La base de données publique deCDDest une ressource précieuse.

CDD Public offre aux utilisateurs de CDD Vault l'accès à plus de 100 ensembles de données bien structurés qui peuvent être facilement exploités et analysés en conjonction avec vos propres données privées. Les composés stockés dans CDD Public peuvent être facilement recherchés et filtrés à l'aide de l'interface chimiquement intelligente de la base de données. CDD VaultL'interface de la base de données est facile à utiliser et chimiquement intelligente. En outre, CDD a récemment développé la capacité de construire des modèles QSAR. Cela signifie que vous pouvez maintenant construire un modèle basé sur n'importe quelle propriété stockée dans CDD Public, et voir comment vos composés se comparent. Cela peut être particulièrement utile pour prédire la sélectivité de la cible ou les propriétés ADME/tox.

En collaboration avec NCBI-PubChem, CDD a maintenant fourni des liens vers des données complémentaires, telles que la bioactivité, l'ADME, la toxicité, les propriétés et les sources, pour plus d'un million de molécules dans CDD Public. En outre, CDD a également ajouté 94 000 structures qui étaient auparavant inconnues de PubChem. Il s'agit notamment d'un certain nombre de collections structure-activité pour des maladies rares et négligées telles que la malaria, la tuberculose et les parasites tropicaux, ainsi que des données sur la toxicité et les propriétés. PubChem a récemment souligné cette annonce sur sa page d'accueil:

La base de données PubChem a récemment dépassé les 50 millions de composés connus, ce qui en fait probablement la collection la plus complète. CDD est fier de la contribution de sa communauté d'utilisateurs. Si vous connaissez un jeu de données public qui, selon vous, pourrait être utile à la communauté CDD , faites-le nous savoir et nous l'ajouterons à la base de données publique CDD .

Voici un échantillon rapide d'ensembles de données de grand intérêt pour les utilisateurs de CDD :

• APPROUVÉ PAR LA FDA : Médicaments approuvés – avec structure moléculaire définie comprenant 763 molécules de la référence de bureau des médecins, 780 de DrugBank, 1151 dans le livre orange 2007, et 1007 de la liste fda du Dr Chris Lipinski.
• KINASE: ChEMBL Kinase SARfari Compounds & BioAssay Data – met à disposition une grande quantité de données SAR pour les composés actifs kinase contre un large éventail de kinases dans un large éventail d’essais, une grande partie de celui-ci extrait manuellement et organisé à partir de la littérature.
• GPCR: PDSP Ki Database– a plus de 47.000 valeurs Ki contre 699 cibles GPCR de la base de données NIMH Psychoactive Drug Screening Program (PDSP)

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Ce blog est rédigé par des membres de la communauté CDD Vault . CDD Vault est une plateforme informatique hébergée de découverte de médicaments qui gère en toute sécurité les données biologiques et chimiques privées et externes. Elle offre des fonctionnalités de base, notamment l'enregistrement des produits chimiques, la relation structure-activité, l'inventaire des produits chimiques et les carnets de notes électroniques.l'inventaire chimique et le carnet de laboratoire électronique.

CDD Vault : L'informatique appliquée à la découverte de médicaments que toute votre équipe de projet adoptera !