Accès publique

En tant que service à la communauté, CDD héberge des données d'accès public pertinentes à la découverte de médicaments provenant de groupes de recherche de pointe du monde entier.

Entièrement intégré au CDD Vault, les utilisateurs ont un accès complet à ces ensembles directement à partir de leurs comptes. Scientifiques sans CDD Vault accès qui souhaitent voir ou exploiter notre référentiel de données d'accès public peut Enregistrez-vous pour avoir accès à un compte gratuit. Nous accueillons et encourageons les contributions. Les scientifiques souhaitant publier sur CDD Public Access devraient nous contacter.

Perlara ArkBase

Publié par: Perlstein Lab Molecules: 56756

PI: Ethan Perlstein

Publié: 10 / 27 / 2019

Un corpus de données de dépistage phénotypique entièrement basé sur un organisme modèle ouvert comprenant des techniques de réutilisation de médicaments et de criblage de découverte du plomb dans des modèles cellulaires de levure, de ver, de mouche et de cellules humaines d'erreurs métaboliques telles que les maladies lysosomales et les troubles congénitaux de la glycosylation. Ces données ont été publiées dans trois études de cas dans les revues G3 (Lao et al., 2019 https://www.g3journal.org/contenu / 9 / 2 / 413.long) et les modèles et mécanismes de la maladie (Iyer et al., 2019a https://dmm.biologists.org/content / early / 2019 / 09 / 18 / dmm.040576.long; Iyer et al., 2019b https://dmm.biologists.org/content / early / 2019 / 10 / 19 / dmm.040584.long).


Activité in vitro et in vivo du récepteur de la sérotonine

Publié par: Nichols Molecules: 84

PI: Dave Nichols

Publié: 10 / 14 / 2019

Les ensembles de données se concentrent sur les systèmes cérébraux qui utilisent la dopamine ou la sérotonine comme neurotransmetteur. Cela inclut les sondes moléculaires qui ne sont spécifiques que pour l'un des cinq types généraux de récepteurs de la dopamine (D1 - D5), ainsi que des ensembles de données sur les récepteurs 5-HT1A, 5-HT2A et 5-HT2A de la sérotonine. Ces projets comprennent une modification structurelle systématique, associée à une analyse pharmacologique, en vue d’identifier les déterminants structurels du domaine de liaison du ligand dans ces récepteurs. L'un des thèmes de ce travail a été d'identifier comment les molécules de différentes classes chimiques peuvent toutes être hébergées dans le même site de liaison au récepteur.


SCLÉROSE EN PLAQUES: Différenciation de l'OL

Publié par: Myelin Repair Foundation Molecules: 710

PI: Tassie Collins

Publié: 10 / 21 / 2016

Analyse de différenciation aiguë des oligodendrocytes Les OPC immunopurifiées par O4 ont été étalés à 5k / well. 1 heures après étalement, l'article à tester a été ajouté et les cellules ont été incubées pendant quatre jours, après quoi les cellules ont été fixées et immunocolorées pour la MBP et les noyaux totaux (DAPI). La différenciation des OPC en OL a été déterminée par quantification de la coloration de la MBP / nombre de cellules (identifiées par coloration nucléaire à la DAPI). Le criblage des composés a été effectué en quadruple à des concentrations de 2 (10 et 2, uM; 2 et 0.4, uM; 0.4 et 0.08, uM). Les données sont normalisées sur DMSO (0% différenciation) et 40 ng / ml T3 (100% différenciation). EC50 est déterminé par rapport à l'EMax de l'article à tester. Pour des détails techniques, voir Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Res Notes. 2016 sept. 5; 9 (1): 419 ou contact [EMAIL PROTECTED] pour des protocoles détaillés.


SCLÉROSE EN PLAQUES: OL Protection

Publié par: Myelin Repair Foundation Molecules: 723

PI: Tassie Collins

Publié: 10 / 21 / 2016

Test de protection des oligodendrocytes - Viabilité (TNF + IFNg) Des OPC étendus ont été étalés à 10K / puits. 24 heures après étalement, l'article à tester a été ajouté, 1hr après l'ajout à l'article à tester, une addition avec 10U / ml d'IFN-gamma / 1ng / ml de TNF-alpha a été ajoutée. Incuber les jours 2, ajouter AlamarBlue et incuber quatre heures. Quantifier la fluorescence AlamarBlue pour lire la viabilité cellulaire. Les données sont mises à l’échelle au DMSO (% d’activité 0) et à la quétiapine 1.1 uM (activité% de 100). Pour les détails techniques, voir Rosler, et. , al, BMC Res Notes. 2016 sept. 5; 9 (1): contact 444 [EMAIL PROTECTED] pour des protocoles détaillés.


SCLÉROSE EN PLAQUES: dosage de la myélinisation

Publié par: Myelin Repair Foundation Molecules: 715

PI: Tassie Collins

Publié: 10 / 21 / 2016

Dosage de la myélinisation corticale Des cellules du cortex cérébral E18 ont été préparées et étalées dans un milieu neuro-basal. Quatre jours plus tard, les médias ont été remplacés par les médias MyM. Le jour 5, des articles de test sont ajoutés et la myélinisation est autorisée pendant huit jours. Le jour 13 in vitro, les cellules ont été fixées et immunocolorées pour MBP et Olig2. La myélinisation a été déterminée par quantification de la coloration des noyaux MBP / Olig2 + et du changement de morphologie de la MBP (alignement de la coloration contiguë de la MBP - longueur de la fibre). La différenciation en OL a été déterminée par la quantification de la densité de la MBP x surface / noyaux Olig2 +. Les composés ont été criblés en double avec des images 4 / puits à des concentrations de 2 (5 et 1, uM). Les données sont normalisées en DMSO (0% différenciation / myélinisation) et DAPT (100% différenciation / myélinisation). Les EC50 sont déterminés par rapport à la réponse à 1 uM DAPT. Pour des détails techniques, voir Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Neurosci. 2016 avr. 22; 17: 16 ou contact [EMAIL PROTECTED] pour des protocoles détaillés.


SCLÉROSE EN PLAQUES: Test de protection contre la tunicamycine HEK293

Publié par: Myelin Repair Foundation Molecules: 740

PI: Tassie Collins

Publié: 10 / 7 / 2016

Test de protection HEK-293

Les cellules HEK-293 (10K / puits) sont incubées pendant X heures, puis l'article à tester est ajouté. Après 24 heure, 1 ng / ml tunicamycine est ajouté. Après une heure supplémentaire d'incubation 100, AlamarBlue est ajouté et la fluorescence est quantifiée 48 quelques heures plus tard. Les données sont normalisées en DMSO (% d'activité 4) et en guanabenz 0 uM (activité% de 5). EC100 est déterminé par rapport à l'EMax de l'article à tester. Contact [EMAIL PROTECTED] pour des protocoles détaillés.


SCLÉROSE EN PLAQUES: Dépistage de la toxicité de l'OL

Publié par: Myelin Repair Foundation Molecules: 709

PI: Tassie Collins

Publié: 10 / 7 / 2016

Essai de toxicité pour les oligodendrocytes (TNF + IFNg)

Essai de toxicité sur des OPC de rats passés, étalonné sur 10k / puits et incubé avec le médicament pendant 2 jours. La lecture est la fluorescence AlamarBlue après l’incubation de 4. Les données sont exprimées en pourcentage de survie par rapport au DMSO (100%). La destruction maximale se fait avec tunicamycine 5 ng / ml, ce qui laisse ~ 15% de cellules en vie. Pour les détails techniques, voir Lariosa-Willingham, et autres, BMC Res Notes. 2016 sept. 5; 9 (1): 419 ou contact [EMAIL PROTECTED] pour des protocoles détaillés.


Solvants Verts

Publié par: Alex Clark Sandbox Molecules: 117

Publié: 9 / 20 / 2016

Données sur les solvants verts, utilisées par l'application mobile éponyme (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Compilé à partir d'informations publiées par l'ACS Green Chemical Institute et GSK Solvent Guide. Publié dans http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


PARASITES: GSK Kineto Box frappe avec pIC50

Publié par: GSK Kineto Box Project (TCAKS) Molécules: 592

PI: Pilar Manzano

Publié: 6 / 16 / 2016

À l'aide d'essais phénotypiques sur des cellules entières, l'ensemble de la diversité des composés 1.8 millions sélectionnés par le criblage à haut débit (HTS) GlaxoSmithKline a été criblé par rapport aux trois kinétoplastides les plus pertinents pour la maladie humaine, à savoir Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi et Trypanosoma brucei. Des analyses antiparasitaires intracellulaires de confirmation et orthogonales secondaires ont été effectuées et le potentiel de cytotoxicité non spécifique a été déterminé. Les composés Hit ont été regroupés chimiquement et triés pour obtenir des propriétés physicochimiques souhaitables. L'espace cible biologique hypothétique couvert par ces ensembles de diversité a été étudié à l'aide de méthodologies bioinformatiques. Par conséquent, trois boîtiers chimiques anti-kinétoplastides d'environ 200 composés chacun ont été assemblés. Cet ensemble de données comprend les composés à succès et tous les résultats de dépistage associés. http://www.nature.com/articles/srep08771


VENDEUR: ASINEX PPI Library

Publié par: ASINEX Molecules: 8400

PI: Mark Parisi

Publié: 3 / 3 / 2016

ASINEX travaille sur la conception et la synthèse de bibliothèques d'interactions protéine-protéine (PPI) depuis 2008. La dernière génération de la bibliothèque ASINEX PPI comprend des molécules de différentes tailles, structures et formes allant des entités fragmentaires aux dérivés macrocycliques conçus comme mimétiques de structure secondaire ou mimétiques d’épitopes.


VENDEUR: ASINEX Elite Library

Publié par: ASINEX Molecules: 12960

PI: Mark Parisi

Publié: 3 / 3 / 2016

Quels problèmes existe-t-il après le premier succès? Asinex a traité ces problèmes avec un profilage ADME approfondi, une conception optimale facilitant la modification de medchem et une évaluation IP pour garantir la nouveauté.


VENDEUR: Bibliothèque phénotypique ASINEX

Publié par: ASINEX Molecules: 9840

PI: Mark Parisi

Publié: 3 / 3 / 2016

Asinex exécute en interne des tests ciblés et phénotypiques et utilise les informations expérimentales recueillies pour créer des ensembles de criblage à la fois ciblés et divers. Fort de cette expérience, Asinex a créé un ensemble de criblage phénotypique. les filtres pour cet ensemble sont les suivants:

MW: 200-450, clogP: -1.0 – 7.0, clogD (pH 7.4): - 5.0 – 4.0, Rot.Bond:0-10, HA: 1-10, HD: 1-5, PSA: XNX , N + O: 15-135, HAC: 2-10, Dipole: 19 – 34, SHP0.3: 3.30 – 2.


VENDOR: ASINEX Diversity Library

Publié par: ASINEX Molecules: 9968

PI: Mark Parisi

Publié: 3 / 3 / 2016

La diversité continue d’être un puissant outil de dépistage, en particulier au début de la phase de «découverte» du médicament. En créant cet ensemble, Asinex a appliqué des outils informatiques pour garantir que l'espace chimique est correctement représenté, tout en incorporant des éléments de ses concepts «Elite» et «BioDesign».


VENDEUR: ASINEX BioDesign

Publié par: ASINEX Molecules: 8041

PI: Mark Parisi

Publié: 3 / 3 / 2016

L'approche BioDesign d'ASINEX intègre les principales caractéristiques structurelles de produits naturels connus sur le plan pharmacologique (par exemple, des alcaloïdes et d'autres métabolites secondaires) dans des échafaudages de synthèse chimique réalisables.


CATALOGUE: Découverte de médicaments distribués (D3) - IUPUI

Publié par: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Molecules: 73234

PI: MJ O'Donnell et WL Scott

Publié: 2 / 24 / 2016

Catalogue et bibliothèque virtuels gratuits et en libre accès de> molécules 73,000: (a) acides aminés α-aminés non naturels de N-Acyl, (b) esters méthyliques d'acides aminés α-aminés de N-Acyle non naturels, et (c) amides primaires de N Acides α-amino aminés non naturels. Les molécules du catalogue ont été obtenues par une énumération basée sur l'alkylation combinatoire en phase solide d'un anion glycine équivalent à 100 R1X suivie d'une N-acylation avec 100 R2CO2H et du clivage de la résine (TFA, MeOH / Et3N, ou TFA, respectivement). L'ensemble de données héritées des molécules 48,818 (au-dessus des ensembles a et b plus les entrées R1X et R2CO2H) a été publié sur 1 / 1 / 2009. Nous encourageons les collègues à communiquer avec nous concernant leur intérêt pour le projet D3 (E-mail: [EMAIL PROTECTED]<mailto:[EMAIL PROTECTED]> ou [EMAIL PROTECTED]<mailto:[EMAIL PROTECTED]>). Références: J. Comb. Chem. 2009, 11, 3-13, 14-33, 34-43; J. Org. Chem. 2014, 79, 3140-51; J. Chem. Educ. 2015, 92, 819-26.


PALUDISME: Écran biochimique de 5 P. falciparum kinases contre le TCAMS de GSK

Publié par: Gregory J. Crowther Molecules: 13451

PI: Gregory J. Crowther

Publié: 2 / 3 / 2016

Les composés à activité cellulaire ~ 13,500 ont été criblés pour déterminer leur activité contre cinq protéines kinases différentes. Tres Cantos antipaludiques de GlaxoSmithKline Set (TCAMS) a été criblée dans des essais biochimiques de Plasmodium falciparum protéines kinases dépendantes du calcium 1 et 4 (CDPK1 / PF3D7_0217500 et CDPK4 / PF3D7_0717500), la protéine kinase associée mitogen-2 (MAPK2 / MAP2 / PF3D7_1113900), la protéine kinase 6 (PK6 / PF3D7_1337100) et protéine kinase 7 (PK7 / PF3D7_0213400). De nouveaux inhibiteurs puissants (IC50 <1 µM) ont été découverts pour trois des kinases: CDPK1, CDPK4 et PK6. Les inhibiteurs de PK6 sont les plus puissants jamais découverts pour cette enzyme et méritent un examen plus approfondi.


Composés publics de la matière noire

Publié par: Composés de la matière noire Molecules: 139352

PI: Guillermo Morales

Publié: 12 / 7 / 2015

Novartis a constaté que 803,990 de leurs composés avait été testé au moins dans les tests Novartis 100 et que les composés 112,872 étaient inactifs (14.0%). Et une analyse des données NIH a montré que les composés 363,598 avaient été testés dans au moins des tests 100 où les composés 131,726 étaient inactifs (36.2%).

Anne Mai Wassermann, Eugen Lounkine, Dominic Hoepfner, Gaelle Le Goff, Frederick J. King, Christian Studer, John M Peltier, Melissa L. Grippo, Vivian Prindle, Jianshi Tao, Ansgar Schuffenhauer, Iain M Wallace, Shanni Chen, Philipp Krastel, Amanda Cobos -Correa, Christian N. Parker, John W. Davies et Meir Glick. La matière chimique noire est un point de départ prometteur pour la découverte de médicaments. Nature Chemical Biology 2015, Vol. 11, pp. 958 – 966 (doi: 10.1038 / nchembio.1936)


ADME: AZ Public ChEMBL Data

Publié par: AZ Public ChEMBL Data Molecules: 5799

PI: Sean Ekins

Publié: 10 / 5 / 2015

DMPK in vitro expérimental et données physicochimiques sur un ensemble de composés divulgués publiquement et déterminés à AstraZeneca. Les références fournies pour les tests illustrent les procédures expérimentales utilisées pour générer les données.

https://www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole guinea pig plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole dog plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole rat plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole mouse plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.Intrinsic clearance measured in human hepatocytes following incubation at 37C. Experimental range <3 to >150 microL/min/1E6 cells. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Bases: >= 2.Second most acidic pKa value (pKa A2) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Acids: <= 11.

Troisième valeur de pKa de base (pKa B3) déterminée par absorption et titrage potentiométrique à l'aide de la méthodologie standard de Sirius Analytical. Domaine expérimental Bases:> = 2.

Deuxième valeur de base de pKa (pKa B2) déterminée par absorption et titrage potentiométrique à l'aide de la méthodologie standard de Sirius Analytical. Domaine expérimental Bases:> = 2.

Valeur de pKa la plus acide (pKa A1) déterminée par absorption et titrage potentiométrique en utilisant la méthodologie standard de Sirius Analytical. Domaine expérimental Acides: <= 11.


Ligands PDB

Publié par: Protein Data Bank (PDB) Molecules: 16826

PI: Dale R. Cameron, Ph.D., MCIC, P.Chem.

Publié: 8 / 3 / 2015

Les informations sur les ligands sont extraites de la PDB, filtrées pour éliminer le "polymère" et autres ligands "non libres" associés, ainsi que les métaux ou les ligands de liaison aux métaux. Les mises à jour de la procédure de filtrage peuvent se produire sans avertissement. Les données sont fournies telles quelles, sans correction supplémentaire ni correction d'erreur. Les liens vers PDB sont fournis par le PBD RCSB et peuvent être cités comme suit:

HM Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, TN Bhat, H. Weissig, IN Shindyalov, PE Bourne (2000) Recherche sur les acides nucléiques de la banque de données sur les protéines, 28: 235-242.

Veuillez signaler les liens rompus, les demandes de données supplémentaires, etc. à l'administrateur du coffre-fort.


EBOLA: petite molécule inhibitrice du virus Ebola

Publié par: Nadia's Sandbox Molecules: 55

PI: Dr. Nadia Litterman

Publié: 2 / 2 / 2015

Cet ensemble de données partagé contient de petites molécules 55 de la littérature (jusqu'à Jan 2015) ayant une activité in vitro et / ou in vivo contre le virus Ebola et divers modèles de maladie. Nous avons inclus une évaluation d'un chimiste médical expérimenté ainsi que les résultats du filtrage de PAINS. (Ce travail a été soumis pour publication par Nadia Litterman, Christopher Lipinski et Sean Ekins dans F1000Research).


VENDOR: Synthonix - Construire de meilleures obligations

Publié par: http://www.synthonix.com Molecules: 10286

Publié: 1 / 2 / 2015

Synthonix aide les pharmaciens à repousser les limites de la découverte de médicaments en leur fournissant un catalogue de blocs de construction 10286 qui leur permettent d'explorer un espace chimique plus complexe et d'élargir la gamme de cibles thérapeutiques potentiellement importantes pour traiter les maladies chroniques et curables dans le monde. Synthonix, Inc: 919-875-9277; E-mail général: [EMAIL PROTECTED]; Synthonix Ltd (Bureau Europe): Bureau: + 44 1223 597934; Email: [EMAIL PROTECTED]


SONDES: Sondes chimiques NIH

Publié par: Probes Vault Molecules: 319

PI: Christopher Lipinski

Publié: 11 / 12 / 2014

Les Instituts nationaux de la santé (NIH) ont financé d'importants efforts de HTS, estimés à plus de X millions de dollars, dans des centres intra-muros et universitaires afin d'identifier des sondes chimiques à petites molécules ou des composés pour outils via le réseau de centres de criblage de bibliothèques moléculaires (MLSCN) et le Réseau de centres de production de sondes de bibliothèque moléculaire (MLPCN). Pour que les composés soient choisis comme sondes, diverses définitions, basées sur une combinaison de puissance, de sélectivité, de solubilité et de disponibilité, ont été utilisées. À ce jour, les centres de dépistage universitaires financés par les NIH ont découvert plus de sondes chimiques 576. Cette collection comprend des structures de sonde, des cibles, des anti-cibles, des valeurs IC300 et d'autres références. Il inclut également une variété de mesures de la similarité des médicaments, notamment le score de désirabilité attribué par le Dr Chris Lipinski, décrit dans «Prévision et validation informatiques de l'évaluation d'un expert par des sondes chimiques». Litterman NK, Lipinski CA, Bunin BA, Ekins S Modèle J Chem Inf. (50)


VENDOR: Azepine Ltd. Collection de blocs de construction

Publié par: Azepine Ltd. Molecules: 600

PI: Julia

Publié: 10 / 8 / 2014

Blocs de construction 600, EN STOCK à des prix compétitifs. Contact [EMAIL PROTECTED]


HTS ciblé par la kinase NEU-CSIC-GSK

Publié par: Pollastri Lab - Northeastern University Molecules: 78

PI: Michael Pollastri

Publié: 9 / 25 / 2014

Cet ensemble de données contient les résultats publiés d'un tamisage à haut débit réalisé via une collaboration entre la Northeastern University (laboratoire Pollastri), le CSIC (laboratoire Navarro) et le laboratoire GlaxoSmithKline Tres Cantos (Maladies du monde en développement). L'article est Diaz et al, PLoS-NTDs:

DOI: 10.1371 / journal.pntd.0003253

S'il vous plaît contactez [EMAIL PROTECTED] avec des questions


VENDOR: Collection HTS de matériel de laboratoire Vitas-M

Publié par: Vitas-M Laboratory Molecules: 388375

Publié: 7 / 11 / 2014

Laboratoire Vitas-M, LTD. La collection de composés HTS concerne les molécules individuelles 400 000, en stock. Tous sont disponibles pour une livraison rapide dans différents formats, y compris mg, micromole, poudre sèche, solution de DMSO et film sec. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [EMAIL PROTECTED]


VENDEUR: Blocs de construction du laboratoire Vitas-M

Publié par: Vitas-M Laboratory Molecules: 33297

Publié: 7 / 10 / 2014

Laboratoire Vitas-M, LTD. La collection de blocs de construction organiques contient plus de 33 articles identifiés et testés par 000. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [EMAIL PROTECTED]


VENDEUR: échafaudages de laboratoire Vitas-M

Publié par: Vitas-M Laboratory Molecules: 2898

Publié: 7 / 8 / 2014

Laboratoire Vitas-M, LTD. Collection d'échafaudages (projet Azalea). Idées avancées pour synthétiser des mini-bibliothèques médicamenteuses. C'est le meilleur choix pour acquérir des composés absolument nouveaux qu'aucun autre fournisseur ne propose. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [EMAIL PROTECTED]


VENDEUR: Fragments de laboratoire Vitas-M

Publié par: Vitas-M Laboratory Molecules: 18631

Publié: 7 / 8 / 2014

Laboratoire Vitas-M, LTD. Collecte de fragments (substances chimiques soumises à la "règle de 3" et à d'autres filtres spéciaux) pour la découverte de médicaments par fragments. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [EMAIL PROTECTED]


VENDOR: Life Chemicals - bibliothèque GPCR

Publié par: Life Chemicals Molecules: 15948

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

La recherche de similarité / pharmacophore est basée sur la prédiction Topomer Search fournie par Sybyl-X. Première étape - une recherche de similarité a supposé une comparaison de composés de base entiers avec des inhibiteurs connus dérivés de BindingeDB et de ChemblDB. Seconde étape - génération des structures 3D d'inhibiteurs connus et co-alignement. Cet espace spatial chimique a été utilisé comme modèle pour l’adaptation du reste de composés "similaires". Cependant, cette méthode a été conçue pour la "sélection de cerises" et une bibliothèque alternative peut être utilisée avec des méthodes de criblage virtuelles (tous les modèles de criblage étant prêts et testés avec des kits de formation) contre ces récepteurs - adénosine, chimiokine, dopamine, gaba-, histamine, muscarinique, opioïde, sphingosine. http://www.lifechemicals.com/


VENDOR: Life Chemicals- Kinase par similarité

Publié par: Life Chemicals Molecules: 62467

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

Recherche de similarité à l'aide de clés publiques MDL et de la limite de similarité Tanimoto de 90%. Les composés de référence presque 25K testés actifs dans les tests biologiques 168 (plus de 100 différentes cibles de kinases) ont été utilisés pour la recherche de similarité. Tous ces composés pourraient être criblés par rapport à une cible plus spécifique allant jusqu'à la commande du client. http://www.lifechemicals.com/


VENDOR: Life Chemicals- Kinase par amarrage

Publié par: Life Chemicals Molecules: 15174

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

La bibliothèque de kinases a été préparée en se basant sur l’amarrage virtuel dans un environnement Sybyl. À cette fin, un ensemble de sites de liaison de structures kinases (environ 20) ont été alignés et analysés. Ces sites superposés ont été utilisés pour la modélisation pharmacophore basée sur la structure via le module Unity de Sybyl-X. Après toute la préparation, un stock entier de 3D a été criblé par rapport à ce modèle à plusieurs pharmacophores et à la fin, un classement supérieur a été réalisé. http://www.lifechemicals.com/


VENDEUR: Life Chemicals- Receptors Nuclear

Publié par: Life Chemicals Molecules: 9896

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

Life Chemicals. Amarrage virtuel et recherche de similarité / pharmacophore. http://www.lifechemicals.com/


VENDOR: Life Chemicals- CNS Library

Publié par: Life Chemicals Molecules: 16535

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

Les filtres du SNC décrits dans la littérature ont été utilisés comme tamis pour l’ensemble du stock. Comme il a été démontré, les seuls composés présentant de tels paramètres peuvent avoir des caractéristiques appropriées pour la perméabilité des tissus nerveux. Tous les descripteurs ont été obtenus à partir de Spreadsheets et des modules Volsurf de Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP = <Accepteurs de liaison H 3.6 = <Donateurs de liaison H 8 = <5 tPSA = <Liaisons rotatives 120 = <5 LogBB1 = -3.0 à 1.0) http://www.lifechemicals.com/


VENDEUR: Life Chemicals - Bibliothèque de produits naturels

Publié par: Life Chemicals Molecules: 7808

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

La première méthode était basée sur l'analyse statistique des descripteurs. Auparavant, une vaste base de données de NP était analysée pour étudier les échafaudages de NP en les organisant sous la forme d'un arbre. Ainsi, l'analyse de la distribution des propriétés de plus de 130 000 NP structures ainsi que l'identification des sous-structures typiques pour des classes particulières de composés naturels ont été effectuées pour générer un ensemble de fragments habituellement présents dans les composés naturels. Cette méthode a été testée sur le dictionnaire des produits naturels (DNP) et les molécules synthétiques (MS) du CRC. Une autre méthode est basée sur l’évaluation de la similarité d’un échafaudage. Le nombre de signatures d'atomes (à partir de fragmnets) générés pour une molécule est égal au nombre d'atomes composant la molécule. Chaque signature d'atome représente indépendamment une caractéristique / un fragment structurel de la molécule, et un score individuel pour celui-ci est calculé. plus grand nombre d'atomes de gagner un score plus élevé. Pour reproduire une telle expérience, nous avons utilisé un module de développement chimique intégré dans CDK-Taverna 2.0. Il contient un indicateur de ressemblance NP, v1.4.1, qui calcule la ressemblance d'un produit naturel (NP) avec une molécule, c'est-à-dire la similarité de la molécule avec l'espace de structure couvert par des produits naturels connus. Tous les résultats ont été notés et vont de -3 à + 3. http://www.lifechemicals.com/


VENDOR: Life Chemicals - Collection de criblage

Publié par: Life Chemicals Molecules: 371998

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

Nouvelles molécules soigneusement conçues et nouvelles, ressemblant à des médicaments, régies par la règle de Lipinski de 5. La seule raison pour laquelle l’écart par rapport à l’ensemble de ces paramètres est un échafaudage unique ou une chimie non standard. Il est prêt à appliquer des filtres de chimie médicinale tels que PAIN ou tout autre filtre ciblé (solubilité, perméabilité, BBB). http://www.lifechemicals.com/


VENDOR: Life Chemicals - Fragments à solubilité garantie

Publié par: Life Chemicals Molecules: 8241

PI: Alexandr Kucherak

Publié: 6 / 20 / 2014

Les composés de fragments ont été sélectionnés en filtrant l'intégralité du stock LC avec la «règle de trois» modifiée. Les fragments ont été testés pour la solubilité en laboratoire d'analyse. La solubilité est garantie à la concentration de 200mM dans le DMSO et 75% des fragments sont solubles dans le tampon pH7.5 à la concentration de 1mM. http://www.lifechemicals.com/


TB: Efficacité de la souris in vivo tirée de la littérature

Publié par: TB in-vivo data2 Molecules: 778

PI: Sean Ekins, PhD

Publié: 4 / 10 / 2014

Regard sur l'avenir: Prédire l'efficacité in vivo de petites molécules par rapport à Mycobacterium tuberculosis. La sélection et la traduction in vitro de causes de maladie en molécules dotées d'une activité in vivo dans un modèle animal de la maladie est un défi qui prend beaucoup de temps et d'argent. Nous démontrons l’apprentissage de composés actifs et inactifs in vivo à l’aide de modèles de classification d’apprentissage automatique (Bayesian, Machines à vecteurs de support et partitionnement récursif) constitués de composés 773. Le modèle bayésien a prévu 8 à partir d'actifs in vivo supplémentaires de 11 non inclus dans le modèle en tant qu'ensemble de test externe. La conservation de soixante-dix années de données sur les Mtb peut donc fournir des modèles informatiques robustes sur le plan statistique permettant de concentrer les ressources sur les antituberculeux de petites molécules actives in vivo. Cela met en évidence un prédicteur rentable pour les tests in vivo ailleurs que dans d'autres maladies. PMID: 24665947


TB: Données pour TB Mobile 2

Publié par: TB Mobile 2.0 Updates Molecules: 79

PI: Sean Ekins

Publié: 3 / 19 / 2014

Composés 79 sélectionnés dans des articles récents avec une ou plusieurs cibles sur la tuberculose ajoutés à TB Mobile pour la version 2 de l'application. Des molécules supplémentaires 20 ont été utilisées en tant que test. Le document est soumis.


PARASITE: Écran de la boîte du paludisme MMV de Schistosoma mansoni

Publié par: CDIPD Vault Molecules: 400

Publié: 11 / 6 / 2013

Écrans de l'organisme complet de Schistosoma mansoni somules (larves post-infectieuses) et d'adultes avec les composés 400 constituant la boîte à paludisme MMV (http://www.mmv.org/malariabox). Seuls les composés de type "médicaments" contenant le phénotype le plus grave par rapport aux somules ont été testés sur des adultes. Les données sont également téléchargées sur ChEMBL. Contacter Conor Caffrey, Centre de découverte et d’innovation sur les maladies parasitaires (www.cdipd.org/), UCSF ([EMAIL PROTECTED]).


Kinase: Activité catalytique de la kinase (publication de Theonie Anastassiadis dans Nature Biotechnology)

Publié par: Kinase Catalytic Activity Molecules: 178

PI: Theonie Anastassiadis

Publié: 8 / 30 / 2013

Activité catalytique de la kinase

Nature Biotechnology 2011 octobre 30; 29 (11): 1039 – 1045.La bibliothèque testée comprenait des composés 178 connus pour inhiber les kinases de toutes les sous-familles de protéines kinases majeures. Par souci de simplicité, tous les composés ont été testés à une concentration de 0.5 µM ​​en présence de 10 µM ​​ATP. 0.5 µM ​​a été choisi malgré une IC50 moyenne rapportée pour ces composés vis-à-vis de leur cible principale 66 nM afin de capturer une activité inhibitrice hors cible plus faible. Chaque paire d'inhibiteur de kinase a été testée en double et les résultats ont été exprimés sous forme de phosphorylation moyenne du substrat en pourcentage. des réactions de contrôle de solvant (ci-après dénommée «activité kinase restante»). L'activité kinase restante moyenne pour chaque couple kinase-inhibiteur est présentée. Les données sur l'activité de la kinase ont été exprimées en pourcentage d'activité de kinase restante dans les échantillons à tester par rapport aux réactions du véhicule (diméthylsulfoxyde).


TB: Mettre à jour les médicaments et les prospects avec des cibles

Publié par: TB: médicaments et leads avec cibles - mise à jour Molecules: 38

Publié: 6 / 14 / 2013

Des composés publiés de la littérature récente sur la tuberculose avec des cibles connues à utiliser comme mise à jour également pour l'application mobile TB

KINASE: Ensemble d'inhibiteurs de kinase publiés par GSK (PKIS)

Publié par: Kinome2 Molecules: 364

Publié: 6 / 6 / 2013

L'ensemble d'inhibiteurs de kinases publiées de GSK (PKIS) est un ensemble d'inhibiteurs de la protéine kinase 367, qui a été annoté pour l'activité de la famille de la protéine kinase et est disponible pour les efforts de dépistage public. Des informations détaillées sur le jeu de dépistage peuvent être trouvées aux liens montrés ci-dessous. La base de données ChEMBL a été le site de référence pour les données de bio-essais sur cet ensemble. Dans un souci d’amélioration de l’accès aux données importantes, nous avons rassemblé les données PKIS que ChEMBL a aimablement rendues disponibles et nous les avons traitées de manière à ce qu’elles puissent être consultées ici sur le site Collaborative Drug Discovery (CDD) (un peu comme nous l’avons déjà fait pour le Kinase SARfari).

Le transfert vers CDD rend les données disponibles de manière plus conviviale. Nous avons également fait du ménage dans l’ensemble de données. Par exemple, il n’existe en réalité que des composés 364 (certains doublons étaient dus à des formes de sel ou à d’autres noms de la même molécule). Nous avons également essayé de normaliser les noms de cibles dans la mesure du possible (par exemple, les kinases IKKA, IKKB et IKKE étaient appelées IKK-alpha, IKK-bêta, IKK-epsilon pour l'ensemble de données de UNC). Non pas que nous soyons parfaits… nous apprécions également les corrections apportées à notre ensemble de données!

Pour résumer, il existe des composés 364 qui ont été testés sur des cibles 225 sur 0.1 et 1, uM. Dans cet ensemble de données, il n'y a qu'un seul protocole, mais les cibles 225 sont répertoriées dans une lecture. La concentration est également une lecture, il est donc facile de limiter les recherches aux écrans exécutés sous 1 et / ou 0.1.

Liens:

1) Plus d’informations sur le GSK PKIS

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2) Données de kinase ChEMBL antérieures sur CDD

https://www.collaborativedrug.com/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

KINASE: Composés ChEMBL Kinase SARfari et données BioAssay


Publié par: CDD Vault Molécules: 54211

PI: CDD

Publié: 3 / 27 / 2013

Une ressource précieuse disponible chez ChEMBL est la kinase SARfari, «un atelier intégré de chimiogénomique axé sur les kinases. Le système incorpore et relie la séquence, la structure, les composés et les données de dépistage de la kinase ». Ressource très utile, cette base de données met à disposition une grande quantité de données SAR pour les composés actifs de la kinase contre une vaste gamme de kinases dans un large éventail de tests, dont une grande partie a été extraite manuellement et préparée à partir de la littérature. Pour rendre ces données disponibles dans l'interface CDD, nous avons pris la table principale de Kinase SARfari et l'avons fusionnée avec une autre table clé de la base de données ChEMBL, en fournissant un champ décrivant le test utilisé dans chaque enregistrement avec beaucoup plus de détails que ceux disponibles dans SARfari natif. . Nous avons maintenant rendu cet ensemble de données fusionné disponible via l’interface CDD. Des données in vitro détaillées sont disponibles pour les kinases 400. De plus, des données fonctionnelles in vivo et ADMET sont également publiées.


TB: ARRA

Publié par: TB ARRA Molecules: 1924

PI: Bob Reynolds

Publié: 3 / 15 / 2013

Données du groupe SRI (Bob Reynolds) et Scott Franzblau - article soumis par Ekins et al.

Les résultats obtenus avec les écrans SRI précédents ont été utilisés pour rechercher des composés similaires dans les bibliothèques de fournisseurs. Ils ont été regroupés et testés in vitro dans une série de panels d’écrans acceptés pour les nouveaux candidats à la découverte de médicaments. Les composés ont également été utilisés comme série d’essais pour les modèles bayésiens générés précédemment, construits avec des informations sur la bioactivité et la cytotoxicité.


TB: GSK

Publié par: TB GSK Molecules: 177

PI: Sean Ekins, PhD

Publié: 2 / 8 / 2013

Données complémentaires du papier ChemMedChem 2013 de Ballell et al publié dans la presse "Alimenter la découverte de médicaments à code source ouvert: la petite molécule 177 mène à la lutte contre la tuberculose"

Les jeux de données originaux sont hébergés sur https://www.ebi.ac.uk/chemblntd. Seules les données M.tb sont présentées ici, mais davantage de données BCG sont disponibles sur ChEMBL.


TRYPANOSOME: Composés de la littérature sur la maladie de Chagas

Publié par: Chagas Public Data Molecules: 531

Publié: 12 / 21 / 2012

Les structures des composés et les références de la littérature ont été sélectionnées pour les molécules 531 testées contre Trypanosoma cruzi in vitro ou in vivo dans la littérature publiée.


TRYPANOSOME: Optimisation de séries chimiques spécifiques contre la trypanosomose humaine africaine (THA)

Publié par: Chagas Public Data Molecules: 5559

Publié: 12 / 12 / 2012

SCYNEXIS Inc, en tant que membre du Consortium d'optimisation des leads DNDi HAT, a développé et examiné les composés 4926 pour rechercher une activité contre T. brucei. Les structures composées et les données d'activité in vitro contre T. brucei brucei sont incluses. Données sur la cytotoxicité et activité contre les parasites eucaryotes apparentés T. brucei rhodesiense, L. donavani et P. falciparum pour un sous-ensemble de composés 34. Toutes les séries de composés rapportés ne sont plus en développement pour la THA car ils se sont avérés avoir une sélectivité médiocre ou des propriétés incompatibles avec l'activité in vivo. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRYPANOSOME: DNDi-Optimisation d'une série de fénarimol pour le traitement de la maladie de Chagas

Publié par: Chagas Public Data Molecules: 743

Publié: 12 / 9 / 2012

Le consortium d'optimisation des leaders DNDi, comprenant Epichem, l'Université Murdoch et CDCO, a développé et analysé une série SAR basée sur le fongicide végétal fenarimol. DNDi a rendu publiques les structures de composés, les données d'activité de T. cruzi et les données de toxicité de cellules L-6 pour les composés 743 de cette série dans ChEMBL-NTD. Les données sur les composés et les analyses biologiques sont incluses ici dans CDD Public. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRYPANOSOME: HTS principal large pour identifier les inhibiteurs de la réplication de T.Cruzi

Publié par: Chagas Public Data Molecules: 303230

Publié: 12 / 6 / 2012

Le Broad Institute a réalisé un criblage à haut débit des composés 303,224 en double dans la souche recombinante Tulahuen de Trypanosoma cruzi exprimant de manière stable la bêta-galactosidase reporter co-cultivée avec le fibroblaste de souris NIH3XXUMX de souris. Parmi les résultats obtenus avec 3, 4,394 ont fait l’objet d’une évaluation supplémentaire de l’activité inhibitrice et de la toxicité des cellules hôtes. Enfin, les composés 4,063 ont été sélectionnés comme composés de sonde potentiels et ensuite validés. Les données du criblage primaire et des dosages secondaires ultérieurs ont été déposées à PubChem. Les données sur les composés chimiques et les analyses biologiques pour le criblage primaire et six analyses secondaires de PubChem sont incluses ici dans CDD Public. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27


TB: Guzman et al., M.tb. Inhibiteurs de la murE ligase

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 8

PI: Sean Ekins

Publié: 12 / 6 / 2012

Données de dépistage basées sur des cellules entières et sur des cibles provenant de la publication TB suivante: Guzman JD, Gupta A, Evangelopoulos D, Basavannacharya C, Pabon LC, Plazas EA, Muñoz DR, Delgado WA, Cuca LE, Ribon W, Gibbons S, Bhakta S. J Antimicrob Chemother. 2010 Oct; 65 (10): 2101-7. Dépistage antituberculeux de produits naturels à partir de plantes colombiennes: 3-méthoxynordomesticine, un inhibiteur de la MurE ligase de Mycobacterium tuberculosis.


VENDEUR: Collection 2 du NIH Clinical Collection (molécules 281)

Publié par: NIH Clinical Collections Molecules: 281

PI: Chef de projet: Mei Steele

Publié: 11 / 21 / 2012

Les NIH Clinical Collection 2 sont des réseaux plaqués de petites molécules 281 qui ont des antécédents d'utilisation dans des essais cliniques sur l'homme. La collection a été assemblée par les Instituts nationaux de la santé (NIH) dans le cadre de l’Initiative de la feuille de route des bibliothèques moléculaires dans le cadre de sa mission qui consiste à permettre l’utilisation d’écrans composés dans la recherche biomédicale.


FOURNISSEUR: matrice de collecte clinique NIH (molécules 446)

Publié par: NIH Clinical Collections Molecules: 446

PI: Chef de projet: Mei Steele

Publié: 11 / 21 / 2012

La collection clinique des NIH est une gamme de petites molécules 446 qui ont déjà été utilisées dans des essais cliniques sur des humains. La collection a été assemblée par les Instituts nationaux de la santé (NIH) dans le cadre de l’Initiative de la feuille de route des bibliothèques moléculaires dans le cadre de sa mission qui consiste à permettre l’utilisation d’écrans composés dans la recherche biomédicale.


TB: Drogues et prospects avec cibles - données utilisées dans une application mobile

Publié par: Molécules et cibles SRI pour les applications mobiles Molécules: 707

Publié: 10 / 23 / 2012

Données actualisées sur les cibles de la tuberculose à caractère essentiel in vivo

informations provenant de TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB et Pubmed, ainsi que

autres références de Malabika Sarker au Stanford Research Institute.

Gyanu Lamichhane de l'Université Johns Hopkins a fourni l'essentiel

information.ref.http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Explorez cet ensemble de données sur mobile: https://itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


TOX: Médicaments et produits chimiques classés par hépatotoxicité

Publié par: CDD Vault Molécules: 83072

PI: CDD

Publié: 7 / 16 / 2012

Pfizer (Hu 2008) a précédemment établi une liste de médicaments et de produits chimiques dotés d'un système de classification basé sur des données cliniques concernant l'hépatotoxicité, afin d'évaluer une technologie de test d'imagerie par imagerie des hépatocytes humains in vitro (HIAT), ce qui a permis d'obtenir une concordance de 75% avec hépatotoxicité clinique. Ce même ensemble de données de composés causant ou non des lésions hépatiques induites par un médicament (DILI) a été utilisé avec des descripteurs moléculaires pour la prédiction in silico via des modèles bayésiens.


TB: Molécules ISR à activité cellulaire entière contre la tuberculose

Publié par: SRI Group Vault Molecules: 23

PI: Sean Ekins, PhD

Publié: 4 / 24 / 2012

Molécules évaluées dans Pharm Res. 2012 Apr 4. PMID: 22477069

Combinaison de méthodes de Cheminformatics et d’analyses de voies pour identifier des molécules ayant une activité de cellule entière contre Mycobacterium Tuberculosis.

Sarker M, Talcott C, Madrid P, Chopra S, Bunin BA, Lamichhane G, Freundlich JS, Ekins S.


PALUDISME: Boîte de paludisme MMV

Publié par: Public: Malaria Box Molecules: 400

Publié: 3 / 29 / 2012

Molécules de la boîte à paludisme MMV, ChEMBL-NTD (https://www.ebi.ac.uk/chemblntd): boîte à paludisme MMV, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows et Tim Wells. Médicaments contre le paludisme (MMV), Boîte postale 1826, 20, Route de Pré-Bois, 1215 Genève 15, Suisse et SCYNEXIS Inc. Boîte postale PO Box 12878 Triangle Park, Caroline du Nord 27709-2878 USA.

Tous les composés de Malaria Box ont été testés in vitro sur 3D7 (souche de P. falciparum sensible à la chloroquine (CQ) mais résistante à la sulfadoxine) et des essais de cytotoxicité ont été réalisés sur des lignées cellulaires de reins embryonnaires humains (HEK-293). Les données sont exprimées en EC50 en nM pour les données de falciparum.


ADME: ADMEdata.com - Un référentiel commercial de données ADME de haute qualité

Publié par: G2 Research ADMEdata.com Molecules: 1760

PI: George Grass

Publié: 1 / 13 / 2012

Exemples de: Perméabilité à Caco-2, Solubilité à l'équilibre @ Valeurs 5pH, Liaison aux protéines humaine, Rat de liaison aux protéines, Perméabilité intestinale chez le lapin, Partitionnement du plasma sanguin humain et hématocrite. Pour obtenir des jeux de données complets et des modèles, contactez directement George Glass, Pharm.D. Ph.D à [EMAIL PROTECTED] (distribué via CDD)


VENDOR: Collection Porse Building Blocks

Publié par: CDD Vault Molécules: 29241

PI: CDD

Publié: 1 / 13 / 2012

Porse File Chemical Co. se consacre à la synthèse de composés sur mesure pour la découverte de médicaments et propose une large gamme de produits à des prix compétitifs et de bonne qualité. L'ensemble actuel est un sous-ensemble sélectionné de nouveaux composés et composants de base de 1554 dans les familles Morpholine, Pipéridine, Pipérazine, Pyrimidine, acides aminés et API. www.porsefinechemical.com, [EMAIL PROTECTED] +86-20-28069055


PARASITES: Schistosoma mansoni schistosomula: Collections spectre et tueurs microsource

Publié par: Brian Suzuki's Sandbox Molecules: 119

Publié: 10 / 5 / 2011


Schistosoma mansoni schistosomula: écran phénotypique des collections spectre et tueur de microsource.

PI: Conor R. Caffrey

Publié: 10 / 5 / 2011

CDD: Public Data 119 hits

Dans le cadre d’une stratégie de repositionnement (repositionnement) du médicament visant à identifier de nouveaux antiparasitaires au Centre Sandler UCSF pour la découverte de médicaments, nous avons développé un criblage partiellement automatisé (phénotypique) du virus de la grippe qui cause la maladie tropicale infectieuse, la schistosomiase. Nous avons examiné les composés 1,260 des collections susmentionnées, notamment les médicaments, les composés apparentés aux médicaments, les produits naturels et divers composés. Nous rapportons les altérations phénotypiques dans les stades larvaires (schistosomula) de Schistosoma mansoni en utilisant des descripteurs simples pour exprimer les réponses multiples et dynamiques du parasite à l'insulte composée. La quantification complète des réponses phénotypiques est en cours. Les données présentées ne concernent que les composés «à succès»; la liste complète des composés des collections respectives peut être obtenue auprès de Microsource Discovery Systems Inc. [EMAIL PROTECTED] pour plus de détails. Découverte de médicaments pour la schistosomiase: les composés actifs et principaux identifiés dans une bibliothèque de médicaments connus par criblage phénotypique à débit moyen. Abdulla MH, DS Ruelas, B Wolff, J Snedecor, KC Lim, F Xu, AR Renslo, J Williams, McKerrow JH, CR Caffrey. PLoS Negl Trop Dis. 2009 juil. 14; 3 (7): e478.PMID: 19597541


TB: écran phénotypique de la bibliothèque de kinases SRI

Publié par: CDD Vault Molécules: 23823

PI: CDD

Publié: 8 / 29 / 2011

Des cibles de kinase sont recherchées dans diverses maladies au-delà de

cancer, y compris immunitaire et métabolique ainsi que virale, parasitaire,

fongique et bactérienne. En particulier, il existe un relativement récent

intérêt pour la kinase et les cibles de liaison à l'ATP chez Mycobacterium

tuberculose afin d'identifier les inhibiteurs et les médicaments potentiels pour

protéines essentielles qui ne sont pas ciblées par les schémas thérapeutiques actuels.

Ici, nous rapportons les résultats de criblage à haut débit pour une

bibliothèque d'environ 26,000 qui a été conçue à partir d'échafaudages d'inhibiteurs de kinases actuels et de sites de liaison de kinases connus. Les données phénotypiques présentées ici peuvent constituer la base de la sélection des échafaudages / composés pour des criblages enzymatiques supplémentaires contre des kinases spécifiques ou d'autres cibles de liaison à l'ATP chez Mycobacterium tuberculosis sur la base de l'activité apparente contre la bactérie entière in vitro.PMID: 21708485

Tuberculose (Edinb). 2011 Jun 25. [Epub ahead of print]

Copyright © 2011 Elsevier Ltd. Tous droits réservés.

Contactez Melinda Sosa pour plus de détails: [EMAIL PROTECTED]

Criblage à haut débit d'une bibliothèque basée sur un inhibiteur de kinase

échafaudages contre Mycobacterium tuberculosis H37Rv.

Reynolds RC, Ananthan S, Faaleolea E, Hobrath JV, Kwong CD, Maddox C, Rasmussen L, Sosa MI, Thammasuvimol E, White EL, Zhang W, Secrist JA 3rd.

Source: Institut de recherche du Sud, 2000 Ninth Avenue South,

Birmingham, AL 35205, États-Unis.


APPROUVÉ par la FDA: V1.1.0, Collection de produits pharmaceutiques NCGC (NPC)

Publié par: NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0 Molecules: 14579

PI: Noel Southall

Publié: 8 / 8 / 2011

La collection de produits pharmaceutiques du NCGC: une ressource complète de médicaments cliniquement approuvés permettant la réutilisation et la génomique chimique. Huang, R., Southall, N., Wang, Y., Yasgar, A., Shinn, P., Jadhav, A., D. Nguyen, Austin, C. Sci. Trad. Med 27. Avril 2011: Vol. 3, numéro 80, p. 80ps16.

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


VENDOR: Catalogue BioBlocks avec informations tarifaires

Publié par: BioBlocks Molecules: 2971

PI: Doug Murphy

Publié: 8 / 3 / 2011

Composés 2989.

BioBlocks propose une collection ciblée d’échafaudages, de blocs de construction et de fragments 2200 pré-qualifiés en tant que composants de médicaments. La majorité de ces composés sont uniquement proposés par BioBlocks et ont trouvé des applications allant des intermédiaires de la découverte de médicaments aux acides aminés de substitution en chimie des peptides.

Des informations actualisées sur les blocs de construction BioBlocks sont disponibles sur www.bioblocks.com.


TOX: données sur les lésions hépatiques d'origine médicamenteuse (DILI)

Publié par: BBB Molecules: 519

Publié: 4 / 29 / 2011

Données sur les lésions hépatiques induites par la drogue: l'ensemble d'entraînement est constitué de données expérimentales de Jim Xu et l'ensemble d'essai correspond à des données de la littérature.

publié dans Drug Metab Dispos. 2010 Dec; 38 (12): 2302-8. Epub 2010 Sep 15. Modèle bayésien prédictif à base de ligand pour les lésions hépatiques induites par un médicament humain.

Ekins S, Williams AJ, Xu JJ.

TB: base de données cible pour les gènes essentiels in vivo


Publié par: Base de données cible SRI TB Molecules: 314

PI: Sean Ekins

Publié: 4 / 21 / 2011

Données conservées pour les cibles de la tuberculose contenant des informations sur l’essentialité in vivo provenant de TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB et Pubmed, ainsi que d’autres références rassemblées par le Dr Malabika Sarker du Stanford Research Institute. Dr. Gyanu Lamichhane de l'Université Johns Hopkins est gentiment reconnu pour ses informations essentielles.

** Veuillez noter qu'il n'y a pas de petites molécules associées à cet ensemble de données **


VENDEUR: Enamine Library

Publié par: Enamine Molecules: 200000

PI: Dmytro Mykytenko

Publié: 4 / 12 / 2011

La bibliothèque de sélection diverse originale de 200K a été générée spécialement pour le médicament collaboratif

Utilisateurs de Discovery issus du plus grand stock mondial de composés de criblage disponibles dans le commerce

(sur les espèces 1.7 M). La bibliothèque contient des composés exclusifs de type médicament avec un ADME raffiné

Propriétés. Nos composés de haute qualité peuvent être sélectionnés et livrés immédiatement

différents formats.


REPOSITIONNEMENT, APPROUVÉ PAR LA FDA: médicaments recyclés à l'aide de méthodes HTS

Publié par: Réutilisation in vitro de molécules: 109

Publié: 3 / 18 / 2011

Drogues identifiées avec de nouvelles utilisations à l'aide de méthodes HTS. Ce tableau étend considérablement une version précédemment publiée "Ekins S, Williams AJ, MD Krasowski, Freundlich JS. Repositionnement in silico de médicaments approuvés pour les maladies rares et négligées. Drug Discov Today. 2011 Mar 1. PMID: 21376136 doi: 10.1016 / j.drudis .2011.02.016 Le tableau répertorie les molécules, Ancien usage / cible, Nouvel usage / cible, comment découvert et références.

Abréviations: CCR5, récepteur de la chimiokine 5; DHFR, dihydrofolate réductase; DOA, Drogues d'abus, FDA, Food and Drug Administration; GLT1, transporteur de glutamate 1; HSP-90, protéine de choc thermique 90; JHCCL, bibliothèque de composés cliniques John Hopkins; Mtb, Mycobacterium tuberculosis; NK-1, récepteur de neurokinine-1; OCTN2.


REPOSITIONNEMENT, APPROUVÉ PAR LA FDA: Produits désignés orphelins

Publié par: Maladies rares réorientant des molécules: 76

Publié: 3 / 18 / 2011

Tableau 2 de la FDA - extrait de la ressource FDA, la base de données de recherche sur les maladies rares (RDRD), qui répertorie les produits désignés par Orphan (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesign/ucm216147.htm) avec les mots clés approbation d'une indication de maladie rare. Ces données ont été analysées par Ekins et Williams (document soumis).


REPOSITIONNEMENT, APPROUVÉ PAR LA FDA: Produits désignés orphelins

Publié par: Maladies rares réorientant des molécules: 105

Publié: 3 / 18 / 2011

Tableau 1 de la FDA - extrait de la ressource FDA, la base de données de recherche sur les maladies rares (RDRD), qui répertorie les produits désignés par Orphan (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesign/ucm216147.htm) avec les mots clés approbation d'une indication commune de maladie.

La FDA n'a pas associé les données aux structures moléculaires.


VENDEUR: Bibliothèque pilote du Colorado Center for Drug Discovery

Publié par: C2D2 Public Molecules: 2240

PI: Greg Miknis, directeur associé

Publié: 3 / 7 / 2011

La bibliothèque contient de petites molécules structurellement diverses qui sont conformes aux critères du type de médicament. Plusieurs chimotypes sont représentés et la bibliothèque est conçue pour être applicable à une grande variété de cibles potentielles.

Pour demander des informations sur la collection, veuillez envoyer une demande à [EMAIL PROTECTED]


LIPID: Base de données sur la structure des cartes lipidiques

Publié par: Lipid Maps Database Molecules: 22215

PI: passerelle lipidomique

Publié: 2 / 11 / 2011

Les structures des cartes lipidiques (http://www.lipidmaps.org/) ont été annotées avec des ions communs 5 (H +, 2H ++, K +, Na +, NH4 +), y compris des acyles gras de mammifères, des glycérolipides, des glycérophospholipides, des sphingolipides, des lipidolipides, des lipides stérol et des lipides prénol . Les structures et les ions peuvent être recherchés par structure et par poids moléculaire pour faciliter l'identification de nouveaux lipides.


TB: Mycobacterium drugome

Publié par: métabolites virtuels Molécules: 274

Publié: 11 / 5 / 2010

Ensemble de données sur les médicaments 274 (approuvés pour une utilisation humaine aux États-Unis et en Europe) tiré d'une publication de Kinnings et al., PLoS Computational Biology, vol 6: e1000976 (2010)

Médicaments co-cristallisés avec au moins une structure dans la PDB. Cet ensemble de données peut être utilisé avec les autres ensembles de données de dépistage de la tuberculose dans le DDP pour déterminer lesquels de ces médicaments approuvés ont une activité contre le Mtb (d'après la littérature.

TB: Inhibiteurs de Mtb non répliquant de la littérature


Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 26

PI: Sean Ekins

Publié: 10 / 28 / 2010

Structures et données des articles publiés:

Darby et Nathan J Chemothermie antimicrob 2010: 65: 1424-1427

Bryk et al., Cell Host et Microbe 2008: 3: 137-145

Lin et al., Arch Biochem Biophys. 2010 501: 214-220

Lin et al., J Biol Chem 2008: 283: 34423-34431

de Cavalho et al: J Med Chem 2009: 52: 5789-5792

Lin et al., Nature 2009: 461: 621-626


VENDEUR: Astatech, Inc. Collection de blocs de construction

Publié par: Astatech, Inc. Molecules: 6140

Publié: 10 / 15 / 2010

AstaTech, Inc. propose des intermédiaires avancés et innovants pour faciliter le processus de découverte de médicaments. Notre vaste sélection comprend des blocs de construction, de nouvelles amines, des amines protégées, des acides aminés non naturels, des cétones, des aldéhydes, des hétérocycles, des anhydrides isatoïques, des acides boroinc et des intermédiaires chiraux. Contact [EMAIL PROTECTED] pour commander des informations.


VENDOR: Catalogue Chemik 2010

Publié par: CDD Vault Molécules: 3889

PI: CDD

Publié: 10 / 5 / 2010

Chemik a aidé avec succès des sociétés de découverte de médicaments telles que Wyeth dans leurs projets en phase initiale. Nous fournissons la matière première et les intermédiaires clés, du gramme au multi-tonnes. Forts de nombreuses années d’expérience dans le domaine 10, nous pouvons aider nos clients à développer un nouvel intermédiaire dans les semaines 4-6 avec des prix compétitifs, une qualité supérieure et un service continu.


PALUDISME: Phénanthrène et Aminoalcools Anthracéniques

Publié par: CDD Vault Molécules: 35

PI: CDD

Publié: 9 / 21 / 2010

Données antipaludiques vs P. berghei chez des souris pour des chlorhydrates d'aminoalcool substitués par un groupe anthracène substitué par un atome d'halogène et phénanthrène. Vingt-sept composés ont montré une activité (Augmentation du temps de survie moyen> 6 jours); huit composés étaient curatifs (IMST> 60 jours). Le tableau inclut les identifiants PubMed pour les détails et les synthèses.


TB: Activité BCG / MTB

Publié par: Novartis: Molécules de données sur la tuberculose: 283

PI: Srinivasa Rao

Publié: 9 / 15 / 2010

Aerobic BCG Activty (MIC50) - composés 274

Activité aérobique MTB (MIC50) - composés 283

Activité ATP anaérobie du BCG (IC50) - composés 283

Activité ATP anaérobie MTB (IC50) - composés 283

Cytotoxicité (CC50) - Composés 223 - Mots clés: Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, TB


PALUDISME: JHU JHCCL Inhibition de Plasmodium falciparum

Publié par: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Molecules: 2693

Publié: 6 / 4 / 2010

Pourcentage d'inhibition des médicaments approuvés par 2663 chez 10 microM

TB, PALUDISME: prévisions bayésiennes pour les cas de paludisme à GSK


Publié par: GSK Data Bayesian Models (Ekins, et al.) Molecules: 13355

PI: Sean Ekins

Publié: 5 / 28 / 2010

Prévisions pour les cas de paludisme chez GSK (publiées par Gamo et al., Nature 465: 305-310 (2010)) à l'aide de modèles bayésiens (publiées par Ekins et par Mol, BioNyst 6: 840-851 (2010)).

Les seuils d'activité (modèle 220,000> 0.31, modèle 2,200> -1.37 sont classés comme actifs dans l'écran de cellules entier).

PALUDISME: Ensemble de données sur le paludisme à cellules entières de l'Hôpital de recherche pour enfants St. Jude


Publié par: St. Jude - Paludisme / Trypanosome Bioactives Molécules: 1524

PI: Kip Guy

Publié: 5 / 26 / 2010

Données supplémentaires pour Nature Article publié par St. Jude CRH (Guiguemde, W, et al., Génétique chimique de Plasmodium falciparum. Nature 465, 311-315 (20 mai 2010)), y compris les structures 1524 testées dans un écran primaire, avec des données supplémentaires dans huit protocoles: analyse Bland-Altman, propriétés ADMET calculées, criblage phylochimogénétique, dosages de sensibilité, synergie et enzymes, ainsi qu’une analyse de fusion thermique.


PALUDISME: Jeu de données Novartis GNF-Pf

Publié par: Novartis Malaria Molecules: 5695

Publié: 5 / 21 / 2010

Les souches de Plasmodium falciparum 3d7 (sensibles à la drogue) et W2 (chloroquine, quinine, pyriméthamine, résistantes à la sulfadoxine), obtenues à partir de MR4, ont été testées dans le cadre d'un test d'infection à base d'érythrocyte, en vue d'une inhibition de la prolifération composés sélectionnés.


FOURNISSEUR: Kit de dépistage anti-paludisme Novel ASINEX Novel

Publié par: ASINEX Molecules: 1

PI: Mark Parisi

Publié: 5 / 20 / 2010

ENSEMBLE DE DONNÉES CONFIDENTIELLES: 594 Nouveaux composés d'ASINEX. Veuillez consulter le fichier ci-joint qui décrit la conception ASINEX.

POUR ACCÈS: Nouveaux utilisateurs CDD - votre enregistrement sera passé par un processus d'approbation avant que l'accès à l'ensemble de données ne soit accordé. Utilisateurs de CDD existants - veuillez contacter [EMAIL PROTECTED]


VENDEUR: ASINEX Tres Cantos (GSK) Antimalarial Subset

Publié par: ASINEX Molecules: 278

PI: Mark Parisi

Publié: 5 / 20 / 2010

Données 278 ASINEX actives anti-paludisme correspondant aux données GSK.

DISPONIBLE POUR EXAMEN IMMÉDIATE. L'ensemble de données correspondant est la propriété exclusive d'ASINEX.Pour plus d'informations, veuillez contacter Mark Parisi: Courriel: [EMAIL PROTECTED]

Téléphone: 1-877-ASINEX1

Fax: 1-336-721 1618-


PALUDISME: Ensemble antipaludéen Tres Cantos (TCAMS)

Publié par: Données anti-paludisme de GSK Molecules: 13471

PI: Javier Gamo

Publié: 5 / 19 / 2010

Criblage d'environ 2 millions de composés dans la bibliothèque de criblage de GlaxoSmithKline identifiée par le biais d'inhibiteurs 13,500 de la prolifération de P. falciparum dans les érythrocytes humains. Les travaux ont été réalisés sur le campus de développement de médicaments de Tres Cantos, GlaxoSmithKline, Severa Ochoa 2 et 28760 Tres Cantos, en Espagne.

TB: Sacchettini et. Al. examen - agents antituberculeux supplémentaires

Publié par: PK Molecules: 18

Publié: 2 / 5 / 2010

Antituberculeux non approuvés de la figure 1 dans Sacchettini JC, Rubin EJ et Freundlich JS Médicaments versus bogues: à la recherche du prédateur persistant Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008).


TB: Données sur les brevets de petites molécules sur la tuberculose

Publié par: TB Patent Data Molecules: 20775

PI: Découverte collaborative de médicaments

Publié: 1 / 27 / 2010

Structures et informations sur les brevets concernant la recherche sur la tuberculose auprès de l'Office américain des brevets et des marques, de l'Office européen des brevets et de l'Organisation mondiale de la propriété intellectuelle.


TB: Makarov et al., Consortiums NM4TB

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 32

PI: Sean Ekins

Publié: 1 / 21 / 2010

Données de relation de structure-activité pour 1,3-benzothiazin-4-ones (BTZ). Données obtenues à partir de l'article "Benzothiazinones Kill Mycobacterium tuberculosis en bloquant la synthèse d'arabinane" publié dans Science par Makarov et al., 2009 et collègues du consortium NM4TB (PMID: 19299584).


VENDOR: TimTec Diversity Set

Publié par: TimTec Molecules: 9998

PI: Vendeur

Publié: 1 / 5 / 2010

Bibliothèque de criblage de divers composés du type médicament 10,000


FOURNISSEUR: Analogs SET de TimTec OGT-Inhibitors

Publié par: TimTec Molecules: 334

PI: Vendeur

Publié: 1 / 5 / 2010

Inhibiteurs de l'O-GlcNAc Transferase Analogues SET


VENDOR: TimTec ActiTarg-K, Modulateurs de Kinase

Publié par: TimTec Molecules: 6212

PI: Vendeur

Publié: 1 / 5 / 2010

ActiTarg-K, compte sur les composés 6,000 fournissant une bibliothèque de criblage de haute qualité de molécules de type médicament afin d'identifier la direction de synthèse de nouveaux inhibiteurs de protéine kinase

VENDOR: Bibliothèque de produits dérivés de produits naturels TimTec

Publié par: TimTec Molecules: 3001

PI: Vendeur

Publié: 1 / 5 / 2010

Dérivés naturels NDL-3000 de TimTec


VENDOR: Bibliothèque de produits naturels TimTec

Publié par: TimTec Molecules: 479

PI: Vendeur

Publié: 1 / 5 / 2010

Produits naturels purs NPL de TimTec


VENDOR: Bibliothèque de criblage

Publié par: AsisChem Molecules: 43121

Publié: 10 / 26 / 2009

Une collection de composés de petites molécules similaires à des médicaments 40,000 disponibles pour votre sélection personnalisée. Tous les composés sont en stock jusqu'à 25mg.


VENDEUR: Building Blocks

Publié par: AsisChem Molecules: 176

Publié: 10 / 26 / 2009

Une collection de composés utiles dans la découverte de médicaments. Tous les composés, s'ils ne sont pas en stock, sont disponibles dans quelques semaines pour des quantités allant jusqu'à 10 grammes.


TB: TAACF - Bibliothèque NIAID CB2

Publié par: Southern Research Institute Molecules: 102634

PI: Robert Goldman

Publié: 9 / 30 / 2009

Résultats du criblage d'une banque de composés commerciaux (ChemBridge) pour la capacité d'inhiber la croissance de la souche H37Rv de M. tuberculosis. Voir PMID: 19758845


TB: inhibiteurs d'EthR (Willand et al.)

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 5

PI: Sean Ekins

Publié: 9 / 28 / 2009

Inhibiteurs de type répressif du répresseur de transcription EthR. Molécules et données de Willand et al. Nature Medicine 15: 537-544 (2009) PMID: 19412174


VENDOR, ADME: Données de référence provenant d’un ensemble de médicaments commerciaux structurellement divers.

Publié par: NM4TB: Karlen Group Site Molecules: 24

PI: Anders Karlen

Publié: 6 / 11 / 2009

Une analyse multivariée des médicaments sur le marché suédois a servi de base à la sélection d'un petit ensemble de composés médicamenteux physico-chimiques variés de 24. Des facteurs tels que la diversité structurelle, la disponibilité commerciale, le prix et une technique d'analyse appropriée pour la quantification ont été pris en compte dans la sélection. La lipophilie, le pKa, la solubilité et la perméabilité sur des monocouches de cellules humaines Caco-2 ont été mesurés pour l'ensemble de données compilées. Nous prévoyons que cet ensemble de données pourra servir d’ensemble de référence pour la validation de nouvelles techniques expérimentales ou de modèles in silico. Il peut également être utilisé comme un ensemble de données de départ diversifié pour le développement de nouveaux modèles informatiques.

Données extraites de:

Présentation d'un ensemble de données sur les médicaments structurellement divers et disponibles dans le commerce pour des études de corrélation et d'analyse comparative.

Sköld C, Winiwarter S, J Wernevik, F Bergström, L Engström, R Allen, Box K, Comer J, Mole J, Hallberg A, Lennernäs H, Lundstedt T, Ungell AL, Karlén A.

J Med Chem. 2006 nov. 16; 49 (23): 6660-71.


TB: Données d'absorption de la littérature publiée

Publié par: CDD: Documentation sur la tuberculose organisée Molécules: 24

Publié: 5 / 28 / 2009

TB Absorption Données de l'article de référence

Inhibition de la biosynthèse des sidérophores par des analogues de 2'-O- [N- (salicyl) sulfamoyle] adénosine substitués par 5-triazole: nucléosides antibactériens efficaces contre Mycobacterium tuberculosis.

Gupte, A .; Boshoff, HI; Wilson, DJ; Neres, J .; Labello, NP; Somu, RV; Xing, C .; Barry, CE; Aldrich, CC

J Med Chem (2008), volume 51, pas de 23, pp 7495-7507, données de perméabilité.


TB: données pharmacocinétiques de la littérature publiée

Publié par: CDD: Documentation sur la tuberculose organisée Molécules: 28

Publié: 5 / 28 / 2009

Données pharmacocinétiques sur la tuberculose provenant de sources publiées. Données SAR pour 28 unique, ainsi que pour les composés courants.

Les données incluent les citations PubMed, les cibles, les cellules et organismes testés, la biodisponibilité, Vm, Vd, Cmax, etc.


TB: Données de toxicité de la littérature publiée

Publié par: CDD: Documentation sur la tuberculose organisée Molécules: 638

Publié: 5 / 28 / 2009

Données sur la toxicité de la tuberculose provenant de sources publiées. Données SAR pour 638 unique, ainsi que des composés courants provenant de références PubMed.

Les données incluent les citations PubMed, les cibles, les testicules de cellules et d’organismes, la viabilité des cellules, LD50, CC50, MNTD, etc.


TB: Données d'efficacité de la littérature publiée

Publié par: CDD: Documentation sur la tuberculose organisée Molécules: 6768

Publié: 5 / 28 / 2009

Données sur l'efficacité de la tuberculose provenant de sources documentaires publiées. Données SAR pour 6771 unique, ainsi que des composés courants provenant de plus de références de 300 PubMed.

Les données incluent les citations PubMed, les cibles, les testicules de cellules et d’organismes, la CMI, le% d’inhibition, EC50-EC100, IC50, etc.


TB: MLSMR

Publié par: Southern Research Institute Molecules: 214507

PI: Robert Goldman

Publié: 5 / 8 / 2009

Une collection diversifiée de composés de plus de 200,000 collectés par le référentiel de petites molécules de Molecular Libraries (MLSMR) a été mise à la disposition du centre de criblage Southern Research Molecular Libraries de Spring 2008 pour un test primaire contre Mtb H37Rv. Les composés les plus actifs de ce criblage primaire ont été sélectionnés et testés à des concentrations de 10 dans un test de réponse à la dose contre H37Rv ainsi que dans un contre-écran de cytotoxicité utilisant des cellules Vero.


PALUDISME: Bibliothèque de composés cliniques Johns Hopkins

Publié par: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Molecules: 1878

Publié: 4 / 28 / 2009

Les médicaments ont été criblés à une concentration de 10 µM. Des parasites synchronisés au stade de cycle provenant de 3D7 sensible à la chloroquine ou de Dd2 multirésistant ont été cultivés dans un milieu RPN 1640 avec du sérum humain 10% et incubés pour 48 ou 96 h en présence de médicament et de [3H] -hypoxanthine. Une plaque à puits 96 avec 0.2 mL de matériau de culture par puits à 0.2% parasitémie et 2-4% hématocrite donne un signal d'incorporation radioactive d'environ 10,000 cpm à 48 h et 20,000 cpm à 96 h avec des fonds de page moins importants que 500 cpm. Les expériences de criblage ont été effectuées en double et le pourcentage d'inhibition est indiqué comme la moyenne de deux expériences.


TB: Revue de littérature

Publié par: TB Literature Data Molecules: 49

PI: Ballel et al.

Publié: 4 / 17 / 2009

Données SAR sur la tuberculose compilées dans une enquête sur les agents actifs contre M. tuberculosis, y compris ceux dont les modes d'action sont connus et inconnus (Ballel et coll., «Nouveaux antimycobactéries synthétiques à petite molécule» dans Agents antimicrobiens et chimiothérapie, June 2005). Mise à jour de 4 / 17 avec TubercuList / TBDB / autres liens cibles et références améliorées.


TB: Sacchettini et al., Compte rendu

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 14

PI: Sean Ekins

Publié: 2 / 18 / 2009

Antituberculeux de première et de deuxième intention des tableaux 1 et 2 dans Sacchettini JC, Rubin EJ et Freundlich JS Drogues versus insectes: à la recherche du prédateur persistant Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41, 52-2008, (XNUMX).


VENDOR: IUPUI - Données publiques sur la découverte de médicaments distribués (D3)

Publié par: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Molecules: 48818

PI: MJ O'Donnell et WL Scott

Publié: 1 / 1 / 2009

Catalogue virtuel en libre accès d'acides aminés non naturels acylés et de leurs esters méthyliques. Nous encourageons nos collègues à communiquer avec nous concernant l'intérêt porté au projet Distributed Drug Discovery et à la méthodologie de synthèse, décrits dans une série de trois articles dans le Journal of Combinatorial Chemistry (sous presse).


VENDEUR: Blocs de construction ASINEX

Publié par: ASINEX Molecules: 6745

PI: Mark Parisi

Publié: 12 / 23 / 2008

Médicament comme Building Blocks, si vous envisagez un programme d’optimisation du plomb, nos Building Blocks peuvent se révéler être exactement ce que vous recherchez.


PARASITES: senteurs

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 228

PI: Sean Ekins

Publié: 12 / 21 / 2008

Données sur les noms de molécules et de structures pour les odeurs extraites d'un livre de Roman Kaiser, intitulé "senteurs significatives dans le monde", publié par Wiley-VCH au format 2006. Le numéro de molécule se rapporte à leur numérotation dans le livre.


TOX: toxcast

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 306

PI: Sean Ekins

Publié: 12 / 18 / 2008

La bibliothèque de toxcast EPA de composés (principalement des pesticides) est disponible à l'adresse http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


APPROUVÉ par la FDA, TOX: Dose journalière maximale recommandée

Publié par: CDD - Sean Ekins Molecules: 1215

PI: Sean Ekins

Publié: 12 / 10 / 2008

Une base de données de la FDA qui contient les valeurs de dose journalières maximales recommandées pour les produits pharmaceutiques supérieurs à 1200. L'ensemble de données représente certaines des molécules utilisées dans la publication suivante Matthews, EJ et coll., Technologies de découverte de médicaments en cours, 1 (1): 61-76. (2004)


VENDEUR: Traditions ayurvédiques face aux besoins actuels en matière de santé et de bien-être

Publié par: Falguni Dasgupta: Compilation de données personnelles Molécules: 37

PI: Falguni Dasgupta

Publié: 10 / 30 / 2008

L’utilisation traditionnelle des plantes médicinales indiennes et de leurs extraits fait l’objet d’une discussion sur les perspectives modernes dans le but de trouver des bases communes, de réévaluer les revendications et de créer des opportunités dans le domaine Santé et Bien-être conformément aux exigences réglementaires, ainsi que de rechercher de nouveaux médicaments. "


PARASITES: Bibliothèque d'inhibiteurs de protéase cystéine Celera de Sandler-UCSF

Publié par: McKerrow Group Molecules: 1860

PI: Jim McKerrow

Publié: 10 / 23 / 2008

T. cruzi et T. brucei in vitro et criblage d'enzymes spécifiques.


APPROUVÉ PAR LA FDA: Drogues approuvées

Publié par: Bibliothèque de composés cliniques Johns Hopkins Molecules: 2815

PI: David Sullivan

Publié: 10 / 16 / 2008

Médicaments approuvés par la FDA avec une structure moléculaire définie, y compris les molécules 763 de Physicians 'Desk Reference, 780 de DrugBank, 1151 du livre orange 2007 et 1007 de la liste du FDA du Dr. Chris Lipinski


VENDEUR: ASINEX GPCR Focused Library

Publié par: ASINEX Molecules: 3502

PI: Mark Parisi

Publié: 10 / 2 / 2008

Haute qualité exceptionnellement médicamenteux comme ensemble orienté GPCR disponible à un taux réduit pour la communauté CDD. Cette bibliothèque intègre notre expertise en chimie médicinale et notre capacité à identifier des fragments privilégiés de la littérature et à les assembler de manière inédite.


GPCR: Base de données PDSP Ki

Publié par: PDSP Ki Database Molecules: 20026

PI: Bryan Roth

Publié: 9 / 16 / 2008

Valeurs supérieures à 47,000 Ki par rapport aux cibles 699 GPCR de la base de données du Programme de dépistage des drogues psychoactives (PDSP) du NIMH


VENDOR: Bibliothèques ASINEX Synergy

Publié par: ASINEX Molecules: 25008

PI: Mark Parisi

Publié: 4 / 26 / 2008

ASINEX a développé une nouvelle bibliothèque à haute diversité riche en fragments de pharmacophore ressemblant à des médicaments. La conception de la bibliothèque repose sur deux formes de Synergy. Le premier concerne les relations entre des techniques orientées diverses et ciblées, le second implique la convergence d’intermédiaires clés à plusieurs étapes (étapes 6-9) afin de créer des composés sophistiqués. Voir le PDF ci-dessous pour plus de détails.


TOX: Structures avec données publiques des profils de toxicité connus

Publié par: Structures ayant des profils de toxicité connus Molecules: 135

PI: Sean Ekins, PhD

Publié: 3 / 28 / 2008

Profils de toxicité tissulaire spécifiques de composés connus avec références


INHIBITEURS PROMISTIQUES: Shoichet publie des inhibiteurs de la promiscuité

Publié par: Shoichet a publié des inhibiteurs de la promiscuité Molécules: 111

PI: Brian Shoichet

Publié: 3 / 26 / 2008

Agrégats créant des "faux positifs" par auto-association de molécules organiques en solution aqueuse


TOX: UC Davis - Données publiques de Hammock

Publié par: UC Davis - Hammock Molecules: 714

PI: Bruce Hammock

Publié: 3 / 17 / 2008

Inhibiteurs de l'époxyde hydrolase soluble (SEH) - ces enzymes ont pour principales fonctions 3: détoxication, catabolisme et régulation des molécules de signalisation.


PALUDISME, TRYPANOSOME: St. Jude Public Data

Publié par: St. Jude - Paludisme / Trypanosome Bioactives Molécules: 2426

PI: Kip Guy

Publié: 3 / 5 / 2008

Résultats du libre accès du laboratoire de Kip Guy à l'Hôpital de recherche pour enfants St. Jude, y compris HTS de substances bioactives contre le paludisme et T. brucei


PALUDISME: Drexel Public Data

Publié par: Université de Drexel Molecules: 195

PI: Jean-Claude Bradley

Publié: 3 / 2 / 2008

Résultats d'une collaboration ouverte sur les données ouvertes entre

Drexel (produits Ugi-4CC) et UCSF (dépistage antipaludéen). Cet ensemble de données représente un exemple de la manière dont les chercheurs peuvent choisir de publier les résultats sélectionnés de manière ouverte. (Par défaut, tous les groupes sont privés.)


PALUDISME: Enquête de l'armée américaine

Publié par: US Army Malaria Literature Survey Molecules: 12318

Publié: 2 / 29 / 2008

Une vaste collection de données DAS animales contenant des médicaments antipaludiques, y compris des structures chimiques, des données de bioactivité, des données pharmacologiques et des données de toxicité (Publié à l'origine par l'armée américaine dans 1946 sous le titre «Enquête sur les médicaments antipaludiques»)


PALUDISME: PlasmoDB

Publié par: UPenn - Paludisme Données de la littérature Molécules: 120

PI: David Roos

Publié: 2 / 19 / 2008

PlasmoDB des inhibiteurs du paludisme compilés à partir de la littérature, y compris la structure chimique, l'identifiant du gène PlasmoDB, le nom du gène cible et les références contre P. falciparum, P. vivax, P. berghei, P. yoelii, P. chabaudi, P. vinckei petteri


PALUDISME: Produits Naturels (NPPDB)

Publié par: Centre national de recherche sur les produits naturels Molécules: 426

PI: Babu Tekwani

Publié: 2 / 15 / 2008

Base de données antipaludique sur les produits naturels contenant des flavones, y compris les données sur l'antipaludique et la cytotoxicité (Université du Mississippi, Centre national de recherche sur les produits naturels)


TB: Résultats du test TAACF

Publié par: Programme de découverte de médicaments en phase précoce de tuberculose Molécules: 812

PI: Bernard Munos

Publié: 2 / 12 / 2008

Activité antibactérienne d'une bibliothèque de composés 812 contre Mycobacterium tuberculosis (H37Rv) disponible au public dans le dosage de cellules entières au bleu Alamar


APPROUVÉ par la FDA: médicaments orphelins

Publié par: Molécules connues: 1721

PI: Christopher Lipinski

Publié: 10 / 26 / 2007

Médicaments approuvés par la FDA avec les indications désignées, le nom du sponsor et les structures chimiques (le cas échéant)