葛兰素史克与在线社区建立独特的联盟,以刺激疟疾的开源药物发现。
2010年5月20日
GSK成为首家免费分享其化合物库中13,500个分子的化学结构的公司。
与来自私营企业和公共领域数据提供者的主要科学研究团体结成联盟。
加利福尼亚州布林格姆。2010年5月19日--葛兰素史克公司(GSK)与领先的公共领域数据提供商欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)、美国国家医学图书馆(NLM)和美国信息学服务提供商Collaborative Drug Discovery(CDD )合作,免费提供超过13500个化合物的关键科学信息,这些信息最终可能导致疟疾的新疗法。
这些数据的发布标志着一家制药公司首次提供如此之多的化合物结构,并且是通过网络主机及其专业研究工具的合作实现的,研究人员将免费获得这些数据。这些信息由研究人员经常使用的网站托管,包括有关GSK自己的化合物库中的分子的高质量科学数据,这些分子已证明对最致命的疟疾寄生虫恶性疟原虫具有效力。
"我们很高兴EMBL-EBI、NLM和CDD ,加入我们这一有价值的努力,将开源原则应用于疟疾的药物发现,"葛兰素史克公司药物发现负责人Patrick Vallance说。"战胜这种疾病将需要许多科学头脑一起工作。我们希望来自世界各地的研究人员现在将使用这些信息来推动进一步的研究,并希望从制药业到学术界的其他团体将他们的信息添加到这个在线资源中。"
这类数据是开发新药道路上的第一步。有了化合物的结构和它们对疟疾寄生虫影响的地方的信息,科学家们就可以对这些化合物进行进一步的研究,以便发现药物,或者了解如何利用这些化合物来抑制寄生虫的生命周期,并最终开发出新的药物。广泛开放这些信息,本质上是"开源"策略应用于药物发现的一个例子。
"将生命科学信息开放给研究界是EMBL-EBI的核心使命,"EMBL-EBI的ChEMBL团队负责人John Overington补充道,该团队将通过其ChEMBL资源作为数据的主要存储库。"我们很自豪能够通过将GSK数据纳入ChEMBL,并将其与大量信息链接起来,帮助研究人员找到新的疟疾治疗方法,从而为GSK数据增加价值。这是药物研究中公私合作新时代的开始。"
"NLM很高兴能参与这次开创性地向公众发布信息,"NLM的PubChem数据库负责人Steve Bryant说,该数据库存放了这些数据。"通过PubChem等公共资源提供这些数据,GSK极大地促进了研究进程,因为这些信息与相关化合物、生物活性结果、已发表的文献和其他资源相联系,这将有助于研究人员为防治疟疾做出新发现。"
"CDD 很高兴能在这一真正的历史性事件中发挥作用,"合作药物发现公司首席执行官Barry A. Bunin评论说。"在大药厂几十年的医学突破中,这是第一次有团体公开分享所有的化学和生物数据--而不仅仅是少数的命中率。 此外,对于表型筛选,CDD 工具允许研究人员开始假设和验证来自全细胞筛选的目标。"
EMBL-EBI将作为该化合物集数据的主要存储库,并将对贡献的进一步信息进行索引和格式化。GSK将在产生更多信息时添加更多信息,并将要求研究这些化合物和数据的外部科学家也这样做。
关于数据
该数据包含了"命中率"或对GSK化合物库中200万种化合物进行筛选的结果,以确定这些化合物对疟疾寄生虫的影响。筛选项目确定了约13,500个对寄生虫有强烈抑制作用的化合物。
激酶抑制剂在以前已知活性、现在被确定为抗疟命中的分子中占了很大比例。这些数据包括GSK目前正在研究的针对该适应症的化学家族,以及该公司之前针对其他适应症进行测试的那些化合物的"作用机制"。
已确定的大多数化合物结构已被归类为能够转化为药物。
目前关于化合物和结构的微生物学信息已经放在网上资源上,研究人员可以很容易地获取。EMBL-EBI网站的建设,使全球的科学家可以将他们的数据添加到该网站的信息中,所有人都可以免费访问。网站主办方的合作和网站上的专业研究工具使信息发布的价值得到了加强,研究人员可以免费使用这些工具。
葛兰素史克感谢疟疾药物创投公司的支持,该公司为本项目提供了资金。
全部信息可在网上查看:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
关于疟疾
疟疾是一种由寄生虫引起的危及生命的疾病,通过被感染的蚊子叮咬传染给人们。每30秒就有一名儿童死于疟疾。2009年有2.43亿个疟疾病例,造成近100万人死亡,其中大部分是非洲儿童。
疟疾,特别是最致命的恶性疟原虫,现有的最佳治疗方法是一种被称为青蒿素类综合疗法的药物组合。然而,寄生虫的抗药性是一个问题,正在破坏疟疾控制工作。目前市场上没有治疗疟疾的青蒿素类药物的有效替代物,也没有接近药物开发过程结束的替代物。
关于葛兰素史克
葛兰素史克是全球领先的研究型制药和医疗保健公司之一,致力于通过让人们做得更多、感觉更好、活得更久来提高人类的生活质量。 有关GSK的更多信息,请访问www.gsk.com。
关于欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)
欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)是欧洲分子生物学实验室(EMBL)的一部分,位于英国剑桥附近的Hinxton的Wellcome Trust Genome Campus。EMBL-EBI源于EMBL为研究界提供公共生物数据库的开创性工作。它托管了一些世界上最重要的生物数据集合,包括DNA序列(ENA)、蛋白质序列(UniProt)、动物基因组(Ensembl)、三维结构(欧洲的蛋白质数据库)、基因表达实验数据(ArrayExpress)、蛋白质-蛋白质相互作用(IntAct)和途径信息(Reactome)。EMBL-EBI容纳了多个研究小组,其科学家不断为生物计算界开发新的工具。 有关EMBL-EBI的更多信息,请访问www.ebi.ac.uk。
关于国家医学图书馆(NLM)
国家医学图书馆(http://www.nlm.nih.gov/)是世界上最大的健康科学图书馆。国家医学图书馆是美国卫生和人类服务部下属的国家卫生研究所(NIH)的一部分。NIH是进行和支持基础、临床和转化医学研究的主要联邦机构,它研究常见和罕见疾病的原因、治疗和治愈方法。有关NIH及其项目的更多信息,请访问www.nih.gov。
关于合作式药物研发 (CDD)
CDD 托管着市场上最广泛使用的药物发现云平台。"CDD Vault " 是安全、私有的工业强度数据库,将传统的药物发现信息学(注册和SAR)与社交网络功能相结合。"CDD Collaborate "通过与外部研究人员安全地交换选定的保密数据来实现实时协作。"CDD 公共 "有独特的内容。 有关CDD 的更多信息,请访问www.collaborativedrug.com
葛兰素史克新闻联络人。
英国。Janet Morgan 电话:+44 (0) 20 8047 5502
美国:Melinda StubbeeMelinda Stubbee 电话:+1 919 483 2839
EMBI-EBI新闻联系。
Katrina Pavelin 电话:+44 (0) 1223 494 452
EMBL-EBI科学外展干事 电子邮件:[email protected]
NLM新闻联系。
Melanie Modlin 电话:+1 301 496 7771
NLM通信和公共联络办公室 电子邮件:[email protected]
CDD 新闻联系人。
Barry Bunin,PhD 电话:+1 650 204 3084
协同药物发现公司总裁兼首席执行官 电子邮件:[email protected]