Le programme de dépistage des médicaments psychoactifs du NIMH et Collaborative Drug Discovery mettent à la disposition de l'ensemble de la communauté des chercheurs de médicaments une base de données sur les relations structure-activité des RCPG consultable chimiquement.

15 octobre 2008

Collaborative Drug Discovery, Inc. (CDD), en partenariat avec le NIMH Psychoactive Drug Screening Program (PDSP) dirigé par le Dr Bryan L. Roth de l'Université de Caroline du Nord Chapel Hill, a annoncé aujourd'hui que le logiciel en ligne CDDhéberge désormais la plus grande base de données Ki de récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) en libre accès, permettant la recherche de sous-structures chimiques et de similitudes. La base de données Ki des RCPG, qui comprend 47 312 constantes de dissociation à l'équilibre des inhibiteurs (valeurs Ki) pour 699 cibles de récepteurs, est désormais disponible sous forme de base de données interrogeable par structure dans le système d'information de recherche collaborative Web 2.0 de CDD .

La base de données Ki du RSDP est une ressource unique dans le domaine public qui fournit des informations sur la capacité des médicaments à interagir avec un nombre croissant de cibles moléculaires. La base de données Ki sert d'entrepôt de données pour les valeurs Ki, ou affinité, publiées et dérivées à l'interne pour un grand nombre de médicaments et de candidats-médicaments sur un nombre croissant de récepteurs couplés aux protéines G, de canaux ioniques, de transporteurs et d'enzymes.

"Le site web de la base de données Ki du RSDP, hébergé par le Centre médical de l'Université de Caroline du Nord, a reçu environ 1 million de visites au cours de l'année dernière", a déclaré le Dr Bryan Roth, directeur du projet RSDP et professeur de pharmacologie. Ces données sont maintenant disponibles avec la recherche de structure chimique dans le système CDD pour que tout le monde puisse les consulter. Le Dr Roth ajoute : "La base de données CDD est une plateforme extrêmement élégante. Je la recommande vivement à tous ceux qui génèrent des données sur la découverte de médicaments."

"C'est un privilège de travailler avec le Dr Bryan Roth pour fournir un accès ouvert aux données du PDSP Ki via la plateforme CDD ", a déclaré le Dr Barry Bunin, président de Collaborative Drug Discovery. "Le siteCDD fournit les données du RSDP Ki dans une base de données traditionnelle exploitable par structure/SAR, combinée à des capacités d'intégration de données publiques et privées, sécurisées et collaboratives, inédites dans le monde. Avec ~40% de tous les médicaments à petites molécules agissant sur les cibles des RCPG, cela aidera la communauté des chercheurs à développer de nouveaux médicaments et à mieux prévoir les effets secondaires potentiels des médicaments hors cible et les interférences probables entre médicaments."

La base de données PDSP Ki rejoint 12 autres sources de données accessibles au public dans le système CDD avec des données chimiques et biologiques pour plus de 40 000 composés, notamment :

  • 1 700 médicaments approuvés par la FDA avec leurs indications et leurs promoteurs
  • Plus de 15 000 composés avec des données sur le paludisme provenant de 5 sources de données publiques.
  • Plus de 850 composés présentant des informations sur l'activité antibactérienne de la tuberculose
  • Un ensemble de données de près de 3 500 produits naturels et dérivés
  • Plus de 25 000 composés disponibles à l'achat

À propos du programme de dépistage des drogues psychoactives du NIMH

Le programme de dépistage des drogues psychoactives (PDSP) du NIMH - http://pdsp.med.unc.edu - assure le dépistage de nouveaux composés psychoactifs pour leur activité pharmacologique et fonctionnelle au niveau des récepteurs, canaux et transporteurs clonés du SNC chez l'homme ou le rongeur, en tant que contractant du National Institute of Mental Health (NIMH). Le dépistage des composés est fourni gratuitement aux chercheurs universitaires qualifiés en utilisant des tests pour un grand nombre d'ADNc humains ou de rongeurs clonés pour les récepteurs, les canaux et les transporteurs du SNC, ainsi que des tests fonctionnels pour déterminer les effets sur les systèmes de second messager, l'activité des canaux et la fonction des transporteurs. Les valeurs Ki sont calculées et enregistrées dans la base de données du PDSP. Des récepteurs clonés sont également disponibles gratuitement pour les chercheurs qualifiés. Pour obtenir une liste des récepteurs/transporteurs actuels, consultez le site http://pdsp.med.unc.edu/pdspw/clones.php.

Pour de plus amples informations, veuillez contacter

Barry Bunin, PhD
Président et PDG
Collaborative Drug Discovery (CDD)
1818 Gilbreth Road, Suite 220
Burlingame, CA 94010
Téléphone : 650-204-3084
[email protected]

Bryan Roth, M.D., Ph.D.
Université de Caroline du Nord Chapel Hill
Département de pharmacologie École de médecine
CB 7365, 8032 Bâtiment Burnett-Womack
Chapel Hill, NC 27599
Téléphone : 919-966-7535
Fax : 919-843-5788
[email protected]