De nouvelles cibles et molécules pour la tuberculose : des données disponibles en accès public !

2 mai 2011

Notre collaboration avec le SRI produit de nouveaux ensembles de données publiques qui tirent parti des petites molécules et des données sur la tuberculose recueillies sur le site CDD et de l'expertise en matière de bases de données sur les voies d'accès. Le Dr Malabika Sarker a terminé la curation des liens vers les gènes cibles, les voies, les structures protéiques, les références et les informations sur l'essentialité in vivo de tous les produits et médicaments pour lesquels nous disposions initialement d'informations sur la tuberculose. Nous avons maintenant des liens vers KEGG, TBDB, Pubmed, PDB, etc.

Le protocole "pistes et cibles" peut être combiné avec le protocole "médicaments et cibles" pour aboutir à plus de 700 molécules et peut être trouvé dans la liste des médicaments contre la tuberculose et des pistes avec cibles

L'ensemble de 314 "cibles essentielles in vivo" est peut-être le premier ensemble de données publiques sur CDD qui ne contient pas de petites molécules. Mais il fournit pour la première fois en un seul endroit des liens entre les gènes, les voies et les protéines pour toutes ces cibles. Cette base de données est une base de données de cibles TB pour les gènes essentiels in vivo.

Ils devraient être des ajouts utiles à nos bases de données sur la tuberculose et pourraient être utiles pour trouver des structures similaires qui pourraient imiter les molécules actives contre une cible particulière.


Ce blog est rédigé par des membres de la communauté CDD Vault . CDD Vault est une plateforme informatique hébergée de découverte de médicaments qui gère en toute sécurité les données biologiques et chimiques privées et externes. Elle offre des fonctionnalités de base, notamment l'enregistrement des produits chimiques, la relation structure-activité, l'inventaire des produits chimiques et les carnets de notes électroniques.l'inventaire chimique et le carnet de laboratoire électronique.

CDD Vault : L'informatique appliquée à la découverte de médicaments que toute votre équipe de projet adoptera !