NIMH精神薬スクリーニングプログラムとCollaborative Drug Discoveryは、化学的に検索可能なGPCR構造活性相関データベースを創薬コミュニティ全体に提供する

2008年10月15日

Collaborative Drug Discovery, Inc.(CDD) は、ノースカロライナ大学チャペルヒル校の Bryan L. Roth 博士が率いる NIMHPsychoactive Drug Screening Program(PDSP) と共同で、CDDのウェブベースのソフトウェアが、オープンアクセスで最大の化学的部分構造および類似性検索が可能な G タンパク質共役型受容体 (GPCR) Ki データベースをホストしていることを発表しました。699の受容体ターゲットに対する47,312の阻害剤の平衡解離定数(Ki値)を収録したPDSP Kiデータベースは、CDD Web 2.0の共同研究情報システムにおいて、構造検索可能なデータベースとして利用できるようになりました。

PDSP Kiデータベースは,拡大する分子標的と相互作用する薬物の能力に関する情報を提供するパブリックドメインのユニークなリソースです。Kiデータベースは、多数のGタンパク質共役型受容体、イオンチャネル、トランスポーター、酵素に対する多数の薬剤および薬剤候補のKi値(親和性)について、公表されているものと社内で作成されたものとのデータウェアハウスとして機能しています。

「PDSPプロジェクトディレクターで薬理学教授のBryan Roth博士は、「ノースカロライナ大学メディカルセンターが主催するPDSP KiデータベースのWebサイトには、昨年1年間で約100万件のアクセスがありました。このデータは、現在、CDD のシステムで化学構造検索ができ、誰でも見ることができます。Roth博士は、「CDD データベースは、非常にエレガントなプラットフォームです。創薬データを作成している人には強くお勧めします。"

Collaborative Drug Discovery社の社長であるBarry Bunin博士は、「Bryan Roth博士と協力して、PDSP KiデータへのオープンアクセスをCDD のプラットフォームで提供できることを光栄に思います」と述べています。「CDD は、PDSP Kiデータを従来の構造/SARマイニング可能なデータベースに加え、世界初のセキュアでコラボレーティブな公開/非公開のデータ統合機能を備えています。低分子医薬品の約40%はGPCRターゲットに作用すると言われており、このデータは、研究者が新薬を開発する上で、ターゲットから外れた場合の副作用や薬物間干渉の可能性をより正確に予測するのに役立ちます」と述べています。

PDSP Kiデータベースは、他の12の公開されたデータソースと一緒に、CDD システムで、以下のような40,000以上の化合物の化学的および生物学的データを提供しています。

  • FDAで承認された1,700種類の医薬品の適応症とスポンサー名
  • 15,000化合物以上のMalariaアッセイデータを5つの公的データソースから収集
  • 850以上の結核抗菌活性情報を持つ化合物
  • 約3,500種類の天然物とその派生物のデータセット
  • 25,000以上の化合物を購入可能

NIMH精神活性物質スクリーニングプログラムについて

NIMH Psychoactive Drug Screening Program (PDSP) - http://pdsp.med.unc.edu- は、National Institute of Mental Health (NIMH) の委託を受けて、クローン化されたヒトまたはネズミのCNS受容体、チャネル、および輸送体における薬理学的および機能的な活性について、新規の精神活性化合物のスクリーニングを行っています。化合物のスクリーニングは、クローン化されたヒトまたはげっ歯類のCNS受容体、チャネル、トランスポーターの多数のcDNAに対するアッセイ、およびセカンドメッセンジャーシステム、チャネル活性、トランスポーター機能に対する影響を決定する機能的アッセイを用いて、資格のある学術研究者に無償で提供される。Ki値を算出し、PDSPデータベースに登録します。クローン化された受容体も、資格のある研究者には無償で提供されます。現在のレセプター/トランスポーターのリストは、http://pdsp.med.unc.edu/pdspw/clones.php

詳細については、以下にお問い合わせください。

バリー・ブニン、PhD
社長兼CEO
コラボレーティブ・ドラッグ・ディスカバリー (CDD)
1818 Gilbreth Road, Suite 220
バーリンゲーム、CA 94010
電話番号650-204-3084
[email protected]

Bryan Roth, M.D.,Ph.D.
ノースカロライナ大学チャペルヒル校
薬理学教室 スクール・オブ・メディスン
CB 7365, 8032 バーネット-ウォマックビル
チャペルヒル, NC 27599
電話:919-966-7535
ファックス:919-843-5788
[email protected]