협력 약물 발견, 약물 발견 을 향상시키기 위해 분산 된 개인 데이터 세트에 걸쳐 바이오 컴퓨팅을위한 도구를 개발하기 위해 단계 II SBIR 보조금을 획득
2013년 11월 19일
캘리포니아 주 벌린게임-2013년 11월 19일 협력 약물 발견 (CDD웹 기반 신약 개발 정보학 플랫폼 제공업체인 이 플랫폼은 계산 모델 및 데이터 공유에 중점을 둔 소프트웨어 개발 프로젝트에 대한 보조금을 받았다고 발표했습니다.
국립 번역 과학 센터의 단계 II 중소기업 혁신 연구 (SBIR) 보조금은 생물학적 데이터의 공유를 가능하게하는 프로그램의 일부입니다.
"1단계에서, 우리는 결핵을 위한 계산 기계 학습 모형이 실험실 간에 공유되고 예측을 하고 시험을 위한 화합물을 선택하는 것을 이용할 수 있었다는 것을 보여주었습니다," Sean Ekins는 말했습니다, Sean Ekins는 말했습니다, Ph.D., D.Sc., 최고 과학 책임자 CDD. 조엘 프룬들리치 (러트거스 -뉴저지 의과 대학), 로버트 레이놀즈 (남부 연구소) 및 앨런 케이시 (감염증 연구소)와 협력하여 새로운 활성 화합물은 체외에서 전체 세포 진균 결핵에 대해 확인되었다 (1-5). Ekins는 "이 작품은 2010년에 화이자와의 귀중한 협력을 따랐으며, 그 결과 전산 ADME 모델(6)에 대한 오픈 소스 도구의 사용을 설명하는 논문이 탄생했습니다. 우리는 그때 사용할 중요한 기회가 있다는 것을 깨달았습니다. CDD 계산 모델을 호스팅하고 선택적으로 공유할 수 있습니다."
보조금은 CDD호스팅 된 데이터의 안전한 선택적 공유의 선구적인 작업, 그리고 에 대한 새로운 제품을 개발하는 데 사용됩니다 CDD.
설명된 이 프로젝트는 국립 번역 과학 센터에서 수상 번호 9R44TR0000942-02에 의해 지원되었습니다. 이 내용은 전적으로 저자의 책임이며 반드시 국립 번역 과학 센터 또는 국립 보건 원의 공식 견해를 나타내는 것은 아닙니다.
공동 의약 발견에 대해
CDD (www.collaborativedrug.com) 시장에서 가장 널리 사용되는 웹 기반 약물 발견 정보학 플랫폼을 제공합니다. CDD Vault®는 기존의 약물 발견 정보학(등록 및 SAR)과 소셜 네트워킹 기능을 결합한 안전하고 민간 산업 강도 데이터베이스입니다. 자유롭게 사용할 수 있는 버전 CDD Vault 연구원이 다양한 과학 데이터 제공업체의 공개 정보의 고유한 집계를 마내수 할 수 있습니다.
미디어 연락처: 배리 부닌, PhD, 공동 약물 발견, (650) 204-3084, [email protected]
참조:
1. 에킨스 S, 케이시 A.C, 로버츠 D. 및 부닌 BA, 마이코박테리움 결핵을 가진 표적 추론을 위한 검열 및 TB 모바일을 위한 베이지안 모델, 제출2013.
2. 에킨스 S, Freundlich JS 및 레이놀즈 RC, 마이코박테리움 결핵 기계 학습 모델및 평가, J Chem Inf 모델, 프레스 2013에 대한 이중 이벤트 데이터 세트를 융합.
3. 에킨스 S, Freundlich JS, 호브라스 JV, 화이트 EL, 레이놀즈 RC, 마이코박테리움 결핵 약물 발견, 팜 레스, 프레스 2013에서 최적화를 선도하기 위해 타격에 대한 전산 방법을 결합.
4. 에킨스 S, 레이놀즈 RC, 프란츠블라우 SG, 완 B, 프룬들리치 JS, 부닌 BA. 검증된 이중 이벤트 베이지안 모델, PLOS ONE, 8(5): e63240, 2013을 사용하여 마이코박테리움 결핵 약물 발견에서 적중 식별을 강화합니다.
5. 에킨스 S, 레이놀즈 RC, 김H, 쿠 M-S, 에코노미디스 M, 탈라우 M, 페이지 SD, 울히셔 LK 레나에르츠 AJ, 부닌 BA, 코넬 N, 프룬들리치 JS. Bayesian 모델은 약물 발견을 위한 생체 활성 및 세포 독성 정보를 활용하여, Chem Biol, 20: 370-378, 2013.
6. 리시 R. 굽타, 기포드, EM, 리스턴 T, 월러 CL, 호만 M, 부닌 BA 및 에킨스 S, 인간의 신진 대사 안정성 및 추가 ADME / 독스 속성을 예측하기위한 오픈 소스 계산 도구를 사용하여, 약물 Metab Dispos, 38: 2083-2090, 2010.