GSKとオンラインコミュニティが独自の提携を結び、マラリアのオープンソース創薬を促進
2010年5月20日
GSK社が化合物ライブラリーの13,500分子の化学構造を自由に共有する初の企業となる
民間企業やパブリックドメインのデータ提供者からの有力な科学研究コミュニティとのアライアンス形成
カリフォルニア州バーリンガム市2010年5月19日、グラクソ・スミスクライン株式会社（以下、GSK）は、パブリックドメインのデータプロバイダーであるEuropean Bioinformatics Institute（EMBL-EBI）、米国国立医学図書館（NLM）、米国のインフォマティクスサービスプロバイダーであるCollaborative Drug Discovery（CDD ）と共同で、マラリアの新しい治療法につながる可能性のある13,500以上の化合物に関する重要な科学情報を自由に利用できるようにしました。
今回のデータ公開は、製薬会社がこれほど多くの化合物の構造を公開するのは初めてのことであり、ウェブホストとその専門的な研究ツールの協力により実現したもので、研究者は無料で利用することができます。この情報は、研究者が日常的に利用しているウェブサイトに掲載されており、最も致命的なマラリアの寄生虫であるファルシパルム（P. falciparum）に対して有効性を示したGSK独自の化合物ライブラリーの分子について、質の高い科学的データが含まれています。
「EMBL-EBI、NLM、CDD が、オープンソースの原則をマラリアの創薬に適用するという価値ある試みに参加してくれたことを嬉しく思います」とGSKの創薬部門責任者Patrick Vallanceは述べています。「この病気を克服するには、多くの科学者が協力する必要があります。この病気を克服するためには、多くの科学者が協力する必要があります。世界中の研究者がこの情報を利用してさらなる研究を進め、製薬会社や大学などの他のグループがこのオンラインリソースに情報を追加することを期待しています」と述べています。
このようなデータは、新薬開発への第一歩となる。化合物の構造と、それがマラリアの寄生虫に影響を与える場所に関する情報があれば、科学者は、創薬のためにこれらの化合物についてさらに研究を進めたり、これらの化合物が寄生虫のライフサイクルを阻害するためにどのように使用されるかを理解したりして、最終的には新薬の開発につなげることができます。この情報を広く開放することは、本質的には、「オープンソース」戦術が創薬に応用されている例です。
"EMBL-EBI の ChEMBL チームのリーダーである John Overington 氏は、「ライフサイエンス情報を研究コミュニティに公開することは、EMBL-EBI の使命の中心です。"GSKのデータをChEMBLに組み込み、研究者がマラリアの新しい治療法を見つけるのに役立つ膨大な情報とリンクさせることで、GSKのデータに付加価値を与えることができることを誇りに思います」と述べています。これは、医薬品研究における官民連携の新時代の幕開けです。"
"NLMのPubChemデータベースの責任者であるSteve Bryant氏は、次のように述べています。「NLMは、このような画期的な情報の一般公開に携わることができ、大変嬉しく思っています。"これらのデータをPubChemのような公開リソースを通じて利用できるようにすることで、GSKは、関連化合物、生物活性の結果、発表された文献、および研究者がマラリアと闘うための新たな発見をするのに役立つその他のリソースと情報がリンクされているため、研究プロセスを大幅に促進しています。
Collaborative Drug Discovery社のCEOであるBarry A. Bunin氏は、「CDD は、この歴史的な出来事の一端を担うことができ、大変嬉しく思っています」とコメントしています。「大手製薬会社が何十年にもわたって医学的ブレークスルーを実現してきた中で、いくつかのヒット化合物だけでなく、すべての化学的・生物学的データをオープンに共有するグループは初めてです。 さらに、表現型のスクリーニングでは、CDD のツールを使うことで、研究者は全細胞スクリーニングで得られたターゲットの仮説と検証を始めることができます」と述べています。
EMBL-EBI は、この化合物に関するデータの主要なリポジトリとして機能し、投稿された情報をインデックス化し、フォーマット化します。GSKは、これらの化合物とデータを研究している外部の科学者にも同様に情報を追加していきます。
データについて
このデータには、GSKの化合物ライブラリーにある200万種類の化合物のマラリア寄生虫に対する効果を決定するためのスクリーニングの結果が含まれています。スクリーニングプロジェクトでは、約13,500種類の化合物の中から、マラリアの寄生虫に対して強い阻害作用を示す化合物が同定されました。
キナーゼ阻害剤は、これまでに活性が確認されていた分子の大部分を占めており、現在は抗マラリア薬のヒット化合物として同定されている。このデータには、GSKがこの適応症で現在研究を行っている化合物群と、同社が他の適応症で試験を行った化合物の「作用機序」が含まれています。
特定された化合物の構造のほとんどは、薬に変換することが可能なものとして分類されています。
化合物とその構造に関する現在の微生物学的情報は、研究者が容易にアクセスできるオンラインリソースに掲載されています。EMBL-EBIサイトは、世界中の研究者が自由にアクセスできるように構築されています。情報公開の価値は、ウェブホストとサイト上の専門的な研究ツールの連携によって高められ、研究者は無料で利用できるようになっています。
GSKは、このプロジェクトに資金を提供してくださった「マラリアベンチャーのための医薬品」の支援に感謝しています。
完全な情報は、オンラインでご覧いただけます。
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
マラリアについて
マラリアは、感染した蚊に刺されることで人に寄生する寄生虫によって引き起こされる生命を脅かす病気です。30秒に1人の割合で子どもがマラリアで死亡しています。2009年には2億4,300万人のマラリア患者が発生し、100万人近くが死亡していますが、その多くはアフリカの子どもたちです。
マラリア、特に最も致死性の高いP. falciparumの治療法は、アルテミシニンをベースとした併用療法（ACT）として知られている薬剤の組み合わせである。しかし、寄生虫の耐性が問題となっており、マラリア対策の努力が妨げられている。マラリア治療のためのアルテミシニンに代わる有効な薬剤は、市場に出回っていないか、あるいは薬剤開発の終盤に差し掛かっている。
グラクソ・スミスクラインについて
グラクソ・スミスクラインは、世界有数の研究開発型の製薬・ヘルスケア企業であり、人々がより多くのことをし、より良く感じ、より長く生きることができるようにすることで、人間の生活の質を向上させることに取り組んでいます。 グラクソ・スミスクラインについての詳細は、www.gsk.comをご覧ください。
欧州バイオインフォマティクス研究所（EMBL-EBI）について
欧州バイオインフォマティクス研究所（EMBL-EBI）は、欧州分子生物学研究所（EMBL）の一部であり、英国ケンブリッジ近郊のヒンクストンにあるウェルカム・トラスト・ゲノム・キャンパス内にあります。EMBL-EBIは、研究コミュニティに生物学的データベースを公開するというEMBLの先駆的な活動から生まれました。DNA配列（ENA）、タンパク質配列（UniProt）、動物ゲノム（Ensembl）、三次元構造（ヨーロッパのProtein Databank）、遺伝子発現実験のデータ（ArrayExpress）、タンパク質-タンパク質相互作用（IntAct）、経路情報（Reactome）など、世界で最も重要な生物学的データのコレクションのいくつかをホストしています。EMBL-EBIにはいくつかの研究グループがあり、その科学者たちはバイオコンピューティングコミュニティのための新しいツールを開発し続けています。 EMBL-EBI の詳細については、www.ebi.ac.ukをご覧ください。
国立医学図書館について
国立医学図書館（http://www.nlm.nih.gov/）は、世界最大の健康科学の図書館です。国立医学図書館は、米国保健福祉省の一部門である国立衛生研究所（NIH）の一部です。NIHは、基礎医学、臨床医学、トランスレーショナル医学の研究を実施し、支援するための主要な連邦機関であり、一般的な疾患と希少疾患の両方の原因、治療法、治療法を研究しています。NIHとそのプログラムの詳細については、www.nih.gov をご覧ください。
Collaborative Drug Discovery (CDD)について
CDD は、市場で最も広く使用されている創薬クラウド・プラットフォームをホストしています。"CDD Vault " は、従来の創薬インフォマティクス（登録やSAR）とソーシャルネットワーキング機能を組み合わせた、セキュアでプライベートな産業用強力データベースです。"CDD Collaborate " は、選択した機密データを外部の研究者と安全に交換することで、リアルタイムのコラボレーションを可能にします。"CDD Public" は独自のコンテンツを持っています。 CDD に関する詳しい情報は、www.collaborativedrug.comをご覧ください。
GSKプレス連絡先
英国ジャネット・モーガン Tel: + 44 (0) 20 8047 5502
米国メリンダ・スタビー Tel: +1 919 483 2839
EMBI-EBIプレス連絡先
カトリーナ・パヴェリン 電話：+44 (0) 1223 494 452
EMBL-EBI 科学アウトリーチ・オフィサー Email:[email protected]
NLMのプレス連絡先。
メラニー・モドリン Tel: +1 301 496 7771
NLM広報・渉外部 Eメール： [email protected]
CDD プレスコンタクト
Barry Bunin,PhD Tel: +1 650 204 3084
コラボラティブ・ドラッグ・ディスカバリー社 代表取締役社長兼ＣＥＯ Email: [email protected]
