알렉스 클라크는 2000년대 초부터 화학정보학 및 전산 약물 발견 소프트웨어 제품을 구축해 왔으며, 10년을 보낸 후 실험실 벤치에서 반응을 실행하기 위해 과학자가 되는 법을 배웠습니다.

정보학으로 풀타임으로 전환한 이후, 그는 2D 또는 3D, 대규모(화학정보학) 또는 소규모(양자 화학), 큰 분자(단백질) 또는 소분자(약물)이든 대부분의 현대 화학 소프트웨어 분야에서 일했습니다. 그는 과학자와 소프트웨어 사이의 인터페이스에 지속적으로 관심을 가지고 있으며, 우리 업계에 계속 도전하고 있으며 시각화 기술, 전자 실험실 노트북 및 모바일, 클라우드 및 웹과 같은 새로운 플랫폼을 위한 기존 소프트웨어를 다시 구상하는 데 많은 노력을 기울였습니다.

그는 과학 문학에 정기적으로 출판, 그리고 2010 년에 기업가가 된 이후 협력의 큰 숫자를 유지 하고있다. 그는 프로젝트에 노력하고 있지 않을 때마다 CDD그는 자신의 회사인 분자 재료 정보학을 지속적으로 유지하며, 미래 지향적인 화학 소프트웨어 아이디어, 방법 및 제품을 끊임없이 실험하고 있습니다. 알렉스는 1999년 뉴질랜드 오클랜드 대학교에서 박사 학위를 취득한 후 북미로 이주했다.

교육 및 교육

오클랜드 대학교
B.Sc.: 화학, 컴퓨터 과학
M.Sc.: 무기/유기금속 화학 (고문: L. 제임스 라이트 & 워렌 로퍼)
Ph.D.: 오가노메탈 화학 (고문: L. 제임스 라이트 & 워렌 로퍼)

캘리포니아 대학교 리버사이드
박사 후 펠로우: 풀러렌 화학 (고문: 크리스토퍼 리드)

미국 오리건 주 인텔리켐(IntelliChem Inc.)
전산 과학자

화학 컴퓨팅 그룹 Inc., 몬트리올, 캐나다
연구 과학자

분자 물질 정보학, Inc.
시조

인용

인용 2015 1259
h-인덱스 27 20
i10 지수 40 32

게시

발행 제목 인용 펍 연도
기계 학습을 사용하여 화학 혼합물 설명을 구문 분석합니다.

A.M. 클라크, P. 게덱, P.P. 청, B.A. 부닌, ACS 오메가, 6, 22400-22409

2021
혼합 구성 캡처: 혼합 물질을 나타내는 개방형 기계 판독 가능한 형식

A.M. 클라크, L.R. 맥에웬, P. 게덱, B.A. 부닌, 화학정보학 저널, 11:33

8 2019
HIV 세포 기반 및 역전사 데이터 세트의 여러 기계 학습 비교

K.M. 조른, T. 레인, D.P. Russo, A.M. 클라크, V. 마카로프, S. 에킨스, 분자 약학, 11, 696-706

39 2019
에볼라 바이러스 베이지안 기계 학습 모델은 시험관 내 새로운 리드를 가능하게

M. 아난트파드마, K.M. 조른, M.A. Lingerfelt, A.M. 클라크, J.S. Freundlich, R.A. 데이비, P.B 마드리드, S. 에킨스, ACS 오메가, 4, 2353-2361

36 2019
종단 간 약물 발견 및 개발을 위한 기계 학습 활용

S. 에킨스, A.C. Puhl, K.M Zorn, T.R. 레인, D.P. Russo, J.J. 클라인, A.J. 히키, A.M 클라크, 자연 재료, 18, 435-441

230 2019
고처리량 선별 데이터 세트의 데이터 마이닝 및 계산 모델링

S. 에킨스, A.M 클라크, K. 돌, K. 그레고리, A. .M. 맥넛, A. 쿨론-스펙터, C. 웨더올, N.K. 리터맨, B.A. 부닌, 기자 진 애세, 197-221

8 2018
결핵 결핵 약물 발견을 위한 기계 학습 모델 비교 및 검증

T. 레인, D.P. Russo, K.M. Zorn, A.M. 클라크, A. 코로토프, V. Tkachenko, R.C. 레이놀즈, A.L. 페리만, J.S. Freundlich, S. 에킨스, 분자 약리학, 15, 4346-4360

69 2018
결핵을 위한 더 많은 약에 대한 공동 약 발견 (MM4TB)

S. 에킨스, A.C. 스펙터, A.M. 클라크, K. 돌, B.A. 부닌, 마약 발견 오늘, 22, 555-565

11 2017
과학 데이터를 식별, 정확하게 선택 및 저장하기 위한 하이브리드 기계 사용자 학습 시스템 및 프로세스

A.M. 클라크, N.K. 리터맨, B.A. 부닌, 미국 특허 제 9,594,743호

6 2017
오픈 소스 베이지안 모델. 3. 빈응답 예측을 위한 복합 모델

A.M. 클라크, S. 에킨스, K. 돌, 화학 정보 및 모델링 저널, 56, 275-285

17 2016
의미 론 웹에 대한 BioAssay 템플릿

A.M. 클라크; N.K. 리터맨, J.E. 크란츠; P. 건드; K. 그레고리; B.A. 부닌, 피어J 컴퓨터 과학, 2, e61

9 2016
공공 및 상업용 생리 활성 화학 데이터의 평행 세계

C.A. 리핀스키, N.K. 리터맨, C. 사우스언, A.J. 윌리엄스, A.M. 클라크, S. 에킨스, 약용 화학 저널, 58, 2068-2076

31 2015
화학 정보학: 모바일 워크플로우 및 데이터 소스 (14장)

A.M. 클라크, 화학 정보의 역사의 미래 (ACS 심포지엄 시리즈 1164), 237-253

2 2015
기계 첫째, 인간 두 번째: 개방형 화학 데이터의 알고리즘 해석의 중요성

A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, S. 에킨스, 화학정보학 저널, 7:9

30 2015
녹색 전자 실험실 노트북의 필요성 (제 9 장)

A.M. 클라크, S. 에킨스, 약물 발견을위한 녹색 화학 전략 (RSC 약물 발견 시리즈), 185-211

1 2015
오픈 소스 베이지안 모델: I. ADME/톡스 및 약물 발견 데이터 세트에 응용 프로그램

S. 에킨스, A.M. 클라크, K. 돌, A. 쿨론-스펙토르, A. 맥넛, G. 그래스, J.S. 프룬들리히, R.C. 레이놀즈, 화학 정보 및 모델링 저널, 55, 1231-1245

99 2015
오픈 소스 베이지안 모델 : II. ChEMBL을 사용하여 모델을 만들고 검증하기 위한 "빅 데이터 집합" 마이닝

A.M. 클라크, S. 에킨스, 화학 정보 및 모델링 저널, 55, 1246-1260

78 2015
미래를 되돌아보기: 골균 결핵 대 작은 분자의 Vivo 효능 예측

S. 에킨스, R. Pottorf, R.C. 레이놀즈, A.J. 윌리엄스, A.M. 클라크, J.S. Freundlich, 화학 정보 및 모델링 저널, 54, 1070-1082

41 2014
더 큰 데이터, 협업 도구 및 예측 약물 발견의 미래

S 에킨스, AM 클라크, SJ 스와미다마스, N 리터맨, AJ 윌리엄스, 컴퓨터 보조 분자 디자인 저널 28 (10), 997-1008

26 2014
TB Mobile 2.0을 위한 오픈 소스 분자 지문을 통합한 새로운 표적 예측 및 시각화 도구

A.M 클라크, S. 에킨스, 엠 사커, 화학정보학 저널, 6:38

39 2014
분자 과학의 모바일 모델링

C.M. 그를케, A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, S. 에킨스, C. 모리스, M.R. 골드스미스, 맥그로힐 과학 기술 연감, 229-233

2014
기계 학습 및 사용자 확인의 하이브리드를 악용하는 생체 분석의 빠르고 정확한 의미 론적 성화

A.M. 클라크, B.A. 부닌, N.K. 리터맨, S.C 슈러, U. 바이저, 피어제이, 524

21 2014
조각을 함께 넣어 : 모바일 장치를위한 반응 중심의 전자 실험실 노트북을 구축.

A. 클라크, J. 화학정보학 6 (S-1), 1

1 2014
녹색 화학 개념을 모바일 화학 응용 프로그램 및 잠재적 용도에 통합

S. 에킨스, A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, ACS 지속 가능한 화학 및 엔지니어링, 1, 8-13

49 2013
모바일 앱을 사용하는 Cheminformatics 워크플로우

S. 에킨스, A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, 화학 바이오 정보학 저널, 13, 1-18

18 2013
약물 발견 병목 현상 을 제거하기위한 네 가지 파괴적인 전략

S. 에킨스, C.L. 월러, M.P. 브래들리, A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, 마약 발견 오늘, 18, 265-271

38 2013
TB 모바일: 알려진 대상을 가진 항 결핵 분자를 위한 모바일 앱

S. 에킨스, A.M. 클라크, 엠 사커, 화학정보학 저널, 5:13

38 2013
출판 품질 출력을 위한 분자 스케치 렌더링

A.M. 클라크, 분자 정보학, 32, 291-301

6 2013
직관적인 협업 모바일 앱으로 Cheminformatics 재정의

A.M. 클라크, S. 에킨스, A.J. 윌리엄스, 분자 정보학, 31, 569-584

31 2012
오픈 약물 발견 팀: 협업을 위한 화학 모바일 앱

S. 에킨스, A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, 분자 정보학, 31, 585-597

40 2012
직관적인 협업 모바일 앱으로 Cheminformatics 재정의

A.M. 클라크, S. 에킨스, A.J. 윌리엄스, 분자 정보학, 31, 569-584

31 2012
오픈 약물 발견 팀: 협업을 위한 화학 모바일 앱

S. 에킨스, A.M. 클라크, A.J. 윌리엄스, 분자 정보학, 31, 585-597

2 2012
신약 개발 의 세계에서 화학을위한 모바일 앱

A.J. 윌리엄스, S. 에킨스, A.M. 클라크, J.J. 잭, R.L. 아포다카, 마약 발견 오늘, 16, 928-939

59 2011
분자 구조의 정확한 사양: 제로 주문 결합 및 명시적 수소 카운팅의 경우

A.M. 클라크, 화학 정보 및 모델링 저널, 52, 3149-3157

18 2011
2D 조각 계층의 묘사

A.M. 클라크, 화학 정보 및 모델링 저널, 50, 37-46

17 2010
분자 다이어그램 스케치를 위한 기본 기본 기본 요소

A.M. 클라크, 화학정보학 저널, 2:8

32 2010
잠재 분자의 프로젝트 데이터베이스에서 공통 스캐폴드의 탐지 및 할당

A.M. 클라크, P. Labute, 약용 화학 저널, 52, 469-483

57 2009
2D 단백질-리간드 복합체 묘사

A.M. 클라크, P. Labute, 화학 정보 및 모델링 저널, 47, 1933-1944

143 2007
동적 생물학적 공간의 설명자로 유연한 3D 약리코포

J.H. Nettles, J.L. 젠킨스, C. 윌리엄스, A.M. 클라크, A. 벤더, Z. 덩, J.W. 데이비스, M. 글릭, 분자 그래픽 및 모델링 저널, 26, 622-633

46 2007
2D 구조 묘사

A.M. 클라크, P. Labute, M. 산타비, 화학 정보 및 모델링 저널, 46, 1107-1123

64 2006
비스(N,N'-디메틸리미다졸-2-ylidene) 수은 클로로트리오도머큐리 디메틸 설프리사이드 솔바테

A.M. 클라크, C.E.F. 리카르드, A.G. 올리버, L.J. 라이트, W.R. 로퍼, 액타 크리스탈로그래픽, C56, 26

9 2000
금속화(Ru 및 Os) 다방향리간 및 선택제품의 결정 구조의 브롬화 및 질화 반응

A.M. 클라크, C.E.F. 리카르드, W.R. 로퍼, L.J. 라이트, 오가노메탈 화학 저널, 598, 262

47 2000
오미움 트리메틸스탄닐 컴플렉스를 트리오도스탄닐 복합체및 주석요오드 본즈의 뉴클레오필성 대체 반응으로 단계별 전환

A.M 클라크, C.E.F. 리커드, T.J. 우드먼, L.J. 라이트, W.R. 로퍼, 오가노메탈, 19, 1766

32 2000
C60의 EPR 스펙트럼에서 '스파이크'의 기원-

P. 폴, R.D. 볼스카, A.M. 클라크, C.A. 리드, 화학 커뮤니케이션, 1229

18 2000
o-C6H4PPh2 리간드를 함유한 루테늄 및 오스뮴의 사이클로메탈복합체

M.A. 베넷, A.M 클라크, M. 콘텔, C.E.F. 리카르드, W.R. 로퍼, L.J. 라이트, 오가노메탈 화학 저널, 601, 299

25 2000
Ph.D. 정무: 루테늄과 오스뮴의 아릴 오가노메탈 화합물

A.M. 클라크

1999
천체 2-(2'-Pyridyl)페닐) 리간드에서 루테늄(II) 또는 오스뮴(II)에 바운드된 페닐 링의 전기필 아로마아염 대체 반응

A.M. 클라크, C.E.F. 리카르드, W.R. 로퍼, L.J. 라이트, 오가노메탈즈, 18, 2813

93 1999
오스뮴(II)에 바인딩된 θ2-8-퀴놀리간드의 5-브롬화 및 이 기능성 리간드의 후속 리튬 및 유도

A.M. 클라크, C.E.F. 리카르드, W.R. 로퍼, L.J. 라이트: 오가노메탈즈, 17, 4535

21 1998
화학 자원 키트, 뉴질랜드화학, 11월/12월 1998
첼라팅 또는 비첼링 8-퀴놀리올 리간드를 포함하는 오스뮴 복합체

A.M. 클라크, C.E.F. 리카르드, W.R. 로퍼, L.J. 라이트, 오가노메탈 화학 저널, 545-546, 619

1997
M.Sc. 정론: 루테늄 및 오스뮴 스탠닐 복합체에 대한 합성 접근법

A.M. 클라크

1996
오스뮴 진골 결합을 가진 오스뮴 진토릴 복합체; 오스[Sn(p-tolyl)3](NO)(CO)2(PPh3)의 크리스탈 구조

A.M 클라크, C.E.F. 리카르드, W.R. 로퍼, L.J. 라이트, 오가노메탈 화학 저널, 543, 111

1996