Découverte de médicaments distribués
22 janvier 2009
Dans le numéro inaugural du volume 11 du Journal of Combinatorial Chemistry, Anthony Czarnik a commenté le concept de "Distributed Drug Discovery", D3. Ce concept a été introduit dans les articles de ce numéro par les professeurs William Scott et Martin O'Donnell de l'IUPUI(Indiana University-Purdue University Indianapolis).
Les trois documents sont les suivants :
Découverte de médicaments distribués, 1ère partie : Lier le monde universitaire et la chimie combinatoire pour trouver des pistes de médicaments pour les maladies du monde en développement
Découverte de médicaments distribués, partie 2 : Répétition globale d'agents alkylants pour la synthèse d'acides aminés non naturels liés à des résines et construction d'un catalogue virtuel D3
Découverte de médicaments distribués, partie 3 : utilisation de la méthodologie D3 pour synthétiser les analogues d'un composé anti-mélanome
Je vous encourage à vous procurer un exemplaire du premier numéro du Journal of Combinatorial Chemistry et à lire directement les articles. Le concept de D3 peut être résumé par cette déclaration tirée du premier des trois articles : "Distributed Drug Discovery (D3) propose que si des équipements et des procédures simples et peu coûteux sont mis au point pour la recherche dans chacune des étapes de base de la découverte de médicaments, à savoir la chimie computationnelle, la chimie de synthèse et le criblage biochimique, ce grand défi de recherche peut être divisé en petites unités gérables et réalisé, en parallèle, sur plusieurs sites universitaires et industriels". Il est clair que nous considérons que nos efforts, ici à Collaborative Drug Discovery, soutiennent D3 et l'éditorial de Tony Czarnik reconnaît que nous travaillons pour soutenir son "noble objectif".
Tony inclut un commentaire de notre propre Barry Bunin où Barry annonce nos efforts pour soutenir le travail de l'IUPUI. Nous fournissons la base de données IUPUI-CDD qui met à disposition tous les réactifs, réactifs et produits. Cette base de données sera mise à jour au cours des prochains mois, au fur et à mesure de l'expansion des travaux. La base de données Distributed Drug Discovery (D3) est un catalogue virtuel de 48 608 dérivés uniques d'acides aminés non naturels acylés obtenus à partir d'une énumération combinatoire. Si vous souhaitez accéder à cette base de données, vous pouvez vous inscrire pour obtenir un compte gratuit de lecture et de téléchargement auprès de Collaborative Drug Discovery (CDD) ici. Nous avons également élaboré un tutoriel complet sur l'utilisation de la base de données D3 sur le site CDD . Vous pouvez le trouver sur le site à la même adresse.
Il s'agit de l'une des nombreuses bases de données qui seront ajoutées au site CDD au cours des prochains mois et nous vous encourageons à utiliser pleinement ces précieuses ressources dès qu'elles seront disponibles. N'oubliez pas de lire les articles du JCC. Il s'agit d'un modèle différent pour la découverte de médicaments, mais à l'heure où la R&D pharmaceutique est mise au défi de produire davantage de médicaments, il DOIT y avoir un changement de stratégie. Les collaborations au sein de l'industrie et avec le monde universitaire feront certainement partie de la stratégie et nous examinerons certaines des approches à cet égard dans des articles ultérieurs. Nous sommes déjà en train de permettre ce changement.
Ce blog est rédigé par des membres de la communauté CDD Vault . CDD Vault est une plateforme informatique hébergée de découverte de médicaments qui gère en toute sécurité les données biologiques et chimiques privées et externes. Elle offre des fonctionnalités de base, notamment l'enregistrement des produits chimiques, la relation structure-activité, l'inventaire des produits chimiques et les carnets de notes électroniques.l'inventaire chimique et le carnet de laboratoire électronique.
CDD Vault : L'informatique appliquée à la découverte de médicaments que toute votre équipe de projet adoptera !