Barry Bunin과 함께하는 Drug Discovery Industry Roundup — 2022년 9월 2일

AlphaFold: “I’m On it More than Spotify.” The rave reviews continue to pour in about AlphaFold, DeepMind’s protein structure program, which set the world of biologic research into overdrive when it was announced last month that a team had predicted structures for most of the known proteins.  Of course it is an open question, how many unknown proteins and post-translational modified proteins and tiny proteins (< 100 AAs) we will discover in the future.  Derek Lowe mentioned the "official" figure for the number of human genes that code for proteins is between 19 and 20 thousand (I think that the current number is 19,370).  Bloomberg carries an article headlined “Drug Discovery Is About to Get Faster. Thank AI.” The article quotes Jay Bradner, president of the Novartis Institutes for BioMedical Research, the pharma company’s research arm for the past 7 years, as saying: “Anybody who could have thought that machine learning was not yet relevant for drug hunting surely must feel different. I'm on it more than Spotify.” David Liu, a professor at the Broad Institute of MIT and Harvard and founder of multiple biotech companies, told Bloomberg that the technology allows researchers in his lab to “achieve that Zen-like understanding state” to decide where to tinker with a protein to change its properties.  (Speaking of Zen-like, parenthetically, my eyes were wide open seeing David Liu’s recent shared African Safari photos of an aggressively huge hippopotamus yawn and an overly curious male white rhino – check out over 100 breathtaking pictures here…the chatter on Twitter was that Professor Liu might have a future career with National Geographic).

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"접시에 정신 분열증이란 무엇입니까?" 뉴요커들이 DNA를 기증할 때 찾는 답변 중 하나다. 마운트 시나이 건강 시스템 (Mount Sinai Health System)은 리제네론 (Regeneron)과 다른 제약 회사를 포함한 연구원들이 연구 할 수있는 환자 유전 정보의 방대한 데이터베이스를 구축하기위한 노력을 시작했으며, 뉴욕 타임즈의 최근 기사에 따르면 "병원과 의약품 제조사가 뉴요커의 DNA에 대한 광대 한 데이터베이스를 구축하기 위해 움직인다"는 제목의 기사에 따르면. 이 프로그램은 Regeneron이 수행 한 시퀀싱을 통해 일상적인 혈액 채취 중에 백만 명이 넘는 자원 봉사자로부터 DNA를 수집하려고합니다. 그 대가로 회사는 프로그램을 이끄는 마운트 시나이 의사들에 따르면 각 참가자의 유전 서열과 부분 의료 기록에 액세스 할 수 있습니다. 시나이 산은 또한 다른 연구원들과도 데이터를 공유 할 계획이라고 이야기에 따르면. Mount Sinai Health System은 뉴욕시에 일곱 개의 병원을 보유하고 있으며 매년 최소 300,000 명의 환자로부터 혈액을 채취합니다. 약 80 %가 혈액 사용을 유전 연구에 사용하는 것에 동의 할 것으로 예상됩니다. DNA 시퀀싱은 의학 연구 전반에 걸쳐 광범위한 가치를 지녀야하지만, 프로젝트를 감독하고있는 마운트 시나이 (Mount Sinai)의 이칸 의과 대학 (Icahn School of Medicine)의 알렉산더 샤니 (Alexander Charney) 박사는 정신 분열증 환자의 DNA 시퀀싱 연구에 참여하고 있습니다. 그는 데이터베이스가 작업을 가속화 할 것으로 예상합니다. "본질적으로 우리가 말하는 것은 '접시에 정신 분열증이란 무엇입니까?'입니다." 그 질문에 대답하려고 노력하면서, Charney 박사는 "실제 질병 과정이 무엇인지 연마하는 데 도움이 될 수 있습니다."라고 말했습니다.

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Chaperones는 물건을 안전하게 유지하는 데 도움이됩니다 ... 분자를 포함한다. 데릭 로우 (Derek Lowe)는 ScienceDirect에 발표 된 최근 논문의 중요성에 대한 매혹적인 블로그 게시물을 가지고 있습니다 "보존 된 Hsp70 결합 사이트를 대상으로하는 캠페인은 세포 내 현지화가 별개의 생물학적 활동과 어떻게 연결되어 있는지 밝혀냅니다." Lowe의 Science 블로그는 더 환상적인 제목을 가지고 있습니다 : "당신의 약물 분자는 어디에 있습니까, 정말로?" 그는 논문에 대해 "우리 모두가 약물 발견 노력에 참여하고 싶지만 거의 그렇게하지 않는 종류의 상세한 모습이 있습니다."라고 말합니다. 이 논문은 Lowe가 "스트레스 하에서 발현되고 중요한 단백질 파트너의 손상을 예방하는 데 도움이되는 분자 샤페론 인 '열 충격 단백질'의 잘 알려진 제품군"으로 묘사 한 Hsp70 억제제를 살펴 봅니다. 나는 살아있는 거의 모든 것이 Hsp70 형 단백질을 가지고 있다고 믿는다. 그들은 세포 생활을 가능하게하는 깊은 기초 조각 중 하나입니다. 이름에서 알 수 있듯이, 그들은 열 스트레스뿐만 아니라 중금속 및 기타 독성 물질에 대한 노출뿐만 아니라 일반적으로 산화 스트레스에 노출되면 증가합니다. " 그는 "이러한 샤페론의 발현 증가는 일반적으로 신경 퇴행과 세포 기능의 연령 관련 감소를 늦추는 방법으로 제안되었다"고 지적했다. 그러나 그는 또한 동전에 양면이 있다고 경고합니다. "Hsp70 단백질은 (예를 들어) 여러 종류의 암세포에서 과발현되며, 단백질 품질을 향상시키고 아폽토시스를 직접 억제함으로써 대사적으로 까다로운 환경에서 함께 매달려 있습니다 (많은 종양 세포의 특징은 '칼에 떨어지고 죽고, 돌연변이를 일으킨다'는 아폽토시스 신호 네트워크를 피할 수있는 능력입니다). 당신이 죽고 싶은 세포를 지키려는 모든 시도는 정말로 죽여야하는 어떤 것을 계속 유지할 위험이 있습니다! "

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카모마일, 파슬리, 양파 ... 그리고 베타 아밀로이드의 뇌를 깨끗이 청소하기 위해 아쿠아 포린 4에 꼬리를 추가하려는 노력. 알츠하이머 병은 지금까지 많은 치료 노력에 저항 한 도전적인 질병입니다.  FIERCE Biotech는 Brain에 발표 된 최근 연구에 대해 "Cleaning House : Scientists Find Genetic Quirk May Help Out Beta Amyloid, Treat Alzheimer 's"라는 제목의 블로그 게시물을 게재합니다. 세인트루이스의 워싱턴 대학 의과 대학 (Washington University School of Medicine)의 연구원들은이 연구에 따르면 유전 적 단점 (readthrough)이라고 불리는 것이 생쥐의 뇌에서 낭비를 제거하는 데 도움이된다는 것을 발견했다. 단백질의 확장 된 버전을 만드는 Readthrough는 뇌의 폐기물 제거와 관련된 구조에서만 발견되었습니다. FIERCE Biotech 기사는 다음과 같이 지적합니다 : "세인트 루이스 연구원은 뇌와 신체의 나머지 부분 사이의 장벽을 유지하는 데 도움이되는 별 모양의 지원 세포 인 성상 세포의 끝발에서 긴 형태의 아쿠아 포린 4를 발견했습니다. 끝발은 혈류를 조절하는 데 도움이되며 노폐물을 혈류로 흘려서 뇌가 원치 않는 단백질로부터 자유로워지는 데 도움이 될 수 있습니다. " 연구자들은 아쿠아 포린 4 유전자의 판독을 증가시킬 수있는 화합물을 스크리닝하고 잠재력을 가진 두 가지를 발견했습니다 : 아피제닌, 카모마일, 파슬리, 양파 및 기타 식물의식이 플라본; 그리고 설파퀴녹살린, 수의학 항생제." 두 물질 모두 아밀로이드를 생성하도록 설계된 마우스에서 아밀로이드를 제거했지만 설파퀴녹살린은 인간에게 안전하지 않은 것으로 간주되며 플라본의 섭취가 무엇인지 명확하지 않았습니다. 연구팀은 현재 판독 능력을 향상시키기 위해 다른 물질을 찾기 위해 노력하고 있습니다.

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배리 에이 부닌, PhD전 세계적으로 신뢰할 수 있는 신약 개발 연구 정보학에 대한 현대적인 접근법을 제공하는 공동 약물 발견의 창립자이자 CEO입니다. CDD Vault^® 개인 및 외부 데이터를 안전하게 관리하는 호스팅된 생물학적 및 화학 데이터베이스입니다.