Collaborative Drug Discovery、創薬のためのクラウドワークスペースの開発に向けたNIHの新規助成金を発表

カリフォルニア州バーリンゲーム - 2022年12月5日 - Collaborative Drug Discoveryは、National Center for Advancing Translational Sciencesから、創薬のためのクラウドワークスペースの開発に対して1,709,776ドルの助成金を受けましたCDD Vault 。

Collaborative Drug Discovery, Inc. (CDD) は、創薬や翻訳に携わる科学者が、複数のシステムやベンダーに分散している異種データベースや計算ツールを簡単、堅牢、かつ安全に統合し、高効率でカスタムメイドの計算ワークフローを実現するための新しい情報科学フレームワーク「Cloud Workspaces for Drug Discovery」を提案するものです。この分野の科学者は通常、複数のソースから得た化学的・生物学的データを組み合わせ、異なるタイプの解析や可視化を専門とする複数のソフトウェアパッケージでそれらを実行し、理想的には解析結果を基礎となる実験データとともに保存する必要があります。現在、このような統合は難しく、費用もかかり、一般的に壊れやすいため、（i）急速に増加する高品質のパブリックアクセスデータリポジトリの利用、（ii）有望な新しい分析ツールや戦略の評価の大きな障壁になっています。モノリシックなプラットフォームは、この問題を解決するために、すべてを一つ屋根の下に集めることを提案しますが、非常に高価であり、柔軟性に限界があります。このようなアプローチは、デスクトップコンピューティングの時代に発展したもので、現代のクラウドベースのワークフロー、特にリモートシステムに分散した大規模なデータセットを組み合わせる必要がある計算集約的な処理の課題にうまく対応することができないのです。クラウドワークスペース（CW）は、この両極端の長所を組み合わせ、短所を回避することを目的としています。CWでは、ユーザー独自の要件やワークフローに合わせた個別のクラウドホスティングソリューションを簡単に作成することができます。CWのアプローチは、モノリシックなソフトウェアソリューションのパフォーマンス、堅牢性、使いやすさを提供しますが、それに伴う柔軟性の欠如やベンダーの固定化はありません。また、パイプライン方式を進化させ、クラウドベースのモデルを採用し、パフォーマンスやセキュリティを犠牲にすることなく分散データリソースを包含することができます。フェーズ1では、CWコンテナ環境とリモートデータベース間で、生物・化学データを堅牢かつ効率的に同期できること（化学物質識別子を正しく関連付けたまま新規または修正データのみを転送できること）を証明し、このコンセプトにとって困難ながらも不可欠な前提条件となりました。フェーズ2では、CWの開発を完了し、ソフトウェアアプリケーションのパートナーやベータ版の顧客エンドユーザーとともに、複数の実世界のアプリケーションでその有効性を実証する予定です。この技術の市場は、学術関係者から中小企業、大手製薬会社まで多岐にわたります。