viDA Therapeutics fallstudie

Ett projektteams utveckling från Excel-kalkylblad till CDD Vault

Dale Cameron, Ph.D., associerad direktör för medicinsk kemi, viDA Therapeutics

Dale Cameron, Ph.D., associerad direktör för medicinsk kemi, viDA Therapeutics

Design och utveckling av nya läkemedel är en svår strävan. Små företag kan spendera en stor tid på att bara hantera data och kommunicera resultat, än mindre om vetenskaplig innovation och hitta nya kandidater för utveckling. viDA Therapeutics var ett sådant företag, och deras användning av Excel-filer för att spåra deras viktiga kemi- och biologidata saknade transparens, kontroll och effektivitet. Genom att genomföra CDD Vault, de uppnådde bättre kontroll av data, mycket förbättrat samarbete och förmågan att spåra olika datatyper (kemi, biologi, farmakologi, strukturell biologi / röntgen, patent, etc.).

Innan CDD Vault

"Klumpigt, benäget att fel och inget riktigt sätt att veta vad som hade gjorts."

Innan CDD Vault, forskare vid viDA Therapeutics klistrade in screeningsdata i Excel-kalkylblad med kemiska namn och leende strängar. Med hjälp av en freeware CDK-verktygssats kunde de visualisera kemiska strukturer i kalkylarket, men det var endast begränsat till Windows PC-användare (exklusive deras externa Mac / Linux-användare). Chiralitet och skildringar hanterades så dåligt att det var svårt att utföra SAR eller till och med förstå data. Kurvmontering utfördes i ett annat tredjepartsprogram med många manuella manuella steg. Och naturligtvis var det som en fri form av samling av ad hoc-kalkylblad svårt att söka och utföra till och med grundläggande analyser. De lagrade till och med sin projektöversikt i ett PowerPoint SAR-dokument som de passerade runt, vilket gjorde hantering och synkronisering till en verklig utmaning.

Skärmdump av Excel-kalkylbladet med vetenskapliga data

Innan CDD Vault, viDA lagrade rå sammansatt data i besvärliga Excel-kalkylark

Erfaren personal vid viDA visste att användning av en databas skulle lösa dessa problem. tyvärr var de tillgängliga arvsystemen för dyra att köpa och krävde för mycket resurser för att implementera, träna och hantera. Och lösningar med öppen källkod var för omogna och på liknande sätt skulle ha krävt en dedikerad IT-person. Sedan hörde viDA om CDD Vault, en värdlösning som är kommersiell kvalitet men ändå överkomlig och inte kräver IT-expertis eller hårdvaruinvestering.

CDD Vault aktiverad

"Förkortade designcykler och fick fördelar jämfört med konkurrenter."

viDA Therapeutics började använda CDD Vault i 2013. Som en värdlösning var den igång omedelbart (ingen installation krävs, ingen IT-personal behövs). Det var så lätt att använda att det tog bara en vecka att migrera sina befintliga data och en månad för att genomföra sina kemister och biologer till kompetens (båda med standardstöd från CDD-personal). De har haft fördelarna med ett enhetligt system och kostnadsbesparingarna för nollfotavtryck sedan dess.
För varje förening lagrar de den kemiska strukturen, partiinformation, beräknade egenskaper, renhet och NMR-spektra. För varje analys fångar de alla dosresponsparameterdata och kurvor, såväl som automatiskt beräknade resultat som pIC50 och specificitet. All denna information är fullständigt sökbar, säkert arkiverad och tillgänglig var som helst via någon modern webbläsare.
Deras analysberäkningar automatiseras nu av CDD Vault och viDA-forskare sparar timmar som traditionellt spenderades manuellt för överföring, diagram, beräkning och sammanfattning. Forskare vid viDA kan omedelbart se vilka experiment som har avslutats för en förening och vad som återstår att göra. Standard "sparade sökningar" gör det möjligt för forskare att dela sammansatta träfflistor med medlemmarna i projektgruppen. Detta gör det enkelt att arbeta effektivt som ett team, samarbeta i realtid för att identifiera och prioritera vilka föreningar som ska flytta genom sina fyra primära skärmar, vilket sparar tid och pengar.

CDD Vault screenhowig molekyldata

Med viDAs screeningsdata säkert innehållna CDD Vault, har de tillgång till alla underliggande råvärden samt de automatiskt beräknade värdena från valfri webbläsare.

Fördelar viDA härledda

Forskare vid viDA Therapeutics lägger nu ner sin tid på att flytta fram sina forskningsprojekt framför att manuellt manipulera och formatera data och kalkylblad. De räknar upp några av de mest övertygande fördelarna med att använda CDD Vault här -

  • Fick ytterligare> 30 dagar / år med vetenskaplig produktivitet när jag övervägde allt från automatiserad databehandling till felidentifiering till kommunikation av resultat.
  • Kontroll av ordförråd resulterar i färre fel och mindre "förlorade" data.
  • Standardiserad analysanalys ger dem bättre kontroll över felspårning och gör det enkelt att jämföra resultat över analyser.
  • Standard sparade sökningar och full tillgång till kurvor resulterar i mer konsekvent kommunikation och större öppenhet i projektgruppen.
  • Hosted programvara gör det enkelt att komma åt var som helst (t.ex. fjärrsamarbetspartners för realtidspresentation under ett möte).
  • Komplett spårning av partiinformation och analytiska data från CRO: er möjliggör samarbete på sitt bästa.
  • Undvika att spendera 1 FTE på IT-expertis för aktiviteter som underhåll, säkerhet, felsökning och systemuppdateringar.

Se en video om hur viDA använder CDD Vault

Om oss handla om CDD Vaultkemiska registrering, struktur-aktivitet relation och samarbete datahantering kapacitet. Om du är intresserad av att lära dig hur det kan hjälpa dig i dina forskningsbehov, skriv till oss på [E skyddas]

Påbörja din gratis provperiod