协作是扭转药物发现业务的关键(第八部分)--标准
2012年2月14日
合作性药物发现平台广泛适用于各个治疗领域、目标和团队
所有的药物发现项目都有许多保守的技术和商业化的障碍。药物开发的监管、科学和经济基础是一致的。 除了不同的分子、目标、检测方法和团队所产生的迷人的、特异的表现之外......在线索识别和优化过程中,还有共同的、系统的技术挑战。 因此,尽管科学项目和检测方法存在巨大差异;幸运的是,在绝大多数情况下的数据层面,共同的标准已经不言而喻(sdf、csv、SMILES、xls、平板、对照、IC50s、超链接、附件、协议)。 这是令人振奋的,因为对于药物发现合作(和合作者)来说,有一种超越文化、语言、时限和预算的通用语言。
共同的标准加上保守的药物优化过程工作流程表明,一套有限的协作技术可以满足绝大多数的药物发现信息学要求。从个别研究人员的需求出发,出现了一个协作科学的共同基础,在此基础上,"所有的船都可以上升"。
从与领先的商业、学术和政府实验室的数百次合作中,我们了解到,每个研究人员都需要细粒度的数据访问控制来实现有效的合作。 控制可以是时间上的、空间上的(数据类型),也可以是项目上的。 在自然的工作流程中对每个合作者的数据访问提供便捷的控制(对数据导入和选择性共享的激活障碍最小)是更有效合作的关键。 有效的合作需要在一个安全的环境中进行精细的控制,以实现选择性的数据共享,而不需要为专利前、出版前和Pubchem前的数据进行多次数据上传(即在数据创建过程中的数据/IP共享能力)。 研究人员希望能在他们的常规工作流程中方便地与任何人、任何人或所有人分享数据。 研究人员希望在任何时候都能方便地分享数据,但需要默认的技术设置来提供最大的隐私作为保障。
有两个 "激活障碍 "需要降低,以便围绕数据进行便捷的合作。 第一个障碍是准确地和有意义地从实验中获取数据,这并不像它听起来那样微不足道,而且它通常被低估了。相反,出于商业化的原因,需要保持数据的私密性的第二个障碍通常被过分强调。 在这种情况下,值得记住的是,即使在申请专利时,信息也是共享的,尽管不是直接以可重复使用的数据库格式。
通过降低存档和选择性共享的 障碍,我们可以开始在整个学术界、工业界、非营利组织和政府的药物发现生态系统中收获由互联网催化的合作。 为了在全球经济中具有竞争力,人们越来越多地在组织之间进行协作。
CDD Vault ,用于化学品注册和SAR,对预算敏感的实验室来说是轻量级的,而且可以协作扩展。 今天,第一次不管研究人员是在同一个房间还是在全球各地,都有办法在一分钟内 "让具有不同知识产权/数据要求的小组一起工作,如同一个人"。
要了解完整的内容,请使用下面的链接找到我们的12部分系列"合作是扭转药物发现业务的关键"的每个条目的链接。
阅读第5部分:合作是扭转药物研发业务的关键--蒙特卡洛模拟。
阅读第6部分:合作是扭转药物发现业务的关键--技术可以让事情变得更简单。
尤其是阅读第9部分。 协作是扭转药物发现业务的关键--《更好地协作》。
第10部分:合作是扭转药物研发业务的关键--向eBay、纳斯达克、航空公司和好莱坞学习。
P.S. 除了合作是一种更开明的科学方法外,以下是合作科学家用CDD :合作科学家使用的5个理由,是最实际的原因。 CDD
您也可以下载Barry Bunin的"合作是扭转药物发现业务的关键"系列全集作为pdf文档。
本博客由CDD Vault 社区成员撰写。CDD Vault 是一个托管的药物发现信息学平台,可以安全地管理私人和外部生物和化学数据。它提供的核心功能包括化学注册、结构活性关系它提供的核心功能包括化学品注册、结构活性关系、化学品库存和电子实验室笔记本功能
CDD Vault :药物发现信息学你的整个项目团队都会接受!