Collaborative Drug Discovery annonce une nouvelle subvention du NIH pour développer des espaces de travail en nuage pour la découverte de médicaments

Burlingame, Californie - 5 décembre 2022 - Collaborative Drug Discovery a reçu une subvention de 1 709 776 $ du National Center for Advancing Translational Sciences, qui fournit CDD Vault pour le développement d'espaces de travail en nuage pour la découverte de médicaments.

Collaborative Drug Discovery, Inc. (CDD) propose de développer des espaces de travail en nuage pour la découverte de médicaments - un nouveau cadre informatique qui permettra aux scientifiques engagés dans la découverte et la traduction de médicaments d'intégrer sans effort, de manière robuste et sécurisée, des bases de données disparates et des outils de calcul distribués par de multiples systèmes et fournisseurs dans des flux de travail de calcul hautement efficaces et personnalisés. Notre technologie innovante résoudra un problème critique qui entrave les efforts de découverte et de traduction de médicaments : les scientifiques de ce domaine doivent généralement combiner des données chimiques et biologiques provenant de plusieurs sources, les faire passer par plusieurs logiciels spécialisés dans différents types d'analyses et de visualisation, puis idéalement stocker les résultats des analyses avec les données expérimentales sous-jacentes. Aujourd'hui, ce type d'intégration est difficile et coûteux à réaliser et généralement fragile, ce qui crée un obstacle important pour (i) exploiter le nombre rapidement croissant de dépôts de données de haute qualité accessibles au public et (ii) évaluer de nouveaux outils et stratégies analytiques prometteurs. Les plates-formes monolithiques proposent de résoudre ce problème en rassemblant tout sous un même toit, mais elles sont extrêmement coûteuses et limitent la flexibilité : aucune plate-forme unique ne peut offrir toutes les capacités. L'approche altermondialiste, qui consiste à rassembler des ressources distinctes, a évolué à l'époque de l'informatique de bureau et ne s'adapte pas bien aux flux de travail modernes basés sur le cloud computing, en particulier aux défis que représente l'exécution d'opérations de calcul intensif nécessitant la combinaison de grands ensembles de données répartis sur des systèmes distants. Les espaces de travail en nuage (CW) visent à combiner les forces et à éviter les faiblesses de ces deux extrêmes. CW permettra essentiellement aux utilisateurs de créer facilement leurs propres solutions personnalisées hébergées dans le nuage, adaptées à leurs exigences et à leurs flux de travail uniques. Notre approche offre les performances, la robustesse et la facilité d'utilisation d'une solution logicielle monolithique, mais sans la rigidité et le verrouillage des fournisseurs qui y sont associés. Elle offre la flexibilité et l'ouverture de la combinaison de ressources discrètes, mais sans les défis d'intégration et la fragilité qui y sont associés, et elle fait progresser l'approche de pipelining pour embrasser les modèles basés sur le cloud et pour englober les ressources de données distribuées sans compromettre la performance ou la sécurité. Dans la phase 1, nous avons prouvé que nous pouvions synchroniser de manière robuste et efficace les données biologiques et chimiques (en transférant uniquement les données nouvelles ou modifiées tout en conservant l'association correcte des identifiants chimiques) entre l'environnement du conteneur CW et les bases de données distantes, ce qui était une condition préalable difficile mais essentielle pour notre concept. Au cours de la phase 2, nous achèverons le développement de CW et démontrerons son efficacité dans de multiples applications réelles avec des partenaires d'applications logicielles et des utilisateurs finaux de clients bêta. Le marché pour cette technologie va des universitaires aux grandes entreprises pharmaceutiques en passant par les petites et moyennes entreprises.