El programa de cribado de fármacos psicoactivos del NIMH y Collaborative Drug Discovery proporcionan una base de datos de relación estructura-actividad de los GPCR con búsqueda química a toda la comunidad de descubrimiento de fármacos

15 de octubre de 2008

Collaborative Drug Discovery, Inc. (CDD), en colaboración con el Programa de Detección de Fármacos Psicoactivos (PDSP) del NIMH, dirigido por el Dr. Bryan L. Roth en la Universidad de Carolina del Norte Chapel Hill, ha anunciado hoy que el software basado en la web CDDalberga ahora la mayor base de datos de Ki de subestructuras químicas y similitudes de acceso abierto de receptores acoplados a proteínas G (GPCR). La base de datos PDSP Ki de 47.312 constantes de disociación de equilibrio de inhibidores (valores Ki) para 699 objetivos de receptores está ahora disponible como base de datos de búsqueda de estructuras en el sistema de información de investigación colaborativa CDD Web 2.0.

La base de datos Ki del PDSP es un recurso único de dominio público que proporciona información sobre la capacidad de los fármacos para interactuar con un número cada vez mayor de dianas moleculares. La base de datos Ki sirve como almacén de datos para los valores Ki, o afinidad, publicados y derivados internamente para un gran número de fármacos y candidatos a fármacos en un número creciente de receptores acoplados a proteínas G, canales iónicos, transportadores y enzimas.

"El sitio web de la base de datos PDSP Ki, alojado en el Centro Médico de la Universidad de Carolina del Norte, recibió cerca de un millón de visitas en el último año", dijo el Dr. Bryan Roth, director del proyecto PDSP y profesor de farmacología. Estos datos están ahora disponibles con búsqueda de estructuras químicas en el sistema CDD para que todo el mundo pueda verlos". Añade el Dr. Roth: "La base de datos CDD es una plataforma extremadamente elegante. La recomiendo encarecidamente a cualquiera que genere datos de descubrimiento de fármacos".

"Es un privilegio trabajar con el Dr. Bryan Roth para proporcionar acceso abierto a los datos del PDSP Ki a través de la plataforma CDD ", dijo el Dr. Barry Bunin, Presidente de Collaborative Drug Discovery. "CDD proporciona los datos del PDSP Ki en una base de datos tradicional extraíble de estructura/SAR combinada con capacidades de integración de datos públicos y privados de colaboración novedosas para el mundo. Dado que el ~40% de todos los fármacos de moléculas pequeñas actúan sobre las dianas de los GPCR, esto ayudará a la comunidad investigadora a desarrollar nuevos fármacos y a predecir mejor los posibles efectos secundarios relacionados con las dianas y las probables interferencias entre fármacos."

La base de datos PDSP Ki se une a otras 12 fuentes de datos disponibles públicamente en el sistema CDD con datos químicos y biológicos de más de 40.000 compuestos, entre ellos:

  • 1.700 medicamentos aprobados por la FDA con indicaciones y patrocinadores
  • Más de 15.000 compuestos con datos de ensayos de malaria procedentes de 5 fuentes de datos públicas
  • Más de 850 compuestos con información sobre la actividad antibacteriana de la tuberculosis
  • Un conjunto de datos de casi 3.500 productos naturales y derivados
  • Más de 25.000 compuestos disponibles para la compra

Acerca del programa de detección de drogas psicoactivas del NIMH

El Programa de detección de drogas psicoactivas del NIMH (PDSP) - http://pdsp.med.unc.edu - proporciona la detección de nuevos compuestos psicoactivos para la actividad farmacológica y funcional en los receptores, canales y transportadores del SNC humanos o de roedores clonados como contratista del Instituto Nacional de Salud Mental (NIMH). El cribado de compuestos se proporciona a investigadores académicos cualificados sin coste alguno, utilizando ensayos para un gran número de ADNc clonados de humanos o roedores para receptores, canales y transportadores del SNC, así como ensayos funcionales para determinar los efectos sobre los sistemas de segundos mensajeros, la actividad de los canales y la función de los transportadores. Los valores Ki se calculan y se registran en la base de datos del PDSP. Los receptores clonados también están disponibles sin coste alguno para los investigadores cualificados. Para ver una lista de los receptores/transportadores actuales, visite http://pdsp.med.unc.edu/pdspw/clones.php.

Para más información, póngase en contacto con

Barry Bunin, PhD
Presidente y Director General
Collaborative Drug Discovery (CDD)
1818 Gilbreth Road, Suite 220
Burlingame, CA 94010
Teléfono: 650-204-3084
[email protected]

Bryan Roth, M.D., Ph.D.
Universidad de Carolina del Norte Chapel Hill
Departamento de Farmacología Facultad de Medicina
CB 7365, 8032 Burnett-Womack Building
Chapel Hill, NC 27599
Teléfono: 919-966-7535
Fax: 919-843-5788
[email protected]