtuales Moléculas: 274

Publicado: 11 / 5 / 2010

Conjunto de datos de medicamentos 274 (aprobado para uso humano en EE. UU. Y Europa) de una publicación de Kinnings et al., PLoS Computational Biology vol 6: e1000976 (2010)

Los medicamentos se cristalizaron con al menos una estructura en PDB. Este conjunto de datos se puede utilizar con los otros conjuntos de datos de detección de TB en CDD para determinar cuáles de estos medicamentos aprobados tienen actividad contra Mtb (de la literatura.

TB: inhibidores de Mtb no replicantes de la literatura


Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 26

PI: Sean Ekins

Publicado: 10 / 28 / 2010

Estructuras y datos de trabajos publicados:

Darby y Nathan J Antimicrob Chemother 2010: 65: 1424-1427

Bryk et al., Cell Host y Microbe 2008: 3: 137-145

Lin y col., Arch Biochem Biophys. 2010 501: 214-220

Lin et al., J Biol Chem 2008: 283: 34423-34431

de Cavalho y col .: J Med Chem 2009: 52: 5789-5792

Lin et al., Nature 2009: 461: 621-626


VENDEDOR: Colección de bloques de construcción de Astatech, Inc.

Publicado por: Astatech, Inc. Moléculas: 6140

Publicado: 10 / 15 / 2010

AstaTech, Inc. ofrece intermedios avanzados y novedosos para facilitar el proceso de descubrimiento de fármacos. Nuestra amplia selección incluye componentes básicos, aminas novedosas, aminas protegidas, aminoácidos no naturales, cetonas, aldehídos, heterociclos, anhídridos isatoicos, ácidos boroinc e intermedios quirales. Contacto [email protected] para pedir información


VENDEDOR: Catálogo Chemik 2010

Publicado por: CDD Vault Moléculas: 3889

PI: CDD

Publicado: 10 / 5 / 2010

Chemik ha ayudado exitosamente a compañías de descubrimiento de drogas como Wyeth en sus proyectos de fase temprana. Proporcionamos la materia prima y los intermedios clave desde gramos hasta toneladas múltiples para ellos. Con 10 años de experiencia en este campo, podemos ayudar a nuestros clientes a desarrollar un nuevo producto intermedio en las semanas 4-6 con precios competitivos, gran calidad y servicio continuo.


MALARIA: Aminoalcoholes de fenantreno y antraceno

Publicado por: CDD Vault Moléculas: 35

PI: CDD

Publicado: 9 / 21 / 2010

Datos antipalúdicos frente a P. berghei en ratones para hidrocloruros de aminoalcohol sustituido con halógeno N-di y monoalquilos sustituidos con antraceno y fenantreno. Veintisiete compuestos mostraron actividad (aumento en el tiempo medio de supervivencia> 6 días); ocho compuestos fueron curativos (días IMST> 60). La tabla incluye ID de PubMed para detalles y síntesis.


TB: Actividad BCG / MTB

Publicado por: Novartis: Moléculas de datos de TB: 283

PI: Srinivasa Rao

Publicado: 9 / 15 / 2010

Aerobic BCG Activty (MIC50) - Compuestos 274

Actividad aeróbica MTB (MIC50) - Compuestos 283

Actividad anaeróbica ATP de BCG (IC50) - compuestos 283

Actividad anaeróbica de ATP MTB (IC50) - compuestos 283

Citotoxicidad (CC50) - Palabras clave de los compuestos 223: Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, TB


MALARIA: JHU JHCCL Inhibición de Plasmodium falciparum

Publicado por: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Moléculas: 2693

Publicado: 6 / 4 / 2010

Porcentaje de inhibición de fármacos aprobados por 2663 en 10 microM

TB, MALARIA: predicciones bayesianas para golpes de malaria GSK


Publicado por: GSK Data Bayesian Models (Ekins, et al.) Moléculas: 13355

PI: Sean Ekins

Publicado: 5 / 28 / 2010

Predicciones para los golpes de malaria GSK (publicado por Gamo et al., Nature 465: 305-310 (2010)) utilizando los modelos bayesianos (publicado por Ekins et al., Mol BioSyst 6: 840-851 (2010)).

Los cortes para la actividad (modelo 220,000> 0.31, modelo 2,200> -1.37 se clasifican como activos en toda la pantalla de la celda).

MALARIA: Conjunto de datos de St. Jude Children's Research Hospital Whole Cell Malaria


Publicado por: St. Jude - Malaria / Tripanosoma Bioactivos Moléculas: 1524

PI: Kip Guy

Publicado: 5 / 26 / 2010

Datos suplementarios para Nature Artículo publicado por St. Jude CRH (Guiguemde, W, et al. Genética química de Plasmodium falciparum. Nature 465, 311-315 (20 May 2010)), incluidas las estructuras 1524 probadas en una pantalla primaria, con datos adicionales en ocho protocolos: análisis de Bland-Altman, propiedades calculadas de ADMET, análisis filogenético, análisis de sensibilidad, sinergia y enzimas, así como un análisis de fusión térmica.


MALARIA: Conjunto de datos Novartis GNF-Pf

Publicado por: Novartis Malaria Moléculas: 5695

Publicado: 5 / 21 / 2010

Las cepas de Plasmodium falciparum 3d7 (susceptibles a los medicamentos) y W2 (resistentes a la cloroquina, quinina, pirimetamina, cicloguanil y sulfadoxina), obtenidas de MR4, se analizaron en un ensayo de infección basado en eritrocitos para determinar la susceptibilidad a la inhibición de la proliferación mediante compuestos seleccionados


VENDEDOR: Novedoso conjunto de detección contra la malaria de ASINEX

Publicado por: ASINEX Moléculas: 1

PI: Mark Parisi

Publicado: 5 / 20 / 2010

CONJUNTO DE DATOS CONFIDENCIALES: 594 Nuevos compuestos de ASINEX. Consulte el archivo adjunto que desarrolla el diseño ASINEX.

PARA ACCEDER: Nuevos usuarios de CDD: su registro se pasará por un proceso de aprobación antes de que se otorgue acceso al conjunto de datos. Usuarios de CDD existentes: comuníquese con [email protected]


VENDEDOR: Subconjunto antipalúdico ASINEX Tres Cantos (GSK)

Publicado por: ASINEX Moléculas: 278

PI: Mark Parisi

Publicado: 5 / 20 / 2010

278 ASINEX activo contra la malaria que coincide con los datos GSK.

DISPONIBLE PARA EVALUACIÓN INMEDIATA. El conjunto de datos correspondiente es propiedad de ASINEX. Para obtener más información, comuníquese con Mark Parisi: Correo electrónico: [email protected]

Teléfono: 1-877-ASINEX1

Fax: 1-336-721-1618


MALARIA: Conjunto antipalúdico Tres Cantos (TCAMS)

Publicado por: GSK Moléculas de datos antipalúdicos: 13471

PI: Javier Gamo

Publicado: 5 / 19 / 2010

Cribado de aproximadamente 2 millones de compuestos en la biblioteca de cribado de GlaxoSmithKline identificados sobre inhibidores 13,500 de la proliferación de P. falciparum en eritrocitos humanos. El trabajo se llevó a cabo en el Campus de Desarrollo de Medicina Tres Cantos, GlaxoSmithKline, Severa Ochoa 2, 28760 Tres Cantos, España.

TB: Sacchettini et. Alabama. revisión - agentes antituberculosos adicionales

Publicado por: PK Moléculas: 18

Publicado: 2 / 5 / 2010

Agentes antituberculosos no aprobados de la Figura 1 en Sacchettini JC, Rubin EJ y Freundlich JS Drogas versus insectos: en busca del depredador persistente Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008).


TB: Tuberculosis Small Molecule Patent Data

Publicado por: TB Patent Data Molecules: 20775

PI: Descubrimiento Colaborativo de Drogas

Publicado: 1 / 27 / 2010

Estructuras e información sobre patentes relacionadas con la investigación de la tuberculosis de la Oficina de Patentes y Marcas de EE. UU., La Oficina Europea de Patentes y la Organización Mundial de la Propiedad Intelectual.


TB: Makarov et al., Consorcios NM4TB

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 32

PI: Sean Ekins

Publicado: 1 / 21 / 2010

Estructura los datos de relación de actividad para 1,3-benzotiazin-4-ones (BTZ). Datos obtenidos del artículo "Benzothiazinones Kill Mycobacterium tuberculosis by Blocking Arabinan Synthesis" publicado en Science por Makarov et al., 2009 y colegas del consorcio NM4TB (PMID: 19299584).


VENDEDOR: TimTec Diversity Set

Publicado por: TimTec Moléculas: 9998

PI: vendedor

Publicado: 1 / 5 / 2010

Biblioteca de cribado de compuestos similares a fármacos 10,000 diversos


VENDEDOR: TimTec OGT-Inhibitors Analogs SET

Publicado por: TimTec Moléculas: 334

PI: vendedor

Publicado: 1 / 5 / 2010

SET de análogos de inhibidores de la O-GlcNAc transferasa


VENDEDOR: TimTec ActiTarg-K, moduladores de quinasa

Publicado por: TimTec Moléculas: 6212

PI: vendedor

Publicado: 1 / 5 / 2010

ActiTarg-K, cuenta con compuestos 6,000 que proporcionan una biblioteca de detección de alto valor de moléculas similares a fármacos para identificar la dirección de síntesis de nuevos inhibidores de la proteína quinasa

VENDEDOR: Biblioteca de derivados de productos naturales de TimTec

Publicado por: TimTec Moléculas: 3001

PI: vendedor

Publicado: 1 / 5 / 2010

Derivados naturales NDL-3000 de TimTec


VENDEDOR: Biblioteca de productos naturales de TimTec

Publicado por: TimTec Moléculas: 479

PI: vendedor

Publicado: 1 / 5 / 2010

Productos naturales puros de NPL de TimTec


VENDEDOR: Biblioteca de cribado

Publicado por: AsisChem Moléculas: 43121

Publicado: 10 / 26 / 2009

Una colección de más de 40,000 compuestos de moléculas pequeñas similares a los medicamentos disponibles para su selección personalizada. Todos los compuestos están en stock hasta 25mg.


VENDEDOR: bloques de construcción

Publicado por: AsisChem Moléculas: 176

Publicado: 10 / 26 / 2009

Una colección de compuestos útiles en el descubrimiento de fármacos. Todos los compuestos, si no están en stock, están disponibles en unas pocas semanas para cantidades de hasta 10 gramos.


TB: TAACF - Biblioteca NIAID CB2

Publicado por: Instituto de Investigación del Sur Moléculas: 102634

PI: Robert Goldman

Publicado: 9 / 30 / 2009

Resultados de la exploración de una biblioteca de compuestos comercial (ChemBridge) para la capacidad de inhibir el crecimiento de la cepa de M. tuberculosis H37Rv. Ver PMID: 19758845


TB: inhibidores de EthR (Willand et al.)

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 5

PI: Sean Ekins

Publicado: 9 / 28 / 2009

Inhibidores similares a fármacos del represor transcripcional EthR. Moléculas y datos de Willand et al Nature Medicine 15: 537-544 (2009) PMID: 19412174


VENDEDOR, ADME: datos de referencia de un conjunto de medicamentos comerciales estructuralmente diversos.

Publicado por: NM4TB: Moléculas del sitio del Grupo Karlen: 24

PI: Anders Karlen

Publicado: 6 / 11 / 2009

Un análisis multivariado de drogas en el mercado sueco fue la base para la selección de un pequeño conjunto fisicoquímicamente diverso de compuestos de drogas 24. En la selección se consideraron factores como la diversidad estructural, la disponibilidad comercial, el precio y una técnica analítica adecuada para la cuantificación. La lipofilia, pKa, solubilidad y permeabilidad a través de monocapas de células Caco-2 humanas se midieron para el conjunto de datos compilados. Anticipamos que este conjunto de datos puede servir como un conjunto de referencia para la validación de nuevas técnicas experimentales o modelos in silico. También se puede utilizar como un conjunto de datos de partida diversos para el desarrollo de nuevos modelos computacionales.

Datos tomados de:

Presentación de un conjunto de datos de medicamentos estructuralmente diversos y comercialmente disponibles para estudios de correlación y evaluación comparativa.

Sköld C, Winiwarter S, Wernevik J, Bergström F, Engström L, Allen R, Box K, Comer J, Mole J, Hallberg A, Lennernäs H, Lundstedt T, Ungell AL, Karlén A.

J Med Chem. 2006 Nov 16; 49 (23): 6660-71.


TB: datos de absorción de la literatura publicada

Publicado por: CDD: Moléculas de literatura curada de tuberculosis: 24

Publicado: 5 / 28 / 2009

Datos de absorción de TB del artículo de referencia

Inhibición de la biosíntesis de sideróforos por análogos sustituidos con 2-triazol de 5'-O- [N- (salicil) sulfamoil] adenosina: nucleósidos antibacterianos eficaces contra Mycobacterium tuberculosis.

Gupte, A .; Boshoff, hola; Wilson, DJ; Neres, J .; Labello, NP; Somu, RV; Xing, C .; Barry, CE; Aldrich, CC

J Med Chem (2008) Vol 51, No 23, pp 7495-7507 Datos de permeabilidad.


TB: datos farmacocinéticos de literatura publicada

Publicado por: CDD: Moléculas de literatura curada de tuberculosis: 28

Publicado: 5 / 28 / 2009

Datos farmacocinéticos de TB de fuentes de literatura publicada. Datos SAR para 28 únicos, así como compuestos comunes.

Los datos incluyen citas de PubMed, objetivos, células y organismos probados, biodisponibilidad, Vm, Vd, Cmax, etc.


TB: datos de toxicidad de la literatura publicada

Publicado por: CDD: Moléculas de literatura curada de tuberculosis: 638

Publicado: 5 / 28 / 2009

Datos de toxicidad de TB de fuentes de literatura publicada. Datos SAR para 638 únicos, así como compuestos comunes de referencias de PubMed.

Los datos incluyen citas de PubMed, objetivos, testículos de células y organismos, viabilidad celular, LD50, CC50, MNTD, etc.


TB: datos de eficacia de la literatura publicada

Publicado por: CDD: Moléculas de literatura curada de tuberculosis: 6768

Publicado: 5 / 28 / 2009

Datos de eficacia de TB de fuentes de literatura publicada. Datos SAR para 6771 únicos, así como compuestos comunes de más de 300 PubMed referencias.

Los datos incluyen citas de PubMed, dianas, testículos de células y organismos, MIC,% de inhibición, EC50-EC100, IC50, etc.


TB: MLSMR

Publicado por: Instituto de Investigación del Sur Moléculas: 214507

PI: Robert Goldman

Publicado: 5 / 8 / 2009

Una colección diversa de más de 200,000 compuestos recolectados por el Repositorio de Moléculas Pequeñas de Bibliotecas Moleculares (MLSMR) se puso a disposición del Centro de Investigación de Bibliotecas Moleculares de Southern Research en Spring 2008 para pruebas primarias contra Mtb H37Rv. Los compuestos más activos de este cribado primario se seleccionaron y probaron a concentraciones de 10 tanto en un ensayo de respuesta de dosis contra H37Rv como en un cribado de citotoxicidad utilizando células vero.


MALARIA: Biblioteca de compuestos clínicos Johns Hopkins

Publicado por: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Moléculas: 1878

Publicado: 4 / 28 / 2009

Las drogas se seleccionaron a una concentración de 10 μM. Parásitos sincronizados en etapa anular de 3D7 sensibles a la cloroquina o Dd2 resistente a múltiples fármacos se cultivaron en medio RPMI 1640 con suero humano 10% y se incubaron para 48 o 96 h en presencia de fármaco y [3H] -hypoxanthine. Una placa de pocillo 96 con 0.2 mL de material de cultivo por pocillo a 0.2% de parasitemia y hematocrito 2-4%, proporciona una señal de incorporación radiactiva de aproximadamente 10,000 cpm a 48 hy 20,000 cpm a 96 h con recuentos de fondo inferiores a 500 cpm. Los experimentos de detección se realizaron por duplicado y el porcentaje de inhibición se informa como el promedio de dos experimentos.


TB: revisión de literatura

Publicado por: TB Literature Data Molecules: 49

PI: Ballel y col.

Publicado: 4 / 17 / 2009

Datos de SAR de tuberculosis compilados en una encuesta de agentes activos contra M. tuberculosis, incluidos aquellos con modos de acción conocidos y desconocidos (Ballel, et al. "Nuevos antimicobacterianos sintéticos de molécula pequeña" en agentes antimicrobianos y quimioterapia, junio 2005). 4 / 17 actualizado con TubercuList / TBDB / otros enlaces de destino y referencias mejoradas.


TB: Sacchettini et al., Revisión

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 14

PI: Sean Ekins

Publicado: 2 / 18 / 2009

Agentes antituberculosos de primera y segunda línea de las Tablas 1 y 2 en Sacchettini JC, Rubin EJ y Freundlich JS Drogas versus errores: en busca del depredador persistente Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008).


VENDEDOR: IUPUI - Datos públicos de descubrimiento distribuido de drogas (D3)

Publicado por: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Moléculas: 48818

PI: MJ O'Donnell y WL Scott

Publicado: 1 / 1 / 2009

Un catálogo virtual de acceso abierto de aminoácidos acilados no naturales y sus ésteres metílicos. Alentamos a nuestros colegas a comunicarse con nosotros sobre el interés en el proyecto Distributed Drug Discovery y la metodología sintética, que se describen en una serie de tres artículos en el Journal of Combinatorial Chemistry (en prensa).


VENDEDOR: bloques de construcción ASINEX

Publicado por: ASINEX Moléculas: 6745

PI: Mark Parisi

Publicado: 12 / 23 / 2008

Drogas como Building Blocks, si está considerando un programa de optimización de leads, nuestros Building Blocks pueden ser exactamente lo que está buscando.


PARASITOS: aromas

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 228

PI: Sean Ekins

Publicado: 12 / 21 / 2008

Datos de nombres de moléculas y estructuras para aromas de un libro de Roman Kaiser, "aromas significativos en todo el mundo" publicados por Wiley-VCH en 2006. El número de molécula se relaciona con su numeración en el libro.


TOX: toxcast

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 306

PI: Sean Ekins

Publicado: 12 / 18 / 2008

Biblioteca de compuestos de toxcast de la EPA (principalmente pesticidas) disponible en http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


TOX APROBADO POR LA FDA: Dosis diaria máxima recomendada

Publicado por: CDD - Sean Ekins Moléculas: 1215

PI: Sean Ekins

Publicado: 12 / 10 / 2008

Una base de datos de la FDA que contiene los valores máximos recomendados de dosis diaria para más de productos farmacéuticos 1200. El conjunto de datos representa algunas de las moléculas utilizadas en la siguiente publicación Matthews, EJ, et al., Current Drug Discovery Technologies, 1 (1): 61-76. (2004)


VENDEDOR: Tradiciones ayurvédicas frente a las necesidades actuales de salud y bienestar

Publicado por: Falguni Dasgupta: Moléculas de compilación de datos personales: 37

PI: Falguni Dasgupta

Publicado: 10 / 30 / 2008

El uso tradicional de las plantas medicinales indias y sus extractos se discute con referencia a las perspectivas modernas con el objetivo de encontrar puntos en común, reevaluar las afirmaciones y crear oportunidades en Salud y Bienestar de conformidad con los requisitos reglamentarios, así como encontrar nuevos fármacos "Leads". "


PARASITOS: Biblioteca de inhibidores de la cisteína proteasa Celera Sandler-UCSF

Publicado por: McKerrow Group Moléculas: 1860

PI: Jim McKerrow

Publicado: 10 / 23 / 2008

In vitro parásitos T. cruzi y T. brucei y cribados enzimáticos específicos.


APROBADO POR LA FDA: Medicamentos aprobados

Publicado por: Johns Hopkins Clinical Compound Library Moléculas: 2815

PI: David Sullivan

Publicado: 10 / 16 / 2008

Fármacos aprobados por la FDA con estructura molecular definida, incluidas las moléculas 763 de la referencia del escritorio del médico, 780 de DrugBank, 1151 en el Orange Book 2007 y 1007 de la lista de la FDA del Dr. Chris Lipinski


VENDEDOR: Biblioteca enfocada GPCR ASINEX

Publicado por: ASINEX Moléculas: 3502

PI: Mark Parisi

Publicado: 10 / 2 / 2008

Conjunto orientado a GPCR de alta calidad excepcionalmente farmacológico disponible a un precio reducido para la comunidad CDD. Esta biblioteca incorpora nuestra experiencia en química medicinal y nuestra capacidad para identificar fragmentos privilegiados de la literatura y reunirlos de una manera sin precedentes.


GPCR: PDSP Ki Database

Publicado por: PDSP Ki Moléculas de la base de datos: 20026

PI: Bryan Roth

Publicado: 9 / 16 / 2008

Sobre los valores de Ki de 47,000 frente a los objetivos 699 GPCR de la base de datos del Programa de detección de drogas psicoactivas (PDSP) de NIMH


VENDEDOR: Bibliotecas de Sinergia ASINEX

Publicado por: ASINEX Moléculas: 25008

PI: Mark Parisi

Publicado: 4 / 26 / 2008

ASINEX ha desarrollado una nueva biblioteca de alta diversidad rica en fármacos como fragmentos de farmacóforos. El diseño de la biblioteca se basa en dos formas de sinergia. El primero es la interrelación entre técnicas orientadas diversas y dirigidas, y el segundo involucra la convergencia de intermedios clave de múltiples pasos (pasos 6-9) para crear compuestos sofisticados. Consulte el PDF a continuación para obtener más detalles.


TOX: estructuras con datos públicos de perfiles de toxicidad conocidos

Publicado por: Estructuras con perfiles de toxicidad conocidos Moléculas: 135

PI: Sean Ekins, PhD

Publicado: 3 / 28 / 2008

Perfiles de toxicidad específica de tejidos de compuestos conocidos con referencias


INHIBIDORES PROMISCOSOS: Shoichet publicó inhibidores promiscuos

Publicado por: Shoichet publicó inhibidores promiscuos Moléculas: 111

PI: Brian Shoichet

Publicado: 3 / 26 / 2008

Agregados que crean "falsos positivos" por autoasociación de moléculas orgánicas en soluciones acuosas


TOX: UC Davis - Datos públicos de la hamaca

Publicado por: UC Davis - Moléculas de hamaca: 714

PI: hamaca de Bruce

Publicado: 3 / 17 / 2008

Inhibidores de epóxido hidrolasas solubles (sEH): estas enzimas tienen funciones principales de 3: desintoxicación, catabolismo y regulación de las moléculas de señalización.


MALARIA, TRIPANOSOMA: St. Jude Public Data

Publicado por: St. Jude - Malaria / Tripanosoma Bioactivos Moléculas: 2426

PI: Kip Guy

Publicado: 3 / 5 / 2008

Resultados de acceso abierto del laboratorio de Kip Guy en el Hospital de Investigación Infantil St. Jude, incluido HTS de bioactivos contra la malaria y T. brucei


MALARIA: Datos públicos de Drexel

Publicado por: Drexel University Moléculas: 195

PI: Jean-Claude Bradley

Publicado: 3 / 2 / 2008

Resultados de una colaboración continua de datos abiertos entre

Drexel (productos Ugi-4CC) y UCSF (detección antipalúdica). Este conjunto de datos representa un ejemplo de cómo los investigadores pueden elegir publicar los resultados seleccionados abiertamente. (Por defecto, en contraste, todos los grupos son privados).


MALARIA: Encuesta del Ejército de EE. UU.

Publicado por: US Army Malaria Literature Survey Moléculas: 12318

Publicado: 2 / 29 / 2008

Una extensa colección de datos SAR de medicamentos antipalúdicos animales, que incluyen estructuras químicas, datos de bioactividad, datos farmacológicos y datos de toxicidad (publicado originalmente por el Ejército de EE. UU. En 1946 como "Una encuesta de medicamentos contra la malaria")


MALARIA: PlasmoDB

Publicado por: UPenn - Malaria Literature Data Molecules: 120

PI: David Roos

Publicado: 2 / 19 / 2008

PlasmoDB de inhibidores de la malaria compilados de la literatura, incluida la estructura química, el identificador del gen PlasmoDB, el nombre del gen objetivo y las referencias contra P. falciparum, P. vivax, P. berghei, P. yoelii, P. chabaudi, P. vinckei petteri


MALARIA: Productos Naturales (NPPDB)

Publicado por: Centro Nacional de Moléculas de Investigación de Productos Naturales: 426

PI: Babu Tekwani

Publicado: 2 / 15 / 2008

Base de datos antipalúdicos de productos naturales de flavona, incluidos datos antipalúdicos y de citotoxicidad (Universidad de Mississippi, Centro Nacional de Investigación de Productos Naturales)


TB: resultados del ensayo TAACF

Publicado por: TB Early Phase Drug Discovery Program Moléculas: 812

PI: Bernard Munos

Publicado: 2 / 12 / 2008

Actividad antibacteriana de una biblioteca disponible públicamente de compuestos 812 contra Mycobacterium tuberculosis (H37Rv) en el ensayo de células enteras Azul Alamar


APROBADO POR LA FDA: Medicamentos huérfanos

Publicado por: Drogas conocidas Moléculas: 1721

PI: Christopher Lipinski

Publicado: 10 / 26 / 2007

Medicamentos aprobados por la FDA con indicaciones designadas, nombre del patrocinador y estructuras químicas (cuando estén disponibles)