Accesso pubblico

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Base Ark Perlara

Pubblicato da: Perlstein Lab Molecules: 56756

PI: Ethan Perlstein

Pubblicato: 10 / 27 / 2019

Un corpus di dati fenotipici di screening fenotipico basato su un modello completamente open source composto da riprogettazione di farmaci e schermate di scoperta di piombo in modelli di lievito, verme, mosca e cellule umane di errori congeniti del metabolismo come la malattia lisosomiale e disturbi congeniti della glicosilazione. Questi dati sono stati pubblicati in tre casi di studio sulle riviste G3 (Lao et al., 2019 https://www.g3journal.org/contenuti / 9 / 2 / 413.long) e modelli e meccanismi delle malattie (Iyer et al., 2019a https://dmm.biologists.org/contenuti / inizio / 2019 / 09 / 18 / DMM.040576.long; Iyer et al., 2019b https://dmm.biologists.org/contenuti / inizio / 2019 / 10 / 19 / DMM.040584.long).


Recettore della serotonina in vitro e attività in vivo

Pubblicato da: Nichols Molecules: 84

PI: Dave Nichols

Pubblicato: 10 / 14 / 2019

I set di dati si concentrano sui sistemi cerebrali che utilizzano la dopamina o la serotonina come neurotrasmettitore. Ciò include sonde molecolari che hanno specificità solo per uno dei cinque tipi generali di recettori della dopamina (D1 - D5), nonché set di dati su serotonina 5-HT1A, 5-HT2A e 5-HT2C. Questi progetti comprendono una sistematica modifica strutturale, unita a saggi farmacologici, al fine di identificare i determinanti strutturali del dominio legante i ligandi in questi recettori. Un tema di questo lavoro è stato quello di identificare come molecole di diverse classi chimiche possano essere sistemate all'interno dello stesso sito di legame del recettore.


SCLEROSI MULTIPLA: differenziazione OL

Pubblicato da: Myelin Repair Foundation Molecole: 710

PI: Tassie Collins

Pubblicato: 10 / 21 / 2016

Il saggio di differenziazione degli oligodendrociti acuti O4 OPC immunopurificati sono stati placcati su 5k / pozzetto. 1 ore dopo la placcatura, è stato aggiunto l'articolo del test e le cellule sono state incubate per quattro giorni, dopo di che le cellule sono state fissate e immunocolorate per MBP e nuclei totali (DAPI). La differenziazione OPC in OL è stata determinata mediante quantificazione della colorazione MBP / numero di cellule (identificata dalla colorazione nucleare DAPI). Lo screening dei composti è stato eseguito in quadruplicato a concentrazioni di 2 (10 e 2 uM; 2 e 0.4 uM; 0.4 & 0.08 uM). I dati sono normalizzati su DMSO (differenziazione 0%) e 40 ng / ml T3 (differenziazione 100%). EC50 è determinato in relazione all'EMax dell'articolo di prova. Per dettagli tecnici vedere Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 419 o contatto [Email protected] per protocolli dettagliati.


SCLEROSI MULTIPLA: protezione OL

Pubblicato da: Myelin Repair Foundation Molecole: 723

PI: Tassie Collins

Pubblicato: 10 / 21 / 2016

Saggio di protezione degli oligodendrociti - vitalità (TNF + IFNg) Gli OPC espansi sono stati placcati su 10K / pozzetto. 24 ore dopo la placcatura, è stato aggiunto l'articolo del test, 1hr dopo l'aggiunta dell'articolo del test, è stato aggiunto un insulto con 10U / ml IFN-gamma / 1ng / ml TNF-alfa. Incubare i giorni 2, aggiungere AlamarBlue e incubare quattro ore. Quantificare la fluorescenza AlamarBlue per leggere la vitalità cellulare. I dati vengono ridimensionati in DMSO (attività 0%) e 1.1 uM quetiapina (attività 100%). Per i dettagli tecnici vedere Rosler, et. , al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): contatto 444 [Email protected] per protocolli dettagliati.


SCLEROSI MULTIPLA: test di mielinizzazione

Pubblicato da: Myelin Repair Foundation Molecole: 715

PI: Tassie Collins

Pubblicato: 10 / 21 / 2016

Le cellule di analisi della mielinizzazione corticale della corteccia cerebrale di E18 sono state preparate e placcate in terreni neuronali. Quattro giorni dopo, i media sono passati a MyM. Il giorno 5 vengono aggiunti articoli di prova e la mielinizzazione può continuare per otto giorni. Il giorno 13 in vitro, le cellule sono state fissate e immunocolorate per MBP e Olig2. La mielinizzazione è stata determinata mediante quantificazione della colorazione dei nuclei MBP / Olig2 + e modifica della morfologia dell'MBP (allineamento della colorazione MBP contigua - lunghezza della fibra). La differenziazione OL è stata determinata mediante quantificazione della densità MBP x area / Olig2 + nuclei. I composti sono stati proiettati in duplicato con immagini / pozzetto 4 a concentrazioni 2 (5 e amp; 1 uM). I dati sono normalizzati a DMSO (differenziazione / mielinizzazione 0%) e DAPT (differenziazione / mielinizzazione 100%). EC50 determinati in relazione alla risposta a 1 uM DAPT. Per dettagli tecnici vedere Lariosa-Willingham, et. , al, BMC Neurosci. 2016 Apr 22; 17: 16 o contatto [Email protected] per protocolli dettagliati.


SCLEROSI MULTIPLA: test di protezione per tunicamicina HEK293

Pubblicato da: Myelin Repair Foundation Molecole: 740

PI: Tassie Collins

Pubblicato: 10 / 7 / 2016

Test di protezione HEK-293

Le cellule HEK-293 (10K / pozzetto) vengono incubate per 24 ore, quindi viene aggiunto l'articolo di prova. Dopo 1 ora, viene aggiunta 100 ng / ml di tunicamicina. Dopo un'ulteriore incubazione di 48 ore, viene aggiunto AlamarBlue e la fluorescenza viene quantificata 4 ore dopo. I dati sono normalizzati su DMSO (attività 0%) e 5 uM guanabenz (attività 100%). EC50 è determinato in relazione all'EMax dell'articolo di prova. Contatto [Email protected] per protocolli dettagliati.


SCLEROSI MULTIPLA: screening della tossicità OL

Pubblicato da: Myelin Repair Foundation Molecole: 709

PI: Tassie Collins

Pubblicato: 10 / 7 / 2016

Test di tossicità per oligodendrociti (TNF + IFNg)

Test di tossicità su OPC di ratto passato, placcato su 10k / ben incubato con farmaco per 2 giorni. La lettura è la fluorescenza AlamarBlue dopo l'incubazione dell'ora 4. I dati sono mostrati come percentuale di sopravvivenza rispetto a DMSO (100%). L'omicidio massimo è con 5 ng / ml di tunicamicina, che lascia in vita ~ 15% di cellule. Per i dettagli tecnici vedere Lariosa-Willingham, et., Al, BMC Res Notes. 2016 Sep 5; 9 (1): 419 o contatto [Email protected] per protocolli dettagliati.


Solventi verdi

Pubblicato da: Alex Clark Sandbox Molecole: 117

Pubblicato: 9 / 20 / 2016

Dati Green Solvents, utilizzati dall'omonima app per dispositivi mobili (http://molmatinf.com/greensolvents.html). Compilato dalle informazioni pubblicate dall'ACS Green Chemical Institute e dalla Guida ai solventi GSK. Pubblicato in http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/sc3000509.


PARASITI: GSK Kineto Box colpisce con pIC50

Pubblicato da: GSK Kineto Box Project (TCAKS) Molecole: 592

PI: Pilar Manzano

Pubblicato: 6 / 16 / 2016

Utilizzando saggi fenotipici di cellule intere, il set di diversità di screening di elevata produttività (HTS) di GlaxoSmithKline di 1.8 milioni di composti è stato sottoposto a screening contro i tre cinetoplastidi più rilevanti per la malattia umana, vale a dire Leishmania donovani, Trypanosoma cruzi e Trypanosoma brucei. Sono stati condotti test antiparassiticidi intracellulari di conferma secondari e ortogonali e è stato determinato il potenziale di citotossicità non specifica. I composti colpiti sono stati raggruppati chimicamente e sottoposti a triage per proprietà fisico-chimiche desiderabili. L'ipotetico spazio target biologico coperto da questi insiemi di diversità è stato studiato attraverso metodologie bioinformatiche. Di conseguenza, sono state assemblate tre scatole chimiche anti-chinetoplastid di circa composti 200 ciascuna. Questo set di dati include composti di successo e tutti i risultati di screening associati. http://www.nature.com/articles/srep08771


VENDORE: Libreria ASPIX PPI

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 8400

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 3 / 3 / 2016

ASINEX ha lavorato alla progettazione e alla sintesi delle librerie di interazione proteina-proteina (PPI) da 2008. L'ultima generazione della libreria PPI ASINEX comprende molecole di varie dimensioni, strutture e forme che vanno da entità simili a frammenti a derivati ​​macrociclici progettati come mimetici di strutture secondarie o come mimetici di epitopi.


VENDITORE: ASINEX Elite Library

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 12960

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 3 / 3 / 2016

Quali sono i problemi dopo il "successo" iniziale? Asinex ha affrontato questi problemi con un'ampia profilazione ADME, un design ottimale per una facile modifica del medchem e una valutazione IP per garantire novità.


VENDITORE: ASINEX Phenotypic Library

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 9840

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 3 / 3 / 2016

Asinex esegue internamente analisi basate su target e fenotipiche e utilizza le informazioni sperimentali che raccoglie per creare sia set di screening basati sul target sia diversi. Attraverso questa esperienza, Asinex ha creato un set di screening fenotipico; i filtri per questo set sono i seguenti:

MW: 200-450, intasamentoP: -1.0 – 7.0, intasamento (pH 7.4): - 5.0 – 4.0, Rot.Bond:0-10, HA: 1-10, HD: 1-5, TPSA: 15 , N + O: 135-2, HAC: 10-19, Dipolo: 34 – 0.3, SHP3.30: 2 – 0.240.


VENDITORE: ASINEX Diversity Library

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 9968

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 3 / 3 / 2016

La diversità continua a essere un potente strumento di screening, soprattutto nella fase iniziale di "indagine" della scoperta di farmaci. Nel creare questo set, Asinex ha applicato strumenti computazionali per garantire che lo spazio chimico sia adeguatamente rappresentato incorporando anche elementi dei suoi concetti "Elite" e "BioDesign".


VENDITORE: ASINEX BioDesign

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 8041

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 3 / 3 / 2016

L'approccio di BioDesign di ASINEX incorpora le caratteristiche strutturali chiave di noti prodotti naturali farmacologicamente rilevanti (ad es. Alcaloidi e altri metaboliti secondari) in scaffold di chimica medicinale sinteticamente fattibili.


CATALOGO: Distributed Drug Discovery (D3) - IUPUI

Pubblicato da: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Molecole: 73234

PI: MJ O'Donnell e WL Scott

Pubblicato: 2 / 24 / 2016

Un catalogo / libreria virtuale gratuito e ad accesso aperto di> molecole 73,000: (a) N-Acil innaturale α-aminoacidi, (b) Esteri metilici di N-Acyl Unnatural α-aminoacidi e (c) Amidi primarie di N -Acil Acidi α-aminoacidi non naturali. Le molecole nel catalogo sono state ottenute da una enumerazione basata sull'alchilazione combinatoria in fase solida di un anione glicina equivalente con 100 R1X seguita da N-acilazione con 100 R2CO2H e scissione di resina (TFA, MeOH / Et3N o TFA, rispettivamente). Il set di dati legacy delle molecole 48,818 (sopra i set a e b più gli input R1X e R2CO2H) è stato pubblicato su 1 / 1 / 2009. Incoraggiamo i colleghi a comunicare con noi in merito all'interesse per il progetto D3 (e-mail: [Email protected]<Mailto:[Email protected]> o [Email protected]<Mailto:[Email protected]>). Riferimenti: J. Comb. Chem. 2009, 11, 3-13, 14-33, 34-43; J. Org. Chem. 2014, 79, 3140-51; J. Chem. Educ. 2015, 92, 819-26.


MALARIA: schermo biochimico di 5 P. falciparum chinasi contro TCK GSK

Pubblicato da: Gregory J. Crowther Molecole: 13451

PI: Gregory J. Crowther

Pubblicato: 2 / 3 / 2016

~ I composti attivi delle cellule 13,500 sono stati sottoposti a screening per l'attività contro cinque diverse proteine ​​chinasi. GlaxoSmithKline Tres Cantos Antimalarial Set (TCAMS) è stato proiettato in saggi biochimici di Plasmodium falciparum calcio-dipendenti proteina chinasi 1 e 4 (CDPK1 / PF3D7_0217500 e CDPK4 / PF3D7_0717500), mitogeno-associated protein chinasi 2 (MAPK2 / MAP2 / PF3D7_1113900), proteina chinasi 6 (PK6 / PF3D7_1337100) e protein chinasi 7 (PK7 / PF3D7_0213400). Sono stati scoperti nuovi potenti inibitori (IC50 <1 µM) per tre delle chinasi: CDPK1, CDPK4 e PK6. Gli inibitori di PK6 sono i più potenti finora scoperti per questo enzima e meritano un ulteriore esame.


Composti della materia oscura pubblici

Pubblicato da: Dark Matter Compounds Molecules: 139352

PI: Guillermo Morales

Pubblicato: 12 / 7 / 2015

Novartis ha scoperto che 803,990 dei loro composti era stato testato in almeno test Novartis 100 e che i composti 112,872 erano inattivi (14.0%). E un'analisi dei dati NIH ha mostrato che i composti 363,598 erano stati testati in almeno saggi 100 in cui i composti 131,726 erano inattivi (36.2%).

Anne Mai Wassermann, Eugen Lounkine, Dominic Hoepfner, Gaelle Le Goff, Frederick J King, Christian Studer, John M Peltier, Melissa L Grippo, Vivian Prindle, Jianshi Tao, Ansgar Schuffenhauer, Iain M Wallace, Shanni Chen, Philipp Krastel, Amanda Cobos -Correa, Christian N Parker, John W Davies e Meir Glick. La sostanza chimica oscura come punto di partenza promettente per la scoperta del piombo da droga. Nature Chemical Biology 2015, Vol. 11, pp. 958 – 966 (doi: 10.1038 / nchembio.1936)


ADME: AZ ChEMBL Public Data

Pubblicato da: AZ Public ChEMBL Data Molecules: 5799

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 10 / 5 / 2015

DMPK sperimentale in vitro e dati fisico-chimici su una serie di composti divulgati pubblicamente determinati ad AstraZeneca. I riferimenti forniti per i saggi esemplificano le procedure sperimentali utilizzate nella generazione dei dati.

https://www.ebi.ac.uk/chembl/doc/inspect/CHEMBL3301361% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole guinea pig plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole dog plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole rat plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.% bound to plasma by equilibrium dialysis. Compound is incubated with whole mouse plasma at 37C for >5hrs. Method described in B. Testa et al (Eds.), Pharmacokinetic Profiling in Drug Research: Biological, Physicochemical, and Computational Strategies, Wiley-VCH, Weinheim, 2006, pp.119-141. Experimental range 10% to 99.95% bound.Intrinsic clearance measured in human hepatocytes following incubation at 37C. Experimental range <3 to >150 microL/min/1E6 cells. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2010, 24, 1730-1736.Most basic pKa value (pKa B1) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Bases: >= 2.Second most acidic pKa value (pKa A2) determined by absorption and potentiometric titration using standard methodology from Sirius Analytical. Experimental range Acids: <= 11.

Terzo valore pKa più elementare (pKa B3) determinato per assorbimento e titolazione potenziometrica usando la metodologia standard di Sirius Analytical. Basi della gamma sperimentale:> = 2.

Secondo valore pKa più elementare (pKa B2) determinato dall'assorbimento e dalla titolazione potenziometrica usando la metodologia standard di Sirius Analytical. Basi della gamma sperimentale:> = 2.

Valore pKa più acido (pKa A1) determinato per assorbimento e titolazione potenziometrica usando la metodologia standard di Sirius Analytical. Intervallo sperimentale Acidi: <= 11.


Ligandi PDB

Pubblicato da: Protein Data Bank (PDB) Molecole: 16826

PI: Dale R. Cameron, Ph.D., MCIC, P.Chem.

Pubblicato: 8 / 3 / 2015

Le informazioni sui ligandi vengono estratte dal PDB, filtrate per rimuovere "polimero" e altri ligandi "non liberi" correlati nonché i leganti per metalli o leganti metallici. Gli aggiornamenti alla procedura di filtro possono avvenire senza preavviso. I dati vengono forniti così come sono senza ulteriore cura o correzione degli errori. I collegamenti al PDB sono forniti dal PBD RCSB e possono essere citati come

HM Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, TN Bhat, H. Weissig, IN Shindyalov, PE Bourne (2000) The Protein Data Bank Research Acids Nucleic Acids, 28: 235-242.

Si prega di segnalare collegamenti interrotti, richieste di dati aggiuntivi, ecc. All'amministratore del Vault


EBOLA: inibitori di piccole molecole del virus Ebola

Pubblicato da: Nadia's Sandbox Molecole: 55

PI: Dr. Nadia Litterman

Pubblicato: 2 / 2 / 2015

Questo set di dati condiviso contiene piccole molecole 55 dalla letteratura (fino a Jan 2015) che hanno attività in vitro o in vivo contro il virus Ebola e vari modelli di malattia. Abbiamo incluso una valutazione di un chimico medicinale esperto nonché i risultati del filtraggio dei PAIN. (Questo lavoro è stato presentato per la pubblicazione da Nadia Litterman, Christopher Lipinski e Sean Ekins a F1000Research).


VENDITORE: Synthonix - Costruire legami migliori

Pubblicato da: http://www.synthonix.com Molecole: 10286

Pubblicato: 1 / 2 / 2015

Synthonix aiuta i chimici medicinali a spingere i confini della scoperta di farmaci fornendo un catalogo di blocchi 10286 che consentono loro di esplorare lo spazio chimico più impegnativo ed espandere la gamma di obiettivi terapeutici potenzialmente significativi per curare le malattie croniche e curabili del mondo. Synthonix, Inc: 919-875-9277; E-mail generale: [Email protected]; Synthonix Ltd (ufficio Europa): ufficio: + 44 1223 597934; E-mail: [Email protected]


SONDE: Sonde chimiche NIH

Pubblicato da: Probes Vault Molecules: 319

PI: Christopher Lipinski

Pubblicato: 11 / 12 / 2014

Il National Institutes of Health (NIH) ha finanziato ampi sforzi HTS, stimati oltre $ 576 milioni, in centri intra-murali e accademici per identificare sonde chimiche a piccole molecole o composti di strumenti tramite la Molecular Libraries Screening Center Network (MLSCN) e il Rete dei centri di produzione di sonde molecolari (MLPCN). Per i composti da eleggere come sonde, sono state utilizzate varie definizioni, basate su una combinazione di potenza, selettività, solubilità e disponibilità. Ad oggi i centri di screening accademici finanziati dal NIH hanno scoperto più di sonde chimiche 300. Questa raccolta include strutture di sonde, target, anti-target, valori IC50 e altri riferimenti. Include anche una varietà di misure di somiglianza di droga tra cui il punteggio di desiderabilità assegnato dal Dr. Chris Lipinski come descritto in "Previsione computazionale e convalida della valutazione di esperti di sonde chimiche". Litterman NK, Lipinski CA, Bunin BA, Ekins S Modello J Chem Inf. (2014)


VENDITORE: Azepine Ltd. Collezione Building Blocks

Pubblicato da: Azepine Ltd. Molecole: 600

PI: Julia

Pubblicato: 10 / 8 / 2014

Blocchi 600, DISPONIBILI a prezzi competitivi. Contatto [Email protected]


HTS con targeting per chinasi NEU-CSIC-GSK

Pubblicato da: Pollastri Lab - Northeastern University Molecules: 78

PI: Michael Pollastri

Pubblicato: 9 / 25 / 2014

Questo set di dati contiene i risultati pubblicati di uno schermo ad alto rendimento eseguito attraverso la collaborazione tra la Northeastern University (Pollastri Laboratory), il CSIC (Navarro Laboratory) e il GlaxoSmithKline Tres Cantos Laboratory (Malattie del mondo in via di sviluppo DPU). L'articolo è Diaz et al, PLoS-NTDs:

DOI: 10.1371 / journal.pntd.0003253

Per informazioni contatta [Email protected] con domande


VENDITORE: Collezione HTS da laboratorio Vitas-M

Editore: Vitas-M Laboratory Molecules: 388375

Pubblicato: 7 / 11 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. La raccolta di composti HTS riguarda le singole molecole 400 000, disponibili. Tutti sono disponibili per la consegna rapida in diversi formati tra cui mg, micromole, polvere secca, soluzione DMSO e film secco. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


VENDITORE: Vitas-M Laboratory Building Blocks

Editore: Vitas-M Laboratory Molecules: 33297

Pubblicato: 7 / 10 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. La raccolta di blocchi organici contiene più di 33 000 elementi identificati e testati. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


VENDITORE: Impalcature da laboratorio Vitas-M

Editore: Vitas-M Laboratory Molecules: 2898

Pubblicato: 7 / 8 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. Collezione di impalcature (progetto Azalea). Idee avanzate per sintetizzare mini-librerie simili a farmaci. È la scelta migliore per acquisire composti assolutamente nuovi che nessun altro fornitore offre. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


VENDITORE: Frammenti di laboratorio Vitas-M

Editore: Vitas-M Laboratory Molecules: 18631

Pubblicato: 7 / 8 / 2014

Vitas-M Laboratory, LTD. Raccolta di frammenti (sostanze chimiche passate attraverso "Rule of 3" e altri filtri speciali) per la scoperta di droghe basata sui frammenti. www.vitasmlab.com Irina Ryabushenko: [Email protected]


VENDOR: Life Chemicals - Libreria GPCR

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 15948

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

La ricerca di somiglianza / farmacoforo si basava sulla previsione della ricerca di Topomer fornita da Sybyl-X. Primo passo: una ricerca di somiglianza ha presupposto un confronto di interi composti stock con inibitori noti derivati ​​da BindingeDB e ChemblDB. Secondo passaggio: generazione di strutture 3D di inibitori noti e loro allineamento. Questo spazio chimico spaziale è stato utilizzato come modello per l'adattamento del resto di composti "simili". Tuttavia, questo metodo è stato progettato per la "raccolta delle ciliegie" e una libreria alternativa può essere realizzata con metodi di screening virtuali (tutti i modelli di screening sono pronti e provati con set di allenamento) contro tali recettori: adenosina, chemochina, dopamina, gaba-, istamina, muscarinico, oppioide, sfingosina. http://www.lifechemicals.com/


VENDORE: Life Chemicals- Kinase per similarità

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 62467

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

Ricerca di somiglianza utilizzando le chiavi pubbliche MDL e il limite di somiglianza Tanimoto di 90%. Quasi i composti di riferimento 25K che sono stati testati attivi nei test biologici 168 (più di 100 diversi target di chinasi), sono stati usati per la ricerca di somiglianza. Tutti questi composti potrebbero essere sottoposti a screening su obiettivi più specifici fino all'ordine del cliente. http://www.lifechemicals.com/


VENDITORE: Life Chemicals - Kinase mediante attracco

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 15174

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

La libreria Kinase è stata preparata basandosi sull'attracco virtuale in un ambiente Sybyl. A tale scopo sono stati allineati e analizzati un insieme di siti di legame delle strutture di chinasi (circa 20). Tali siti sovrapposti sono stati utilizzati per la modellazione farmacoforo basata su struttura tramite modulo Unity di Sybyl-X. Dopo tutta la preparazione, un intero stock di 3D è stato sottoposto a screening su questo modello multi-farmacoforo e alla fine è stata eseguita una classifica. http://www.lifechemicals.com/


VENDITORE: Sostanze chimiche per la vita - Recettori nucleari

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 9896

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

Prodotti chimici di vita. Docking virtuale e ricerca di somiglianza / farmacoforo. http://www.lifechemicals.com/


VENDITORE: Life Chemicals- Biblioteca CNS

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 16535

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

I filtri CNS che sono descritti in letteratura sono stati usati come setaccio per tutto il nostro stock. Come è stato mostrato, gli unici composti con tali parametri possono avere caratteristiche appropriate per la permeabilità del tessuto nervoso. Tutti i descrittori sono stati ottenuti da fogli di calcolo e moduli Volsurf di Sybyl. (MW 200 = 350 cLogP = <3.6 H-Bond Acceptors = <8 H-Bond Donors = <5 tPSA = <120 Rotatable Bonds = <5 LogBB1 = -3.0 to 1.0) http://www.lifechemicals.com/


VENDITORE: Life Chemicals - Biblioteca naturale simile a un prodotto

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 7808

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

Il primo metodo era basato sull'analisi statistica dei descrittori. In precedenza è stato analizzato un ampio database di NP per studiare i ponteggi NP disponendoli sotto forma di un albero. Pertanto, sono state condotte analisi della distribuzione delle proprietà di più di 130 000 NP e identificazione di sottostrutture tipiche di particolari classi di composti naturali per generare un insieme di frammenti normalmente presenti nei composti naturali. Questo metodo è stato testato su CRC Dictionary of Natural Products (DNP) e molecole sintetiche (SMs). Un altro metodo si basa sulla valutazione della somiglianza dell'impalcatura. Il numero di firme atomiche (da fragmnets) generate per una molecola è uguale al numero di atomi che compongono la molecola. Ogni firma dell'atomo rappresenta in modo indipendente una caratteristica / frammento strutturale della molecola e viene calcolato un punteggio individuale per essa. maggior numero di atomi ottenendo punteggio più alto. Per riprodurre questo esperimento abbiamo utilizzato un modulo di sviluppo del modulo chimico implementato in CDK-Taverna 2.0. Contiene un marcatore NP-Likeness v1.4.1 che calcola la somiglianza del prodotto naturale (NP) di una molecola, cioè la somiglianza della molecola con lo spazio della struttura coperto da prodotti naturali noti. Tutti i risultati sono stati segnati e variavano da -3 a + 3. http://www.lifechemicals.com/


VENDOR: Life Chemicals- Collezione di screening

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 371998

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

Piccole molecole attentamente progettate, simili a farmaci, con la regola di Lipinski di 5 e l'unica ragione per deviare dal set di questi parametri è un impalcatura unica o una chimica non standard. È pronto per l'applicazione di filtri chimici medicinali come DOLORE o qualsiasi filtro mirato (solubilità, permeabilità, BBB). http://www.lifechemicals.com/


VENDORE: Life Chemicals - Frammenti con solubilità garantita

Pubblicato da: Life Chemicals Molecole: 8241

PI: Alexandr Kucherak

Pubblicato: 6 / 20 / 2014

I composti del frammento sono stati selezionati filtrando l'intero stock di LC con una "Regola del tre" modificata. Frammenti sono stati testati per la solubilità in laboratorio analitico. La solubilità è garantita alla concentrazione di 200mM in DMSO e 75% di frammenti è solubile in tampone pH7.5 alla concentrazione di 1mM. http://www.lifechemicals.com/


TB: efficacia del topo in vivo dalla letteratura

Pubblicato da: TB in-vivo data2 Molecole: 778

PI: Sean Ekins, PhD

Pubblicato: 4 / 10 / 2014

Guardando indietro al futuro: prevedere l'efficacia in vivo delle piccole molecole rispetto al tubercolosi del Mycobacterium. La selezione e la traduzione in vitro porta a una malattia in molecole con attività in vivo in un modello animale della malattia è una sfida che richiede molto tempo e denaro. Dimostriamo di apprendere da composti attivi e inattivi in ​​vivo usando modelli di classificazione di machine learning (bayesiano, Support Vector Machines e partizionamento ricorsivo) costituiti da composti 773. Il modello bayesiano ha previsto 8 su 11 ulteriori attivi in ​​vivo non inclusi nel modello come set di test esterno. La cura di settant'anni di dati Mtb può quindi fornire modelli computazionali statisticamente robusti per focalizzare le risorse su antitubercolari attivi in ​​vivo di piccole molecole. Ciò evidenzia un predittore economico per test in vivo altrove in altre malattie. PMID: 24665947


TB: dati per TB Mobile 2

Pubblicato da: TB Mobile Aggiornamenti 2.0 Molecole: 79

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 3 / 19 / 2014

Composti 79 selezionati da articoli recenti con uno o più target in TB aggiunti a TB Mobile per la versione 2 dell'app. Le molecole aggiuntive di 20 sono state utilizzate come set di test. Il documento è stato inviato.


PARASITE: scatola di malaria MMV di Schistosoma mansoni

Pubblicato da: CDIPD Vault Molecules: 400

Pubblicato: 11 / 6 / 2013

Schermi di organismi interi di Schistosoma mansoni somules (larve post-infettive) e adulti con i composti 400 che compongono il MMV Malaria Box (http://www.mmv.org/malariabox). Solo i composti "simili a farmaci" della scatola della malaria che producono i fenotipi più gravi contro i somuli sono stati testati contro gli adulti. I dati vengono inoltre caricati su ChEMBL. Contatta Conor Caffrey, Center for Discovery and Innovation in Parasitic Diseases (www.cdipd.org/), UCSF ([Email protected]).


Kinase: Kinase Activity Catalytic (Theonie Anastassiadis Publication in Nature Biotechnology)

Pubblicato da: Kinase Catalytic Activity Molecules: 178

PI: Theonie Anastassiadis

Pubblicato: 8 / 30 / 2013

Attività catalitica di chinasi

Nature Biotechnology 2011 October 30; 29 (11): 1039 – 1045 La libreria testata comprendeva composti 178 noti per inibire le chinasi da tutte le principali sottofamiglie di protein chinasi Per semplicità, tutti i composti sono stati testati a una concentrazione di 0.5 µM ​​in presenza di 10 µM ​​ATP. 0.5 µM ​​è stato scelto nonostante una media di IC50 riportata per questi composti verso i loro target primari di 66 nM al fine di catturare un'attività inibitoria off-target più debole.Ogni coppia di chinasi-inibitore è stata testata in duplice copia e i risultati sono stati espressi come fosforilazione media del substrato in percentuale delle reazioni di controllo del solvente (d'ora in poi denominate "attività chinasi rimanente"). Viene presentata l'attività chinasi media rimanente per ciascuna coppia di chinasi-inibitore. I dati sull'attività della chinasi sono stati espressi come percentuale di attività chinasi rimanente nei campioni di test rispetto alle reazioni del veicolo (dimetilsolfossido).


TB: aggiorna farmaci e lead con obiettivi

Pubblicato da: TB: droghe e derivazioni con obiettivi - aggiorna le molecole: 38

Pubblicato: 6 / 14 / 2013

Composti pubblicati dalla recente letteratura per la TB con obiettivi noti da utilizzare come aggiornamento anche per l'app mobile TB

KINASE: Set di inibitori della cinasi pubblicati GSK (PKIS)

Pubblicato da: Kinome2 Molecole: 364

Pubblicato: 6 / 6 / 2013

Il set di inibitori della chinasi (GSK) pubblicato da GSK (PKIS) è un insieme di inibitori della protein-chinasi 367, che è stato annotato per l'attività della famiglia della protein-chinasi ed è disponibile per le attività di screening pubblico. Informazioni dettagliate sul set di screening sono disponibili ai link indicati di seguito. Il database ChEMBL è stato il sito "go-to" per i dati di biotest su questo set. Nello spirito di migliorare l'accesso a dati importanti, abbiamo raccolto i dati PKIS che ChEMBL ha gentilmente reso disponibili e li abbiamo elaborati in modo da poterli accedere qui sul sito Collaborative Drug Discovery (CDD) (proprio come abbiamo fatto in precedenza per il Database di Kinase SARfari).

Il trasferimento a CDD rende i dati disponibili in un modo più "medico-amichevole". Abbiamo anche riordinato il set di dati. Ad esempio, in realtà ci sono solo composti 364 (alcuni duplicati erano dovuti a forme saline o nomi alternativi della stessa molecola). Abbiamo anche cercato di normalizzare i nomi dei target, ove possibile (ad esempio, le chinasi IKKA, IKKB e IKKE erano chiamate IKK-alpha, IKK-beta, IKK-epsilon per il set di dati di UNC). Non che siamo perfetti ... apprezziamo anche eventuali correzioni al nostro set di dati!

Per riassumere, ci sono composti 364 che sono stati testati su target 225 su 0.1 e 1 uM. In questo set di dati, esiste un solo protocollo, ma le destinazioni 225 sono elencate in una lettura. Anche la concentrazione è una lettura, quindi è facile limitare le ricerche alle schermate eseguite su 1 e / o 0.1 uM.

Collegamento:

1) Ulteriori informazioni sul GSK PKIS

http://www.maggichurchouseevents.co.uk/bmcs/Downloads/CBDD%20-%20Zuercher%20Bill.pdf

http://www.chordomafoundation.org/wp-content/uploads/2013/04/2013-Flanagan-Drewry.pdf

http://chembl.blogspot.co.uk/2013/05/pkis-data-in-chembl.html

2) Dati precedenti della chinasi ChEMBL su CDD

https://www.collaborativedrug.com/buzz/2013/04/04/kinome-sar-for-collaborative-drug-discoverers/

KINASE: ChEMBL Kinase SARfari Compounds e dati BioAssay


Pubblicato da: CDD Vault Molecole: 54211

PI: CDD

Pubblicato: 3 / 27 / 2013

Una risorsa preziosa disponibile presso ChEMBL è la Kinase SARfari, “un banco di lavoro di chemogenomica integrato focalizzato sulle chinasi. Il sistema incorpora e collega la sequenza chinasi, la struttura, i composti e i dati di screening ”. Una risorsa estremamente utile, questo database mette a disposizione una grande quantità di dati SAR per i composti attivi della chinasi contro una vasta gamma di chinasi in una vasta gamma di saggi, molti dei quali estratti manualmente e curati dalla letteratura. Per rendere disponibili questi dati nell'interfaccia CDD, abbiamo preso la tabella principale di Kinase SARfari e li abbiamo uniti con un'altra tabella chiave del database ChEMBL, fornendo un campo che descrive il dosaggio utilizzato in ciascun record in modo molto più dettagliato di quello disponibile in SARfari nativo . Ora abbiamo reso disponibile questo set di dati unito tramite l'interfaccia CDD. Dati dettagliati in vitro sono disponibili per le chinasi 400. Inoltre, vengono pubblicati anche dati funzionali in vivo e ADMET.


TB: ARRA

Pubblicato da: TB ARRA Molecole: 1924

PI: Bob Reynolds

Pubblicato: 3 / 15 / 2013

Dati da SRI (Bob Reynolds) e Scott Franzblau group - articolo presentato da Ekins et al.

I successi dei precedenti schermi SRI sono stati utilizzati per cercare composti simili nelle librerie dei distributori, raggruppati e testati in vitro in una serie di pannelli di schermi accettati per i nuovi candidati alla scoperta di nuovi farmaci. I composti sono stati anche usati come set di test per modelli bayesiani precedentemente generati costruiti con informazioni sulla bioattività e citotossicità.


TB: GSK

Pubblicato da: TB GSK Molecole: 177

PI: Sean Ekins, PhD

Pubblicato: 2 / 8 / 2013

Dati supplementari tratti dall'articolo di Ballell et al. ChemMedChem 2013 sulla stampa "alimentare la scoperta di farmaci open source: la piccola molecola 177 induce la tubercolosi"

I set di dati originali sono ospitati su https://www.ebi.ac.uk/chemblntd qui sono mostrati solo i dati M.tb ma più dati BCG sono disponibili presso ChEMBL


TRYPANOSOME: Composti di letteratura sulla malattia di Chagas

Pubblicato da: Chagas Public Data Molecules: 531

Pubblicato: 12 / 21 / 2012

Strutture composte e riferimenti bibliografici sono stati curati per le molecole 531 testate contro il tripanosoma cruzi in vitro o in vivo nella letteratura pubblicata.


TRYPANOSOME: ottimizzazione di serie chimiche specifiche contro la tripanosomiasi africana umana (HAT)

Pubblicato da: Chagas Public Data Molecules: 5559

Pubblicato: 12 / 12 / 2012

SCYNEXIS Inc, in qualità di membro del DNDi HAT Lead Optimization Consortium, ha sviluppato e selezionato composti 4926 per attività contro T. brucei. Sono inclusi strutture composte e dati di attività in vitro contro T. brucei brucei. Dati di citotossicità e attività contro i parassiti eucariotici correlati T. brucei rhodesiense, L. donavani e P. falciparum per un sottoinsieme di composti 34. Tutte le serie di composti segnalate non sono più in fase di sviluppo per HAT in quanto sono risultate avere scarsa selettività o proprietà incompatibili con l'attività in vivo. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1011-hat-001


TRYPANOSOME: DNDi-Ottimizzazione della serie fenarimol per il trattamento della malattia di Chagas

Pubblicato da: Chagas Public Data Molecules: 743

Pubblicato: 12 / 9 / 2012

Il DNDi Lead Optimization Consortium, tra cui Epichem, Murdoch University e CDCO, ha sviluppato e proiettato una serie SAR basata sul fenarimolo fungicida vegetale. DNDi ha reso pubbliche le strutture dei composti, i dati sull'attività di T. cruzi e i dati sulla tossicità delle cellule L-6 per i composti 743 di questa serie in ChEMBL-NTD. I composti e i dati dei saggi biologici sono inclusi qui nel CDD Public. http://www.dndi.org/diseases-projects/open-innovation/1012-chagas-001


TRYPANOSOME: ampio primario HTS per identificare gli inibitori della replica di T.Cruzi

Pubblicato da: Chagas Public Data Molecules: 303230

Pubblicato: 12 / 6 / 2012

Il Broad Institute ha eseguito uno schermo ad alto rendimento di composti 303,224 in duplicato nel ceppo di Tulahuen ricombinante di Trypanosoma cruzi che esprime stabilmente reporter di beta-galattosidasi co-coltivato con cellule ospiti, fibroblasto di topo NIH3T3. Tra i risultati di 4,394, 4,063 è stato ulteriormente valutato per l'attività inibitoria e la tossicità delle cellule ospiti. Infine, i composti 27 sono stati selezionati come potenziali composti della sonda e ulteriormente validati. PubChem ha depositato i dati dalla schermata principale e dai successivi saggi secondari. I composti chimici e i dati dei saggi biologici per lo schermo primario e sei saggi secondari di PubChem sono inclusi qui in CDD Public. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21634083


TB: Guzman et al., M.tb. Inibitori della ligasi muraria

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 8

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 12 / 6 / 2012

Dati di screening basati su cellule intere e target dalla seguente pubblicazione TB: Guzman JD, Gupta A, Evangelopoulos D, Basavannacharya C, Pabon LC, Plazas EA, Muñoz DR, Delgado WA, Cuca LE, Ribon W, Gibbons S, Bhakta S. J Antimicrob Chemother. 2010 ott; 65 (10): 2101-7. Screening antitubercolare di prodotti naturali di piante colombiane: 3-metossinordomesticina, un inibitore della ligasi MurE di Mycobacterium tuberculosis.


VENDITORE: array 2 della NIH Clinical Collection (molecole 281)

Pubblicato da: NIH Clinical Collections Molecole: 281

PI: Project Manager: Mei Steele

Pubblicato: 11 / 21 / 2012

NIH Clinical Collection 2 sono array placcati di piccole molecole 281 che hanno una storia di utilizzo negli studi clinici sull'uomo. La collezione è stata assemblata dal National Institutes of Health (NIH) attraverso la Roadmap Initiative Molecular Libraries come parte della sua missione per consentire l'uso di schermi composti nella ricerca biomedica.


VENDITORE: array NIH Clinical Collection (molecole 446)

Pubblicato da: NIH Clinical Collections Molecole: 446

PI: Project Manager: Mei Steele

Pubblicato: 11 / 21 / 2012

La NIH Clinical Collection è una serie placcata di piccole molecole 446 che hanno una storia di utilizzo negli studi clinici sull'uomo. La collezione è stata assemblata dal National Institutes of Health (NIH) attraverso la Roadmap Initiative Molecular Libraries come parte della sua missione per consentire l'uso di schermi composti nella ricerca biomedica.


TB: droghe e lead con target: dati utilizzati nell'app mobile

Pubblicato da: molecole SRI e target per le app mobili Molecole: 707

Pubblicato: 10 / 23 / 2012

Dati aggiornati a cura di target TB con essenzialità in vivo

informazioni da TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB e Pubmed nonché

altri riferimenti di Malabika Sarker presso lo Stanford Research Institute.

Gyanu Lamichhane alla Johns Hopkins University ha fornito l'essenzialità

information.ref.http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22477069

Esplora questo set di dati su dispositivo mobile: https://itunes.apple.com/app/tb-mobile/id567461644


TOX: Farmaci e sostanze chimiche classificati per epatotossicità

Pubblicato da: CDD Vault Molecole: 83072

PI: CDD

Pubblicato: 7 / 16 / 2012

Pfizer (Hu 2008) ha precedentemente compilato un elenco di farmaci e sostanze chimiche con uno schema di classificazione basato su dati clinici per l'epatotossicità, al fine di valutare una tecnologia di analisi dell'imaging degli epatociti umani in vitro (HIAT), risultante in una concordanza di 75% con epatotossicità clinica. Questo stesso set di dati di composti che causano o non causano danno epatico indotto da farmaci (DILI) è stato utilizzato insieme a descrittori molecolari per la previsione in silico tramite modelli bayesiani.


TB: Molecole SRI con attività a cellule intere contro la TB

Pubblicato da: SRI Group Vault Molecules: 23

PI: Sean Ekins, PhD

Pubblicato: 4 / 24 / 2012

Molecole valutate in Pharm Res. 2012 Apr 4. PMID: 22477069

Combinazione di metodi cheminformatici e analisi dei percorsi per identificare le molecole con l'attività delle cellule intere contro la tubercolosi del micobatterio.

Sarker M, Talcott C, Madrid P, Chopra S, Bunin BA, Lamichhane G, Freundlich JS, Ekins S.


MALARIA: MMV Malaria Box

Pubblicato da: Pubblico: Malaria Box Molecules: 400

Pubblicato: 3 / 29 / 2012

Molecole di MMV Malaria Box, ChEMBL-NTD (https://www.ebi.ac.uk/chemblntd): MMV Malaria Box, Simon Macdonald, Paul Willis, Paul Kowalczyk, Thomas Spangenberg, Jeremy Burrows e Tim Wells. Medicinali per Malaria Venture (MMV), casella postale 1826, 20, rte de Pré-Bois, 1215 Ginevra 15, Svizzera e SCYNEXIS Inc. Casella postale 12878 Research Triangle Park, Carolina del Nord 27709-2878 USA.

Tutti i composti contenuti nella Malaria Box sono stati sottoposti a screening in vitro su 3D7 (ceppo sensibile alla clorochina (CQ) ma resistente alla solfadossina di P. falciparum) e sono stati condotti test di citotossicità su linee cellulari di embrioni umani (HEK-293). I dati sono espressi come EC50 in nM per i dati di falciparum.


ADME: ADMEdata.com - Un repository commerciale di dati ADME di alta qualità

Pubblicato da: G2 Research ADMEdata.com Molecole: 1760

PI: George Grass

Pubblicato: 1 / 13 / 2012

Esempi di: permeabilità di Caco-2, solubilità in equilibrio @ valori 5pH, legame umano con proteine, ratto di legame proteico, permeabilità intestinale di coniglio, divisione del plasma sanguigno umano ed ematocrito. Per set di dati e modelli completi, contattare direttamente George Glass, Pharm.D. Dottorato di ricerca presso [Email protected] (distribuito tramite CDD)


VENDITORE: Collezione Porse Building Blocks

Pubblicato da: CDD Vault Molecole: 29241

PI: CDD

Pubblicato: 1 / 13 / 2012

Porse File Chemical Co. è dedicata alla sintesi di nuovi composti personalizzati per la scoperta di farmaci e offre una vasta gamma di prodotti con prezzi competitivi e buona qualità. Il set attuale è un sottoinsieme selezionato di nuovi composti e componenti di base 1554 diversi nelle famiglie Morpholine, Piperidine, Piperazine, Pyrimidine, aminoacid e API. www.porsefinechemical.com, [Email protected] + 86-20-28069055


PARASITI: Schistosoma mansoni schistosomula: Microsource Spectrum & Killer Collections

Pubblicato da: Brian Suzuki's Sandbox Molecules: 119

Pubblicato: 10 / 5 / 2011


Schistosoma mansoni schistosomula: schermo fenotipico delle collezioni Microsource Spectrum & Killer.

PI: Conor R. Caffrey

Pubblicato: 10 / 5 / 2011

CDD: hit 119 di dati pubblici

Nell'ambito di una strategia di riposizionamento (riposizionamento) di farmaci per identificare nuovi antiparassitari presso l'UCSF Sandler Center for Drug Discovery, abbiamo sviluppato uno schermo di organismo intero (fenotipico) parzialmente automatizzato per il flusso sanguigno che causa la malattia tropicale infettiva, schistosomiasi. Abbiamo esaminato i composti 1,260 delle collezioni sopra menzionate che includono farmaci, composti simili a farmaci, prodotti naturali e composti vari. Segnaliamo le alterazioni fenotipiche negli stadi larvali (schistosomula) di Schistosoma mansoni usando semplici descrittori per trasmettere le risposte multiple e dinamiche del parassita all'insulto composto. È in corso la quantificazione completa delle risposte fenotipiche. I dati presentati riguardano solo i composti "hit"; l'elenco completo dei composti nelle rispettive collezioni può essere ottenuto dal contatto di Microsource Discovery Systems Inc. [Email protected] per ulteriori dettagli. Scoperta di farmaci per la schistosomiasi: composti colpiti e di piombo identificati in una biblioteca di farmaci noti mediante screening fenotipico a media produttività. Abdulla MH, Ruelas DS, Wolff B, Snedecor J, Lim KC, Xu F, Renslo AR, Williams J, McKerrow JH, Caffrey CR. PLoS Negl Trop Dis. 2009 lug 14; 3 (7): e478.PMID: 19597541


TB: Schermata fenotipica della libreria di chinasi SRI

Pubblicato da: CDD Vault Molecole: 23823

PI: CDD

Pubblicato: 8 / 29 / 2011

Gli obiettivi di chinasi sono perseguiti in una varietà di malattie oltre

cancro, compresi quelli immunitari e metabolici, nonché virali, parassiti,

fungina e batterica. In particolare, c'è un relativamente recente

interesse per chinasi e target di legame ATP in Mycobacterium

tubercolosi al fine di identificare inibitori e potenziali farmaci per

proteine ​​essenziali che non sono prese di mira dagli attuali regimi farmacologici.

Qui, riportiamo i risultati di screening ad alto rendimento per un target

libreria di circa composti 26,000 che è stata progettata sulla base degli attuali scaffold inibitori della chinasi e siti noti di legame con la chinasi. I dati fenotipici presentati nel presente documento possono costituire la base per la selezione di scaffold / composti per ulteriori schermi enzimatici contro chinasi specifica o altri target di legame ATP in Mycobacterium tuberculosis in base all'attività apparente contro tutti i batteri in vitro.PMID: 21708485

Tubercolosi (Edinb). 2011 Jun 25. [Epub prima della stampa]

Copyright © 2011 Elsevier Ltd. Tutti i diritti riservati.

Contatta Melinda Sosa per maggiori dettagli: [Email protected]

Screening ad alto rendimento di una libreria basata sull'inibitore della chinasi

impalcature contro Mycobacterium tuberculosis H37Rv.

Reynolds RC, Ananthan S, Faaleolea E, Hobrath JV, Kwong CD, Maddox C, Rasmussen L, Sosa MI, Thammasuvimol E, White EL, Zhang W, Secrist JA 3rd.

Fonte: Southern Research Institute, 2000 Ninth Avenue South,

Birmingham, AL 35205, USA.


OMOLOGATO FDA: NCGC Pharmaceutical Collection (NPC) V1.1.0

Pubblicato da: NCGC Pharmaceutical Collection NPC V1.1.0 Molecole: 14579

PI: Noel Southall

Pubblicato: 8 / 8 / 2011

La collezione farmaceutica NCGC: una risorsa completa di farmaci approvati clinicamente che consente la ricomposizione e la genomica chimica. Huang, R., Southall, N., Wang, Y., Yasgar, A., Shinn, P., Jadhav, A., Nguyen, D., Austin, C. Sci Transl Med 27 April 2011: Vol. 3, edizione 80, p. 80ps16.

http://stm.sciencemag.org/content/3/80/80ps16.abstract


VENDITORE: Catalogo BioBlocks con informazioni sui prezzi

Pubblicato da: BioBlocks Molecole: 2971

PI: Doug Murphy

Pubblicato: 8 / 3 / 2011

Composti 2989.

BioBlocks offre una raccolta mirata di oltre ponteggi 2200, blocchi e frammenti pre-qualificati come componenti di farmaci. La maggior parte di questi composti sono offerti unicamente da BioBlocks e hanno trovato applicazioni che vanno dagli intermedi per la scoperta di farmaci agli surrogati di aminoacidi nella chimica dei peptidi.

Dettagli aggiornati sui blocchi di costruzione BioBlocks sono disponibili su www.bioblocks.com


TOX: Dati di danno epatico indotti da farmaci (DILI)

Pubblicato da: BBB Molecole: 519

Pubblicato: 4 / 29 / 2011

Dati di danno epatico indotti da farmaci: il set di allenamento è costituito da dati sperimentali di Jim Xu e il set di test rappresenta dati di letteratura.

pubblicato in Drug Metab Dispos. 2010 Dec; 38 (12): 2302-8. Epub 2010 Sep 15. Un modello bayesiano predittivo a base di ligando per danno epatico indotto da farmaci.

Ekins S, Williams AJ, Xu JJ.

TB: Database di destinazione per geni essenziali in vivo


Pubblicato da: SRI TB Target Database Molecules: 314

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 4 / 21 / 2011

Dati curati per target TB con informazioni di essenzialità in vivo da TBDB, Biocyc, Metacyc, PDB e Pubmed, nonché altri riferimenti raccolti dal Dr. Malabika Sarker presso lo Stanford Research Institute. Il Dr. Gyanu Lamichhane della Johns Hopkins University è gentilmente riconosciuto per aver fornito informazioni sull'essenzialità.

** si prega di notare che non ci sono piccole molecole associate a questo set di dati **


VENDITORE: Enamine Representative Diverse Screening Library

Pubblicato da: Enamine Molecules: 200000

PI: Dmytro Mykytenko

Pubblicato: 4 / 12 / 2011

La diversa libreria di screening 200K originale è stata generata appositamente per Collaborative Drug

Utenti alla scoperta del più grande stock al mondo di composti per screening disponibili in commercio

(su specie 1.7 M). La biblioteca presenta esclusivi composti simili a farmaci con raffinato ADME

proprietà. I nostri composti di alta qualità possono essere raccolti in ciliegio e forniti immediatamente

diversi formati.


RIPOSIZIONAMENTO, OMOLOGATO FDA: Farmaci Ricondizionati usando i metodi HTS

Pubblicato da: Riproposizione in vitro Molecole: 109

Pubblicato: 3 / 18 / 2011

Farmaci identificati con nuovi usi usando i metodi HTS. Questa tabella estende notevolmente una versione precedentemente pubblicata "Ekins S, Williams AJ, Krasowski MD, Freundlich JS. Riposizionamento in silico di farmaci approvati per malattie rare e trascurate Drug Discov oggi. 2011 Mar 1. PMID: 21376136 doi: 10.1016 / j.drudis .2011.02.016 La tabella elenca le molecole, Vecchio uso / bersaglio, nuovo uso / bersaglio, come scoperto e riferimenti.

Abbreviazioni: CCR5, recettore delle chemochine 5; DHFR, Diidrofolato reduttasi; DOA, Droghe di abuso, FDA, Food and Drug Administration; GLT1, trasportatore di glutammato 1; HSP-90, proteina da shock termico 90; JHCCL, Biblioteca composta clinica di John Hopkins; Mtb, Mycobacterium tuberculosis; NK-1, recettore neurocinina-1; OCTN2.


RIPOSIZIONAMENTO, OMOLOGATO FDA: Prodotti designati orfani

Pubblicato da: Malattie rare che ripropongono Molecole: 76

Pubblicato: 3 / 18 / 2011

Tabella FDA 2 - dalla risorsa FDA, il database di ricerca sulle malattie rare (RDRD), che elenca i prodotti designati da orfani (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) con almeno un marketing approvazione per un'indicazione di malattia rara. Questi dati sono stati analizzati da Ekins e Williams (documento inviato).


RIPOSIZIONAMENTO, OMOLOGATO FDA: Prodotti designati orfani

Pubblicato da: Malattie rare che ripropongono Molecole: 105

Pubblicato: 3 / 18 / 2011

Tabella FDA 1 - dalla risorsa FDA, il database di ricerca sulle malattie rare (RDRD), che elenca i prodotti designati da orfani (http://www.fda.gov/ForIndustry/DevelopingProductsforRareDiseasesConditions/HowtoapplyforOrphanProductDesignation/ucm216147.htm) con almeno un marketing approvazione per un'indicazione comune della malattia.

La FDA non ha associato i dati con le strutture molecolari.


VENDITORE: Colorado Center for Drug Discovery Pilot Library

Pubblicato da: C2D2 Molecole pubbliche: 2240

PI: Greg Miknis, direttore associato

Pubblicato: 3 / 7 / 2011

La biblioteca contiene piccole molecole strutturalmente diverse che si conformano a criteri simili a farmaci. Sono rappresentati diversi chemiotipi e la libreria è progettata per essere applicabile a una vasta gamma di potenziali target.

Per richiedere informazioni sulla raccolta, si prega di inviare una richiesta a [Email protected]


LIPID: Database di strutture delle mappe lipidiche

Pubblicato da: Lipid Maps Database molecole: 22215

PI: Gateway Lipidomics

Pubblicato: 2 / 11 / 2011

Le strutture delle mappe lipidiche (http://www.lipidmaps.org/) sono state annotate con gli ioni comuni 5 (H +, 2H ++, K +, Na +, NH4 +) tra cui acili grassi dei mammiferi, glicerolipidi, glicerofosfolipidi, sfingolipidi, lipidi sterolici e lipidi prenolici . Le strutture e gli ioni sono ricercabili per struttura e MW per facilitare l'identificazione di nuovi lipidi.


TBC: Micobatterio drugome

Pubblicato da: metabolites virtuali Molecole: 274

Pubblicato: 11 / 5 / 2010

Set di dati di farmaci 274 (approvato per uso umano negli Stati Uniti e in Europa) da una pubblicazione di Kinnings et al., PLoS Computational Biology vol 6: e1000976 (2010)

Farmaci co-cristallizzati con almeno una struttura in PDB.Questo set di dati può essere utilizzato con gli altri set di dati di screening della TB nel CDD per determinare quali di questi farmaci approvati hanno attività contro Mtb (dalla letteratura.

TB: Inibitori di Mtb non replicanti dalla letteratura


Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 26

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 10 / 28 / 2010

Strutture e dati dagli articoli pubblicati:

Darby e Nathan J Antimicrob Chemother 2010: 65: 1424-1427

Bryk et al., Cell Host e Microbe 2008: 3: 137-145

Lin et al., Arch Biochem Biophys. 2010 501: 214-220

Lin et al., J Biol Chem 2008: 283: 34423-34431

di Cavalho e altri: J Med Chem 2009: 52: 5789-5792

Lin et al., Natura 2009: 461: 621-626


VENDITORE: Collezione Astatech, Inc. Building Block

Pubblicato da: Astatech, Inc. Molecole: 6140

Pubblicato: 10 / 15 / 2010

AstaTech, Inc. offre intermedi avanzati e innovativi per facilitare il processo di scoperta di farmaci. La nostra vasta selezione comprende elementi costitutivi, nuove ammine, ammine protette, amminoacidi innaturali, chetoni, aldeidi, eterocicli, anidridi isatoiche, acidi di boroinc e intermedi chirali. Contatto [Email protected] per informazioni sull'ordinazione.


VENDITORE: Catalogo Chemik 2010

Pubblicato da: CDD Vault Molecole: 3889

PI: CDD

Pubblicato: 10 / 5 / 2010

Chemik ha aiutato con successo aziende di scoperta di droga come Wyeth nei loro progetti di fase iniziale. Forniamo loro la materia prima e gli intermedi chiave dai grammi alle multi tonnellate. Con 10 anni di esperienza in questo campo, possiamo aiutare i nostri clienti a sviluppare un nuovo intermedio nelle settimane 4-6 con prezzi competitivi, grande qualità e servizio continuo.


MALARIA: fenantrene e antracene aminoacoli

Pubblicato da: CDD Vault Molecole: 35

PI: CDD

Pubblicato: 9 / 21 / 2010

Dati antimalarici vs P. berghei nei topi per antracene sostituito con alogeno e fenantrene N-di- e mono-alchilsostituiti amminoalcolici cloridrati. Ventisette composti hanno mostrato attività (aumento del tempo medio di sopravvivenza> 6 giorni); otto composti erano curativi (IMST> 60 giorni). La tabella include gli ID PubMed per dettagli e sintesi.


TB: Attività BCG / MTB

Pubblicato da: Novartis: TB Data Molecules: 283

PI: Srinivasa Rao

Pubblicato: 9 / 15 / 2010

BCG Activty aerobica (MIC50) - composti 274

Attività aerobica MTB (MIC50) - Composti 283

Attività anaerobica di BCG ATP (IC50) - Composti 283

Attività ATP anaerobica MTB (IC50) - Composti 283

Citotossicità (CC50) - Parole chiave dei composti 223: Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, TB


MALARIA: JHU JHCCL Inibizione del plasmodio falciparum

Pubblicato da: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Molecole: 2693

Pubblicato: 6 / 4 / 2010

Inibizione percentuale dei farmaci approvati da 2663 a 10 microM

TB, MALARIA: previsioni bayesiane per i colpi di malaria GSK


Pubblicato da: GSK Data Bayesian Models (Ekins, et al.) Molecole: 13355

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 5 / 28 / 2010

Previsioni per i successi della malaria GSK (pubblicati da Gamo et al., Nature 465: 305-310 (2010)) usando i modelli bayesiani (pubblicati da Ekins et al., Mol BioSyst 6: 840-851 (2010)).

I tagli per l'attività (modello 220,000> 0.31, modello 2,200> -1.37 sono classificati come attivi nell'intero schermo della cella).

MALARIA: set di dati sulla malaria a cellule intere dell'ospedale per la ricerca dei bambini di St. Jude


Pubblicato da: St. Jude - Malaria / Trypanosome Bioactives Molecole: 1524

PI: Kip Guy

Pubblicato: 5 / 26 / 2010

Dati supplementari per Nature Articolo pubblicato da St. Jude CRH (Guiguemde, W, et al. Genetica chimica di Plasmodium falciparum. Natura 465, 311-315 (20 maggio 2010)), comprese le strutture 1524 testate in uno schermo primario, con dati aggiuntivi in otto protocolli: analisi di Bland-Altman, proprietà ADMET calcolate, schermo filogenico, saggi di sensibilità, sinergie ed enzimi, nonché analisi di fusione termica.


MALARIA: set di dati Novartis GNF-Pf

Pubblicato da: Novartis Malaria Molecole: 5695

Pubblicato: 5 / 21 / 2010

I ceppi di plasmodio falciparum 3d7 (sensibili ai farmaci) e W2 (clorochina, chinina-, pirimetamina, resistente al cloglogilil e sulfadossina), ottenuti da MR4, sono stati testati in un saggio di infezione da eritrociti per inibizione dell'infezione composti selezionati.


VENDITORE: set di screening anti-malaria romanzo ASINEX

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 1

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 5 / 20 / 2010

SET DI DATI RISERVATI: 594 Nuovi composti di ASINEX. Si prega di consultare il file allegato che elabora il design ASINEX.

PER L'ACCESSO: Nuovi utenti CDD: la tua registrazione verrà passata attraverso un processo di approvazione prima di concedere l'accesso al set di dati. Utenti CDD esistenti: contattare [Email protected]


VENDITORE: Sottoinsieme antimalarico ASINEX Tres Cantos (GSK)

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 278

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 5 / 20 / 2010

278 ASINEX dati anti-malaria attivi corrispondenti ai dati GSK.

DISPONIBILE PER LO SCREENING IMMEDIATO. Il set di dati corrispondente è di proprietà di ASINEX. Per ulteriori informazioni, contattare Mark Parisi: Email: [Email protected]

Telefono: 1-877-ASINEX1

Fax: 1-336-721-1618


MALARIA: Tres Cantos Antimalarial Set (TCAMS)

Pubblicato da: GSK Molecole di dati antimalarici: 13471

PI: Javier Gamo

Pubblicato: 5 / 19 / 2010

Lo screening di circa 2 milioni di composti nella libreria di screening di GlaxoSmithKline identificato su 13,500 inibitori della proliferazione di P. falciparum negli eritrociti umani. Il lavoro è stato svolto presso il Campus di sviluppo della medicina di Tres Cantos, GlaxoSmithKline, Severa Ochoa 2, 28760 Tres Cantos, Spagna.

TB: Sacchettini et. al. revisione - agenti antitubercolosi aggiuntivi

Pubblicato da: PK Molecules: 18

Pubblicato: 2 / 5 / 2010

Agenti antitubercolosi non approvati di Figura 1 in Sacchettini JC, Rubin EJ e Freundlich JS Farmaci contro insetti: alla ricerca del predatore persistente Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (2008).


TB: Dati di brevetto per la piccola molecola della tubercolosi

Pubblicato da: TB Patent Data Molecules: 20775

PI: Collaborative Drug Discovery

Pubblicato: 1 / 27 / 2010

Strutture e informazioni sui brevetti riguardanti la ricerca sulla tubercolosi dall'Ufficio brevetti e marchi degli Stati Uniti, dall'Ufficio europeo dei brevetti e dall'Organizzazione mondiale della proprietà intellettuale.


TB: Makarov et al., Consorzi NM4TB

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 32

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 1 / 21 / 2010

Dati di relazione di attività della struttura per 1,3-benzotiazin-4-one (BTZ). Dati ottenuti dall'articolo "Benzothiazinones Kill Mycobacterium tuberculosis by Blocking Arabinan Synthesis" pubblicato su Science da Makarov et al., 2009 e colleghi dei consorzi NM4TB (PMID: 19299584).


VENDITORE: Set di diversità TimTec

Pubblicato da: TimTec Molecole: 9998

PI: Venditore

Pubblicato: 1 / 5 / 2010

Libreria di screening di diversi composti simili a farmaci 10,000


VENDITORE: SET di analoghi degli inibitori OGT di TimTec

Pubblicato da: TimTec Molecole: 334

PI: Venditore

Pubblicato: 1 / 5 / 2010

Analoghi degli O-GlcNAc Transferase Inhibitors SET


VENDITORE: TimTec ActiTarg-K, modulatori di chinasi

Pubblicato da: TimTec Molecole: 6212

PI: Venditore

Pubblicato: 1 / 5 / 2010

ActiTarg-K, conta su composti 6,000 fornendo una libreria di screening di alto valore di molecole simili a farmaci per identificare la direzione di sintesi per i nuovi inibitori della proteina chinasi

VENDITORE: Biblioteca di derivati ​​di prodotti naturali TimTec

Pubblicato da: TimTec Molecole: 3001

PI: Venditore

Pubblicato: 1 / 5 / 2010

Derivati ​​naturali NDL-3000 da TimTec


VENDITORE: TimTec Natural Product Library

Pubblicato da: TimTec Molecole: 479

PI: Venditore

Pubblicato: 1 / 5 / 2010

NPL Pure Natural Products di TimTec


VENDOR: Libreria di screening

Pubblicato da: AsisChem Molecole: 43121

Pubblicato: 10 / 26 / 2009

Una raccolta di oltre 40,000 composti di piccole molecole simili a farmaci disponibili per la tua selezione personalizzata. Tutti i composti sono disponibili fino a 25mg.


VENDORE: Building Blocks

Pubblicato da: AsisChem Molecole: 176

Pubblicato: 10 / 26 / 2009

Una raccolta di composti utili nella scoperta di farmaci. Tutti i composti se non in stock sono disponibili entro poche settimane per quantità fino a 10 grammi.


TB: TAACF - Libreria NIAID CB2

Pubblicato da: Southern Research Institute Molecole: 102634

PI: Robert Goldman

Pubblicato: 9 / 30 / 2009

Risultati dello screening di una libreria di composti commerciali (ChemBridge) per la capacità di inibire la crescita del ceppo M. tuberculosis H37Rv. Vedi PMID: 19758845


TB: inibitori di EthR (Willand et al.)

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 5

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 9 / 28 / 2009

Inibitori simili a farmaci del repressore trascrizionale EthR. Molecole e dati da Willand et al Nature Medicine 15: 537-544 (2009) PMID: 19412174


VENDOR, ADME: benchmark dei dati da una serie di droghe commerciali strutturalmente diverse.

Pubblicato da: NM4TB: Karlen Group Site Molecules: 24

PI: Anders Karlen

Pubblicato: 6 / 11 / 2009

Un'analisi multivariata di farmaci sul mercato svedese è stata la base per la selezione di un piccolo insieme fisicamente chimico-diversificato di composti farmacologici 24. Nella selezione sono stati considerati fattori come la diversità strutturale, la disponibilità commerciale, il prezzo e un'adeguata tecnica analitica per la quantificazione. La lipofilia, la pKa, la solubilità e la permeabilità attraverso i monostrati di cellule Caco-2 umane sono state misurate per il set di dati compilato. Prevediamo che questo set di dati può fungere da set di riferimento per la convalida di nuove tecniche sperimentali o modelli in silico. Può anche essere utilizzato come set di dati di partenza diversificato per lo sviluppo di nuovi modelli computazionali.

Dati presi da:

Presentazione di una serie di dati sui farmaci strutturalmente diversi e disponibili in commercio per studi di correlazione e benchmarking.

Sköld C, Winiwarter S, Wernevik J, Bergström F, Engström L, Allen R, Box K, Comer J, Mole J, Hallberg A, Lennernäs H, Lundstedt T, Ungell AL, Karlén A.

J Med Chem. 2006 Nov 16; 49 (23): 6660-71.


TB: Dati di assorbimento dalla letteratura pubblicata

Pubblicato da: CDD: TB Curated Literature Molecules: 24

Pubblicato: 5 / 28 / 2009

TB Assorbimento Dati dall'articolo di riferimento

Inibizione della biosintesi del sideroforo da parte di 2-triazolo analoghi sostituiti di 5'-O- [N- (salicil) sulfamoil] adenosina: nucleosidi antibatterici efficaci contro il Mycobacterium tuberculosis.

Gupte, A .; Boshoff, HI; Wilson, DJ; Neres, J .; Labello, NP; Somu, RV; Xing, C .; Barry, CE; Aldrich, CC

J Med Chem (2008) Vol 51, No 23, pp 7495-7507Permeability data.


TB: Dati farmacocinetici della letteratura pubblicata

Pubblicato da: CDD: TB Curated Literature Molecules: 28

Pubblicato: 5 / 28 / 2009

Dati farmacocinetici di TB da fonti di letteratura pubblicate. Dati SAR per 28 unici e composti comuni.

I dati includono citazioni, target, cellule e organismi testati da PubMed, biodisponibilità, Vm, Vd, Cmax, ecc.


TB: dati di tossicità dalla letteratura pubblicata

Pubblicato da: CDD: TB Curated Literature Molecules: 638

Pubblicato: 5 / 28 / 2009

Dati di tossicità da TB provenienti da fonti di letteratura pubblicate. Dati SAR per 638 unici, nonché composti comuni da riferimenti PubMed.

I dati includono citazioni di PubMed, target, test di cellule e organismi, vitalità cellulare, LD50, CC50, MNTD, ecc.


TB: dati di efficacia dalla letteratura pubblicata

Pubblicato da: CDD: TB Curated Literature Molecules: 6768

Pubblicato: 5 / 28 / 2009

Dati di efficacia TB da fonti di letteratura pubblicate. Dati SAR per 6771 unici, nonché composti comuni provenienti da oltre riferimenti XMUMX PubMed.

I dati includono citazioni di PubMed, target, test di cellule e organismi, MIC,% di inibizione, EC50-EC100, IC50, ecc.


TB: MLSMR

Pubblicato da: Southern Research Institute Molecole: 214507

PI: Robert Goldman

Pubblicato: 5 / 8 / 2009

Una raccolta diversificata di oltre 200,000 composti raccolti dal Molecular Libraries Small Molecule Repository (MLSMR) sono stati resi disponibili al Southern Research Molecular Libraries Screening Center in Spring 2008 per i test primari contro Mtb H37Rv. I composti più attivi di questo schermo primario sono stati selezionati e testati a concentrazioni di 10 sia in un test di risposta alla dose contro H37Rv sia in uno schermo di contrasto di citotossicità usando cellule Vero.


MALARIA: Johns Hopkins Clinical Compound Library

Pubblicato da: Johns Hopkins - Sullivan (2008) Molecole: 1878

Pubblicato: 4 / 28 / 2009

I farmaci sono stati sottoposti a screening ad una concentrazione di 10 μM. I parassiti sincronizzati dello stadio ad anello di 3D7 sensibile alla clorochina o Dd2 resistente a più farmaci sono stati coltivati ​​in terreno RPMI 1640 con siero umano 10% e incubati per 48 o 96 h in presenza di farmaco e [3H] -ipossantina. Una piastra per pozzetti 96 con 0.2 mL di materiale di coltura per pozzetto con parassemia 0.2% ed ematocrito 2-4%, fornisce un segnale di incorporazione radioattivo di circa 10,000 cpm a 48 he 20,000 cpm a 96 h con sfondo inferiore a 500 cpm. Gli esperimenti di screening sono stati eseguiti in doppio e l'inibizione percentuale è riportata come media di due esperimenti.


TB: Revisione della letteratura

Pubblicato da: TB Literature Data Molecules: 49

PI: Ballel, et al.

Pubblicato: 4 / 17 / 2009

Dati SAR per la tubercolosi raccolti in un sondaggio di agenti attivi contro M. tuberculosis, compresi quelli con modalità di azione sia conosciute che sconosciute (Ballel, et al. “New Small Molecule Synthetic Antimycobacterials” in agenti antimicrobici e chemioterapia, giugno 2005). Aggiornato 4 / 17 con TubercuList / TBDB / altri collegamenti target e riferimenti migliorati.


TB: Sacchettini et al., Recensione

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 14

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 2 / 18 / 2009

Agenti antitubercolari di prima e seconda linea delle tabelle 1 e 2 in Sacchettini JC, Rubin EJ e Freundlich JS Farmaci contro bug: alla ricerca del persistente predatore Mycobacterium tuberculosis, Nature Reviews Microbiology, 6, 41-52, (XNUM).


VENDITORE: IUPUI - Distributed Drug Discovery (D3) Dati pubblici

Pubblicato da: IUPUI - D3 Enum 73K N-AcylAA-OH, -OMe, -NH2 Molecole: 48818

PI: MJ O'Donnell e WL Scott

Pubblicato: 1 / 1 / 2009

Un catalogo virtuale ad accesso aperto di aminoacidi innaturali acilati e loro esteri metilici. Incoraggiamo i nostri colleghi a comunicare con noi in merito all'interesse per il progetto Distributed Drug Discovery e la metodologia sintetica, che sono descritti in una serie di tre articoli nel Journal of Combinatorial Chemistry (in corso di stampa).


VENDITORE: ASINEX Building Blocks

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 6745

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 12 / 23 / 2008

Farmaci come Building Blocks, se stai prendendo in considerazione un programma di ottimizzazione dei lead, i nostri Building Blocks potrebbero rivelarsi esattamente quello che stai cercando.


PARASITI: profumi

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 228

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 12 / 21 / 2008

Dati di nomi di molecole e strutture per i profumi di un libro di Roman Kaiser, "profumi significativi in ​​tutto il mondo", pubblicato da Wiley-VCH in 2006. Il numero della molecola si riferisce alla loro numerazione nel libro.


TOX: toxcast

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 306

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 12 / 18 / 2008

Libreria di composti tossicodipendenti EPA (principalmente pesticidi) disponibile su http://www.epa.gov/ncct/dsstox/DataFiles.html

http://www.epa.gov/ncct/toxcast/


OMOLOGATO FDA, TOX: dose giornaliera massima raccomandata

Pubblicato da: CDD - Sean Ekins Molecole: 1215

PI: Sean Ekins

Pubblicato: 12 / 10 / 2008

Un database FDA che contiene i valori massimi di dose giornaliera raccomandati per oltre 1200 prodotti farmaceutici. Il set di dati rappresenta alcune delle molecole utilizzate nella seguente pubblicazione Matthews, EJ, et al., Current Drug Discovery Technologies, 1 (1): 61-76. (2004)


VENDITORE: Tradizioni ayurvediche di fronte alle attuali esigenze di salute e benessere

Pubblicato da: Falguni Dasgupta: Raccolta di dati personali Molecole: 37

PI: Falguni Dasgupta

Pubblicato: 10 / 30 / 2008

L'uso tradizionale delle piante medicinali indiane e dei loro estratti è discusso con riferimento alle prospettive moderne con l'obiettivo di trovare motivi comuni, rivalutare le affermazioni e creare opportunità nel settore sanitario e del benessere in conformità con i requisiti normativi, nonché trovare nuovi "farmaci". "


PARASITI: Sandler-UCSF Celera Cysteine ​​Protease Inhibitor Library

Pubblicato da: McKerrow Group Molecole: 1860

PI: Jim McKerrow

Pubblicato: 10 / 23 / 2008

Parassiti in vitro di T. cruzi e T. brucei e specifici schermi enzimatici.


APPROVATO FDA: Farmaci approvati

Pubblicato da: Johns Hopkins Clinical Compound Library Molecole: 2815

PI: David Sullivan

Pubblicato: 10 / 16 / 2008

Farmaci approvati dalla FDA con struttura molecolare definita, tra cui molecole 763 dal Physicians 'Desk Reference, 780 da DrugBank, 1151 nell'Orange Book 2007 e 1007 dall'elenco FDA del Dr. Chris Lipinski


VENDITORE: Libreria focalizzata sul GPCR ASINEX

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 3502

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 10 / 2 / 2008

Set orientato ai farmaci eccezionalmente di alta qualità come GPCR disponibile a una tariffa scontata per la comunità CDD. Questa biblioteca incorpora la nostra competenza in chimica medicinale e la nostra capacità di identificare frammenti privilegiati dalla letteratura e assemblarli in un modo senza precedenti.


GPCR: Database Ki PDSP

Pubblicato da: PDSP Ki Database Molecules: 20026

PI: Bryan Roth

Pubblicato: 9 / 16 / 2008

Oltre i valori Ki 47,000 rispetto agli obiettivi GPN 699 dal database del programma di screening dei farmaci psicoattivi NIMH (PDSP)


VENDITORE: ASINEX Synergy Libraries

Pubblicato da: ASINEX Molecole: 25008

PI: Mark Parisi

Pubblicato: 4 / 26 / 2008

ASINEX ha sviluppato una nuova libreria ad alta diversità ricca di frammenti di farmaci come il farmacoforo. Il design della biblioteca si basa su due forme di Synergy. Il primo è l'interrelazione tra tecniche diverse e mirate, e il secondo prevede la convergenza di intermedi chiave multi-step (passi 6-9) al fine di creare composti sofisticati. Vedi il PDF qui sotto per maggiori dettagli.


TOX: Strutture con dati pubblici sui profili di tossicità noti

Pubblicato da: Strutture con profili di tossicità noti Molecole: 135

PI: Sean Ekins, PhD

Pubblicato: 3 / 28 / 2008

Profili di tossicità specifica dei tessuti di composti noti con riferimenti


INIBITORI PROMISCHI: Shoichet ha pubblicato inibitori promiscui

Pubblicato da: Shoichet ha pubblicato inibitori promiscui Molecole: 111

PI: Brian Shoichet

Pubblicato: 3 / 26 / 2008

Aggregati che creano "falsi positivi" per autoassociazione di molecole organiche in soluzioni acquose


TOX: UC Davis - Dati pubblici di Hammock

Pubblicato da: UC Davis - Hammock Molecules: 714

PI: Bruce Hammock

Pubblicato: 3 / 17 / 2008

Inibitori dell'epossido idrolasi solubile (sEH): questi enzimi hanno le funzioni principali di 3: disintossicazione, catabolismo e regolazione delle molecole di segnalazione.


MALARIA, TRYPANOSOME: St. Jude Public Data

Pubblicato da: St. Jude - Malaria / Trypanosome Bioactives Molecole: 2426

PI: Kip Guy

Pubblicato: 3 / 5 / 2008

Risultati di accesso aperto dal laboratorio di Kip Guy presso il St. Jude Children's Research Hospital, tra cui HTS di bioattivi contro la malaria e T. brucei


MALARIA: Drexel Public Data

Pubblicato da: Drexel University Molecole: 195

PI: Jean-Claude Bradley

Pubblicato: 3 / 2 / 2008

Risultati di una collaborazione aperta di dati aperti tra

Drexel (prodotti Ugi-4CC) e UCSF (screening antimalarico). Questo set di dati rappresenta un esempio di come i ricercatori possono scegliere di pubblicare apertamente i risultati selezionati. (Per impostazione predefinita, al contrario, tutti i gruppi sono privati.)


MALARIA: US Army Survey

Pubblicato da: US Army Malaria Literature Survey Molecules: 12318

Pubblicato: 2 / 29 / 2008

Un'ampia raccolta di dati SAR sugli animali da farmaco antimalarici, tra cui strutture chimiche, dati di bioattività, dati farmacologici e dati di tossicità (pubblicato originariamente dall'esercito americano in 1946 come "A Survey of Malaria Drugs")


MALARIA: PlasmoDB

Pubblicato da: UPenn - Malaria Literature Data Molecules: 120

PI: David Roos

Pubblicato: 2 / 19 / 2008

PlasmoDB di inibitori della malaria compilati dalla letteratura, tra cui struttura chimica, identificatore del gene PlasmoDB, nome del gene target e riferimenti contro P. falciparum, P. vivax, P. berghei, P. yoelii, P. chabaudi, P. vinckei petteri


MALARIA: Prodotti naturali (NPPDB)

Pubblicato da: National Center for Natural Products Research Molecules: 426

PI: Babu Tekwani

Pubblicato: 2 / 15 / 2008

Database antimalarico di prodotti naturali flavonici, inclusi dati antimalarici e citotossicità (Università del Mississippi, National Center for Natural Products Research)


TB: Risultati del dosaggio TAACF

Pubblicato da: TB Early Phase Drug Discovery Program Molecole: 812

PI: Bernard Munos

Pubblicato: 2 / 12 / 2008

Attività antibatterica di una libreria pubblicamente disponibile di composti 812 contro Mycobacterium tuberculosis (H37Rv) nel saggio su cellule intere Alamar Blue


APPROVATO dalla FDA: farmaci orfani

Pubblicato da: Farmaci noti Molecole: 1721

PI: Christopher Lipinski

Pubblicato: 10 / 26 / 2007

Farmaci approvati dalla FDA con indicazioni designate, nome dello sponsor e strutture chimiche (se disponibili)