CDD的公共数据库是一种宝贵的资源。

2014年6月24日

CDD Public为CDD Vault用户提供了100多个精心策划的数据集,这些数据集可以轻松地与您自己的私人数据一起进行挖掘和分析。存储在CDD Public中的化合物可以使用CDD Vault易于使用的化学智能界面轻松搜索和过滤。此外,CDD最近还开发了建立QSAR模型的能力。这意味着您现在可以基于CDD Public中存储的任何属性建立一个模型,并查看您的化合物如何比较。这对于预测目标选择性或ADME/毒物属性可能特别有用。

NCBI-PubChem合作,CDD现在已经为CDD Public中的100多万个分子提供了支持数据的链接,如生物活性、ADME、毒性、特性和来源。此外,CDD还增加了94,000个以前不为PubChem所知的结构。这些结构包括一些罕见和被忽视的疾病,如疟疾,结核病和热带寄生虫的结构-活性集合,以及毒性和属性数据。PubChem最近在其主页上强调了这一公告。

PubChemWebPagwithCDD

PubChem数据库最近已经超过了5000万个已知化合物,使其成为最全面的收集。CDD为我们的用户社区的这一贡献感到自豪。如果你知道一个你认为对CDD社区有价值的公共数据集--请告诉我们,我们将把它添加到CDD公共数据库中。

以下是CDD用户的高兴趣数据集的快速样本。

  • FDA批准的。已批准的药物-- -- 具有明确的分子结构,包括来自《医生案头参考》的763个分子,来自DrugBank的780个分子,2007年橙皮书中的1151个分子,以及Chris Lipinski博士的FDA清单中的1007个分子。
  • KINASE: ChEMBL激酶SARfari化合物和生物分析数据--提供了大量的激酶活性化合物的SAR数据,针对广泛的激酶,在广泛的分析中,大部分数据都是从文献中手工挖掘和策划的。
  • GPCR。PDSP Ki数据库--有超过47,000个针对699个GPCR目标的Ki值,这些Ki值来自NIMH精神活性药物筛选计划(PDSP)数据库

本博客由CDD Vault社区成员撰写。CDD Vault是一个托管的药物发现信息学平台,可以安全地管理私人和外部生物和化学数据。它提供的核心功能包括化学注册结构活性关系、生物活性关系等。 化學品庫存電子實驗室筆記本功能!

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