ジム・ヴィケル、元エリ・リリー、アペックス・セラピューティクス

2011年5月19日

ジム・ヴィケルのヘッドショット

Jim Wikel は、Apex Therapeutics のチーフケミストです。1971年から2004年までイーライリリーで科学者および研究マネージャーとして様々な役職を歴任し、構造・計算科学、ディスカバリーケミストリー研究・技術部門の責任者、上級研究員を務めました。2005年から2006年12月にIcosystem Inc.の一部門となるまで、マサチューセッツ州ケンブリッジの新興企業Coalesix Inc.の最高技術責任者を務めました。彼の経験により、化学、生物学、統計学の各分野を理解し、翻訳することができるようになり、予測モデルと経験的アプローチの両方を使用して、医薬品開発のための分子を最適化することができるようになりました。マーシャル大学で化学の理学士号と有機化学の理学修士号を取得。

"私はウェストバージニア州南部の炭鉱地帯の出身でした大学に行くのは一般的ではありませんでした退職後はリリー社で計算化学と構造生物学のトップを務めました

インタビュー：Barry Bunin,PhD, CEO, Collaborative Drug Discovery, Inc.

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編集されたインタビューのトランスクリプト

バリー・ブニン
最初の質問、簡単に言うと、あなたが関わっている現在の研究について教えてください。

ジム・ヴィケル
インディアナ大学医学部との共同研究では、子供の癌を治療するための新しい化学療法に焦点を当てていますので、そこの生物学者といくつかのデータを共有しています。これまで生物学者は化学や化学構造には興味がありませんでした。彼らは、生物学的な駆動力とメカニズムを理解する必要性に基づいて化合物を追求してきましたが、構造を最適化する方法や、目的に適した化合物にするための微調整にはあまり注目していませんでした。私たちは彼らと協力して、その情報を共有し、化学的な面で彼らを教育すると同時に、私も生物学的な面でこの特定の分野の教育を受けています。その点ではうまくいっていると思います。私たちは社内の化学にはアクセスできないので、すべてを受託研究機関を通じて行っていますので、どのような化合物が作られているのか、どこで作られているのか、生物学的なアッセイ結果はどのようなものなのか、というデータを社内で共有することができます。

バリー・ブニン
おそらく、多くの研究者が産業界の視点で考えていくことになるので、共同研究の学術的な側面-産業界の側面についても少し話をしてみてください。

ジム・ヴィケル
基礎科学はもちろん医学部のアカデミックな環境から生まれたものですが、私たちはそれを大学の外に持ち出して、創薬や薬の最適化プロセスのために進化させようとしています。そして、大学が所有する知的財産を活用して、その技術を中心とした小さな会社を設立しました。この小さな会社（Apex Therapeutics）は、大手製薬会社の経験豊富なベテランで構成されており、このプロセス全体のステップAからステップBに進むために何が必要かを理解しています。私たちは、学術関係者と緊密に協力して、これらの化合物を開発し、その外観や挙動をより医薬品に近いものにするために努力しています。小グループに代表される製薬企業の人材から得た経験は、学術的な発見に直接生かされており、新しい物質組成を開発し、化合物をより強力に、より選択的にし、医薬品候補としてより適したものにするという点で、これらの資産の価値を高めることができました。

バリー・ブニン
もし、想像通りにうまくいったら、この研究から何が生まれるのか、そして、もっと謙虚な目標は何なのか、その両方を考えることは常に良いことです。うまくいったら、これは子供のがんのプロジェクトだとおっしゃっていましたが、この研究から会社を立ち上げようと思ったきっかけについてお聞かせください。

ジム・ヴィケル
もちろん、研究室で発見されたこの発見を、毎日のように目にする患者さんに直接応用したいと考えていますが、研究室で発見された化合物をどのようにしてヒトに投与し、自分の考えがうまくいくかどうかを確認することができません。私たちがこの研究を大学の外に持ち出すことでやりたいことは、追加のリソースを活用することができるだけでなく、この研究を完全に開発することができるようになることです。私が思うに、それを持ち出すことの利点は、より広い範囲の絵筆を使って問題に取り組むことができ、そのために新たな才能やスキルをもたらすことができるということです。私たちは、今まで無反応だった子供たちに、そして後に成人にも、追加の治療法を提供したいと考えています。もちろん、私たちの最終的な目標は、この薬が有用な薬として認められるようにすることです。近い将来、私たちはいくつかの候補を特定することに焦点を当てています。この特定の患者さんを対象にするためには何が必要かを議論するために、FDAとのプレIND会議に向けて、予備的なPKデータを取得したいと考えています。私たちはそのために軌道に乗っていると思います。

バリー・ブニン
CDD を使用する前は、どのようにデータをコラボレーションまたは管理していましたか？また、その時にCDD を選択したのはなぜですか？

ジム・ヴィッケル
彼らはエクセルのスプレッドシートやパワーポイントのスライドを配りました。学術的な壁の中にいる限りは、それなりにうまくいっていたと思います。全員がエクセルのバージョンを持っていましたし、全員が生物学者でしたから、単純な識別子や一般名、構造上の何らかの呼称があれば、全員が全く問題ありませんでした。しかし、化学の分野に携わるようになり、壁の外に出て地理的に異なるグループ間で共有したいと思うようになると、別の方法を取らなければならなくなりました。エクセルのスプレッドシートを回せばデータは得られますが、それにはいくつかの課題がありました。例えば、どのバージョンを持っているかという修正ログ....、データシートが回され、人々が何かを加えたり引いたり、自分のコメントやメモをしたりしたため、本当にねじれたデータの束になってしまったのです。もう一つ、化学者として本当に困ったことは、構造をエクセルに取り込むことでした。構造を見ることはできても、その絵が何であるかを気にしない生物学者に負担をかけないようなフォーマットに構造を変換するのです。最初は、画像ファイルを入れたExcelのスプレッドシートを渡していました。その際、データを整理するのに少し問題がありました。写真がいつもソートされないのです。そこで、Excelにプラグインを埋め込んで試してみたところ、ある程度は成功しましたが、理想的とは言えませんでした。もちろん、プラグインを使っても、SMARTやSMILESの文字列で検索しない限り、構造検索機能はありませんでした。 OracleデータベースやSQLタイプのデータベースなど、市販のデータベースを使って検索することもできましたが、生物学者や化学者の多くは専門知識を持っておらず、そこまでして検索したいとは思わないため、複雑さが増してしまいました。私たちは、化学者にグラフィカルな画像や構造検索機能を提供しつつ、薬理学者や生物学者にそのイメージを負担させないような、中間的なものを見つけなければなりませんでした。そして、CDD は、その目標を達成しました。とても簡単です。地理的に離れた場所にいても、すべての機能にアクセスできるので、ほとんどトレーニングを受けずに、データベースに入力されたデータをほぼリアルタイムで確認することができます。つまり、簡単で直感的な操作が可能なのです。

バリー・ブニン
このインタビューでは、もう少し個人的な話をしたいと思います。孫と遊んでいる時間もあるでしょうし、自分を養うために科学をする必要はないと思いますが、今のキャリアの段階で何をしているのか、何がインスピレーションになっているのかを話してください。これまでの人生で科学の分野でやってきたことを考えると、何が魅力的で面白いのでしょうか？

ジム・ヴィケル
私は２００４年からビッグファーマを退職しましたが、正直言って、退職はうまくいかなかったし、思ったようにはいかなかったと思います。私は、研究や製薬会社でやっていたことを楽しんでいたにもかかわらず、それでいいと思っていました。だから、私は辞めて、背を向けて、それだけだと思って出て行きました。しかし、そうではなかったのです。他の趣味にもかかわらず、人脈やネットワークを通じて、科学の世界に引き戻されていることが分かりました。私には他にも趣味があります。孫もいますし、忙しい毎日を送っていますが、私はいつも、一日のうちの大部分を科学に費やしています。プロジェクトに参加しようという話をしても、私にとっては楽しくて面白いものでなければ、やらないというのが本音です。今のところ、別の仕事に就きたいとは思っていないので、やりたいからやるのであって、やらなければならないからやるのではない。それだけで、仕事に対する見方や受け止め方が全く違ってくると思います。私はこれにかなりの時間を費やしていますが、外に出て他のことをしたり、特定の研究テーマに1日8時間もかけていなくても、罪悪感を感じません。基本的には肉をつけずに趣味にしてしまうと、とても楽しいです。いつになったら置くのかわからない。

バリー・ブニン
あなたのことを知らない人もいるかもしれませんが、あなたはリリーで様々な役割を担ってきました。そして、PhD 、多くの人はガラスの天井があると思っていますが、あなたはその必要がないこと、実力主義であることを証明しています。感動的なお話だと思いますので、その経緯と、最初から最後までのリリーでの経過について少しお話しください。

ジム・ヴィケル
どこまでがいいのかわからないけど全部あげよう不要なものは編集してもいい私の立場から見ても興味深い道だったからだ私はウェストバージニア州南部の炭鉱地帯から来ました大学に行くのは一般的ではありませんでした私の小さな石炭の町の主な雇用主は、炭鉱と鉄道会社でした。それが私の人生でした。大学に進学した時は少数派でしたが、この小さな町では誰も聞いたことのない化学を専攻しました。みんな大学に行ってビジネスマンか教師になると思っていた私は化学の学士号を取得しましたが、仕事には就けませんでした。1969年には軍隊だけが雇われていた彼らは私を入隊させようとしたが私は失敗したそれで行き詰まった仕事がないどうすればいいの？ 1971年には状況が良くなるだろうと思って、数年間大学院に入学しました。少しはマシになっていました。何百社もの製薬会社に応募しました。大学院で論文の研究をしていた時に、教授の一人が私にこの特定の業界の方向性を教えてくれました。私が応募した時には、何百もの不採用が出ました。面接のオファーは１社だけイーライリリー＆カンパニーでここに来て面接を受けてオファーを受けましたそれで私はそれでいいと言いました、働きに行くつもりです。もし就職が決まっていなかったら、予備のプランとして、もう少し大学院に行くことになっていました。リリーではラボラットとして働き、化学の仕事をし、薬用化学を学びました。そこには素晴らしい先生がいて、私に柔軟性と自由な学習と成長を許してくれました。振り返ってみると、私はその人と関わることができたのはとても幸運でした。時間をかけてゆっくりと出世していき、最終的には自分の研究室で上級職を任されるようになりました。リリーでの35年間の約半分は、薬用化学者として研究室で過ごしました。80年代のどこかでMDLが登場し、コンピュータの力が入ってきて、コンピュータに興味を持ち始めました。もちろん私の世代ではコンピュータの技術に触れることはありませんでした。しかし、コンピュータの力とそれが化学にどう応用できるのかということに興味を持ちました。当時は定性的な意味でのQSARを開発していたのですが、今日では当たり前になっているような数学的な計算や物性の計算は一切していませんでした。基本的にはドライディングモデルと紙と鉛筆だけでした。そこで私はMDLソフトウェアに興味を持ち、ちょっとしたプログラムを書き始めました。当時のFortranを少しハックして、DCL、DECのコマンド言語を使って、MACCSから物を取り出して、リシャッフルして、MACCSソフトに戻して、表示するようになりました。そんな感じでコツを覚えて、そのツールを使って実験科学に役立つようになっていきました。それが最終的には、1989年頃にリリー社がCray社のスーパーコンピュータを手に入れ、計算化学のグループを作ったときに、その機会につながりました。私は研究室を離れ、当時は物理化学者が3人、結晶学者が1人、私が1人のグループに参加していました。このグループは時間をかけて大きくなり、最終的には私が計算化学グループのトップになりました。当時、約20人の計算化学者がいましたが、私のグループにはさらに10人の結晶学者がいて、私はこれらの人たちに責任を持ち、そのほとんどが博士号を持っていました。私が退職した後、リリー社で計算化学と構造生物学の責任者を務めましたが、それは私にとって素晴らしいキャリアでした。振り返ってみると、このキャリアはとても楽しいものでした。私は多くのことを学び、今も多くのことを学び続けています。

バリー・ブニン
いいわよそれは素晴らしいことです。

ジム・ヴィケル
聞いた話なのかな？

バリー・ブニン
それは.........そうですね........こんなに詳しく、そして美しく聞いたのは初めてです。素晴らしい話だと思います科学者の皆さんに関連した質問をしたいのですが、明らかに極秘のことは伏せておきますが、創薬や科学の分野で、日常的な実験を超えた、ある種の刺激的な瞬間に何かが起こったとしたら、その瞬間を教えていただけますか？それは大学院であったかもしれませんし、産業界であったかもしれませんし、どこかであったかもしれませんが、何か共有できることがあれば教えてください。それが最後の質問です。

ジム・ヴィケル
研究には「あぁ」と思う瞬間がたくさんありますが、私もそうでした。私は化学者として、最終的にリリー社の農業部門の医薬品として上市されることになった化合物の製造プロセスを考える初期のプロセス研究に携わる機会がありました。この化学的な作業は、「あぁ」と思う瞬間を何度も与えてくれました。また、最近では前代未聞の規模と期間のプロジェクトに携わりましたが、抗ウイルス剤の研究プロジェクトがあり、約10年間の大半を私が唯一の化学者として担当しました。 10 年の間に何人かの人が出入りしましたが、それはすべて分子生物学以前のものでしたので、物事の進行はかなり遅く、化学はもちろん、空気、火、水から始まり、すべてのことを行うのには長い時間がかかりました。しかし、最終的には、2つの化合物をクリニックでヒトの中に入れることができました。人間では、ある時リリーに化学者として面接に来た応募者がいましたが、結果的に彼は... 少し話を戻します。臨床試験、ヒトの試験では、この場合、風邪、ライノウイルスを感染した患者に投与しました。その病気を人間に与えることができます一般的には、いくつかのセンターでは、少なくとも当時、春休みにキャンパスを離れた学生を連れてきて、ライノウイルスを感染させ、ある者にはプラセボを投与します。インタビューに来てくれた人の中には、大学にいて、この研究にボランティアで参加していた人がいました。彼が薬をもらったと思ったのか、プラセボをもらったと思ったのかをメモして交換しました。その答えは今でもわかりません。しかし、それは私のキャリアについての個人的なコメントとしては良いものでした。計算機的な意味では、初期の頃に Cray-2 を使って仕事をしていて、Cray 以前は 12 時間から 24 時間かけてMOPAC の計算をしていたのに、突然、数分で同じ計算をしてくれる Cray-2 を手に入れたことは、技術的な観点から見て本当に「アッ」と言う間の瞬間でした。私はこの40年間で多くのことを見てきたと思います。私は多くのテクノロジーとビジネスの多くの変化を見てきました。私が最近目の当たりにした「ああ」という瞬間の一つは、20年未満の医薬品化学者としてのキャリアを振り返ってみると、1,000種類の化合物を作っていたかもしれませんが、今日では研究室でできることはバケツの中の一滴に過ぎません。私が皆さんにお伝えしている違いは、当時は1/2グラムから1グラムの化合物を作っていましたが、それはインビボアッセイや広範なスクリーニングを行うための最低限の量に過ぎませんでした。

バリー・ブニン
最後の最後を締めくくる素敵なメモだと思いますし、インタビューにお付き合いいただきありがとうございました。

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このブログは、CDD Vault コミュニティのメンバーが執筆しています。CDD Vault は、プライベートおよび外部の生物学的・化学的データを安全に管理する、ホスト型の創薬インフォマティクス・プラットフォームです。化学物質の登録、構造活性相関、化学物質のインベントリ、電子ラボノート機能などのコア機能を提供しています。化学物質の登録、構造活性相関、化学物質のインベントリ、電子ラボノート機能などのコア機能を提供しています。

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