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    案例研究

    优领医药借助 CDD Vault 协同中美两地团队与多家 CRO,加速新药候选物发现

    概要

    优领医药是一家初创生物技术公司,通过使用 CDD Vault 实现化合物和检测数据的集中管理,与美国和中国的 CRO  进行安全协作,并保护分散在多个项目中的知识产权。 借助共享的数据环境、项目级控制以及结构屏蔽功能,优领医药能够在一个系统内支持远程研究、CRO 直接数据导入、化合物注册以及曲线分析。

    acerand therapeutics

    优领医药借助 CDD Vault 协同中美两地团队与多家 CRO,加速新药候选物发现


    背景

    优领医药 Acerand Therapeutics 由行业资深人士与礼来亚洲基金(LAV)共同创立,是一家专注于发现和开发具有“同类最佳”和“同类首创”潜力的新型药物候选分子,并推进其进入临床开发阶段的创新型生物技术公司。 该公司在中国上海和美国印第安纳波利斯均设有运营机构,以体现其整体全球战略和商业意图。

    公司成立于 2020 年 6 月,其化学家和生物学家致力于研发用于治疗肿瘤和自身免疫性疾病的新药。

    “我们都是药物猎手,因此通常不必担心支持我们工作的所有科学基础设施,”优领医药的计算化学家兼药物设计师高岑博士说道。 “我们中的许多人来自拥有内部系统和支持团队的大型制药企业。作为一家初创公司,我们深知需要一个坚实的科学信息学平台来支持我们的工作。”

    优领医药的化学家和生物学家需要一个中央数据库,用于存储和分析小分子、检测方法及相关数据。同时,公司还需一个能与美国和中国合作 CRO(合同研究组织)顺畅对接的信息学系统。


    解决方案

    优领医药部署了 Collaborative Drug Discovery 公司的CDD Vault——这一托管式药物发现信息学平台能够安全地管理内部和外部的生物及化学数据。

    这一选择顺理成章,因为优领医药的几位科学家或是之前曾使用过CDD Vault,或是在业界和学术界有同事使用过该产品并对其赞不绝口。

    “令我们印象深刻的是,我们合作的所有 CRO 都熟悉 CDD Vault,” 高博士说,“这些 CRO 要么在内部将其用于自身项目,要么因合作企业使用该产品而拥有相关操作经验。 大家都对 CDD Vault 赞誉有加,因此很容易做出这个决定。”

    优领医药部署了两个 Vault 实例——一个供公司两个办公地点共享的生产环境 Vault,以及一个用于测试的沙盒 Vault。虽然两个办公地点共享同一个数据库,但它们通过独立的项目将数据完全隔离,以保护各团队在开展不同项目和针对不同治疗靶点时所拥有的知识产权。


    优势

    自采用 CDD Vault 以后,优领医药已收获诸多益处,包括:

    • 易于使用且易于管理

    • 与CRO轻松协作

    • 严格的安全措施以保护知识产权

    • 叠加实验曲线可视化

    • 支持远程办公

    • 卓越的客户支持


    易于使用且易于管理

    优领医药对 CDD Vault 极其简便的使用体验和管理方式印象深刻。

    “我们的生物学家和化学家只需接受一小时左右的简短培训,就能轻松使用 CDD Vault,”高博士说,“它基于浏览器,界面设计非常合理,这无疑提高了易用性。”

    高博士深知 CDD Vault 的使用便捷性,因为每当同事遇到问题时,他们都会找他咨询。

    “作为一家小型生物技术公司,我们没有专职的 IT 人员。我是计算化学家,所以如果有任何问题,大家都会直接来找我。部署初期有过几个小问题,但很快问题都解决了。使用 CDD Vault 的一切操作都非常自然。”

    高博士表示,CDD Vault 确实完全符合公司的需求。

    “作为一家早期阶段的药物研发公司,我们有特定的需求,例如存储检测数据和登记化合物。CDD提供的解决方案既简单易用,又完全符合我们的需求。此外,我们还需要严格的安全保障,而 CDD 也做到了这一点。CDD 所提供的解决方案对于像我们这样的生物技术初创公司而言,简直再合适不过了。”


    与CRO的轻松协作——“他们比我们更了解CDD Vault”

    对优领医药来说,一个令人惊喜的发现是,无论是在美国还是中国,CDD Vault在其合作的化学和生物学CRO中都得到了广泛应用。

    “似乎所有主要 CRO 要么自己正在使用 CDD Vault,要么至少通过与他人合作对 CDD 有了深入的了解,”高先生说。“我们刚起步时,CRO 们对 CDD Vault 的了解甚至比我们还多。他们会就如何优化各项任务向我们提出建议。”

    这一切使得该公司与众多化学和生物学 CRO 之间的协作变得十分顺畅。

    “CRO 会将数据直接导入我们的 CDD Vault,因此他们要么是从自己的 CDD 系统中导入,要么已经建立了将内部数据转换为符合 CDD 规范格式以便上传的流程,”高博士说。 “CRO 能够自行上传数据为我们节省了时间,这样我们就不必花时间去处理这些数据。CDD Vault 无疑促进了我们的协作流程,而我们计划增加更多 CRO 以满足工作流需求。”


    严密的安全措施保护知识产权

    作为一家药物发现公司,保护知识产权对优领医药而言至关重要。CDD Vault 的多层安全防护正是优领医药选择其作为信息学平台的原因之一。

    CDD Vault 具备多层安全防护机制,包括对传输中的数据采用 TLS 加密,以及硬件和软件双重防火墙。

    “CDD Vault 的安全性意味着,我们的某家化学 CRO 可以在 CDD Vault 中注册化合物,而某家生物学 CRO 则可以上传该化合物的检测数据,同时严格限制各方可见的内容和可执行的操作,”高博士表示。 “CDD Vault 的‘结构屏蔽’功能意味着,一家生物学 CRO 只能看到化合物编号,而无法看到其化学结构。”

    了解 CDD Vault 如何支持协作药物发现

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    同样的数据隔离功能也在优领医药的两个站点之间构筑了一道屏障。作为其组织结构的一部分,每个站点都负责各自的项目,并致力于实现不同的目标。

    “CDD Vault 很方便地将我们的项目、数据和知识产权在同一个数据库中进行了隔离,让我们只能查看自己团队的数据。在与 CRO 或其他方共享数据时,我们可以进行极其精细的控制。这有助于我们保护知识产权,对于像我们这样的早期药物发现公司而言,这是至关重要的。”


    实验曲线叠加可视化

    优领医药的科学家们高度评价 CDD Vault 的可视化功能,包括动态叠加检测曲线的能力,例如在创建半数最大抑制浓度(IC50)表格时。

    “我们的生物学家使用 CDD Vault 可视化功能来拟合曲线、生成 IC50 表格,并执行类似的分析任务,”高博士说。 “借助 CDD 可视化功能,我们可以将单一化合物的多条测定曲线叠加到一张图表中。这使我们能够观察同一化合物在不同实验运行中的测定变异性,或比较多个化合物在不同实验运行中的表现。通过为每次实验运行使用不同的颜色,我们可以轻松识别差异并发现规律。”

    CDD 可视化功能既高效又易于使用。

    “当以汇总形式查询数据时,叠加曲线会自动生成,”高博士说。“如果没有 CDD Vault 可视化功能,当曲线分散在两张不同的图片中时,尤其是当它们的刻度不同或存在其他格式差异时,比较曲线将非常困难。我们非常喜欢这一功能。”


    对远程办公人员的支援

    “当公司在疫情期间成立时,对远程办公人员的支持至关重要——因为优领医药的所有员工最初都是通过远程办公开展工作的,一年后,随着 COVID-19 疫情持续蔓延,他们仍继续采用这种方式。”

    “从公司成立之初,我们就几乎没进过办公室,”高博士说,“从疫情中期开始,我们不得不学会如何通过远程方式处理所有事务。CDD Vault 基本上是我们共享真实数据的唯一途径。 我们可以将数据放在幻灯片上,但当我们需要查看真实的 IC50 曲线时,我们的生物学家会将数据导入 CDD。我们的化学家则登录 CDD 查看数据。如果没有 CDD Vault,我真不知道我们该如何完成这些工作。”

    卓越的客户支持

    优领医药对 CDD 提供的客户支持的质量和速度印象深刻。

    “我们有时在下班后发送邮件,仍能在几小时内收到回复。有时加班到很晚,半夜收到回复时我们都会感到惊讶。CDD 提供的客户服务是我们见过最好的。”


    关于 Collaborative Drug Discovery

    Collaborative Drug Discovery 提供了一种现代化的药物发现数据解决方案,深受全球数千名顶尖研究人员的信赖。

    CDD Vault 是一款托管型信息学平台,可安全管理私有及外部的生物和化学数据。其核心功能包括:

    • 化学物质注册

    • 结构活性关系

    • 库存管理

    • 可视化

    • 电子实验笔记本功能

    其他资源

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    CDD Vault 是如何帮助 Acerand 保护知识产权的?

    CDD Vault 使 Acerand 能够在共享环境中将不同项目分隔开来,并控制每个内部团队或外部合作伙伴能够查看的内容。例如,一家生物领域的合同研究组织(CRO)可以处理化合物 ID 和检测数据,而无需查看机密的化学结构。

    CDD Vault 是如何支持 Acerand 的多个站点和合同研究组织(CRO)的?

    Acerand 在其两个站点间使用一个共享的生产级 Vault,此外还设有一个用于测试的沙箱级 Vault。在此架构下,项目级控制措施确保了项目与知识产权的分离,而合同研究组织(CRO)可在权限仅限于其所需数据的前提下,将数据直接导入 CDD Vault。

    Acerand 为何选择 CDD Vault?

    Acerand 需要一个集中式系统,用于存储小分子、检测结果及相关药物发现数据,同时支持与美国和中国合同研究组织(CRO)合作伙伴之间的协作。CDD Vault 之所以脱颖而出,是因为它易于采用、培训需求极低,且符合一家没有专职内部 IT 支持的早期生物技术公司的需求。