CDD"的公共数据库是一个宝贵的资源。
2014年6月24日
CDD Public为CDD Vault 用户提供了访问100多个精心策划的数据集的机会，这些数据集可以很容易地与你自己的私人数据一起被挖掘和分析。储存在CDD Public中的化合物可以使用''易于使用的化学智能界面轻松地进行搜索和过滤。 CDD Vault的易于使用的化学智能界面。此外，CDD ，最近还开发了建立QSAR模型的能力。这意味着你现在可以根据存储在CDD Public中的任何属性建立一个模型，并查看你的化合物如何比较。这对预测目标的选择性或ADME/毒物特性可能特别有用。
与NCBI-PubChem合作，CDD ，现在已经提供了支持数据的链接，如生物活性、ADME、毒性、属性和来源，为CDD Public中的一百多万个分子提供支持。此外，CDD 还增加了94,000个以前在PubChem中未知的结构。这些包括一些罕见和被忽视的疾病的结构-活性集合，如疟疾、结核病和热带寄生虫，以及毒性和属性数据。PubChem最近在其主页上强调了这一公告。
PubChem数据库最近已超过5000万个已知的化合物，使它很可能成为最全面的集合。CDD ，为我们的用户社区的这种贡献感到自豪。如果你知道一个你认为对CDD 社区有价值的公共数据集 -请让我们知道，我们将把它添加到CDD 公共数据库。
下面是对CDD 用户感兴趣的数据集的一个快速抽样。
- FDA批准的。已批准的药物-- -- 具有明确的分子结构，包括来自《医生案头参考》的763个分子，来自DrugBank的780个分子，2007年橙皮书中的1151个分子，以及Chris Lipinski博士的FDA清单中的1007个分子。
- KINASE: ChEMBL激酶SARfari化合物和生物分析数据--提供了大量的激酶活性化合物的SAR数据，针对广泛的激酶，在广泛的分析中，大部分数据都是从文献中手工挖掘和策划的。
- GPCR。PDSP Ki数据库--有超过47,000个针对699个GPCR目标的Ki值，这些Ki值来自NIMH精神活性药物筛选计划（PDSP）数据库。
本博客由CDD Vault 社区成员撰写。CDD Vault 是一个托管的药物发现信息学平台，可以安全地管理私人和外部生物和化学数据。它提供的核心功能包括化学注册、结构活性关系它提供的核心功能包括化学品注册、结构活性关系、化学品库存和电子实验室笔记本功能
CDD Vault ：药物发现信息学你的整个项目团队都会接受！
