GSK et les communautés en ligne créent une alliance unique pour stimuler la découverte de médicaments à source ouverte contre le paludisme

20 mai 2010

GSK devient la première entreprise à partager librement les structures chimiques de 13 500 molécules de sa bibliothèque de composés

Alliances formées avec les principales communautés de recherche scientifique du secteur privé et les fournisseurs de données du domaine public

Logos GSK

BURLINGAME, Calif. le19 mai 2010 - GlaxoSmithKline (GSK) s'est associée à d'importants fournisseurs de données du domaine public, soit l'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), la National Library of Medicine (NLM) des États-Unis et le fournisseur de services informatiques américain Collaborative Drug Discovery (CDD), pour mettre gratuitement à la disposition du public des renseignements scientifiques clés sur plus de 13 500 composés qui pourraient mener à de nouveaux traitements contre la malaria.

La publication de ces données marque la première fois qu'une entreprise pharmaceutique met à disposition les structures d'un si grand nombre de composés. Elle est rendue possible grâce à la collaboration des hôtes web et de leurs outils de recherche spécialisés, qui seront mis gratuitement à la disposition des chercheurs. L'information, qui est hébergée sur des sites web régulièrement utilisés par les chercheurs, comprend des données scientifiques de haute qualité sur les molécules de la propre bibliothèque de composés de GSK qui ont démontré leur puissance contre le parasite le plus mortel du paludisme, P. falciparum.

"Nous sommes ravis que l'EMBL-EBI, la NLM et CDD se soient joints à nous dans cet effort louable visant à appliquer les principes de l'open source à la découverte de médicaments contre le paludisme", a déclaré Patrick Vallance, responsable de la découverte de médicaments chez GSK. "Pour vaincre cette maladie, il faudra que de nombreux esprits scientifiques travaillent ensemble. Nous espérons que les chercheurs du monde entier utiliseront ces informations pour mener d'autres études et que d'autres groupes, de l'industrie pharmaceutique aux universités, ajouteront leurs informations à cette ressource en ligne."

Ce type de données est la première étape sur la voie du développement de nouveaux médicaments. Grâce à la structure des composés et aux informations sur l'endroit où ils affectent le parasite de la malaria, les scientifiques pourraient ensuite mener d'autres recherches sur ces composés en vue de la découverte de médicaments ou pour comprendre comment ceux-ci pourraient être utilisés pour inhiber le cycle de vie du parasite et, finalement, conduire à de nouveaux médicaments. L'ouverture de ces informations est essentiellement un exemple de tactique "open source" appliquée à la découverte de médicaments.

"Mettre les informations sur les sciences de la vie à la disposition de la communauté des chercheurs est au cœur de la mission de l'EMBL-EBI", a ajouté John Overington, chef de l'équipe ChEMBL de l'EMBL-EBI, qui agira comme principal dépositaire des données par le biais de sa ressource ChEMBL. "Nous sommes fiers de pouvoir ajouter de la valeur aux données de GSK en les incorporant dans le ChEMBL et en les reliant à un vaste éventail d'informations qui pourraient aider les chercheurs à trouver de nouveaux traitements contre la malaria. C'est le début d'une nouvelle ère de collaboration public-privé dans la recherche sur les médicaments".

"La NLM est ravie de participer à cette diffusion révolutionnaire d'informations au public", a déclaré Steve Bryant, responsable de la base de données PubChem de la NLM, qui héberge les données. "En rendant ces données disponibles par le biais de ressources publiques telles que PubChem, GSK facilite grandement le processus de recherche, car les informations sont liées à des composés apparentés, aux résultats de la bioactivité, à la littérature publiée et à d'autres ressources qui aideront les chercheurs à faire de nouvelles découvertes pour lutter contre le paludisme".

"CDD est ravi de jouer un rôle dans cet événement véritablement historique", a déclaré Barry A. Bunin, PDG de Collaborative Drug Discovery. "Au cours des décennies de percées médicales des Big Pharmas, c'est la première fois qu'un groupe partage ouvertement toutes les données chimiques et biologiques - et pas seulement les quelques succès. De plus, pour les cribles phénotypiques, les outils de CDD permettent aux chercheurs de commencer à émettre des hypothèses et à valider les cibles des cribles de cellules entières."

L'EMBL-EBI servira de dépôt principal pour les données sur cet ensemble de composés, et indexera et formatera les informations supplémentaires qui y seront apportées. GSK ajoutera d'autres informations au fur et à mesure qu'elles seront générées et les scientifiques externes qui font des recherches sur ces composés et les données seront demandées de la même manière.

A propos des données

Les données contiennent les résultats d'un criblage des 2 millions de composés de la bibliothèque de composés de GSK afin de déterminer l'effet de ces composés sur le parasite de la malaria. Le projet de criblage a identifié environ 13 500 composés qui ont montré une forte inhibition sur le parasite.

Les inhibiteurs de kinases constituaient une grande partie des molécules dont l'activité était connue auparavant et qui sont maintenant identifiées comme des antipaludiques efficaces. Les données comprennent les familles chimiques que GSK recherche actuellement pour cette indication et les "mécanismes d'action" des composés que la société a déjà testés pour d'autres indications.

La plupart des structures de composés identifiées ont été classées comme pouvant être converties en médicaments.

Les informations microbiologiques actuelles sur les composés et les structures ont été mises sur des ressources en ligne facilement accessibles aux chercheurs. Le site de l'EMBL-EBI a été construit de manière à ce que les scientifiques du monde entier puissent ajouter leurs données aux informations qui s'y trouvent, avec un accès gratuit pour tous. La valeur de la diffusion des informations est renforcée par la collaboration des hôtes web et des outils de recherche spécialisés du site, qui sont mis gratuitement à la disposition des chercheurs.

GSK remercie le soutien de Medicines for Malaria Venture, qui a contribué au financement de ce projet.

Des informations complètes peuvent être consultées en ligne à l'adresse suivante

www.ebi.ac.uk/chembl

http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

www.collaborativedrug.com/

À propos du paludisme

Le paludisme est une maladie mortelle causée par des parasites qui se transmettent à l'homme par les piqûres de moustiques infectés. Un enfant meurt du paludisme toutes les 30 secondes. En 2009, on a recensé 243 millions de cas de paludisme, qui ont causé près d'un million de décès, principalement chez les enfants africains.

Le meilleur traitement disponible pour le paludisme - en particulier la souche la plus mortelle P. falciparum - est une combinaison de médicaments connue sous le nom de combinaisons thérapeutiques à base d'artémisinine (ACT). Cependant, la résistance des parasites est un problème qui mine les efforts de lutte contre le paludisme. Il n'existe aucune alternative efficace aux artémisinines pour le traitement du paludisme, ni sur le marché, ni à la fin du processus de développement du médicament.

À propos de GlaxoSmithKline

GlaxoSmithKline - l'une des plus grandes entreprises de recherche pharmaceutique et de soins de santé au monde - s'est engagée à améliorer la qualité de la vie humaine en permettant aux gens d'être plus actifs, de se sentir mieux et de vivre plus longtemps. Pour plus d'informations sur GSK, visitez le site www.gsk.com.

À propos de l'Institut européen de bio-informatique (EMBL-EBI)

L'Institut européen de bioinformatique (EMBL-EBI) fait partie du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL) et est situé sur le campus du Wellcome Trust Genome à Hinxton, près de Cambridge (Royaume-Uni). L'EMBL-EBI est né du travail de pionnier de l'EMBL qui a fourni des bases de données biologiques publiques à la communauté des chercheurs. Il abrite certaines des plus importantes collections de données biologiques au monde, notamment des séquences d'ADN (ENA), des séquences de protéines (UniProt), des génomes animaux (Ensembl), des structures tridimensionnelles (la banque de données des protéines en Europe), des données provenant d'expériences d'expression génétique (ArrayExpress), des interactions protéine-protéine (IntAct) et des informations sur les voies d'accès (Reactome). L'EMBL-EBI accueille plusieurs groupes de recherche et ses scientifiques développent continuellement de nouveaux outils pour la communauté de la bioinformatique. Pour plus d'informations sur l'EMBL-EBI, visitez le site www.ebi.ac.uk

À propos de la Bibliothèque nationale de médecine (NLM)

La Bibliothèque nationale de médecine(http://www.nlm.nih.gov/) est la plus grande bibliothèque au monde dans le domaine des sciences de la santé. La NLM fait partie des National Institutes of Health (NIH), une composante du ministère américain de la santé et des services sociaux. Les NIH sont la principale agence fédérale chargée de mener et de soutenir la recherche médicale fondamentale, clinique et translationnelle, et ils étudient les causes, les traitements et les remèdes des maladies courantes et rares. Pour plus d'informations sur le NIH et ses programmes, visitez le site www.nih.gov.

À propos de Collaborative Drug Discovery (CDD)

CDD héberge la plateforme en nuage de découverte de médicaments la plus utilisée sur le marché. "CDD Vault " est la base de données industrielle privée et sécurisée qui combine l'informatique traditionnelle de découverte de médicaments (enregistrement et SAR) avec des capacités de réseau social. "CDD Collaborate " permet une collaboration en temps réel en échangeant de manière sécurisée des données confidentielles sélectionnées avec des chercheurs externes. "CDD Public" a un contenu unique. Pour plus d'informations sur CDD, visitez le site www.collaborativedrug.com.

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NLM Office of Communications and Public Liaison Courriel : [email protected]
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Barry Bunin, PhD Tel : +1 650 204 3084

Président et directeur général de Collaborative Drug Discovery, Inc. Email : [email protected]